; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0012246 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0012246
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionCACTA en-spm transposon protein
Genome locationchr05:17134236..17134475
RNA-Seq ExpressionIVF0012246
SyntenyIVF0012246
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0045869.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold243G004050 [Cucumis melo var. makuwa]5.35e-1355.84Show/hide
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KAA0062461.1 hypothetical protein E6C27_scaffold130G00490 [Cucumis melo var. makuwa]3.86e-1562.69Show/hide
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        MS+ N  IPD + GIFR FR AS D LY RF+ ILHRTE ER++R  +EKR  IA CSSSP +SSSL
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KAA0066534.1 hypothetical protein E6C27_scaffold25G00940 [Cucumis melo var. makuwa]5.23e-1354.79Show/hide
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KAA0066543.1 CACTA en-spm transposon protein [Cucumis melo var. makuwa]2.55e-1054.93Show/hide
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        MS++N GIP+A  GIF+R   ASG+PLY RFS + HRTE ER K  E   + SV +  S  P I SSLPSL
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TYK00236.1 CACTA en-spm transposon protein [Cucumis melo var. makuwa]3.23e-0953.52Show/hide
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        MS++N GIP+A  GIF+R   ASG+PLY RFS + HRTE ER K  E   + SV +     P I SSLPSL
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7V9W7 Uncharacterized protein1.1e-1062.69Show/hide
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A0A5A7VET5 CACTA en-spm transposon protein4.0e-0854.93Show/hide
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A0A5A7VGT9 Uncharacterized protein8.1e-0954.79Show/hide
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A0A5D3BPQ2 CACTA en-spm transposon protein3.4e-0753.52Show/hide
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A0A5D3CU45 Uncharacterized protein2.1e-0955.84Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTTTAATGAGCGTCAAGAATAAGGGTATTCCCGACGCCTTAAGTGGGATCTTCCGACGTTTTCGTGATGCGTCGGGAGATCCCCTATATAATCGTTTCAGTTCTAT
TTTACACAGAACTGAAATCGAAAGGAAAAAGAGAGAAATTAAAGAGAAACGATCCGTCATCGCCCGTTGTTCATCGTCACCGTTCATTTCGTCGTCGTTGCCGTCCCTTG
TCGTCTGCCATCTTAGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGLMSVKNKGIPDALSGIFRRFRDASGDPLYNRFSSILHRTEIERKKREIKEKRSVIARCSSSPFISSSLPSLVVCHLR