CuGenDBv2

Gene ID	IVF0011897
Organism	Cucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 33A-like
Genome location	chr11:26458134..26471238
RNA-Seq Expression	IVF0011897
Synteny	IVF0011897
Gene Ontology terms	GO:2000762 - regulation of phenylpropanoid metabolic process (biological process) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0016592 - mediator complex (cellular component)
InterPro domains	IPR039638 - Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 33A/B

Homology

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        PWPCMPIVASLWTQK
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KHK6 Uncharacterized protein

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A0A1S3C9B9 LOW QUALITY PROTEIN: mediator of RNA polymerase II transcription subunit 33A-like

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        NSS GNMRHLIVEACIARNLLDTSAYFWRGYVNGCISQMPQSIPPQAPGWSAFMKGALLNHIMINVLTSTPASSLAELEKIFEIAVKGSDEEKISAATIL
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        PWPCMPIVASLWTQK
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A0A5A7SQH3 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 33A-like

0.0e+00

99.9

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A0A6J1H3P1 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 33A isoform X1

0.0e+00

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        PVAYRLYLELLRRHAFKLKSHIHGLKYKEVMASVDAVL LSETFNLPA+DPGTLVVE+IFSIVW+LLDATL DEGLL+LI+EEKSKWP +PQEMELDGHN
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        GYDDKWTEQRERL+NVN+ELTIEIIGKFL+D+VTSRIL LACRNMPSHWADLIQRLQL+GENSSVLR SKS +SEIFLQF  DTWTIFSQEFKQNSQ+KF
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        HPIRAFGSPA+SASLCHRT YSALWLPLDLVLEDAMDGYQVEATSAIEKITSLVKTLKAINGTSWHDTFLGLWIA+LRLVQRERDPIEGPVPRIDTRLCL
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        NSSAGNMRHLIVEACIARNLLDTSAYFWRGYVNGCI+QMPQSIPPQAPGWSAF+KGA LNHIMI VLTSTPASSLAELEKIFEIAVKGSDEEKISAATIL
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Query:  PWPCMPIVASLWTQK
        PWPCMPIVASLWTQK
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A0A6J1KVA0 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 33A isoform X1

0.0e+00

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Query:  MAVSVQNNLWDRVTELTKVAQQKGVDPLLWAIQLSSNLNSAGVVLPSVELANLLVSHICWENNEPVSWKFLEKALMLNIVPPILVLALLTTRVISRRQFQ
        MAV+V N+ WDRVTELTKVAQQKGVDPL WAIQLSSNLNS+GVVLPSVELAN+LVSHICW+NNEPVSWKFLEKALMLNIVPPILVLALL TRVISRRQFQ
Subjt:  MAVSVQNNLWDRVTELTKVAQQKGVDPLLWAIQLSSNLNSAGVVLPSVELANLLVSHICWENNEPVSWKFLEKALMLNIVPPILVLALLTTRVISRRQFQ

Query:  PVAYRLYLELLRRHAFKLKSHIHGLKYKEVMASVDAVLCLSETFNLPANDPGTLVVEFIFSIVWQLLDATLADEGLLELIMEEKSKWPAKPQEMELDGHN
        PVAYRLYLELLRRHAFKLKSHIHGLKYKEVMASVDAVL LSETFNLPA+DPGTLVVE+IFSIVW+LLDATL DEGLL+LI+EEKSKWP +PQEMELDGHN
Subjt:  PVAYRLYLELLRRHAFKLKSHIHGLKYKEVMASVDAVLCLSETFNLPANDPGTLVVEFIFSIVWQLLDATLADEGLLELIMEEKSKWPAKPQEMELDGHN

Query:  GYDDKWTEQRERLRNVNIELTIEIIGKFLEDSVTSRILQLACRNMPSHWADLIQRLQLLGENSSVLRNSKSLDSEIFLQFTSDTWTIFSQEFKQNSQQKF
        GYDDKWTEQRERL+NVN+ELTIEIIGKFL+D+VTSRIL LACRNMPSHWADLIQRLQLLGENSSVLR SKSL+SEIFLQF  DTWTIFSQEFK+NSQ+KF
Subjt:  GYDDKWTEQRERLRNVNIELTIEIIGKFLEDSVTSRILQLACRNMPSHWADLIQRLQLLGENSSVLRNSKSLDSEIFLQFTSDTWTIFSQEFKQNSQQKF

Query:  HPIRAFGSPAASASLCHRTHYSALWLPLDLVLEDAMDGYQVEATSAIEKITSLVKTLKAINGTSWHDTFLGLWIASLRLVQRERDPIEGPVPRIDTRLCL
        HPIRAFGSPAASASLCHRT YSALWLPLDLVLEDAMDGYQVEATSAIEKITSLVKTLKAINGTSWHDTFLGLWIA+LRLVQRERDPIEGPVPRIDTRLCL
Subjt:  HPIRAFGSPAASASLCHRTHYSALWLPLDLVLEDAMDGYQVEATSAIEKITSLVKTLKAINGTSWHDTFLGLWIASLRLVQRERDPIEGPVPRIDTRLCL

Query:  LLCITVLVIADLIEEEESATIDETEYVASHHWKEKKTPGKCRNELISSLQILGEYQSLLTPPQDVISACNQAAAKAMMFVSGISVNNAYFECINMKDMPM
        LLCITVLVIADLIEEEES TIDETE  AS+HWKEKK PGKCRNELISSLQILGEYQSLLTPPQ VISACNQAAAKAMMF+SGISV+NAYFECINMKDMPM
Subjt:  LLCITVLVIADLIEEEESATIDETEYVASHHWKEKKTPGKCRNELISSLQILGEYQSLLTPPQDVISACNQAAAKAMMFVSGISVNNAYFECINMKDMPM

Query:  NSSAGNMRHLIVEACIARNLLDTSAYFWRGYVNGCISQMPQSIPPQAPGWSAFMKGALLNHIMINVLTSTPASSLAELEKIFEIAVKGSDEEKISAATIL
        NSSAGNMRHLIVEACIARNLLDTSAYFWRGYVNGCI+QMPQSIPPQAPGWSAF+KGA LNHIMI VLTSTPASSL ELEKIFEIAVKGSDEEKISAATIL
Subjt:  NSSAGNMRHLIVEACIARNLLDTSAYFWRGYVNGCISQMPQSIPPQAPGWSAFMKGALLNHIMINVLTSTPASSLAELEKIFEIAVKGSDEEKISAATIL

Query:  CGASLIRGWNIQEHTVHYITRLLSPPVPTDYSGCESHLIGYAPMLNVLIVGIASIDCVQIFSLHGLVPQLACSLMPICEVFGSCVPNLNWTLSTGEEISA
        CGASLIRGWNIQEHTVHYITRLLSPPVP DYSGCESHLIGYAPMLNVLIVGIASIDCVQIFSLHGLVPQLACSLMPICEVFGSCVPNLNWTL+TGEEISA
Subjt:  CGASLIRGWNIQEHTVHYITRLLSPPVPTDYSGCESHLIGYAPMLNVLIVGIASIDCVQIFSLHGLVPQLACSLMPICEVFGSCVPNLNWTLSTGEEISA

Query:  HAVFSNAFTLLLKLWRFNHPPLDHGVGDAPTVGSQLTPEYLLLVRNSHLISGNVHKDRNKMRLSAVASSSSPQPIFVDSFPKLKAWYRQHQACIASTLSG
        HAVFSNAFTLLLKLWRFNHPPLDHGVGDAPTVGSQLTPEYLLLVRNSHL+SGNVHKDRNKMRLSAVASSSSPQPIFVDSFPKLK WYRQHQACIASTLSG
Subjt:  HAVFSNAFTLLLKLWRFNHPPLDHGVGDAPTVGSQLTPEYLLLVRNSHLISGNVHKDRNKMRLSAVASSSSPQPIFVDSFPKLKAWYRQHQACIASTLSG

Query:  HVHGNPVHQTVDGLLNMMFRRINGGNQPLTSVTSGSSSSSGAGNEDPSLRPKLPAWDIMEAVPFVIDAALTACAHGKLSPRELATGLKDLADFLPASLAT
        HVHGNPVHQTVDGLLNMMFRRINGGNQPLTSVTSGSSSSSG GNED SLRPKLPAWDIMEAVPFVIDAALTACAHGKLSPRELATGLKDLADFLPASLAT
Subjt:  HVHGNPVHQTVDGLLNMMFRRINGGNQPLTSVTSGSSSSSGAGNEDPSLRPKLPAWDIMEAVPFVIDAALTACAHGKLSPRELATGLKDLADFLPASLAT

Query:  IVSYFSAEVTRGLWKPVFMNGTDWPSPAENLSNVEEQIKKILAATGVDVPSLAAGGSSPATLPLPLAAFVSLTITYKIDRASQRFLNLAGPALESLAAGC
        IVSYFSAEVTRGLWKPVFMNG+DWPSPA NLSNVEEQIKKILAATGVDVPSLAAGGSSPATLPLPLAAFVSLTITYKIDRAS+RFLNLAGPALESLAAGC
Subjt:  IVSYFSAEVTRGLWKPVFMNGTDWPSPAENLSNVEEQIKKILAATGVDVPSLAAGGSSPATLPLPLAAFVSLTITYKIDRASQRFLNLAGPALESLAAGC

Query:  PWPCMPIVASLWTQK
        PWPCMPIVASLWTQK
Subjt:  PWPCMPIVASLWTQK

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

F4IN69 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 33B

1.0e-305

55.97

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Query:  QNNLWDRVTELTKVAQQKGVDPLLWAIQLSSNLNSAGVVLPSVELANLLVSHICWENNEPVSWKFLEKALMLNIVPPILVLALLTTRVISRRQFQPVAYR
        Q +LW+ VT L + AQ+K VDPL WA+QL   L SAG+ LPS +LA  LV+HI WEN+ P+SWK LEKA+ +NIVPP+LVLALL+ RVI  R+  P AYR
Subjt:  QNNLWDRVTELTKVAQQKGVDPLLWAIQLSSNLNSAGVVLPSVELANLLVSHICWENNEPVSWKFLEKALMLNIVPPILVLALLTTRVISRRQFQPVAYR

Query:  LYLELLRRHAFKLKSHIHGLKYKEVMASVDAVLCLSETFNLPANDPGTLVVEFIFSIVWQLLDATLADEGLLELIMEEKSKWPAKPQEMELDGHNGYDDK
        LY+ELL+RHAF     I    Y + M S+D +L LSETF +   +PG++++ F+FSIVW+LLDA+L +EGLLEL   ++SKWP+ P +M+LDG      K
Subjt:  LYLELLRRHAFKLKSHIHGLKYKEVMASVDAVLCLSETFNLPANDPGTLVVEFIFSIVWQLLDATLADEGLLELIMEEKSKWPAKPQEMELDGHNGYDDK

Query:  WTEQRERLRNVNIELTIEIIGKFLEDSVTSRILQLACRNMPSHWADLIQRLQLLGENSSVLRNSKSLDSEIFLQFTSDTWTIFSQEFKQNSQQKFHPIRA
          E  + L   N E+ IE+I +FL++ VTSRIL LA +NM                                             E K   + +FH I +
Subjt:  WTEQRERLRNVNIELTIEIIGKFLEDSVTSRILQLACRNMPSHWADLIQRLQLLGENSSVLRNSKSLDSEIFLQFTSDTWTIFSQEFKQNSQQKFHPIRA

Query:  FGSPAASASLCHRTHYSALWLPLDLVLEDAMDGYQVEATSAIEKITSLVKTLKAINGTSWHDTFLGLWIASLRLVQR-------------------ERDP
         GS  A       T  SALWLP+DL  ED MDG Q  A SA+E +T LVK L+A N TSWHD FL LW+A+LRLVQR                   ERDP
Subjt:  FGSPAASASLCHRTHYSALWLPLDLVLEDAMDGYQVEATSAIEKITSLVKTLKAINGTSWHDTFLGLWIASLRLVQR-------------------ERDP

Query:  IEGPVPRIDTRLCLLLCITVLVIADLIEEEESATIDETEYVASHHWKEKKTPGKCRNELISSLQILGEYQSLLTPPQDVISACNQAAAKAMMFVSGISVN
        IEGPVPR DT LC+LL +T L +A++IEEEES  ID+T    S+ WKEKK  GKCR  LI+SLQ LG+Y+SLLTPP+ V S  NQAAAKA+MF+SGI+ +
Subjt:  IEGPVPRIDTRLCLLLCITVLVIADLIEEEESATIDETEYVASHHWKEKKTPGKCRNELISSLQILGEYQSLLTPPQDVISACNQAAAKAMMFVSGISVN

Query:  NAYFECINMKDMPMNSSAGNMRHLIVEACIARNLLDTSAYFWRGYVNGCISQMPQSIPPQAPGWSAFMKGALLNHIMINVLTSTPASSLAELEKIFEIAV
        N  +E  +M +    S++G         C  R  L T   F    V G       S       WS  MKG+ L   + N L +TPASSLAE+EK++E+A 
Subjt:  NAYFECINMKDMPMNSSAGNMRHLIVEACIARNLLDTSAYFWRGYVNGCISQMPQSIPPQAPGWSAFMKGALLNHIMINVLTSTPASSLAELEKIFEIAV

Query:  KGSDEEKISAATILCGASLIRGWNIQEHTVHYITRLLSPPVPTDYSGCESHLIGYAPMLNVLIVGIASIDCVQIFSLHGLVPQLACSLMPICEVFGSCVP
         GS++EKI+ A+ILCGASL RGW+IQEH + +I  LLSPP P D SG  SHLI  AP LNVL+VGI+ IDCV IFSLHG+VP LA +LMPICE FGS VP
Subjt:  KGSDEEKISAATILCGASLIRGWNIQEHTVHYITRLLSPPVPTDYSGCESHLIGYAPMLNVLIVGIASIDCVQIFSLHGLVPQLACSLMPICEVFGSCVP

Query:  NLNWTLSTGEEISAHAVFSNAFTLLLKLWRFNHPPLDHGVGDAPTVGSQLTPEYLLLVRNSHL-ISGNVHKDRNKMRLSAVASSSSPQPIFVDSFPKLKA
        N+ WTL TGE IS+HAVFS AFTLLL+LWRF+HPPLD+ +GD P VG Q +PEYLLLVRN  L   G   KDR   R  +     S  PIF+DSFP+LK 
Subjt:  NLNWTLSTGEEISAHAVFSNAFTLLLKLWRFNHPPLDHGVGDAPTVGSQLTPEYLLLVRNSHL-ISGNVHKDRNKMRLSAVASSSSPQPIFVDSFPKLKA

Query:  WYRQHQACIASTLSGHVHGNPVHQTVDGLLNMMFRRIN-GGNQPLTSVTSGSSSSSGAGNEDPSLRPKLPAWDIMEAVPFVIDAALTACAHGKLSPRELA
        WYRQHQ C+AS LS    G+PVH  VD LL+MMF++ N GG+Q LT  +SGSSS S +G +D S + KLPAWDI+EA PFV+DAALTACAHG LSPRELA
Subjt:  WYRQHQACIASTLSGHVHGNPVHQTVDGLLNMMFRRIN-GGNQPLTSVTSGSSSSSGAGNEDPSLRPKLPAWDIMEAVPFVIDAALTACAHGKLSPRELA

Query:  TGLKDLADFLPASLATIVSYFSAEVTRGLWKPVFMNGTDWPSPAENLSNVEEQIKKILAATGVDVPSLAAGGSSPATLPLPLAAFVSLTITYKIDRASQR
        TGLK LADFLPA+L T+VSYFS+EVTRGLWKPV MNGTDWPSPA NL++VE+QI+KILAATGVDVP L A G S ATLPLPLAA VSLTITYK+D+A++R
Subjt:  TGLKDLADFLPASLATIVSYFSAEVTRGLWKPVFMNGTDWPSPAENLSNVEEQIKKILAATGVDVPSLAAGGSSPATLPLPLAAFVSLTITYKIDRASQR

Query:  FLNLAGPALESLAAGCPWPCMPIVASLWTQK
        FL L GPAL+SLAA CPWPCMPIV SLWTQK
Subjt:  FLNLAGPALESLAAGCPWPCMPIVASLWTQK

Q9LUG9 Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 33A

0.0e+00

64.29

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Query:  MAVSVQNNLWDRVTELTKVAQQKGVDPLLWAIQLSSNLNSAGVVLPSVELANLLVSHICWENNEPVSWKFLEKALMLNIVPPILVLALLTTRVISRRQFQ
        M V  +  +WD V ELTK+AQ+  VDP LWA QLSSNL    V LPS ELA ++VS+ICW+NN P+ WKFLE+A+ L +V P++VLALL  RV+  R  Q
Subjt:  MAVSVQNNLWDRVTELTKVAQQKGVDPLLWAIQLSSNLNSAGVVLPSVELANLLVSHICWENNEPVSWKFLEKALMLNIVPPILVLALLTTRVISRRQFQ

Query:  PVAYRLYLELLRRHAFKLKSHIHGLKYKEVMASVDAVLCLSETFNLPANDPGTLVVEFIFSIVWQLLDATLADEGLLELIMEEKSKWPAKPQEMELDGHN
          AYR+YLELL+R+ F +K HI G  Y++VM SV  +L LSE F+L  + PG L+VEF+F +V QLLDA L+DEGLLEL  +  S+W  K Q+ME+D   
Subjt:  PVAYRLYLELLRRHAFKLKSHIHGLKYKEVMASVDAVLCLSETFNLPANDPGTLVVEFIFSIVWQLLDATLADEGLLELIMEEKSKWPAKPQEMELDGHN

Query:  GYDDKWTEQRERLRNVNIELTIEIIGKFLEDSVTSRILQLACRNMPSHWADLIQRLQLLGENSSVLRNSKSLDSEIFLQFTSDTWTIFSQEFKQNSQQKF
         Y++K T   E+L+++N  + IE+I +FL ++V +R+L L   N  S W + +Q++QLLGENSS L++SK L+S   LQ  S+    +S + K  S +K 
Subjt:  GYDDKWTEQRERLRNVNIELTIEIIGKFLEDSVTSRILQLACRNMPSHWADLIQRLQLLGENSSVLRNSKSLDSEIFLQFTSDTWTIFSQEFKQNSQQKF

Query:  HPIRAFGSPAASASLCHRTHYSALWLPLDLVLEDAMDGYQVEATSAIEKITSLVKTLKAINGTSWHDTFLGLWIASLRLVQRERDPIEGPVPRIDTRLCL
        + I  FGS ++ A LCH    S+LWLPLDLV EDAMDGYQV  TSAIE IT L KTLK ING++WHDTFLGLWIA+LRLVQRERDPIEGP+PR+DTRLC+
Subjt:  HPIRAFGSPAASASLCHRTHYSALWLPLDLVLEDAMDGYQVEATSAIEKITSLVKTLKAINGTSWHDTFLGLWIASLRLVQRERDPIEGPVPRIDTRLCL

Query:  LLCITVLVIADLIEEEESATIDETEYVASHHWKEKKTPGKCRNELISSLQILGEYQSLLTPPQDVISACNQAAAKAMMFVSGISVNNAYFECINMKDMPM
         LCI  LV+A+LIEE +  ++ E                K R++L++SLQ+LG++  LL PP+ V+SA N+AA KA++F+SG +V  + F+ INMKDMP+
Subjt:  LLCITVLVIADLIEEEESATIDETEYVASHHWKEKKTPGKCRNELISSLQILGEYQSLLTPPQDVISACNQAAAKAMMFVSGISVNNAYFECINMKDMPM

Query:  NSSAGNMRHLIVEACIARNLLDTSAYFWRGYVNGCISQMPQSIPPQAPGWSAFMKGALLNHIMINVLTSTPASSLAELEKIFEIAVKGSDEEKISAATIL
        N S GNMRHLIVEACIARN+LD SAY W GYVNG I+Q+PQS+P + P WS+F+KGA LN  M+N L S PASSLAELEK+FE+AVKGSD+EKISAAT+L
Subjt:  NSSAGNMRHLIVEACIARNLLDTSAYFWRGYVNGCISQMPQSIPPQAPGWSAFMKGALLNHIMINVLTSTPASSLAELEKIFEIAVKGSDEEKISAATIL

Query:  CGASLIRGWNIQEHTVHYITRLLSPPVPTDYSGCESHLIGYAPMLNVLIVGIASIDCVQIFSLHGLVPQLACSLMPICEVFGSCVPNLNWTLSTGEEISA
        CGASL RGWNIQEHTV Y+TRLLSPPVP DYS  E+HLIGYA MLNV+IVGI S+D +QIFSLHG+VPQLACSLMPICE FGS  P+++WTL +GE ISA
Subjt:  CGASLIRGWNIQEHTVHYITRLLSPPVPTDYSGCESHLIGYAPMLNVLIVGIASIDCVQIFSLHGLVPQLACSLMPICEVFGSCVPNLNWTLSTGEEISA

Query:  HAVFSNAFTLLLKLWRFNHPPLDHGVGDAPTVGSQLTPEYLLLVRNSHLISGNV-HKDRNKMRLSAVASSSSPQPIFVDSFPKLKAWYRQHQACIASTLS
        ++VFSNAFTLLLKLWRFNHPP++HGVGD PTVGSQLTPE+LL VRNS+L+S  +  +DRN+ RLS VA ++S QP+FVDSFPKLK WYRQHQ CIA+TLS
Subjt:  HAVFSNAFTLLLKLWRFNHPPLDHGVGDAPTVGSQLTPEYLLLVRNSHLISGNV-HKDRNKMRLSAVASSSSPQPIFVDSFPKLKAWYRQHQACIASTLS

Query:  GHVHGNPVHQTVDGLLNMMFRRINGGNQPLTSVTSGSSSSSGAGNEDPSLRPKLPAWDIMEAVPFVIDAALTACAHGKLSPRELATGLKDLADFLPASLA
        G  HG+PVHQTV+ LLNM F ++  G+Q L  V SG+SSSSGA +ED ++RP+ PAWDI++AVP+V+DAALTAC HG+LSPR+LATGLKDLADFLPASLA
Subjt:  GHVHGNPVHQTVDGLLNMMFRRINGGNQPLTSVTSGSSSSSGAGNEDPSLRPKLPAWDIMEAVPFVIDAALTACAHGKLSPRELATGLKDLADFLPASLA

Query:  TIVSYFSAEVTRGLWKPVFMNGTDWPSPAENLSNVEEQIKKILAATGVDVPSLAAGGSSPATLPLPLAAFVSLTITYKIDRASQRFLNLAGPALESLAAG
        TIVSYFSAEV+RG+WKPVFMNG DWPSPA NLS VEE I KILA TGVD+PSLA GGSSPATLPLPLAAFVSLTITYKID+AS+RFLNLAGPALE LAAG
Subjt:  TIVSYFSAEVTRGLWKPVFMNGTDWPSPAENLSNVEEQIKKILAATGVDVPSLAAGGSSPATLPLPLAAFVSLTITYKIDRASQRFLNLAGPALESLAAG

Query:  CPWPCMPIVASLWTQKPNVGVISLSFQHLVQSSFRT
        CPWPCMPIVASLWTQK         F  LV S+ RT
Subjt:  CPWPCMPIVASLWTQKPNVGVISLSFQHLVQSSFRT

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G48110.1 reduced epidermal fluorescence 4

7.1e-307

55.97

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Query:  QNNLWDRVTELTKVAQQKGVDPLLWAIQLSSNLNSAGVVLPSVELANLLVSHICWENNEPVSWKFLEKALMLNIVPPILVLALLTTRVISRRQFQPVAYR
        Q +LW+ VT L + AQ+K VDPL WA+QL   L SAG+ LPS +LA  LV+HI WEN+ P+SWK LEKA+ +NIVPP+LVLALL+ RVI  R+  P AYR
Subjt:  QNNLWDRVTELTKVAQQKGVDPLLWAIQLSSNLNSAGVVLPSVELANLLVSHICWENNEPVSWKFLEKALMLNIVPPILVLALLTTRVISRRQFQPVAYR

Query:  LYLELLRRHAFKLKSHIHGLKYKEVMASVDAVLCLSETFNLPANDPGTLVVEFIFSIVWQLLDATLADEGLLELIMEEKSKWPAKPQEMELDGHNGYDDK
        LY+ELL+RHAF     I    Y + M S+D +L LSETF +   +PG++++ F+FSIVW+LLDA+L +EGLLEL   ++SKWP+ P +M+LDG      K
Subjt:  LYLELLRRHAFKLKSHIHGLKYKEVMASVDAVLCLSETFNLPANDPGTLVVEFIFSIVWQLLDATLADEGLLELIMEEKSKWPAKPQEMELDGHNGYDDK

Query:  WTEQRERLRNVNIELTIEIIGKFLEDSVTSRILQLACRNMPSHWADLIQRLQLLGENSSVLRNSKSLDSEIFLQFTSDTWTIFSQEFKQNSQQKFHPIRA
          E  + L   N E+ IE+I +FL++ VTSRIL LA +NM                                             E K   + +FH I +
Subjt:  WTEQRERLRNVNIELTIEIIGKFLEDSVTSRILQLACRNMPSHWADLIQRLQLLGENSSVLRNSKSLDSEIFLQFTSDTWTIFSQEFKQNSQQKFHPIRA

Query:  FGSPAASASLCHRTHYSALWLPLDLVLEDAMDGYQVEATSAIEKITSLVKTLKAINGTSWHDTFLGLWIASLRLVQR-------------------ERDP
         GS  A       T  SALWLP+DL  ED MDG Q  A SA+E +T LVK L+A N TSWHD FL LW+A+LRLVQR                   ERDP
Subjt:  FGSPAASASLCHRTHYSALWLPLDLVLEDAMDGYQVEATSAIEKITSLVKTLKAINGTSWHDTFLGLWIASLRLVQR-------------------ERDP

Query:  IEGPVPRIDTRLCLLLCITVLVIADLIEEEESATIDETEYVASHHWKEKKTPGKCRNELISSLQILGEYQSLLTPPQDVISACNQAAAKAMMFVSGISVN
        IEGPVPR DT LC+LL +T L +A++IEEEES  ID+T    S+ WKEKK  GKCR  LI+SLQ LG+Y+SLLTPP+ V S  NQAAAKA+MF+SGI+ +
Subjt:  IEGPVPRIDTRLCLLLCITVLVIADLIEEEESATIDETEYVASHHWKEKKTPGKCRNELISSLQILGEYQSLLTPPQDVISACNQAAAKAMMFVSGISVN

Query:  NAYFECINMKDMPMNSSAGNMRHLIVEACIARNLLDTSAYFWRGYVNGCISQMPQSIPPQAPGWSAFMKGALLNHIMINVLTSTPASSLAELEKIFEIAV
        N  +E  +M +    S++G         C  R  L T   F    V G       S       WS  MKG+ L   + N L +TPASSLAE+EK++E+A 
Subjt:  NAYFECINMKDMPMNSSAGNMRHLIVEACIARNLLDTSAYFWRGYVNGCISQMPQSIPPQAPGWSAFMKGALLNHIMINVLTSTPASSLAELEKIFEIAV

Query:  KGSDEEKISAATILCGASLIRGWNIQEHTVHYITRLLSPPVPTDYSGCESHLIGYAPMLNVLIVGIASIDCVQIFSLHGLVPQLACSLMPICEVFGSCVP
         GS++EKI+ A+ILCGASL RGW+IQEH + +I  LLSPP P D SG  SHLI  AP LNVL+VGI+ IDCV IFSLHG+VP LA +LMPICE FGS VP
Subjt:  KGSDEEKISAATILCGASLIRGWNIQEHTVHYITRLLSPPVPTDYSGCESHLIGYAPMLNVLIVGIASIDCVQIFSLHGLVPQLACSLMPICEVFGSCVP

Query:  NLNWTLSTGEEISAHAVFSNAFTLLLKLWRFNHPPLDHGVGDAPTVGSQLTPEYLLLVRNSHL-ISGNVHKDRNKMRLSAVASSSSPQPIFVDSFPKLKA
        N+ WTL TGE IS+HAVFS AFTLLL+LWRF+HPPLD+ +GD P VG Q +PEYLLLVRN  L   G   KDR   R  +     S  PIF+DSFP+LK 
Subjt:  NLNWTLSTGEEISAHAVFSNAFTLLLKLWRFNHPPLDHGVGDAPTVGSQLTPEYLLLVRNSHL-ISGNVHKDRNKMRLSAVASSSSPQPIFVDSFPKLKA

Query:  WYRQHQACIASTLSGHVHGNPVHQTVDGLLNMMFRRIN-GGNQPLTSVTSGSSSSSGAGNEDPSLRPKLPAWDIMEAVPFVIDAALTACAHGKLSPRELA
        WYRQHQ C+AS LS    G+PVH  VD LL+MMF++ N GG+Q LT  +SGSSS S +G +D S + KLPAWDI+EA PFV+DAALTACAHG LSPRELA
Subjt:  WYRQHQACIASTLSGHVHGNPVHQTVDGLLNMMFRRIN-GGNQPLTSVTSGSSSSSGAGNEDPSLRPKLPAWDIMEAVPFVIDAALTACAHGKLSPRELA

Query:  TGLKDLADFLPASLATIVSYFSAEVTRGLWKPVFMNGTDWPSPAENLSNVEEQIKKILAATGVDVPSLAAGGSSPATLPLPLAAFVSLTITYKIDRASQR
        TGLK LADFLPA+L T+VSYFS+EVTRGLWKPV MNGTDWPSPA NL++VE+QI+KILAATGVDVP L A G S ATLPLPLAA VSLTITYK+D+A++R
Subjt:  TGLKDLADFLPASLATIVSYFSAEVTRGLWKPVFMNGTDWPSPAENLSNVEEQIKKILAATGVDVPSLAAGGSSPATLPLPLAAFVSLTITYKIDRASQR

Query:  FLNLAGPALESLAAGCPWPCMPIVASLWTQK
        FL L GPAL+SLAA CPWPCMPIV SLWTQK
Subjt:  FLNLAGPALESLAAGCPWPCMPIVASLWTQK

AT3G23590.1 REF4-related 1

0.0e+00

64.29

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Query:  MAVSVQNNLWDRVTELTKVAQQKGVDPLLWAIQLSSNLNSAGVVLPSVELANLLVSHICWENNEPVSWKFLEKALMLNIVPPILVLALLTTRVISRRQFQ
        M V  +  +WD V ELTK+AQ+  VDP LWA QLSSNL    V LPS ELA ++VS+ICW+NN P+ WKFLE+A+ L +V P++VLALL  RV+  R  Q
Subjt:  MAVSVQNNLWDRVTELTKVAQQKGVDPLLWAIQLSSNLNSAGVVLPSVELANLLVSHICWENNEPVSWKFLEKALMLNIVPPILVLALLTTRVISRRQFQ

Query:  PVAYRLYLELLRRHAFKLKSHIHGLKYKEVMASVDAVLCLSETFNLPANDPGTLVVEFIFSIVWQLLDATLADEGLLELIMEEKSKWPAKPQEMELDGHN
          AYR+YLELL+R+ F +K HI G  Y++VM SV  +L LSE F+L  + PG L+VEF+F +V QLLDA L+DEGLLEL  +  S+W  K Q+ME+D   
Subjt:  PVAYRLYLELLRRHAFKLKSHIHGLKYKEVMASVDAVLCLSETFNLPANDPGTLVVEFIFSIVWQLLDATLADEGLLELIMEEKSKWPAKPQEMELDGHN

Query:  GYDDKWTEQRERLRNVNIELTIEIIGKFLEDSVTSRILQLACRNMPSHWADLIQRLQLLGENSSVLRNSKSLDSEIFLQFTSDTWTIFSQEFKQNSQQKF
         Y++K T   E+L+++N  + IE+I +FL ++V +R+L L   N  S W + +Q++QLLGENSS L++SK L+S   LQ  S+    +S + K  S +K 
Subjt:  GYDDKWTEQRERLRNVNIELTIEIIGKFLEDSVTSRILQLACRNMPSHWADLIQRLQLLGENSSVLRNSKSLDSEIFLQFTSDTWTIFSQEFKQNSQQKF

Query:  HPIRAFGSPAASASLCHRTHYSALWLPLDLVLEDAMDGYQVEATSAIEKITSLVKTLKAINGTSWHDTFLGLWIASLRLVQRERDPIEGPVPRIDTRLCL
        + I  FGS ++ A LCH    S+LWLPLDLV EDAMDGYQV  TSAIE IT L KTLK ING++WHDTFLGLWIA+LRLVQRERDPIEGP+PR+DTRLC+
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        N S GNMRHLIVEACIARN+LD SAY W GYVNG I+Q+PQS+P + P WS+F+KGA LN  M+N L S PASSLAELEK+FE+AVKGSD+EKISAAT+L
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GATGTTTGTATCTGGAATCAGTGTTAATAATGCATATTTTGAATGCATTAATATGAAAGACATGCCGATGAACTCTTCAGCTGGAAATATGCGTCATTTGATTGTTGAAG
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CCCAACTTACTCCAGAATATTTACTCTTAGTGAGAAATTCCCATCTGATATCTGGAAATGTCCACAAAGATCGCAATAAAATGAGACTTTCAGCAGTAGCAAGTTCCTCT
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mRNA sequence

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TTTGAATGCATTAATATGAAAGACATGCCGATGAACTCTTCAGCTGGAAATATGCGTCATTTGATTGTTGAAGCTTGCATTGCTAGAAATCTCCTGGATACATCTGCATA
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CTTTGTGGGGCCTCCTTGATCCGAGGCTGGAATATTCAGGAACATACTGTCCATTATATTACTAGGTTACTTTCTCCTCCAGTTCCCACGGATTACTCTGGATGTGAAAG
TCATTTGATAGGCTATGCTCCAATGCTGAATGTGCTTATTGTTGGAATAGCATCTATTGATTGTGTTCAGATTTTTTCTCTACATGGTTTGGTTCCACAGCTTGCATGTT
CACTGATGCCAATCTGTGAGGTTTTTGGCTCATGTGTGCCAAATCTCAATTGGACGTTATCAACAGGGGAAGAAATCTCTGCTCATGCTGTGTTTTCAAATGCGTTTACT
CTTCTCTTAAAGCTTTGGAGATTTAACCATCCTCCTCTAGACCATGGTGTGGGTGATGCACCTACGGTTGGATCCCAACTTACTCCAGAATATTTACTCTTAGTGAGAAA
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GGATATAATGGAAGCTGTTCCTTTTGTGATTGATGCTGCTCTAACAGCCTGTGCTCATGGAAAGCTTTCTCCTCGTGAGTTGGCTACAGGACTCAAAGATCTAGCCGATT
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Protein sequence

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PALESLAAGCPWPCMPIVASLWTQKPNVGVISLSFQHLVQSSFRTAMP

IVF0011897 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome