| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0034049.1 putative RNA-binding protein ARP1 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] | 1.46e-187 | 99.61 | Show/hide |
Query: MTMMTTTTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
MTMMTTTTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
Subjt: MTMMTTTTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
Query: GARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQAAM
GARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQAAM
Subjt: GARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQAAM
Query: VGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNPGP
VG NTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNPGP
Subjt: VGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNPGP
|
|
| XP_004143608.1 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X1 [Cucumis sativus] | 2.03e-179 | 96.55 | Show/hide |
Query: MTMMTTTTNSN---TNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNL
MTMMTTTTN+N TNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHF KFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNL
Subjt: MTMMTTTTNSN---TNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNL
Query: ASLGARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQ
ASLGARRGGSRSASATPPQAPQPGSN GGPRTT+AATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGY+NGHYTQMYPGQ
Subjt: ASLGARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQ
Query: AAMVGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNPG
A MVGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNPG
Subjt: AAMVGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNPG
|
|
| XP_008445852.2 PREDICTED: probable RNA-binding protein ARP1 isoform X1 [Cucumis melo] | 3.18e-187 | 100 | Show/hide |
Query: MTMMTTTTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
MTMMTTTTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
Subjt: MTMMTTTTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
Query: GARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQAAM
GARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQAAM
Subjt: GARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQAAM
Query: VGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNPG
VGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNPG
Subjt: VGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNPG
|
|
| XP_008445853.2 PREDICTED: probable RNA-binding protein ARP1 isoform X2 [Cucumis melo] | 2.52e-186 | 100 | Show/hide |
Query: MTMMTTTTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
MTMMTTTTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
Subjt: MTMMTTTTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
Query: GARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQAAM
GARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQAAM
Subjt: GARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQAAM
Query: VGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNP
VGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNP
Subjt: VGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNP
|
|
| XP_011654915.1 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X2 [Cucumis sativus] | 1.61e-178 | 96.54 | Show/hide |
Query: MTMMTTTTNSN---TNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNL
MTMMTTTTN+N TNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHF KFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNL
Subjt: MTMMTTTTNSN---TNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNL
Query: ASLGARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQ
ASLGARRGGSRSASATPPQAPQPGSN GGPRTT+AATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGY+NGHYTQMYPGQ
Subjt: ASLGARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQ
Query: AAMVGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNP
A MVGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNP
Subjt: AAMVGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNP
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0KNL6 RRM domain-containing protein | 1.5e-139 | 96.55 | Show/hide |
Query: MTMMTTTTNSN---TNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNL
MTMMTTTTN+N TNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHF KFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNL
Subjt: MTMMTTTTNSN---TNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNL
Query: ASLGARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQ
ASLGARRGGSRSASATPPQAPQPGSN GGPRTT+AATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGY+NGHYTQMYPGQ
Subjt: ASLGARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQ
Query: AAMVGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNPG
AMVGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNPG
Subjt: AAMVGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNPG
|
|
| A0A1S3BD62 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X2 | 9.3e-145 | 100 | Show/hide |
Query: MTMMTTTTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
MTMMTTTTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
Subjt: MTMMTTTTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
Query: GARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQAAM
GARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQAAM
Subjt: GARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQAAM
Query: VGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNP
VGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNP
Subjt: VGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNP
|
|
| A0A1S3BEI0 probable RNA-binding protein ARP1 isoform X1 | 1.9e-145 | 100 | Show/hide |
Query: MTMMTTTTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
MTMMTTTTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
Subjt: MTMMTTTTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
Query: GARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQAAM
GARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQAAM
Subjt: GARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQAAM
Query: VGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNPG
VGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNPG
Subjt: VGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNPG
|
|
| A0A5A7SY01 Putative RNA-binding protein ARP1 isoform X1 | 1.1e-145 | 99.61 | Show/hide |
Query: MTMMTTTTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
MTMMTTTTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
Subjt: MTMMTTTTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASL
Query: GARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQAAM
GARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQAAM
Subjt: GARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMYPGQAAM
Query: VGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNPGP
VG NTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNPGP
Subjt: VGANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNPGP
|
|
| A0A6J1CCJ5 probable RNA-binding protein ARP1 | 5.7e-118 | 86.61 | Show/hide |
Query: TNSNTNAGL-FGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGG
+N++ NAGL FGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHF+KFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACED+APIINGRRANCNLASLGARRG
Subjt: TNSNTNAGL-FGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGG
Query: SRSASATPPQAPQ-PGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVN--GHYTQMYPGQAAMVGA
+++ATPPQAP PGSNGGG +T+A +P NHVQWYYPAGT PTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKL Y+N GHY+Q+YPGQ AMVGA
Subjt: SRSASATPPQAPQ-PGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYVN--GHYTQMYPGQAAMVGA
Query: NTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNP
NTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPT AGPFAAVPPTSIMSKP +VGPNP
Subjt: NTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNP
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q5ZJX4 RNA-binding protein 38 | 9.6e-22 | 56.47 | Show/hide |
Query: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGAR
DTT TK+FVGGL + T ++R +F+ FG+I EAV+I+D+ TG+S+GYGFVT D +A++AC+D PII+GR+AN NLA LGA+
Subjt: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGAR
|
|
| Q5ZMA3 RNA-binding protein 24 | 2.8e-21 | 50.49 | Show/hide |
Query: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGGSRSASATPPQAP
DTT TK+FVGGL + T ++R +F+ FG+I EAV+I+D+ TG+S+GYGFVT D +A++AC+D PII+GR+AN NLA LGA+ P+
Subjt: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGGSRSASATPPQAP
Query: QPG
QPG
Subjt: QPG
|
|
| Q6GQD3 RNA-binding protein 24-A | 2.8e-21 | 50.49 | Show/hide |
Query: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGGSRSASATPPQAP
DTT TK+FVGGL + T ++R +F+ FG+I EAV+I+D+ TG+S+GYGFVT D +A++AC+D PII+GR+AN NLA LGA+ P+
Subjt: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGGSRSASATPPQAP
Query: QPG
QPG
Subjt: QPG
|
|
| Q9I8B3 RNA-binding protein 24-B | 2.8e-21 | 50.49 | Show/hide |
Query: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGGSRSASATPPQAP
DTT TK+FVGGL + T ++R +F+ FG+I EAV+I+D+ TG+S+GYGFVT D +A++AC+D PII+GR+AN NLA LGA+ P+
Subjt: DTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGGSRSASATPPQAP
Query: QPG
QPG
Subjt: QPG
|
|
| Q9M1S3 Probable RNA-binding protein ARP1 | 9.2e-57 | 52.83 | Show/hide |
Query: TTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGG
TT++N N G FGDT LTKVFVGGLAW+T KEAM DHF K+G+ILEAVIISDKLT RSKGYGFVTFKDA++A +ACEDS PIINGRRANCNLASLG R
Subjt: TTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGG
Query: SRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAP--GNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYV-----NGHYTQMYP----
+S + T PQ GP+ AT P GNH QWYYP+G Q HQ VPFYGY PS Y+A ++++N K+GYV NG+Y QM P
Subjt: SRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAP--GNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYV-----NGHYTQMYP----
Query: -------------GQAAMVG-ANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFA-AVPPTS
G MVG A+ ++P Y +Y YHQS A+G P P+ + P + + PP S
Subjt: -------------GQAAMVG-ANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFA-AVPPTS
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G22910.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.4e-36 | 41.53 | Show/hide |
Query: GDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGGSRSASATPPQA
GDTT TKVFVGGLAWET KE M+ HF++FGEILEAV+I+DK +GRSKGYGFVTF++AE+A+ AC D+ P+I+GRRANCNLASLG +R + P
Subjt: GDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGGSRSASATPPQA
Query: PQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSP-SPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMY-----PGQAAMVGANTLMPMYP
P G GGG + P P F H PH P+ +GYSP SP Y + + G +G +Y G A + P YP
Subjt: PQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSP-SPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMY-----PGQAAMVGANTLMPMYP
Query: LYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNPGP
H P F ++ P PPT M + T P P
Subjt: LYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGPNPGP
|
|
| AT1G22910.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 3.1e-36 | 41.8 | Show/hide |
Query: GDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGGSRSASATPPQA
GDTT TKVFVGGLAWET KE M+ HF++FGEILEAV+I+DK +GRSKGYGFVTF++AE+A+ AC D+ P+I+GRRANCNLASLG +R + P
Subjt: GDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGGSRSASATPPQA
Query: PQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSP-SPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMY-----PGQAAMVGANTLMPMYP
P G GGG + P P F H PH P+ +GYSP SP Y + + G +G +Y G A + P YP
Subjt: PQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSP-SPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMY-----PGQAAMVGANTLMPMYP
Query: LYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGP
H P F ++ P PPT M + V P
Subjt: LYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFAAVPPTSIMSKPTTVGP
|
|
| AT1G22910.3 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 4.8e-37 | 42.13 | Show/hide |
Query: GDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGGSRSASATPPQA
GDTT TKVFVGGLAWET KE M+ HF++FGEILEAV+I+DK +GRSKGYGFVTF++AE+A+ AC D+ P+I+GRRANCNLASLG +R + P
Subjt: GDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGGSRSASATPPQA
Query: PQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSP-SPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMY-----PGQAAMVGANTLMPMY-
P G GGG + P P F H PH P+ +GYSP SP Y + + G +G +Y G A + P Y
Subjt: PQPGSNGGGPRTTTAATAPGNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSP-SPTYIATDISYNHKLGYVNGHYTQMY-----PGQAAMVGANTLMPMY-
Query: --------------PLYHYHQSHAMGMPAHIFPPS
P YH+ S+ P H PP+
Subjt: --------------PLYHYHQSHAMGMPAHIFPPS
|
|
| AT3G54770.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 6.5e-58 | 52.83 | Show/hide |
Query: TTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGG
TT++N N G FGDT LTKVFVGGLAW+T KEAM DHF K+G+ILEAVIISDKLT RSKGYGFVTFKDA++A +ACEDS PIINGRRANCNLASLG R
Subjt: TTNSNTNAGLFGDTTLTKVFVGGLAWETPKEAMRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGG
Query: SRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAP--GNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYV-----NGHYTQMYP----
+S + T PQ GP+ AT P GNH QWYYP+G Q HQ VPFYGY PS Y+A ++++N K+GYV NG+Y QM P
Subjt: SRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAP--GNHVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYV-----NGHYTQMYP----
Query: -------------GQAAMVG-ANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFA-AVPPTS
G MVG A+ ++P Y +Y YHQS A+G P P+ + P + + PP S
Subjt: -------------GQAAMVG-ANTLMPMYPLYHYHQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFA-AVPPTS
|
|
| AT3G54770.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.0e-43 | 48.05 | Show/hide |
Query: MRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGN
M DHF K+G+ILEAVIISDKLT RSKGYGFVTFKDA++A +ACEDS PIINGRRANCNLASLG R ATPP GN
Subjt: MRDHFQKFGEILEAVIISDKLTGRSKGYGFVTFKDAESAKKACEDSAPIINGRRANCNLASLGARRGGSRSASATPPQAPQPGSNGGGPRTTTAATAPGN
Query: HVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYV-----NGHYTQMYP-----------------GQAAMVG-ANTLMPMYPLYHY
H QWYYP+G Q HQ VPFYGY PS Y+A ++++N K+GYV NG+Y QM P G MVG A+ ++P Y +Y Y
Subjt: HVQWYYPAGTHPTPFHHQPHQPVPFYGYSPSPTYIATDISYNHKLGYV-----NGHYTQMYP-----------------GQAAMVG-ANTLMPMYPLYHY
Query: HQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFA-AVPPTS
HQS A+G P P+ + P + + PP S
Subjt: HQSHAMGMPAHIFPPSPTTAGPFA-AVPPTS
|
|
