; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0011808 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0011808
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationchr08:25789343..25789543
RNA-Seq ExpressionIVF0011808
SyntenyIVF0011808
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TYK08389.1 putative nuclease HARBI1 [Cucumis melo var. makuwa]9.59e-3387.88Show/hide
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TYK10940.1 putative nuclease HARBI1 [Cucumis melo var. makuwa]9.30e-41100Show/hide
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XP_008441953.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103485952 [Cucumis melo]9.59e-3387.88Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7T808 Putative nuclease HARBI12.9e-2896.97Show/hide
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A0A5A7V6M3 Putative nuclease HARBI13.6e-2690.91Show/hide
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A0A5D3CDG6 Putative nuclease HARBI11.1e-2487.88Show/hide
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A0A5D3CHV9 Putative nuclease HARBI12.4e-30100Show/hide
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A0A5D3DG22 Retrotransposon protein4.6e-2690.77Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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