; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0012712 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0012712
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionshort-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like
Genome locationchr09:23165604..23171244
RNA-Seq ExpressionIVF0012712
SyntenyIVF0012712
Gene Ontology termsGO:0016491 - oxidoreductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002347 - Short-chain dehydrogenase/reductase SDR
IPR036291 - NAD(P)-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004145894.1 short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic [Cucumis sativus]4.55e-22097.76Show/hide
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XP_022922238.1 short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita moschata]1.56e-21193.29Show/hide
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XP_038876124.1 short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like isoform X1 [Benincasa hispida]4.02e-21190.88Show/hide
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XP_038876125.1 short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like isoform X2 [Benincasa hispida]1.70e-21595.53Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KQF8 Uncharacterized protein3.8e-17197.76Show/hide
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A0A1S3AUS1 short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like7.0e-17399.68Show/hide
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A0A6J1E611 short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like isoform X11.2e-16493.29Show/hide
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A0A6J1E865 short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like isoform X21.5e-16292.97Show/hide
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A0A6J1ID90 short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic-like isoform X12.7e-16492.97Show/hide
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A0A078IS66 Short-chain dehydrogenase TIC 32 A, chloroplastic7.4e-9555.84Show/hide
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A0A078ISJ6 Short-chain dehydrogenase TIC 32 B, chloroplastic8.7e-9656.35Show/hide
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A2RVM0 Short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic1.0e-12070.19Show/hide
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        LAKK+W+F+T L
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Q6RVV4 Short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic1.5e-13273.89Show/hide
Query:  MWLF-RRKGPSGFSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFA
        MW F  +KG SGFS SSTAE+VT GID TGLTAIVTGASSGIG+ET RVLALRG HVIMGVRN+ A ++V++TI+K+ PSAK+DA+ELDLSS+ SV+KFA
Subjt:  MWLF-RRKGPSGFSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFA

Query:  SDYQSSGFPLNILVNNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHVGHFLLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYG
        S++ SSG PLNIL+NNAGIMA PF LSKDNIELQFATNH+GHFLLTNLLL+ MKKT  ESKKEGRIVNV+SEAHR+ YPEGIRFD IND+S YN  +AYG
Subjt:  SDYQSSGFPLNILVNNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHVGHFLLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYG

Query:  QSKLSNILHANELTRRFKEEGLNLTANSLHPGIITTNLFRHFNYGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYFMNSNLHKATQHGQDMD
        QSKL+N+LHAN+LT+  KE+G+N+TANSLHPG I TNLFRH +  NG++N +GK++ KNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYF +SN++K T HG+D+D
Subjt:  QSKLSNILHANELTRRFKEEGLNLTANSLHPGIITTNLFRHFNYGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYFMNSNLHKATQHGQDMD

Query:  LAKKLWEFTTNLLK
        LAKKLW+F+ NL+K
Subjt:  LAKKLWEFTTNLLK

Q91WL8 WW domain-containing oxidoreductase2.1e-4937.78Show/hide
Query:  FSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFASDYQSSGFPLNI
        +  S+TA E+  G D TG   +VTGA+SGIG ETA+  AL G HVI+  RNL         I++E   AK++AM LDL+ + SV+ FA  +++    L++
Subjt:  FSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFASDYQSSGFPLNI

Query:  LVNNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHVGHFLLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGIND-------------ESRYNKMQAY
        LV NAG  A P+GL+KD +E  F  NH+GHF L  LL + + +++       R++ VSSE+HR+T         IND              S Y  M AY
Subjt:  LVNNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHVGHFLLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGIND-------------ESRYNKMQAY

Query:  GQSKLSNILHANELTRRFKEEGLNLTANSLHPGIITTNLFRHFNYGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYFMNSNLHKATQHGQDM
         +SKL NIL +NEL RR    G  +T+N++HPG +  +     ++   ++ T+ +   K++QQGAATT Y A+ P+++G+ G YF N      ++  Q  
Subjt:  GQSKLSNILHANELTRRFKEEGLNLTANSLHPGIITTNLFRHFNYGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYFMNSNLHKATQHGQDM

Query:  DLAKKLWEFTTNLLK
        + A+ LWE +  L++
Subjt:  DLAKKLWEFTTNLLK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G11410.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein6.6e-12371.06Show/hide
Query:  MWLFRRKGPSGFSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFAS
        MW F  KG SGFS+ STAEEVT GIDGTGLTAIVTGASSGIG ET RVLALRGVHV+M VRN ++G  VR+ I+KE P AKID M+LDLSSMASVR FAS
Subjt:  MWLFRRKGPSGFSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFAS

Query:  DYQSSGFPLNILVNNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHVGHFLLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYGQ
        +YQS   PLN+L+NNAGIMA PF LS DNIELQFATNH+GHFLLTNLLLE MKKTA+ES +EGRIV VSSE HR+ Y EG++FD INDE+RYN +QAYGQ
Subjt:  DYQSSGFPLNILVNNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHVGHFLLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYGQ

Query:  SKLSNILHANELTRRFKEEGLNLTANSLHPGIITTNLFRHFNYGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYFMNSNLHKATQHGQDMDL
        SKL NILHA EL R FKE+G+N+TANSLHPG I TNL R+ ++ N I N VGK + K++ QGAATTCY ALHPQ KGVSGEY M++N+      G+D DL
Subjt:  SKLSNILHANELTRRFKEEGLNLTANSLHPGIITTNLFRHFNYGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYFMNSNLHKATQHGQDMDL

Query:  AKKLWEFTTNL
        AKKLWEF+  L
Subjt:  AKKLWEFTTNL

AT4G23420.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein3.0e-12371.15Show/hide
Query:  MWLFRRKGPSGFSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFAS
        MW F  KG SGFSS STAEEVT G+DGTGLTAIVTGASSGIG ETARVLALRGVHV+M VRN  AG  V+E IVK+ P AK+D MEL+LSSM SVRKFAS
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Query:  DYQSSGFPLNILVNNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHVGHFLLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYGQ
        +Y+S+G PLN+L+NNAGIMA PF LSKDNIELQFATNH+GHFLLT LLL+ MK T+ ESK+EGRIVNVSSEAHRY+YPEG+RFD INDES Y+ ++AYGQ
Subjt:  DYQSSGFPLNILVNNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHVGHFLLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYGQ

Query:  SKLSNILHANELTRRFKEEGLNLTANSLHPGIITTNLFRHFN-YGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYFMNSNLHKATQHGQDMD
        SKL N+LHANEL ++ KE+G+N+TANSLHPG I TNL+ +FN Y  G V  V K M K+V QGAATTCYVAL+PQV GV+GEYF +SN+ K  +  +D +
Subjt:  SKLSNILHANELTRRFKEEGLNLTANSLHPGIITTNLFRHFN-YGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYFMNSNLHKATQHGQDMD

Query:  LAKKLWEFTTNL
        LAKKLW+F+T L
Subjt:  LAKKLWEFTTNL

AT4G23420.2 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein3.0e-12371.15Show/hide
Query:  MWLFRRKGPSGFSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFAS
        MW F  KG SGFSS STAEEVT G+DGTGLTAIVTGASSGIG ETARVLALRGVHV+M VRN  AG  V+E IVK+ P AK+D MEL+LSSM SVRKFAS
Subjt:  MWLFRRKGPSGFSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFAS

Query:  DYQSSGFPLNILVNNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHVGHFLLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYGQ
        +Y+S+G PLN+L+NNAGIMA PF LSKDNIELQFATNH+GHFLLT LLL+ MK T+ ESK+EGRIVNVSSEAHRY+YPEG+RFD INDES Y+ ++AYGQ
Subjt:  DYQSSGFPLNILVNNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHVGHFLLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYGQ

Query:  SKLSNILHANELTRRFKEEGLNLTANSLHPGIITTNLFRHFN-YGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYFMNSNLHKATQHGQDMD
        SKL N+LHANEL ++ KE+G+N+TANSLHPG I TNL+ +FN Y  G V  V K M K+V QGAATTCYVAL+PQV GV+GEYF +SN+ K  +  +D +
Subjt:  SKLSNILHANELTRRFKEEGLNLTANSLHPGIITTNLFRHFN-YGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYFMNSNLHKATQHGQDMD

Query:  LAKKLWEFTTNL
        LAKKLW+F+T L
Subjt:  LAKKLWEFTTNL

AT4G23430.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein1.2e-11969.87Show/hide
Query:  MWLFRRKGPSGFSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFAS
        MW F  KG SGFSS STAEEVT G+DGTGLTAIVTGASSGIG ETARVL+LRGVHV+M VRN ++G  V+E IVK+ P AK+D MELDLSSM SVRKFAS
Subjt:  MWLFRRKGPSGFSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFAS

Query:  DYQSSGFPLNILVNNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHVGHFLLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYGQ
        +Y+S+G PLN+L+NNAGIMA PF LSKDNIELQFATNH+GHFLLT LLL+ MK T+ ESK+EGRIVN+SSEAHR++YPEG+RFD IND+S  + M+AYGQ
Subjt:  DYQSSGFPLNILVNNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHVGHFLLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYGQ

Query:  SKLSNILHANELTRRFKEEGLNLTANSLHPGIITTNLFRHFN-YGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYFMNSNLHKATQHGQDMD
        SKL N+LHANELT++ KE+G+N+TANSLHPG I TNL R+FN Y    V  V K + K+V QGAATTCYVAL+PQV GVSGEYF +SN+ K     +D +
Subjt:  SKLSNILHANELTRRFKEEGLNLTANSLHPGIITTNLFRHFN-YGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYFMNSNLHKATQHGQDMD

Query:  LAKKLWEFTTNL
        LAKK+W+F+T L
Subjt:  LAKKLWEFTTNL

AT4G23430.2 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein7.3e-12270.19Show/hide
Query:  MWLFRRKGPSGFSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFAS
        MW F  KG SGFSS STAEEVT G+DGTGLTAIVTGASSGIG ETARVL+LRGVHV+M VRN ++G  V+E IVK+ P AK+D MELDLSSM SVRKFAS
Subjt:  MWLFRRKGPSGFSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFAS

Query:  DYQSSGFPLNILVNNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHVGHFLLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYGQ
        +Y+S+G PLN+L+NNAGIMA PF LSKDNIELQFATNH+GHFLLT LLL+ MK T+ ESK+EGRIVN+SSEAHR++YPEG+RFD IND+S Y+ M+AYGQ
Subjt:  DYQSSGFPLNILVNNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHVGHFLLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYGQ

Query:  SKLSNILHANELTRRFKEEGLNLTANSLHPGIITTNLFRHFN-YGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYFMNSNLHKATQHGQDMD
        SKL N+LHANELT++ KE+G+N+TANSLHPG I TNL R+FN Y    V  V K + K+V QGAATTCYVAL+PQV GVSGEYF +SN+ K     +D +
Subjt:  SKLSNILHANELTRRFKEEGLNLTANSLHPGIITTNLFRHFN-YGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYFMNSNLHKATQHGQDMD

Query:  LAKKLWEFTTNL
        LAKK+W+F+T L
Subjt:  LAKKLWEFTTNL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGGTTATTCAGAAGAAAAGGGCCATCTGGATTTTCGTCTTCTTCCACTGCCGAGGAAGTTACTGATGGAATCGATGGCACTGGTCTTACCGCCATTGTTACAGGAGC
ATCAAGCGGTATTGGCTCTGAAACTGCGCGTGTTCTCGCATTACGTGGAGTCCATGTCATTATGGGCGTTAGGAATTTAGAAGCTGGTAGAAATGTCAGAGAAACCATCG
TGAAGGAGAATCCCTCTGCAAAAATTGATGCCATGGAGTTGGATCTTAGCTCCATGGCGTCTGTAAGAAAATTTGCCTCAGATTACCAGTCGTCTGGGTTTCCACTTAAC
ATCCTCGTTAACAATGCAGGAATAATGGCAACCCCTTTTGGACTTTCAAAAGATAATATAGAGCTGCAATTTGCGACAAACCACGTAGGCCATTTCCTTTTGACAAATCT
ACTTTTGGAAAATATGAAGAAAACTGCCGCTGAAAGTAAGAAAGAAGGAAGAATTGTAAATGTCTCCTCCGAAGCTCATCGTTACACATATCCTGAAGGCATCCGATTCG
ATGGAATTAATGATGAATCAAGGTATAACAAAATGCAGGCTTATGGCCAGTCAAAGTTATCTAATATTCTGCATGCCAATGAACTTACCAGACGTTTCAAGGAAGAAGGA
TTAAACTTAACCGCAAACTCACTCCACCCGGGGATAATCACCACAAATCTTTTCCGCCACTTCAATTATGGCAATGGTATAGTAAACACCGTTGGCAAAATCATGTTTAA
AAATGTTCAACAGGGTGCAGCAACGACCTGCTATGTGGCATTGCATCCACAAGTAAAGGGAGTGAGTGGTGAATATTTTATGAATAGTAACCTACACAAGGCAACCCAAC
ATGGCCAGGATATGGACTTGGCTAAGAAACTTTGGGAGTTTACCACCAATTTACTCAAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGATCTTGGAAAATTAACCCCTCATGTTTTGGCCGACGTTTTAAAAGTTGCTTAAATCTTTCCACAAGAATGAATCAAGCTGGTAATCGAGCAGCTGAATCGCGATATGG
GTGTGTTAGTAATGGGTTCTTAATATCGATATCAATGGCGTTTTTTTAAGTAATTCAACGTTAAATTGAACAATTATTGCTGGCAATTGACATTTCTTGATAGTTTGTTA
CAATAGAACGTGAATTTGGACACGAGTGTCATGCGCGGAAAGAGGTGGCAGAATGCATGGTTCTTATTAACGCAGTGATTTGCCCGGCGGTGGTTGGTTATTAGAAGCAT
AAAGTTTCAGGCGAATTTGCAGATTTGGATAAATCCCGATTGGGTTTTCAGATTTCATCTCTCTTTAATCGAGGCAATGTGGTTATTCAGAAGAAAAGGGCCATCTGGAT
TTTCGTCTTCTTCCACTGCCGAGGAAGTTACTGATGGAATCGATGGCACTGGTCTTACCGCCATTGTTACAGGAGCATCAAGCGGTATTGGCTCTGAAACTGCGCGTGTT
CTCGCATTACGTGGAGTCCATGTCATTATGGGCGTTAGGAATTTAGAAGCTGGTAGAAATGTCAGAGAAACCATCGTGAAGGAGAATCCCTCTGCAAAAATTGATGCCAT
GGAGTTGGATCTTAGCTCCATGGCGTCTGTAAGAAAATTTGCCTCAGATTACCAGTCGTCTGGGTTTCCACTTAACATCCTCGTTAACAATGCAGGAATAATGGCAACCC
CTTTTGGACTTTCAAAAGATAATATAGAGCTGCAATTTGCGACAAACCACGTAGGCCATTTCCTTTTGACAAATCTACTTTTGGAAAATATGAAGAAAACTGCCGCTGAA
AGTAAGAAAGAAGGAAGAATTGTAAATGTCTCCTCCGAAGCTCATCGTTACACATATCCTGAAGGCATCCGATTCGATGGAATTAATGATGAATCAAGGTATAACAAAAT
GCAGGCTTATGGCCAGTCAAAGTTATCTAATATTCTGCATGCCAATGAACTTACCAGACGTTTCAAGGAAGAAGGATTAAACTTAACCGCAAACTCACTCCACCCGGGGA
TAATCACCACAAATCTTTTCCGCCACTTCAATTATGGCAATGGTATAGTAAACACCGTTGGCAAAATCATGTTTAAAAATGTTCAACAGGGTGCAGCAACGACCTGCTAT
GTGGCATTGCATCCACAAGTAAAGGGAGTGAGTGGTGAATATTTTATGAATAGTAACCTACACAAGGCAACCCAACATGGCCAGGATATGGACTTGGCTAAGAAACTTTG
GGAGTTTACCACCAATTTACTCAAATAATCCAACTTTTTTTAAAAGTTATTTTCTGATACAATATGGTGATTTAAAACTCTAGTTTTAAAAGAGAGTATATGTCAATTAC
AGCTAAATTATGCTCATTGGCCAATCTCTCTCTTTTGTTTGTAGATTGTTGATGTGATATTTCTATCTCACTGGATTGTGTTAAGTTGTATTGTATGTGTCTTTAAAAGC
CTTACCTTATTTAGTAGATTTAGACCTACTATTAAGGTGATTTCTAGATTGGTGTTTGTAACGTATTGTGTAGTGTTAAGACCAATGTTTCTTTGTTTCTATAAATATAT
CCTTATTGAGTTCTCTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MWLFRRKGPSGFSSSSTAEEVTDGIDGTGLTAIVTGASSGIGSETARVLALRGVHVIMGVRNLEAGRNVRETIVKENPSAKIDAMELDLSSMASVRKFASDYQSSGFPLN
ILVNNAGIMATPFGLSKDNIELQFATNHVGHFLLTNLLLENMKKTAAESKKEGRIVNVSSEAHRYTYPEGIRFDGINDESRYNKMQAYGQSKLSNILHANELTRRFKEEG
LNLTANSLHPGIITTNLFRHFNYGNGIVNTVGKIMFKNVQQGAATTCYVALHPQVKGVSGEYFMNSNLHKATQHGQDMDLAKKLWEFTTNLLK