; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0011224 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0011224
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptiondisease resistance protein RGA2-like
Genome locationchr11:6814727..6815225
RNA-Seq ExpressionIVF0011224
SyntenyIVF0011224
Gene Ontology termsGO:0006952 - defense response (biological process)
GO:0043531 - ADP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002182 - NB-ARC
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase
IPR044974 - Disease resistance protein, plants


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0042414.1 disease resistance protein RGA2-like [Cucumis melo var. makuwa]1.15e-8887.35Show/hide
Query:  MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL
        MA KMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETIS+LEDHKIVGRDVEVESIVK VIDASNNQ TSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL
Subjt:  MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL

Query:  VRQHFDKTVWVCVSEPFI--------------GTSNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN
        VRQHFDKTVWVCVSEPFI              G SNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFL+ DDVWN
Subjt:  VRQHFDKTVWVCVSEPFI--------------GTSNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN

KAA0066305.1 disease resistance protein RGA2-like [Cucumis melo var. makuwa]1.43e-8985.8Show/hide
Query:  MMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQH
        MMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETIS+LEDHKIVGRDVEVESIVK VIDASNNQ TSILPIVGMGGLGKTTLAKLVF HELVRQH
Subjt:  MMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQH

Query:  FDKTVWVCVSEPFI--------------GTSNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN
        FDKTVWVCVSEPFI              G SNGGDSKEV L ELQKEMLGQTYFL+ DDVWN
Subjt:  FDKTVWVCVSEPFI--------------GTSNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN

TYK00972.1 disease resistance protein RGA2-like [Cucumis melo var. makuwa]2.96e-9286.14Show/hide
Query:  MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL
        MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETIS+LEDHKIVGRDVEVESIVK VIDASNNQ TSILPIVGMGGLGKTTLAKLVF HEL
Subjt:  MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL

Query:  VRQHFDKTVWVCVSEPFI--------------GTSNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN
        VRQHFDKTVWVCVSEPFI              G SNGGDSKEV L ELQKEMLGQTYFL+ DDVWN
Subjt:  VRQHFDKTVWVCVSEPFI--------------GTSNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN

XP_008462780.1 PREDICTED: disease resistance protein RGA2-like [Cucumis melo]6.57e-8687.35Show/hide
Query:  MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL
        MA KMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETIS+LEDHKIVGRDVEVESIVK VIDASNNQ TSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL
Subjt:  MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL

Query:  VRQHFDKTVWVCVSEPFI--------------GTSNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN
        VRQHFDKTVWVCVSEPFI              G SNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFL+ DDVWN
Subjt:  VRQHFDKTVWVCVSEPFI--------------GTSNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN

XP_016902928.1 PREDICTED: disease resistance protein RGA2-like [Cucumis melo]6.99e-8686.14Show/hide
Query:  MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL
        MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETIS+LEDHKIVGRDVEVESIVK VIDASNNQ TSILPIVGMGGLGKTTLAKLVF HEL
Subjt:  MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL

Query:  VRQHFDKTVWVCVSEPFI--------------GTSNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN
        VRQHFDKTVWVCVSEPFI              G SNGGDSKEV L ELQKEMLGQTYFL+ DDVWN
Subjt:  VRQHFDKTVWVCVSEPFI--------------GTSNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CHQ5 disease resistance protein RGA2-like1.5e-7287.35Show/hide
Query:  MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL
        MA KMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETIS+LEDHKIVGRDVEVESIVK VIDASNNQ TSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL
Subjt:  MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL

Query:  VRQHFDKTVWVCVSEPFI--------------GTSNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN
        VRQHFDKTVWVCVSEPFI              G SNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFL+ DDVWN
Subjt:  VRQHFDKTVWVCVSEPFI--------------GTSNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN

A0A1S4E3X3 disease resistance protein RGA2-like3.7e-7186.14Show/hide
Query:  MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL
        MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETIS+LEDHKIVGRDVEVESIVK VIDASNNQ TSILPIVGMGGLGKTTLAKLVF HEL
Subjt:  MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL

Query:  VRQHFDKTVWVCVSEPFI--------------GTSNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN
        VRQHFDKTVWVCVSEPFI              G SNGGDSKEV L ELQKEMLGQTYFL+ DDVWN
Subjt:  VRQHFDKTVWVCVSEPFI--------------GTSNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN

A0A5A7TG70 Disease resistance protein RGA2-like1.5e-7287.35Show/hide
Query:  MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL
        MA KMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETIS+LEDHKIVGRDVEVESIVK VIDASNNQ TSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL
Subjt:  MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL

Query:  VRQHFDKTVWVCVSEPFI--------------GTSNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN
        VRQHFDKTVWVCVSEPFI              G SNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFL+ DDVWN
Subjt:  VRQHFDKTVWVCVSEPFI--------------GTSNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN

A0A5D3BQC0 Disease resistance protein RGA2-like3.7e-7186.14Show/hide
Query:  MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL
        MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETIS+LEDHKIVGRDVEVESIVK VIDASNNQ TSILPIVGMGGLGKTTLAKLVF HEL
Subjt:  MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL

Query:  VRQHFDKTVWVCVSEPFI--------------GTSNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN
        VRQHFDKTVWVCVSEPFI              G SNGGDSKEV L ELQKEMLGQTYFL+ DDVWN
Subjt:  VRQHFDKTVWVCVSEPFI--------------GTSNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN

A0A5D3C5G4 Putative disease resistance protein RGA35.4e-7084.94Show/hide
Query:  MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL
        MAKKMMTL+ LLEKHY EAAPLGLV NEN RPEIDVISQYRETIS+LEDHKIVGRDVEVESIVK VIDASNNQ TSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL
Subjt:  MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHEL

Query:  VRQHFDKTVWVCVSEPFI--------------GTSNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN
        VRQHFDKTVWVCVSEPFI              G SNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFL+ DDVWN
Subjt:  VRQHFDKTVWVCVSEPFI--------------GTSNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q7XA39 Putative disease resistance protein RGA41.3e-1741.27Show/hide
Query:  RETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASN-NQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQHFDKTVWVCVSEPF---------IG----TSNGGDS
        RET   L + K+ GRD E + IVK +I+  N  +   + PI+GMGGLGKTTLA+++FN E V +HF+  +WVCVS+ F         IG    +S   + 
Subjt:  RETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASN-NQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQHFDKTVWVCVSEPF---------IG----TSNGGDS

Query:  KEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN
             ++LQ+ + G+ Y L+ DDVWN
Subjt:  KEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN

Q7XA40 Putative disease resistance protein RGA35.5e-1941.27Show/hide
Query:  RETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVI-DASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQHFDKTVWVCVSEPF-------------IGTSNGGDS
        R+T   L + K+ GR+ E + IVK +I + S ++   +LPI+GMGGLGKTTLA++VFN + + +HF+  +WVCVS+ F              G S G   
Subjt:  RETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVI-DASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQHFDKTVWVCVSEPF-------------IGTSNGGDS

Query:  KEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN
           L ++LQ+ + G+ YFL+ DDVWN
Subjt:  KEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN

Q7XA42 Putative disease resistance protein RGA14.2e-1942.06Show/hide
Query:  RETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVID-ASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQHFDKTVWVCVSEPF---------IGTSNGGDSKEVL
        RET S L + ++ GRD E + IVK +I+ AS+ Q  S+LPI+GMGGLGKTTL+++VFN + V + F   +W+C+S+ F         + +  G    ++ 
Subjt:  RETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVID-ASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQHFDKTVWVCVSEPF---------IGTSNGGDSKEVL

Query:  LRELQKEML----GQTYFLLFDDVWN
        L  LQK++     G+ YFL+ DDVWN
Subjt:  LRELQKEML----GQTYFLLFDDVWN

Q7XBQ9 Disease resistance protein RGA24.2e-1943.31Show/hide
Query:  RETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVI-DASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQHFDKTVWVCVSEPF---------IGTSNG----GD-
        RET S L + ++ GRD E + IVK +I + S+ Q  S+LPI+GMGGLGKTTLA++VFN + V +HF   +W+CVSE F         + +  G    G+ 
Subjt:  RETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVI-DASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQHFDKTVWVCVSEPF---------IGTSNG----GD-

Query:  SKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN
            L ++LQ+ + G+ Y L+ DDVWN
Subjt:  SKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN

Q8W474 Probable disease resistance protein At1g583905.7e-1635.51Show/hide
Query:  RPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQHFDKTVWVCVSEPF---------IGTS
        +P+ D   + R+T SK  +   VG +V V+ +V +++D  N Q   ++ I GMGGLGKTTLA+ VFNHE V+  FD+  WVCVS+ F         +   
Subjt:  RPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQHFDKTVWVCVSEPF---------IGTS

Query:  NGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLL--------FDDVW
           + K+ +L+  + E+  + + LL        FDD+W
Subjt:  NGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLL--------FDDVW

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G53350.1 Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family9.9e-1635.94Show/hide
Query:  QYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQHFDKTVWVCVSEPF---------IGTSNGGDSKEV
        + R+T S+  +  +VG D  VE +V H+++   N    ++ + GMGG+GKTTLA+ VF+H++VR+HFD   WVCVS+ F         +      D   +
Subjt:  QYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQHFDKTVWVCVSEPF---------IGTSNGGDSKEV

Query:  LLRE--LQKEML----GQTYFLLFDDVW
         + E  LQ E+        Y L+ DDVW
Subjt:  LLRE--LQKEML----GQTYFLLFDDVW

AT1G58390.1 Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family4.0e-1735.51Show/hide
Query:  RPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQHFDKTVWVCVSEPF---------IGTS
        +P+ D   + R+T SK  +   VG +V V+ +V +++D  N Q   ++ I GMGGLGKTTLA+ VFNHE V+  FD+  WVCVS+ F         +   
Subjt:  RPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQHFDKTVWVCVSEPF---------IGTS

Query:  NGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLL--------FDDVW
           + K+ +L+  + E+  + + LL        FDD+W
Subjt:  NGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLL--------FDDVW

AT1G58400.1 Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family2.2e-1533.85Show/hide
Query:  QYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQHFDKTVWVCVSEPF---------IGTSNGGDSKEV
        + R+T S+  +   VG +V V+ +V ++++  + Q   I+ + GMGGLGKTTLA+ VFNHE V+  FD+  WVCVS+ F         +      ++K+ 
Subjt:  QYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQHFDKTVWVCVSEPF---------IGTSNGGDSKEV

Query:  LLRELQKEMLGQTYFLL--------FDDVW
        +L+  + E+  + + LL        FDD+W
Subjt:  LLRELQKEMLGQTYFLL--------FDDVW

AT3G50950.1 HOPZ-ACTIVATED RESISTANCE 11.3e-1536.36Show/hide
Query:  SKLEDH-KIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQHFDKTVWVCVSEPF------------IGTSNGGDSKEVLL
        S + DH ++VG + +   I K  +  SN+    I+  VGMGGLGKTT+A+ VFN + +   F++ +WV VS+ F            +G ++ GD    LL
Subjt:  SKLEDH-KIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQHFDKTVWVCVSEPF------------IGTSNGGDSKEVLL

Query:  RELQKEMLGQTYFLLFDDVWN
        R++Q+ +LG+ Y ++ DDVW+
Subjt:  RELQKEMLGQTYFLLFDDVWN

AT3G50950.2 HOPZ-ACTIVATED RESISTANCE 11.3e-1536.36Show/hide
Query:  SKLEDH-KIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQHFDKTVWVCVSEPF------------IGTSNGGDSKEVLL
        S + DH ++VG + +   I K  +  SN+    I+  VGMGGLGKTT+A+ VFN + +   F++ +WV VS+ F            +G ++ GD    LL
Subjt:  SKLEDH-KIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQHFDKTVWVCVSEPF------------IGTSNGGDSKEVLL

Query:  RELQKEMLGQTYFLLFDDVWN
        R++Q+ +LG+ Y ++ DDVW+
Subjt:  RELQKEMLGQTYFLLFDDVWN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGAAAAAAATGATGACTCTTGTAGAATTGTTAGAAAAGCATTACAATGAGGCTGCTCCTTTAGGACTAGTGGTGAATGAAAATGCAAGACCAGAGATCGATGTTAT
TAGTCAATATCGAGAGACAATTTCAAAACTCGAAGATCATAAGATTGTGGGGAGGGATGTTGAAGTTGAAAGTATAGTGAAACACGTGATTGATGCTAGCAATAATCAAT
TTACATCTATCCTACCCATTGTTGGTATGGGTGGATTAGGAAAAACAACTTTGGCAAAGTTAGTTTTCAACCATGAGTTGGTTAGACAACATTTTGATAAAACTGTATGG
GTATGTGTCTCTGAACCATTTATTGGCACTTCTAATGGAGGGGATAGTAAGGAGGTTTTACTTCGTGAACTCCAAAAAGAGATGCTTGGCCAAACATATTTTCTTCTGTT
TGACGATGTTTGGAACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGAAAAAAATGATGACTCTTGTAGAATTGTTAGAAAAGCATTACAATGAGGCTGCTCCTTTAGGACTAGTGGTGAATGAAAATGCAAGACCAGAGATCGATGTTAT
TAGTCAATATCGAGAGACAATTTCAAAACTCGAAGATCATAAGATTGTGGGGAGGGATGTTGAAGTTGAAAGTATAGTGAAACACGTGATTGATGCTAGCAATAATCAAT
TTACATCTATCCTACCCATTGTTGGTATGGGTGGATTAGGAAAAACAACTTTGGCAAAGTTAGTTTTCAACCATGAGTTGGTTAGACAACATTTTGATAAAACTGTATGG
GTATGTGTCTCTGAACCATTTATTGGCACTTCTAATGGAGGGGATAGTAAGGAGGTTTTACTTCGTGAACTCCAAAAAGAGATGCTTGGCCAAACATATTTTCTTCTGTT
TGACGATGTTTGGAACTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAKKMMTLVELLEKHYNEAAPLGLVVNENARPEIDVISQYRETISKLEDHKIVGRDVEVESIVKHVIDASNNQFTSILPIVGMGGLGKTTLAKLVFNHELVRQHFDKTVW
VCVSEPFIGTSNGGDSKEVLLRELQKEMLGQTYFLLFDDVWN