CuGenDBv2

Gene ID	IVF0011296
Organism	Cucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	Cytochrome c biogenesis protein CcsA
Genome location	chr05:8675524..8676495
RNA-Seq Expression	IVF0011296
Synteny	IVF0011296
Gene Ontology terms	GO:0017004 - cytochrome complex assembly (biological process) GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0020037 - heme binding (molecular function)
InterPro domains	IPR002541 - Cytochrome c assembly protein IPR017562 - Cytochrome c-type biogenesis protein CcsA IPR045062 - Cytochrome c-type biogenesis protein CcsA/CcmC

Homology

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QHB76014.1 cytochrome c biogenesis protein [Cucumis melo subsp. melo]

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A0A286NFV0 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

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Q09FZ7 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

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Q09WW9 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

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Subjt:  RNTSFFSLKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWI

Query:  CYFGVNLLGIGLDSYGSFTLTSN
        CYFGVNLLGIGL SYGSFTLTSN
Subjt:  CYFGVNLLGIGLDSYGSFTLTSN

Q0ZIW9 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

8.3e-142

79.88

Show/hide

Query:  MIFLTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLINETVGLYVSSEKGMIVTFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWALSIIHLFAYLKKYKNHLSV
        MIF T EHILTHISFSV+SIVITI LITLL++E VGL  SSEKGMI TFFCITGLLVTRWIYL H PLSDLYESL+FLSW+ SIIH+  Y KK+KNHL  
Subjt:  MIFLTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLINETVGLYVSSEKGMIVTFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWALSIIHLFAYLKKYKNHLSV

Query:  SAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVLALQSHWLMMHVSMMVLGYVALLCGSLFSVAPIVITFQKAIRIFGKNNNLLNALFSFDEIQYINEGNYFV
        SA+TAPS IFTQGFATSG LTEMHQS +LV ALQS WLMMHVSMMVLGY ALLCGSL SVA +VITF++ IRI  KNN+ LN  FSFDEIQY+N+GN  +
Subjt:  SAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVLALQSHWLMMHVSMMVLGYVALLCGSLFSVAPIVITFQKAIRIFGKNNNLLNALFSFDEIQYINEGNYFV

Query:  RNTSFFSLKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWI
        +NTSF S++NYY++Q IQQLDHWSYR+ISLGF+FL+IGILSGAVWANE WGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKN +  NSAIVASMGFLIIWI
Subjt:  RNTSFFSLKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWI

Query:  CYFGVNLLGIGLDSYGSFTLTSN
        CYFGVNLLGIGL SYGSFT +SN
Subjt:  CYFGVNLLGIGLDSYGSFTLTSN

Q2QD41 Cytochrome c biogenesis protein CcsA

3.8e-171

96.28

Show/hide

Query:  MIFLTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLINETVGLYVSSEKGMIVTFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWALSIIHLFAYLKKYKNHLSV
        MIF TFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLINETVGLYVSSEKGMI TFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWA SIIHLF Y KKYKNHLSV
Subjt:  MIFLTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLINETVGLYVSSEKGMIVTFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWALSIIHLFAYLKKYKNHLSV

Query:  SAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVLALQSHWLMMHVSMMVLGYVALLCGSLFSVAPIVITFQKAIRIFGKNNNLLNALFSFDEIQYINEGNYFV
        SAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLV ALQSHWLMMHVSMMVLGY ALLCGSLFSVA IVITFQKAIRIF KNNNLLNALFSF+EIQYINEGNYFV
Subjt:  SAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVLALQSHWLMMHVSMMVLGYVALLCGSLFSVAPIVITFQKAIRIFGKNNNLLNALFSFDEIQYINEGNYFV

Query:  RNTSFFSLKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWI
        RNTSFFS KNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWI
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Query:  CYFGVNLLGIGLDSYGSFTLTSN
        CYFGVNLLGIGL SYGSFTLTSN
Subjt:  CYFGVNLLGIGLDSYGSFTLTSN

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

ATCG01040.1 Cytochrome C assembly protein

2.3e-118

68.81

Show/hide

Query:  MIFLTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLIN--ETVGLYVSSEKGMIVTFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWALSIIHLFAYLKKYKNHL
        MIF   EHILTHISFSV+SIV+TI  +TLL+N  E +G + SS+KG+I+TFF ITGLL+TRWIY  H PLS+LYESL+FLSWA SIIH+ +Y  K K   
Subjt:  MIFLTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLIN--ETVGLYVSSEKGMIVTFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWALSIIHLFAYLKKYKNHL

Query:  SVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVLALQSHWLMMHVSMMVLGYVALLCGSLFSVAPIVITFQKAIRIFG----KNNNLLNALFSFDEIQYIN
         ++ ITAPS IF QGFATSG L +M QS +LV ALQS WLMMHVSMM+LGY ALLCGSL S+A +VITF+K    F     K N LLN LFSFD + YIN
Subjt:  SVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVLALQSHWLMMHVSMMVLGYVALLCGSLFSVAPIVITFQKAIRIFG----KNNNLLNALFSFDEIQYIN

Query:  EGNYFV--RNTSFFSLKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVAS
        E N  +  +N +F   +NYY+ QLIQQLD WS+RIISLGFIFL++GILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLH +TN+N  G+NSAIVA 
Subjt:  EGNYFV--RNTSFFSLKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVAS

Query:  MGFLIIWICYFGVNLLGIGLDSYGSFT
        +GF++IWICYFGVNLLGIGL SYGSFT
Subjt:  MGFLIIWICYFGVNLLGIGLDSYGSFT

Sequences

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CDS sequence

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ATGATATTTTTAACTTTCGAGCATATATTAACTCATATATCATTTTCGGTCATTTCAATTGTCATTACAATTCAGTTAATAACCTTATTAATCAATGAAACCGTAGGACT
CTATGTTTCGTCAGAAAAGGGCATGATAGTTACTTTTTTCTGTATAACAGGATTATTAGTTACTCGTTGGATTTATTTGAGGCATTTACCATTAAGTGATTTATATGAAT
CATTACTATTTCTTTCATGGGCTTTATCCATTATTCATCTATTTGCTTATTTAAAAAAATATAAAAACCATTTAAGTGTAAGCGCAATAACCGCGCCAAGTACTATTTTT
ACACAAGGTTTTGCTACTTCAGGTTTTTTAACTGAAATGCATCAATCCCCACTATTAGTTCTCGCTCTCCAATCTCATTGGTTAATGATGCACGTAAGTATGATGGTATT
AGGTTATGTAGCTCTTTTATGTGGATCATTATTTTCAGTAGCTCCTATAGTGATTACATTTCAAAAAGCTATAAGAATTTTTGGTAAAAACAATAATTTATTAAATGCGT
TATTTTCCTTTGATGAGATCCAATACATCAACGAAGGGAACTATTTTGTAAGAAACACTTCCTTTTTTTCTTTGAAGAATTATTATAAGTCTCAACTGATTCAACAATTA
GATCATTGGAGTTATCGTATTATTAGTCTAGGGTTTATCTTTTTAAGCATAGGTATTCTTTCAGGGGCAGTATGGGCTAATGAGACATGGGGATCGTATTGGAATTGGGA
CCCAAAGGAAACTTGGGCATTTATTACTTGGACGATATTTGCAATTTATTTACATACGCGAACAAATAAAAATTTTGAAGGTGTAAATTCCGCAATTGTGGCCTCTATGG
GTTTTCTTATAATTTGGATATGCTATTTTGGGGTCAATCTATTAGGGATAGGGCTAGATAGTTATGGTTCATTTACATTAACATCTAATTGA

mRNA sequence

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Protein sequence

Show/hide protein sequence

MIFLTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLINETVGLYVSSEKGMIVTFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWALSIIHLFAYLKKYKNHLSVSAITAPSTIF
TQGFATSGFLTEMHQSPLLVLALQSHWLMMHVSMMVLGYVALLCGSLFSVAPIVITFQKAIRIFGKNNNLLNALFSFDEIQYINEGNYFVRNTSFFSLKNYYKSQLIQQL
DHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLDSYGSFTLTSN

IVF0011296 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome