; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0012062 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0012062
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionzinc finger protein 511
Genome locationchr03:1684571..1686723
RNA-Seq ExpressionIVF0012062
SyntenyIVF0012062
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR039258 - Zinc finger protein 511


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056568.1 zinc finger protein 511 [Cucumis melo var. makuwa]6.47e-11782.33Show/hide
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XP_004138793.1 zinc finger protein 511 [Cucumis sativus]1.74e-11991.89Show/hide
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XP_008441334.1 PREDICTED: zinc finger protein 511 [Cucumis melo]9.04e-12290.31Show/hide
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XP_038885473.1 zinc finger protein 511 [Benincasa hispida]7.85e-11690.27Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMY3 Uncharacterized protein4.7e-9391.4Show/hide
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A0A1S3B3Y4 zinc finger protein 5116.6e-9590.31Show/hide
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A0A5D3DLV5 Zinc finger protein 5112.0e-9182.33Show/hide
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A0A6J1E4J7 zinc finger protein 5111.7e-8791.38Show/hide
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A0A6J1JHI5 zinc finger protein 5113.9e-8784.1Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6P0X2 Zinc finger protein 5111.2e-2134.93Show/hide
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        Q  +A+  DMY+CLVE C  KFK+ + R  H+V  H + A F F K
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Q7ZZ00 Zinc finger protein 5113.1e-2536.2Show/hide
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Q8NB15 Zinc finger protein 5114.2e-2236.77Show/hide
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        RF  +  FF  G+V+R +  + V + + +  EK ++   A        C + GC     +LDD+E HY++ H   CS C R +P+  LL  H+ E HDS 
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        FQ  ++   DMY+CLVEGC  KFK+ + R  H+V  H + A F F K   P K++
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Q9V574 Protein lethal(2)k102012.0e-1133.05Show/hide
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          V++  +E K  P  K+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G14140.1 zinc ion binding;nucleic acid binding;zinc ion binding1.2e-6970.45Show/hide
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        M V++  E  FP W P +RRF PDSPFFASGNVERE+LAKQV LD TEDE   LH      +  I CPIVGC   LKSLD FEDHYN+RH ASCSVC RV
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Sequences Show/hide sequences
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TGAAATCTCTGGATGACTTTGAAGATCATTACAATTCAAGGCATGCTGCCTCTTGTTCAGTTTGCCCTAGAGTTTACCCGACATCACGCCTACTTAGTTTACATGTCTCT
GAGGCGCACGACTCGTTCTTTCAAGCAAAAGTCGCACGTGGCTATGACATGTATGAATGCCTGGTGGAAGGTTGTGGTTTGAAGTTCAAAAGCTATAAAAGCAGACACCA
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GGAAGAAACCTCCAGAATGGAAGTCGAGAATGAAATTATGGATGGCCTCATTTCAGGAGTATCTAAACTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CTCTGGAAATGTCGAGCGCGAAATCTTAGCCAAACAGGTTGCCTTGGATTTAACCGAAGATGAAAAGCTACAGCTGCATAATATGGCAGTTGATGCTAGCAGTGAAATCT
TTTGCCCAATTGTTGGTTGCGGTGCACACTTGAAATCTCTGGATGACTTTGAAGATCATTACAATTCAAGGCATGCTGCCTCTTGTTCAGTTTGCCCTAGAGTTTACCCG
ACATCACGCCTACTTAGTTTACATGTCTCTGAGGCGCACGACTCGTTCTTTCAAGCAAAAGTCGCACGTGGCTATGACATGTATGAATGCCTGGTGGAAGGTTGTGGTTT
GAAGTTCAAAAGCTATAAAAGCAGACACCAGCATCTAGTGGACAAGCATAAATTTTCTGCTTCATTTGAATTCTTTAAGAAAGCCCATCCATCTAAGAACAAAGACAGAA
AATGTATCGTAAACAAGCCATTCAAGGAAGGGAAGAAACCTCCAGAATGGAAGTCGAGAATGAAATTATGGATGGCCTCATTTCAGGAGTATCTAAACTAAGTACTTCGG
ACTCAACTCCTTCGTCAATCAGCTTTGGCCGGAGGCACACTCGAGGGTTAACATTTGTTCCTCGAGCAGTTCAGCGAGAGAAAGTGTCAGACTCCTCAACAGCTGGAACA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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