; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0012557 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0012557
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like
Genome locationchr12:7624682..7629762
RNA-Seq ExpressionIVF0012557
SyntenyIVF0012557
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001857 - Ribosomal protein L19
IPR008991 - Translation protein SH3-like domain superfamily
IPR038657 - Ribosomal protein L19 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_031743853.1 50S ribosomal protein L19-2, chloroplastic isoform X2 [Cucumis sativus]1.53e-15390.4Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV41 Uncharacterized protein1.1e-11890.4Show/hide
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A0A1S3CHC3 50S ribosomal protein L19-2, chloroplastic-like isoform X14.7e-13096.41Show/hide
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A0A1S3CHF9 50S ribosomal protein L19-2, chloroplastic-like isoform X21.9e-13196.8Show/hide
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A0A1S3CHY3 50S ribosomal protein L19, chloroplastic-like isoform X33.0e-10884Show/hide
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A0A6J1GUP7 54S ribosomal protein subunit img1, mitochondrial-like isoform X22.5e-9978.4Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P82413 50S ribosomal protein L19, chloroplastic9.7e-2453.27Show/hide
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Q2G8H1 50S ribosomal protein L191.8e-1444.57Show/hide
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Q2VZV5 50S ribosomal protein L191.1e-1442.39Show/hide
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Q8RXX5 50S ribosomal protein L19-2, chloroplastic2.4e-2237.8Show/hide
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Q8W463 50S ribosomal protein L19-1, chloroplastic6.3e-2352.17Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G24240.1 Ribosomal protein L19 family protein2.0e-4856.52Show/hide
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        AVEEV+  REIP+IKPGYIVQLKVEVPENKRR+S +KG+VIARRNAGLNSTFRIRR+VAGVG+ES+FPLYSPN++ ++   ++K
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AT4G11630.1 Ribosomal protein L19 family protein3.8e-4769.17Show/hide
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AT4G17560.1 Ribosomal protein L19 family protein4.5e-2452.17Show/hide
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        +M IL+++A+E  +  R +P+I+ G IV++K+EVPENKRR+S  KGIV++R+NAG+++T RIRR++AG+G+E +FP+YSPNIK ++    RK
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AT5G11750.1 Ribosomal protein L19 family protein2.4e-4669.4Show/hide
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AT5G47190.1 Ribosomal protein L19 family protein1.7e-2337.8Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAGGTTTTCGCAGAATTAATCAATTGGTGCGAAGGCAAAGTCCTGATGCACATTTCAAATTGATTAGAGGTTATCCTCTGAATGGGGATGCTAGCTGTAGCTGCTC
GGCCCCAATGTTGATGGAAAACAGTTTTACTATTCCTTGTCTTTTTGGGAAGTCATATGGGTCTTTGAGTGGTTCCCTCTGGAGGTCTTTCTCGTGGTCGGGCAATCAAT
ATCCGGAAGCATTCAAAAATATGAGCTCTCAAATGGAATTTGTGGCTTTGAGAAAACATGCATCTTCAACTTTTTCAGTAATCCAAAGTTCTAGGCCACATTTTTTTCAG
TTGGCAGAAATTGCAGCTCCTTTTTCTAGTAGGGGCATTGCTACGACAAGCTCGATGGGATCAGCTCTACTGGGATCCCCTGCAGTTGATTCTGTTATACCCCCTCGCAT
CAAATTTAAGAGACTTGATAAAACGTCAAGACACATAATGCAGATTTTAGACAAGGAAGCTGTTGAGGAGGTAAAAGCACATAGAGAAATTCCAGATATAAAGCCAGGCT
ATATTGTGCAGCTCAAAGTGGAAGTACCTGAGAACAAGCGACGTATCTCAACATTGAAAGGTATCGTGATAGCCAGACGAAATGCCGGTCTAAACTCAACTTTTAGAATA
AGGAGGGTAGTTGCTGGTGTTGGGATCGAATCCCTCTTCCCTCTATACTCACCGAACATAAAGAGATTAAGGTGTTGGAGAAGAAGAAAGTGCGCAGGGCTAAGCTTTAC
TATCTTAGGGACAAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CTCTTCCCTCTATACTCACCGAACATAAAGAGATTAAGGTGTTGGAGAAGAAGAAAGTGCGCAGGGCTAAGCTTTACTATCTTAGGGACAAAATGAACGCGCTTAAGAAG
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CAAGCAAACCGTGTCATCATTTATCTTTTTGTTGGTCGGTTGCCTGATTTTTCCCCTTCTTTGAAATGCCAAAGAGCTTGCTGTTTGTAATATATGGCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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