; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0012329 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0012329
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionReticulon-like protein
Genome locationchr05:24958624..24964119
RNA-Seq ExpressionIVF0012329
SyntenyIVF0012329
Gene Ontology termsGO:0005789 - endoplasmic reticulum membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR003388 - Reticulon
IPR044647 - Reticulon-like protein B17/18/21


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A1S4E0Y2 Reticulon-like protein1.7e-22099.5Show/hide
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Subjt:  RLVPFVNELLQNLKALFRGDSSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHGEHWLKLCGSSWKLCSHKRGVFVAIFFLVWNFSSTLY

Query:  RVWAAFIVLVSFRYYQESPERDVWVKNGEVASRNNTVS-TSSKLKRQY
        RVWA F V VSF+YYQE       VKNGEVA +N++VS +SSKLKRQY
Subjt:  RVWAAFIVLVSFRYYQESPERDVWVKNGEVASRNNTVS-TSSKLKRQY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q16799 Reticulon-15.0e-0425.62Show/hide
Query:  NKQKLQTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISFISLISHMGLLYLTAIF---VHSSIFGRRKRIDSD-------DENFVVEEEDMIRFA
        NKQK    +DL+ WRD  ++G+VFG   L+++ S        S +S+++++ L  L+A     ++ S+    ++ D         +    + +E + ++ 
Subjt:  NKQKLQTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISFISLISHMGLLYLTAIF---VHSSIFGRRKRIDSD-------DENFVVEEEDMIRFA

Query:  KRLVPFVNELLQNLKALFR-GDSSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLP
          L  +VN  L+ L+ LF   D   ++K  VL+++L   G+      +L +  + +FTLP
Subjt:  KRLVPFVNELLQNLKALFR-GDSSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLP

Q56X72 Reticulon-like protein B215.5e-5140.21Show/hide
Query:  KELNECKEKVISSSTSQDFFDAFEEEIEKESFDVKEINLPERKKIIA-------------------QTFPGNKQKLQTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNL
        KE+N  KE  +     +  F  F+         V++I+ P  K+  +                     F  ++ KLQ+L+DL+MWRD SRS LVFG G  
Subjt:  KELNECKEKVISSSTSQDFFDAFEEEIEKESFDVKEINLPERKKIIA-------------------QTFPGNKQKLQTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNL

Query:  VIILSCFIKNINISFISLISHMGLLYLTAIFVHSSIFGRRKRIDSDDENFVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLKALFRGDSSATMKVGVLLFVLAKWG
        +II S +  ++N SFIS++++MGL+YL  +FV  S+  R    +   +   V EED+ R  + ++P++NE L  L+ALF GD S T+K+GV+LFVLA+ G
Subjt:  VIILSCFIKNINISFISLISHMGLLYLTAIFVHSSIFGRRKRIDSDDENFVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLKALFRGDSSATMKVGVLLFVLAKWG

Query:  SFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLI--------THGEHWLKLCGSSWKLCSHKRGVFVAIFFLVWNFSSTLYRVWAAFIVLVSFRYYQ
        S ITLWN+ K GF+G FT+PK+          +G  W++    +W+ C+HK+ V +A+F LVWN SS   RVWAAF++LV+FRYYQ
Subjt:  SFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLI--------THGEHWLKLCGSSWKLCSHKRGVFVAIFFLVWNFSSTLYRVWAAFIVLVSFRYYQ

Q5IS59 Reticulon-15.0e-0425.62Show/hide
Query:  NKQKLQTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISFISLISHMGLLYLTAIF---VHSSIFGRRKRIDSD-------DENFVVEEEDMIRFA
        NKQK    +DL+ WRD  ++G+VFG   L+++ S        S +S+++++ L  L+A     ++ S+    ++ D         +    + +E + ++ 
Subjt:  NKQKLQTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISFISLISHMGLLYLTAIF---VHSSIFGRRKRIDSD-------DENFVVEEEDMIRFA

Query:  KRLVPFVNELLQNLKALFR-GDSSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLP
          L  +VN  L+ L+ LF   D   ++K  VL+++L   G+      +L +  + +FTLP
Subjt:  KRLVPFVNELLQNLKALFR-GDSSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLP

Q6DR04 Reticulon-like protein B171.6e-2934.91Show/hide
Query:  QTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISFISLISHMGLLYLTAIFVHSSIFGRRKRIDSDDENFVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLK
        + + DL+MWRD ++S L FG G L  + SCF K +N S  S +S++GL+ L   F+ +++  R+   +     F V E+D++R A+R++P  N  +    
Subjt:  QTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISFISLISHMGLLYLTAIFVHSSIFGRRKRIDSDDENFVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLK

Query:  ALFRGDSSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHGEHWLK--------LCGSSWKLCSHKRGVFVAIFFLVWNFSSTLYRVWAAF
         LF G+ S T+KV   L + A++G  ITLW +   GF   FT+PKL +   H +           G +W +CSHK+ +  +     WN +S   R++A F
Subjt:  ALFRGDSSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHGEHWLK--------LCGSSWKLCSHKRGVFVAIFFLVWNFSSTLYRVWAAF

Query:  IVLVSFRYYQES
        I+LV FRY +++
Subjt:  IVLVSFRYYQES

Q8LDS3 Reticulon-like protein B183.1e-2226.5Show/hide
Query:  SSPSSGDEQSRKSPTPSRRLRSNGSPNKPVQVSGEKTERNSTRKKTDQSRKSVVA---LTKPPTNGIGKTSSEKSFKELNECKEKVISSSTSQDFFDAFE
        SSP +  E    SP+P R+ R+                R S R   + +  +V A    TK   NG+  + S ++F+      E ++ +  + +      
Subjt:  SSPSSGDEQSRKSPTPSRRLRSNGSPNKPVQVSGEKTERNSTRKKTDQSRKSVVA---LTKPPTNGIGKTSSEKSFKELNECKEKVISSSTSQDFFDAFE

Query:  EEIEKESFDVKEINLPERKK-----IIAQTFPGNKQK-----------LQTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCF-IKNINISFISLISHMGLLY
        +E ++     K++   +++K     ++A   P + Q             + + DLIMWRD ++S L FG G +  + +CF  K  N S  S IS++GLL+
Subjt:  EEIEKESFDVKEINLPERKK-----IIAQTFPGNKQK-----------LQTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCF-IKNINISFISLISHMGLLY

Query:  LTAIFVHSSIFGRRKRIDSDDENFVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLKALFRGDSSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHG
        L   F+ +++  R++  +       + E+D++R A+R++P  N  +     LF G+ + T+KV   + + A++G  ITLW +   GF   FT+PKL +  
Subjt:  LTAIFVHSSIFGRRKRIDSDDENFVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLKALFRGDSSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHG

Query:  EHWLKL---CG-----SSWKLCSHKRGVFVAIFFLVWNFSSTLYRVWAAFIVLVSFRYYQESPERD
           L     C       +W +C+HK+ V  +     WN +S   R  A FI++V  RY +++ + D
Subjt:  EHWLKL---CG-----SSWKLCSHKRGVFVAIFFLVWNFSSTLYRVWAAFIVLVSFRYYQESPERD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20590.1 Reticulon family protein1.1e-3034.91Show/hide
Query:  QTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISFISLISHMGLLYLTAIFVHSSIFGRRKRIDSDDENFVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLK
        + + DL+MWRD ++S L FG G L  + SCF K +N S  S +S++GL+ L   F+ +++  R+   +     F V E+D++R A+R++P  N  +    
Subjt:  QTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISFISLISHMGLLYLTAIFVHSSIFGRRKRIDSDDENFVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLK

Query:  ALFRGDSSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHGEHWLK--------LCGSSWKLCSHKRGVFVAIFFLVWNFSSTLYRVWAAF
         LF G+ S T+KV   L + A++G  ITLW +   GF   FT+PKL +   H +           G +W +CSHK+ +  +     WN +S   R++A F
Subjt:  ALFRGDSSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHGEHWLK--------LCGSSWKLCSHKRGVFVAIFFLVWNFSSTLYRVWAAF

Query:  IVLVSFRYYQES
        I+LV FRY +++
Subjt:  IVLVSFRYYQES

AT2G20590.2 Reticulon family protein3.2e-2236.08Show/hide
Query:  QTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISFISLISHMGLLYLTAIFVHSSIFGRRKRIDSDDENFVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLK
        + + DL+MWRD ++S L FG G L  + SCF K +N S  S +S++GL+ L   F+ +++  R+   +     F V E+D++R A+R++P  N  +    
Subjt:  QTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISFISLISHMGLLYLTAIFVHSSIFGRRKRIDSDDENFVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLK

Query:  ALFRGDSSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHGEHWLKLCG
         LF G+ S T+KV   L + A++G  ITLW +   GF   FT+PKL +   H +   G
Subjt:  ALFRGDSSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHGEHWLKLCG

AT4G28430.1 Reticulon family protein2.2e-2326.5Show/hide
Query:  SSPSSGDEQSRKSPTPSRRLRSNGSPNKPVQVSGEKTERNSTRKKTDQSRKSVVA---LTKPPTNGIGKTSSEKSFKELNECKEKVISSSTSQDFFDAFE
        SSP +  E    SP+P R+ R+                R S R   + +  +V A    TK   NG+  + S ++F+      E ++ +  + +      
Subjt:  SSPSSGDEQSRKSPTPSRRLRSNGSPNKPVQVSGEKTERNSTRKKTDQSRKSVVA---LTKPPTNGIGKTSSEKSFKELNECKEKVISSSTSQDFFDAFE

Query:  EEIEKESFDVKEINLPERKK-----IIAQTFPGNKQK-----------LQTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCF-IKNINISFISLISHMGLLY
        +E ++     K++   +++K     ++A   P + Q             + + DLIMWRD ++S L FG G +  + +CF  K  N S  S IS++GLL+
Subjt:  EEIEKESFDVKEINLPERKK-----IIAQTFPGNKQK-----------LQTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCF-IKNINISFISLISHMGLLY

Query:  LTAIFVHSSIFGRRKRIDSDDENFVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLKALFRGDSSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHG
        L   F+ +++  R++  +       + E+D++R A+R++P  N  +     LF G+ + T+KV   + + A++G  ITLW +   GF   FT+PKL +  
Subjt:  LTAIFVHSSIFGRRKRIDSDDENFVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLKALFRGDSSATMKVGVLLFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHG

Query:  EHWLKL---CG-----SSWKLCSHKRGVFVAIFFLVWNFSSTLYRVWAAFIVLVSFRYYQESPERD
           L     C       +W +C+HK+ V  +     WN +S   R  A FI++V  RY +++ + D
Subjt:  EHWLKL---CG-----SSWKLCSHKRGVFVAIFFLVWNFSSTLYRVWAAFIVLVSFRYYQESPERD

AT5G58000.1 Reticulon family protein3.9e-5240.21Show/hide
Query:  KELNECKEKVISSSTSQDFFDAFEEEIEKESFDVKEINLPERKKIIA-------------------QTFPGNKQKLQTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNL
        KE+N  KE  +     +  F  F+         V++I+ P  K+  +                     F  ++ KLQ+L+DL+MWRD SRS LVFG G  
Subjt:  KELNECKEKVISSSTSQDFFDAFEEEIEKESFDVKEINLPERKKIIA-------------------QTFPGNKQKLQTLMDLIMWRDFSRSGLVFGVGNL

Query:  VIILSCFIKNINISFISLISHMGLLYLTAIFVHSSIFGRRKRIDSDDENFVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLKALFRGDSSATMKVGVLLFVLAKWG
        +II S +  ++N SFIS++++MGL+YL  +FV  S+  R    +   +   V EED+ R  + ++P++NE L  L+ALF GD S T+K+GV+LFVLA+ G
Subjt:  VIILSCFIKNINISFISLISHMGLLYLTAIFVHSSIFGRRKRIDSDDENFVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLKALFRGDSSATMKVGVLLFVLAKWG

Query:  SFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLI--------THGEHWLKLCGSSWKLCSHKRGVFVAIFFLVWNFSSTLYRVWAAFIVLVSFRYYQ
        S ITLWN+ K GF+G FT+PK+          +G  W++    +W+ C+HK+ V +A+F LVWN SS   RVWAAF++LV+FRYYQ
Subjt:  SFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLI--------THGEHWLKLCGSSWKLCSHKRGVFVAIFFLVWNFSSTLYRVWAAFIVLVSFRYYQ


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATTTAAGCCGGCGGAGAGCGGCGGTGGCAGCCAGAGGGAACGTGGTAGCTGGGTCTGTGTGGGAGAGTAGAATCAGATTCGATGAAGTCAGAGGTGGTATTAAGGT
TTTTAATGGAGACGATGAAAATGCTGAATGTGGGGTTCCGACAACCGCCGCTTCCGCTGCCGCTGGCGGCAGCGGAAGGAGGAAGACGTGGAAATCCGATGAGGGTTTTA
ACCCGATTCTTATTGCGGAGGAAAAACCAGAGTCATCGCCGAGTAGCGGCGATGAACAGAGTCGGAAAAGTCCGACTCCTTCACGGAGATTGAGATCCAACGGCAGTCCA
AATAAGCCAGTTCAAGTTTCCGGCGAGAAAACAGAGAGAAACTCAACGAGGAAGAAGACTGATCAATCTCGTAAATCGGTTGTTGCGCTTACCAAACCACCGACGAATGG
AATCGGAAAAACCTCGTCGGAGAAAAGTTTCAAAGAGTTAAACGAATGCAAAGAGAAAGTGATTTCGTCTTCCACATCTCAAGATTTCTTCGATGCATTTGAAGAAGAGA
TTGAGAAAGAAAGCTTCGATGTTAAGGAAATTAATTTACCAGAACGGAAGAAAATCATCGCACAAACTTTCCCGGGAAACAAACAGAAATTGCAGACATTAATGGATTTG
ATAATGTGGAGAGATTTTTCAAGATCCGGTTTGGTTTTTGGAGTGGGAAATTTGGTTATAATCCTCTCTTGTTTTATCAAAAACATCAATATCAGCTTTATCAGTTTGAT
TTCGCATATGGGTCTTCTTTATCTGACTGCCATTTTCGTCCATAGTTCCATTTTTGGGAGGAGAAAAAGGATCGATTCTGATGATGAAAATTTTGTGGTTGAAGAAGAAG
ATATGATTCGATTTGCTAAACGGTTAGTTCCTTTTGTGAATGAATTGCTCCAAAATCTCAAGGCTCTATTCCGTGGAGATTCCTCTGCCACCATGAAGGTGGGTGTGTTG
CTGTTTGTTTTGGCAAAGTGGGGTAGCTTCATAACCCTTTGGAATGTCCTCAAAATTGGATTCATCGGGGTTTTCACACTGCCCAAATTAATTACCCACGGTGAACACTG
GTTGAAACTTTGTGGGAGTTCTTGGAAGTTATGTTCCCACAAGAGAGGTGTGTTCGTTGCCATCTTTTTTCTCGTATGGAATTTCTCATCGACTCTATATCGCGTATGGG
CAGCTTTCATAGTGTTGGTTAGCTTTCGGTACTACCAGGAGTCTCCAGAGAGAGATGTTTGGGTTAAAAATGGAGAAGTAGCTTCAAGAAACAACACCGTTTCGACGAGT
TCAAAGCTCAAGAGACAATATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAATCATTTCCATTTCCATTTCCATTTCCATTTCCATTTCTCACCCATCTTCACTTTTCTTTCAGATTCCCAAGAACAAAATATAAAAATTAATTTTAAAAAAAAAGAAG
AAGAGGAAATTCAAGAATCAATCCCATCTCTTCTTCCTCAACTTGCCACTTACCATTTGGCATCATAAAGACAAAATTCTCTGTTTCTCTTCTCACCGCCACAGGGATTC
TCCTTCCCTCCGCCATTGTTTCTCTGCTCCAAACCTTCCACTCCCTTCACAACACCCACATTCAACTGGGATTTTCTTCTTCTTCTTTCCCATCTCCCCATTTTTTTAAA
TTCTTCAAATTTATTCGCTGTTGGGTTCTTACTTTCTTTTCTAGACGTCGGCCATGGATTTAAGCCGGCGGAGAGCGGCGGTGGCAGCCAGAGGGAACGTGGTAGCTGGG
TCTGTGTGGGAGAGTAGAATCAGATTCGATGAAGTCAGAGGTGGTATTAAGGTTTTTAATGGAGACGATGAAAATGCTGAATGTGGGGTTCCGACAACCGCCGCTTCCGC
TGCCGCTGGCGGCAGCGGAAGGAGGAAGACGTGGAAATCCGATGAGGGTTTTAACCCGATTCTTATTGCGGAGGAAAAACCAGAGTCATCGCCGAGTAGCGGCGATGAAC
AGAGTCGGAAAAGTCCGACTCCTTCACGGAGATTGAGATCCAACGGCAGTCCAAATAAGCCAGTTCAAGTTTCCGGCGAGAAAACAGAGAGAAACTCAACGAGGAAGAAG
ACTGATCAATCTCGTAAATCGGTTGTTGCGCTTACCAAACCACCGACGAATGGAATCGGAAAAACCTCGTCGGAGAAAAGTTTCAAAGAGTTAAACGAATGCAAAGAGAA
AGTGATTTCGTCTTCCACATCTCAAGATTTCTTCGATGCATTTGAAGAAGAGATTGAGAAAGAAAGCTTCGATGTTAAGGAAATTAATTTACCAGAACGGAAGAAAATCA
TCGCACAAACTTTCCCGGGAAACAAACAGAAATTGCAGACATTAATGGATTTGATAATGTGGAGAGATTTTTCAAGATCCGGTTTGGTTTTTGGAGTGGGAAATTTGGTT
ATAATCCTCTCTTGTTTTATCAAAAACATCAATATCAGCTTTATCAGTTTGATTTCGCATATGGGTCTTCTTTATCTGACTGCCATTTTCGTCCATAGTTCCATTTTTGG
GAGGAGAAAAAGGATCGATTCTGATGATGAAAATTTTGTGGTTGAAGAAGAAGATATGATTCGATTTGCTAAACGGTTAGTTCCTTTTGTGAATGAATTGCTCCAAAATC
TCAAGGCTCTATTCCGTGGAGATTCCTCTGCCACCATGAAGGTGGGTGTGTTGCTGTTTGTTTTGGCAAAGTGGGGTAGCTTCATAACCCTTTGGAATGTCCTCAAAATT
GGATTCATCGGGGTTTTCACACTGCCCAAATTAATTACCCACGGTGAACACTGGTTGAAACTTTGTGGGAGTTCTTGGAAGTTATGTTCCCACAAGAGAGGTGTGTTCGT
TGCCATCTTTTTTCTCGTATGGAATTTCTCATCGACTCTATATCGCGTATGGGCAGCTTTCATAGTGTTGGTTAGCTTTCGGTACTACCAGGAGTCTCCAGAGAGAGATG
TTTGGGTTAAAAATGGAGAAGTAGCTTCAAGAAACAACACCGTTTCGACGAGTTCAAAGCTCAAGAGACAATATTGAGCAATTTTGAGCCTTTTTTCTCTGTTTTTTTTT
TCTTTTTCTAAAGATAGTTAAAATTTACCATGTAAATTCATGCACACTATGGTAGAAATGCATCAGCTTGTATCTCAGGAGAAAAAAAATGGAAAATGTCTTCTTTTTTA
TTTATTTTTATTTTTATTTTCAAATTCAATAATTTCATTTTATTTTATCTCAAAGTGAGTGAAAAAGGGAAGGATC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDLSRRRAAVAARGNVVAGSVWESRIRFDEVRGGIKVFNGDDENAECGVPTTAASAAAGGSGRRKTWKSDEGFNPILIAEEKPESSPSSGDEQSRKSPTPSRRLRSNGSP
NKPVQVSGEKTERNSTRKKTDQSRKSVVALTKPPTNGIGKTSSEKSFKELNECKEKVISSSTSQDFFDAFEEEIEKESFDVKEINLPERKKIIAQTFPGNKQKLQTLMDL
IMWRDFSRSGLVFGVGNLVIILSCFIKNINISFISLISHMGLLYLTAIFVHSSIFGRRKRIDSDDENFVVEEEDMIRFAKRLVPFVNELLQNLKALFRGDSSATMKVGVL
LFVLAKWGSFITLWNVLKIGFIGVFTLPKLITHGEHWLKLCGSSWKLCSHKRGVFVAIFFLVWNFSSTLYRVWAAFIVLVSFRYYQESPERDVWVKNGEVASRNNTVSTS
SKLKRQY