; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0013029 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0013029
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionABC transporter C family member 2-like
Genome locationchr07:11163649..11164104
RNA-Seq ExpressionIVF0013029
SyntenyIVF0013029
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0032373.1 hypothetical protein E6C27_scaffold219G002410 [Cucumis melo var. makuwa]2.27e-3155.78Show/hide
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KAA0054018.1 hypothetical protein E6C27_scaffold318G00750 [Cucumis melo var. makuwa]5.74e-3251.57Show/hide
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        GHLR  S   IQLLLG                                TI HL SDPPP
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KAA0054803.1 hypothetical protein E6C27_scaffold437G00890 [Cucumis melo var. makuwa]5.74e-8482.14Show/hide
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TYJ99656.1 hypothetical protein E5676_scaffold562G00370 [Cucumis melo var. makuwa]4.08e-9186.31Show/hide
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TYK19527.1 hypothetical protein E5676_scaffold416G00180 [Cucumis melo var. makuwa]1.93e-3256.25Show/hide
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        I  IGHL  VS  +I LLL        D   +  RS   +G  R
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7UFQ3 Uncharacterized protein5.2e-6593.62Show/hide
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        AHRSTILIR IGHLRHVSSLVIQLLLGTIDHL SDPPPW +
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A0A5A7UG51 Uncharacterized protein4.0e-2556.69Show/hide
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        VG IGHL   S  AIQL+L DDR F ++S  LVGVI HLCR+  S IQLL  DDQ FA  STAL+GAIGHLRRA  S+IQL LGDD AF+ R   LI+V+
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             +     +    TI HL SDPPP
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A0A5D3BKI6 Uncharacterized protein1.8e-7098.58Show/hide
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        AHRSTILIRVIGHLRHVSSLVIQLLLGTIDHLSSDPPPW +
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A0A5D3D7H5 Uncharacterized protein1.8e-2563.87Show/hide
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A0A5D3E8P3 Uncharacterized protein2.4e-2555.78Show/hide
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         HLRRA  S IQL L D RAFA  STIL+R I HLRH S  VIQLLL
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATCGGGCATTTTCGTCAGATCCACTGTCCTGTAGGAGTGATCGGGCATCTTCGTAGTACTTCGTCGTCAGCAATCCAACTTGTCTTAGGGGACGATCGGGCATTTAT
CGTCAAATCCCCCGTCCTGGTAGGAGTGATCAGACATCTTTGTCGTGCTTCGCTGTCAGGGATCCAACTTCTACTGTGGGATGATCAGGCATTTGCCATTAGCTCCACCG
CCCTAGTAGGAGCGATTGGACATCTTCGTCGTGCTTTGCTGTCAGCGATCCAACTTCAACTAGGAGATGATCGGGCATTTGCCCACAGATCCACCATTCTAATAAGAGTG
ATTGGACATCTTCGTCATGTTTCGTCGTTAGTCATCCAACTTCTACTAGGGACGATCGATCATTTGTCGTCAGATCCACCACCCTGGTATGAGCGATCAGGCATCTTCAT
CGGACTTCACCGTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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