; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0012688 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0012688
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionlight-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic
Genome locationchr03:3620842..3626832
RNA-Seq ExpressionIVF0012688
SyntenyIVF0012688
Gene Ontology termsGO:0006850 - mitochondrial pyruvate transmembrane transport (biological process)
GO:0016310 - phosphorylation (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0009579 - thylakoid (cellular component)
GO:0031305 - integral component of mitochondrial inner membrane (cellular component)
GO:0016301 - kinase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0050833 - pyruvate transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsIPR023329 - Chlorophyll a/b binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7016405.1 Light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.68e-9787.11Show/hide
Query:  MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPSPP-SQ
        MSGACSIPFA IKIP+TSSSPA     ASPSASA+SSASSSS+ HSS+RF SSKPF+FTIRSSQTEGPLRRP+APSLR+PSPPSPPSPTPPLKP+PP SQ
Subjt:  MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPSPP-SQ

Query:  SPPSPVL--KQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
        +PPSP    K DNVITLEFQR KAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGI+DLE
Subjt:  SPPSPVL--KQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

XP_004140959.1 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic [Cucumis sativus]4.60e-9889.53Show/hide
Query:  MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPSPPSQS
        MSGACS PF +IKIPSTSSSPAAT++AAS SAS SSSASSSSSL    RF SSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPS TPPLKP+PP QS
Subjt:  MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPSPPSQS

Query:  PPSPVLKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
        PPS     DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
Subjt:  PPSPVLKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

XP_008441491.1 PREDICTED: proline-rich receptor-like protein kinase PERK14 [Cucumis melo]1.38e-117100Show/hide
Query:  MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPSPPSQS
        MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPSPPSQS
Subjt:  MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPSPPSQS

Query:  PPSPVLKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
        PPSPVLKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
Subjt:  PPSPVLKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

XP_023551626.1 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.68e-9787.11Show/hide
Query:  MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPSPP-SQ
        MSGACSIPFA IKIP+TSSSPA     ASPSASA+SSASSSS+ HSS+RF SSKPF+FTIRSSQTEGPLRRP+APSLR+PSPPSPPSPTPPLKP+PP SQ
Subjt:  MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPSPP-SQ

Query:  SPPSPVL--KQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
        +PPSP    K DNVITLEFQR KAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGI+DLE
Subjt:  SPPSPVL--KQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

XP_038884716.1 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic [Benincasa hispida]3.00e-9888.14Show/hide
Query:  MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPSPPSQS
        MSGACSIPFA IKIP  SSSPAA   A SPSASASSSASSSS  H+SLRF SSKPF+FTIRSSQTEGPLRRP+APSLR+PSPPSP SPTPPLKP+PP QS
Subjt:  MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPSPPSQS

Query:  PPSPV---LKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
        PPSPV   +KQDNVITLEFQR KAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGI+DLE
Subjt:  PPSPV---LKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KBA0 Uncharacterized protein3.2e-7589.53Show/hide
Query:  MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPSPPSQS
        MSGACS PF +IKIPSTSSSPAAT++AAS SAS SSSASSS    SSLRF SSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPS TPPLKP+PP QS
Subjt:  MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPSPPSQS

Query:  PPSPVLKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
        PPS     DNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
Subjt:  PPSPVLKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

A0A1S3B3J8 proline-rich receptor-like protein kinase PERK142.7e-90100Show/hide
Query:  MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPSPPSQS
        MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPSPPSQS
Subjt:  MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPSPPSQS

Query:  PPSPVLKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
        PPSPVLKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
Subjt:  PPSPVLKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

A0A6J1FIC8 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic4.6e-7486.6Show/hide
Query:  MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPS-PPSQ
        MSGACSIPFA IKIP+TSSSPA     ASPSASA+SSASSSS+ HSS+RF S+KPF+FTIRSSQTEGPLRRP+APSLR+PSPPSPPSPTPPLKP+ PPSQ
Subjt:  MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPS-PPSQ

Query:  SPPSP--VLKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
        +PPSP    K DNVITLEFQR KAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGI+DLE
Subjt:  SPPSP--VLKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

A0A6J1HG91 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic3.0e-6578.28Show/hide
Query:  MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPSPPSQS
        MSGACS PFA IKIP+ SSS A    A SPSASA+SS SSSS+ HSS+RF SSKPF+FTIRSSQT+GP+RRP+APSLR+PSPPSPP   PPLKP P S +
Subjt:  MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPSPPSQS

Query:  PP-------SPVLKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
         P       + V KQDN ITLEFQR KAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGI+DL+
Subjt:  PP-------SPVLKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

A0A6J1K1U3 light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic3.9e-7386.08Show/hide
Query:  MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPSPP-SQ
        MSGACSIPFA IKIP+ SSSPA     ASPSASA+SSASSSS+ HSS+RF SSKPF+FTIRSSQTEGPLRRP+APSLR+PSPPSPPSPTPPLKP+PP SQ
Subjt:  MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPSPP-SQ

Query:  SPPSP--VLKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
        +PPSP    K DNVITLEFQR KAKELQEYFKQKKLDE DQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGI+DLE
Subjt:  SPPSP--VLKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9FEC1 Light-harvesting complex-like protein OHP2, chloroplastic4.9e-4164.41Show/hide
Query:  SSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSA-PSLRDPS---PPSPPSPTPPLKPSPPSQSPPSPVLKQDNVITL
        +SP       +PS+S+SSS +SSS   S+    ++KP +F IR SQTEGPLRRPSA P+LR+P    PPS PS +PP  PSPP Q   +  +   +V T+
Subjt:  SSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSA-PSLRDPS---PPSPPSPTPPLKPSPPSQSPPSPVLKQDNVITL

Query:  EFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
        EFQR KAKELQEYFKQKKL+ A QGPFFGF  KNEISNGRWAMFGFAVG+LTEYATGS+ VDQVKILLSNFGI+DLE
Subjt:  EFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G34000.1 one-helix protein 23.5e-4264.41Show/hide
Query:  SSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSA-PSLRDPS---PPSPPSPTPPLKPSPPSQSPPSPVLKQDNVITL
        +SP       +PS+S+SSS +SSS   S+    ++KP +F IR SQTEGPLRRPSA P+LR+P    PPS PS +PP  PSPP Q   +  +   +V T+
Subjt:  SSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSA-PSLRDPS---PPSPPSPTPPLKPSPPSQSPPSPVLKQDNVITL

Query:  EFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE
        EFQR KAKELQEYFKQKKL+ A QGPFFGF  KNEISNGRWAMFGFAVG+LTEYATGS+ VDQVKILLSNFGI+DLE
Subjt:  EFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCAGGGGCTTGTTCAATCCCCTTCGCCAACATCAAAATCCCCTCCACTTCTTCCTCACCGGCCGCCACCGCCTCTGCCGCTTCTCCCTCCGCCTCCGCCTCC
TCTTCCGCTTCTTCTTCATCCTCCCTTCACTCTTCCCTCCGATTCCACTCCTCCAAGCCTTTCCTCTTCACCATTCGAAGCTCTCAGACCGAAGGCCCTCTTCGG
AGACCCTCCGCTCCTTCTCTCAGAGACCCCTCGCCGCCCTCTCCCCCTTCGCCCACGCCTCCTCTCAAGCCTTCTCCTCCCTCGCAATCGCCTCCCTCACCGGTT
TTGAAACAGGATAATGTGATCACATTGGAGTTTCAGAGGCTGAAGGCTAAGGAGCTTCAGGAGTATTTTAAGCAGAAGAAGCTTGATGAAGCTGATCAGGGACCG
TTCTTTGGCTTCATCGGGAAGAATGAAATTTCTAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTCGCTGTTGGATTACTGACTGAGTATGCAACTGGTTCAAACTTTGTT
GATCAAGTAAAGATCCTTCTCTCAAATTTTGGGATAATAGATCTCGAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTTGTCTTAGTTCATTCTGAAATTCATCAATGGCTTGCATTTTTCTGAAACTTGGCGACATCATATCCACACCAAACATATCCCCTCAAATCCCAATCCATTTC
TCTTAACCAAATCCATTTTTCATCTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTCCTTTTTGACTTCAATTCCCAATTCCTTCGATTCTTCCATTTCACTTCCACTCAC
AATTTTCTGAAATGTCAGGGGCTTGTTCAATCCCCTTCGCCAACATCAAAATCCCCTCCACTTCTTCCTCACCGGCCGCCACCGCCTCTGCCGCTTCTCCCTCCG
CCTCCGCCTCCTCTTCCGCTTCTTCTTCATCCTCCCTTCACTCTTCCCTCCGATTCCACTCCTCCAAGCCTTTCCTCTTCACCATTCGAAGCTCTCAGACCGAAG
GCCCTCTTCGGAGACCCTCCGCTCCTTCTCTCAGAGACCCCTCGCCGCCCTCTCCCCCTTCGCCCACGCCTCCTCTCAAGCCTTCTCCTCCCTCGCAATCGCCTC
CCTCACCGGTTTTGAAACAGGATAATGTGATCACATTGGAGTTTCAGAGGCTGAAGGCTAAGGAGCTTCAGGAGTATTTTAAGCAGAAGAAGCTTGATGAAGCTG
ATCAGGGACCGTTCTTTGGCTTCATCGGGAAGAATGAAATTTCTAATGGAAGGTGGGCTATGTTTGGTTTCGCTGTTGGATTACTGACTGAGTATGCAACTGGTT
CAAACTTTGTTGATCAAGTAAAGATCCTTCTCTCAAATTTTGGGATAATAGATCTCGAATGACACGATGTACAAGGTCGATGTTGCTATATTTTTCCATTTTCTT
TAATTATGTATCTACATGATGTAATTCATCCTATAGTCTTTATGAGAGTTTTGTTGTCTGTTACACTTAATTACCATTCAAGTGTGTGTGCTCCTTGCAATACTT
ACTGTTTTTCTGTTATATATAAAAATCTTCCCTTTTTTTATGAGTCTTTGTAATTCTAATGCACTGGGAGCATATTCTTGTTCACACCTTGCCAAAATTCTGTAC
CTTCATTTATTGGAGGTTCCATTTACATAATAAAAACCTTGTAAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSGACSIPFANIKIPSTSSSPAATASAASPSASASSSASSSSSLHSSLRFHSSKPFLFTIRSSQTEGPLRRPSAPSLRDPSPPSPPSPTPPLKPSPPSQSPPSPV
LKQDNVITLEFQRLKAKELQEYFKQKKLDEADQGPFFGFIGKNEISNGRWAMFGFAVGLLTEYATGSNFVDQVKILLSNFGIIDLE