; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0013449 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0013449
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionFasciclin-like arabinogalactan protein 7
Genome locationchr01:3643223..3645000
RNA-Seq ExpressionIVF0013449
SyntenyIVF0013449
Gene Ontology termsGO:0009834 - plant-type secondary cell wall biogenesis (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR000782 - FAS1 domain
IPR036378 - FAS1 domain superfamily
IPR045003 - Fasciclin-like arabinogalactan protein, group A


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0059150.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Cucumis melo var. makuwa]3.36e-177100Show/hide
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XP_038888065.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Benincasa hispida]1.76e-16393.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K597 FAS1 domain-containing protein2.3e-13498.43Show/hide
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A0A1S3C2C3 fasciclin-like arabinogalactan protein 73.6e-13599.22Show/hide
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A0A5D3BU74 Fasciclin-like arabinogalactan protein 73.3e-136100Show/hide
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A0A6J1C1K1 fasciclin-like arabinogalactan protein 72.7e-12290.2Show/hide
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A0A6J1I0D1 fasciclin-like arabinogalactan protein 74.6e-12290.98Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8LEE9 Fasciclin-like arabinogalactan protein 125.2e-3042.18Show/hide
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Q8LEJ6 Fasciclin-like arabinogalactan protein 113.6e-2335.42Show/hide
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         +S  NP+ T AG    G+F LN T     ++I +G  +  V++SV+S   +AVYQVD++LLP A+FG+ + P PAP     ++  + +  D
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Q9SIL7 Fasciclin-like arabinogalactan protein 61.1e-2437.25Show/hide
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Q9SJ81 Fasciclin-like arabinogalactan protein 75.1e-7867.38Show/hide
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        PAP ++  +D+PS V D   A S    P SSH+
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Q9ZWA8 Fasciclin-like arabinogalactan protein 95.6e-2434.02Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G03870.1 FASCICLIN-like arabinoogalactan 93.9e-2534.02Show/hide
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AT2G04780.1 FASCICLIN-like arabinoogalactan 73.6e-7967.38Show/hide
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Query:  NLTADQLKSLILFHGLPHYYSLAEFRNLSLQNPIPTFAGGQFSLNFTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKLLLPEAIFGTDIPPTPAPA
        NLT DQLK L+LFH LPHYYSL+EF+NLS   P+ TFAGGQ+SL FTDVSGT+ I S WT TKVSSSV S+DPVAVYQV+++LLPEAIFGTD+PP PAPA
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Query:  PAPDIAPAADAPSDVIDGRAAPSSEPKPSSSHR
        PAP ++  +D+PS V D   A S    P SSH+
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AT2G04780.2 FASCICLIN-like arabinoogalactan 73.6e-7967.38Show/hide
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        M  ++  A++ L   SA+A+TASPP+    PTPAPAPAP+ VNLT+LL+VAGPFHTFL YL ST VI+TFQNQANNTEEG+TIFVPKD AF AQK P LS
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        NLT DQLK L+LFH LPHYYSL+EF+NLS   P+ TFAGGQ+SL FTDVSGT+ I S WT TKVSSSV S+DPVAVYQV+++LLPEAIFGTD+PP PAPA
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        PAP ++  +D+PS V D   A S    P SSH+
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AT2G20520.1 FASCICLIN-like arabinogalactan 68.0e-2637.25Show/hide
Query:  PAPAPAPDFVNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIDTFQNQANNTEEGVTIFVPKDSAFSAQKKPSLSNLTADQLKSLILFHGLPHYYSLAEFRNLSLQN
        PAP      +NLT +L     F T +  L +T+V      Q N++++G+TIF P D+AF+  K  +L++LT  Q   L+L+H +P YYSL++   L   N
Subjt:  PAPAPAPDFVNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIDTFQNQANNTEEGVTIFVPKDSAFSAQKKPSLSNLTADQLKSLILFHGLPHYYSLAEFRNLSLQN

Query:  PIPTFA----GGQFSLNFTD--VSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKLLLPEAIFGTDIPPTPAPAPAPDIAPA-ADAPSDVIDGRAAPSSE
        P+ T A    GG F LNFT    S  +++ +G   T++++++    P+AVY VD +LLPE +FGT   PT APAP    + + AD+P+   + ++A SS 
Subjt:  PIPTFA----GGQFSLNFTD--VSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKLLLPEAIFGTDIPPTPAPAPAPDIAPA-ADAPSDVIDGRAAPSSE

Query:  PKPS
         + S
Subjt:  PKPS

AT5G60490.1 FASCICLIN-like arabinogalactan-protein 123.7e-3142.18Show/hide
Query:  ALLLLSSSSANAQTASPPSFS-PTPAPAPAPDF-VNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIDTFQNQANNTEEGVTIFVPKDSAFSAQKKPSLSNLTADQL
        +L++L  +     T +P   S P+PA APAP    N+T +L  AG F  F+  L+ST V +    Q NN++ G+TIF P DS+F+  K  +L++LT +Q 
Subjt:  ALLLLSSSSANAQTASPPSFS-PTPAPAPAPDF-VNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIDTFQNQANNTEEGVTIFVPKDSAFSAQKKPSLSNLTADQL

Query:  KSLILFHGLPHYYSLAEFRNLSLQNPIPTFAG----GQFSLNFTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKLLLPEAIFGTDIPPTPAPAPAP
          LI FH +P Y S + F+ +S  NP+ T AG    G F LN T    T++I SG TNT VS +V+S   +AVYQVDK+LLP+ +F    P  PAPAPAP
Subjt:  KSLILFHGLPHYYSLAEFRNLSLQNPIPTFAG----GQFSLNFTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKLLLPEAIFGTDIPPTPAPAPAP

Query:  DIAPAADAPSD
         ++ +     D
Subjt:  DIAPAADAPSD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGATTTTTCATGGTTTTCACTGTTTGTAGTGCATTGTTGCTTCTGAGCTCTTCATCTGCCAATGCCCAAACAGCCAGCCCCCCCTCATTTAGCCCGACCCCGGCACC
AGCGCCAGCCCCAGATTTTGTAAACCTCACAGATCTGCTCACTGTAGCTGGTCCATTTCACACCTTCCTCAGTTACCTCCAGTCCACCAAAGTCATCGACACCTTCCAAA
ACCAAGCCAATAACACAGAGGAAGGAGTGACTATTTTTGTCCCAAAAGACAGCGCTTTCTCCGCGCAAAAGAAACCGTCTCTCTCAAATCTCACCGCAGATCAACTCAAG
TCTCTCATCCTATTTCATGGCTTGCCACATTACTATTCCCTTGCCGAATTCCGGAACCTCAGCCTTCAGAATCCGATCCCAACGTTCGCCGGTGGGCAATTCAGCTTGAA
CTTCACAGACGTTTCTGGGACTATCCATATTGGGTCTGGCTGGACTAACACAAAAGTTAGTAGCAGTGTGCATTCAAGTGATCCTGTTGCTGTTTACCAAGTAGACAAAC
TTCTTCTGCCTGAGGCAATCTTCGGAACTGATATCCCACCAACCCCGGCCCCAGCACCCGCGCCTGATATCGCTCCTGCTGCTGATGCTCCTTCGGATGTTATTGATGGG
AGGGCTGCTCCATCTTCAGAACCAAAGCCTTCATCTTCCCATAGGATCATCAATTGGGGAATTTTGATTCACATTGTTTTGGGTATCTCTGGTGGATTTTTGTTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCATCTCTTAGTTTATCACCCAATTAACTGTCTCTTCTTCACCACCTCATTGCCTTTTCTTCTCCATTTCTTTAAATACTTGCTTCAATTTTCCATCTTTATTTGTATTT
CTCATCTCCTCCTTCCCCATTATTTCTCTGTCAGACCCCCCCTTCTCTCTTCTCTGGCCTGGAAGTTGTGGAAAATGGGATTTTTCATGGTTTTCACTGTTTGTAGTGCA
TTGTTGCTTCTGAGCTCTTCATCTGCCAATGCCCAAACAGCCAGCCCCCCCTCATTTAGCCCGACCCCGGCACCAGCGCCAGCCCCAGATTTTGTAAACCTCACAGATCT
GCTCACTGTAGCTGGTCCATTTCACACCTTCCTCAGTTACCTCCAGTCCACCAAAGTCATCGACACCTTCCAAAACCAAGCCAATAACACAGAGGAAGGAGTGACTATTT
TTGTCCCAAAAGACAGCGCTTTCTCCGCGCAAAAGAAACCGTCTCTCTCAAATCTCACCGCAGATCAACTCAAGTCTCTCATCCTATTTCATGGCTTGCCACATTACTAT
TCCCTTGCCGAATTCCGGAACCTCAGCCTTCAGAATCCGATCCCAACGTTCGCCGGTGGGCAATTCAGCTTGAACTTCACAGACGTTTCTGGGACTATCCATATTGGGTC
TGGCTGGACTAACACAAAAGTTAGTAGCAGTGTGCATTCAAGTGATCCTGTTGCTGTTTACCAAGTAGACAAACTTCTTCTGCCTGAGGCAATCTTCGGAACTGATATCC
CACCAACCCCGGCCCCAGCACCCGCGCCTGATATCGCTCCTGCTGCTGATGCTCCTTCGGATGTTATTGATGGGAGGGCTGCTCCATCTTCAGAACCAAAGCCTTCATCT
TCCCATAGGATCATCAATTGGGGAATTTTGATTCACATTGTTTTGGGTATCTCTGGTGGATTTTTGTTTTGATTGTCATCAGAAATCCTACCATCCATTTATTACATTTA
TGAAAACTATATTGCCATTTTGTTTTGTTATTGATGTGAAGCTCCATTTTTTTGTGAACATATATTATGTTGTTGGATTTGTGCATGAGAATTCCTATTGTGTGGTCTAT
AAATTATGATGGGGAAGGAATTTTGTTTTACAGTTTCAATGTTTCAATACCATCACCATTCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGFFMVFTVCSALLLLSSSSANAQTASPPSFSPTPAPAPAPDFVNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIDTFQNQANNTEEGVTIFVPKDSAFSAQKKPSLSNLTADQLK
SLILFHGLPHYYSLAEFRNLSLQNPIPTFAGGQFSLNFTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKLLLPEAIFGTDIPPTPAPAPAPDIAPAADAPSDVIDG
RAAPSSEPKPSSSHRIINWGILIHIVLGISGGFLF