| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0064834.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucumis melo var. makuwa] | 9.05e-162 | 100 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD
PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD
|
|
| XP_008445340.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucumis melo] | 2.14e-162 | 100 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADE
PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADE
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADE
|
|
| XP_011649457.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 isoform X2 [Cucumis sativus] | 9.75e-159 | 98.01 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDD+RDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADE
PDTRRSISPR+TPPSR RSD+E SPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADE
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADE
|
|
| XP_031736561.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 isoform X1 [Cucumis sativus] | 4.72e-156 | 95.72 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDR------SM
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDD+RDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDR SM
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDR------SM
Query: SPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADE
SPTRHSPDTRRSISPR+TPPSR RSD+E SPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADE
Subjt: SPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADE
|
|
| XP_038884086.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Benincasa hispida] | 3.64e-154 | 96.81 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDD RDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTR S
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADE
PDTRRSISPRRTPP RGRSD+E SP DNGS DDKPVDSRSPSPARSDADE
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADE
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LQG4 RRM domain-containing protein | 6.3e-124 | 98.01 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDD+RDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADE
PDTRRSISPR+TPPSR RSD+E SPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADE
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADE
|
|
| A0A1S3BCG4 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 1.0e-126 | 100 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADE
PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADE
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADE
|
|
| A0A5A7VC44 Serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 3.0e-126 | 100 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD
PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD
|
|
| A0A6J1K4H2 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 | 6.1e-119 | 95.2 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPR RHRDDYRDRDYRRRSRSRSRER+DRDRPHRSERERYRSRSRSASPDR KDRRRGRDD ERRSASHSDRSMSP RHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD
PDTRRSISPRRTPPSRGRSD E SP+ DNGSPDDKPVDSRSPSPA+SDAD
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDAD
|
|
| A0A6J1K6Z8 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X1 | 2.1e-119 | 95.22 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPR RHRDDYRDRDYRRRSRSRSRER+DRDRPHRSERERYRSRSRSASPDR KDRRRGRDD ERRSASHSDRSMSP RHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADE
PDTRRSISPRRTPPSRGRSD E SP+ DNGSPDDKPVDSRSPSPA+SDADE
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADE
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 5.3e-27 | 45.29 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
Query: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
R+G + RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R + R R RSRSRS S RS R + + RS S S RS SP
Subjt: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
Query: --TRHSPDTRRSISPRRTPPSRG
R S RS SP ++P G
Subjt: --TRHSPDTRRSISPRRTPPSRG
|
|
| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.5e-26 | 45.29 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
Query: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R + R R RSRSRS S RS R + + RS S S RS SP
Subjt: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
Query: --TRHSPDTRRSISPRRTPPSRG
R S RS SP ++P G
Subjt: --TRHSPDTRRSISPRRTPPSRG
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.5e-26 | 45.29 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
Query: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R + R R RSRSRS S RS R + + RS S S RS SP
Subjt: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
Query: --TRHSPDTRRSISPRRTPPSRG
R S RS SP ++P G
Subjt: --TRHSPDTRRSISPRRTPPSRG
|
|
| Q62093 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.5e-26 | 45.29 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
Query: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R + R R RSRSRS S RS R + + RS S S RS SP
Subjt: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
Query: --TRHSPDTRRSISPRRTPPSRG
R S RS SP ++P G
Subjt: --TRHSPDTRRSISPRRTPPSRG
|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 1.1e-64 | 63.1 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERE-RYRSRSRSASPDRSKDRR
I KGRV+E S ++R RS RSRSPR R RDDYR++DYR+RSRSRS +R R+R +R+ R R+RSRSASPD K R
Subjt: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERE-RYRSRSRSASPDRSKDRR
Query: RGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARS
RGR D+E RS S S S SP R SP RS SP++T P+R E SP DK + RSPSP RS
Subjt: RGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARS
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 3.2e-11 | 37.35 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRGR
SLLV N+ +DL F+++G V D+++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG +L GRE+ V FA+ E +K M + + GR
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRGR
Query: ------------SRSRSP-------RSRHRDDYR--DRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSD-RSM
SRSRSP RSR D Y R + RS S ERYD R + SR RS +P R K R RRS S S RS
Subjt: ------------SRSRSP-------RSRHRDDYR--DRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSD-RSM
Query: SPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADE
SP SP RS+SPRR+ R RSP+ S +P SRS SP DE
Subjt: SPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARSDADE
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 1.2e-10 | 36.07 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRK
FG S D+ SLLV N+ +DL F+++G V D+++PRD TGD RGF F+++ +A +A ++DG +L GRE+ V FA+ N +K +
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRK
Query: GRVMESSSKT-RGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSR-----------SRERYDRDRPHRSERERYR------SRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERR
R + ++ R + R RSP R R R RSRSR SR +DR + ER R SR RS SP R K R RR
Subjt: GRVMESSSKT-RGRSRSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSR-----------SRERYDRDRPHRSERERYR------SRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERR
Query: SAS-HSDRSMSPTR---HSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSP
S S +RS +P + SP R+S SP TP RG + +RSP
Subjt: SAS-HSDRSMSPTR---HSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSP
|
|
| AT5G18810.1 SC35-like splicing factor 28 | 4.9e-12 | 31.74 | Show/hide |
Query: LLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRGRS
LL+ N+ +DL F+++G + D+++PR+ TG+ RGF FV+Y+YA++A +A+ +++ +++ GREI + FA+ E + + M +++ T G
Subjt: LLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRGRS
Query: RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRG
R DY+R S HRS R RYRS SRS SP R + R S D SP R S RS PR +
Subjt: RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERERYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRG
Query: RSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARS
R N RSP+ + P+ SR S +RS
Subjt: RSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARS
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 7.7e-66 | 63.1 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERE-RYRSRSRSASPDRSKDRR
I KGRV+E S ++R RS RSRSPR R RDDYR++DYR+RSRSRS +R R+R +R+ R R+RSRSASPD K R
Subjt: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERE-RYRSRSRSASPDRSKDRR
Query: RGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARS
RGR D+E RS S S S SP R SP RS SP++T P+R E SP DK + RSPSP RS
Subjt: RGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARS
|
|
| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 7.7e-66 | 63.1 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERE-RYRSRSRSASPDRSKDRR
I KGRV+E S ++R RS RSRSPR R RDDYR++DYR+RSRSRS +R R+R +R+ R R+RSRSASPD K R
Subjt: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDYRDRDYRRRSRSRSRERYDRDRPHRSERE-RYRSRSRSASPDRSKDRR
Query: RGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARS
RGR D+E RS S S S SP R SP RS SP++T P+R E SP DK + RSPSP RS
Subjt: RGRDDDERRSASHSDRSMSPTRHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDNERSPKGDNGSPDDKPVDSRSPSPARS
|
|
