; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0013652 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0013652
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRibonuclease P
Genome locationtig00000084_ERROPOS800000:540651..542427
RNA-Seq ExpressionIVF0013652
SyntenyIVF0013652
Gene Ontology termsGO:0001682 - tRNA 5'-leader removal (biological process)
GO:0090502 - RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic (biological process)
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InterPro domainsIPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily
IPR033443 - Pentacotripeptide-repeat region of PRORP


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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A0A1S3B8R1 Ribonuclease P1.8e-16999.67Show/hide
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A0A5A7T5Z9 Proteinaceous RNase P 11.8e-16999.67Show/hide
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A0A5D3D8F5 Proteinaceous RNase P 14.7e-170100Show/hide
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E5GBK7 PPR_long domain-containing protein1.8e-16999.67Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4JKB6 Proteinaceous RNase P 31.3e-5542.23Show/hide
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Q66GI4 Proteinaceous RNase P 1, chloroplastic/mitochondrial4.2e-9961.13Show/hide
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Q680B9 Proteinaceous RNase P 21.5e-5944.59Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G16650.1 proteinaceous RNase P 21.0e-6044.59Show/hide
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Query:  PTAKVIEDWFNSESASEVGKK--HWDVNKVREGIVRRGGGWHGEGWLGSGKWRLVRTGIDDNGVCHSCAQKLVCIDIDPKETEDFASSLTKLANQR
         T K+IE+WF  E A EVG      DV  +RE ++  GGGWHG GW+G GKW + +  +   G C SC+++L C+D +  ET+ F  SL  LA  R
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AT2G32230.1 proteinaceous RNase P 13.0e-10061.13Show/hide
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        KK  + +PE +L+ KLDMCSK G V++AL LYDEAR +GVQL  +HYNVLLY+CS       S  N      LSRG +I++QMI DKV PNEATFT+ AR
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Query:  IAGAMDDPEMAFSLVKQMEDYHIAPRLRSYGPALFGFCRKLMPEGAYEVDSHMLASAVEPEEPELSALLKLSSDVKRADKVYELLHRLRRTVRQVSEPTA
        +A A DDPEMAF +VKQM+ + I PRLRSYGPALFGFCRK   + AYEVD+HM+ S V PEEPEL+ALLK+S D K ADKVY+ L RLR  VRQVS+ T 
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Query:  KVIEDWFNSESASEVGKKHWDVNKVREGIVRRGGGWHGEGWLGSGKWRLVRTGIDDNGVCHSCAQKLVCIDIDPKETEDFASSLTKLANQR-VKDNFGKF
         +IE+WF SE A++ G K WDV K+R+ +V  GGGWHG+GWLG+GKW + RT +D+NGVC  C +KLVCIDI+P ETE FA+SLT+LA +R VK NF +F
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Query:  R
        +
Subjt:  R

AT4G21900.1 proteinaceous RNase P 39.1e-5742.23Show/hide
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        KK     PE  L   L  CSK   +  AL LYD A  S  ++L   H+  LLYLCS+          +L +V + RG +I+ +M++  +SPNE++ T++A
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        R+A A  D + AF LVK +        PRLR+Y PAL  FC  L  E  YEV+ HM AS +  EE E+SALLK+S+   R +KVY  L +LR  V  VSE
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Query:  PTAKVIEDWFNSESASEVGKK--HWDVNKVREGIVRRGGGWHGEGWLGSGKWRLVRTGIDDNGVCHSCAQKLVCIDIDPKETEDFASSLTKLANQR
         T+K IE+WF    ASEV       D+  +R  +++ GGGWHG GW+G GKW + +  +   G C SC + L C+D +  ETEDF +SL  LA +R
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AT5G60430.1 drug transmembrane transporters;antiporters9.6e-1443.28Show/hide
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        +RE +++ GGGWHG GW+G GKW + +  +   G C SC+++L C+D +  ET+ F  SL  LA +R
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AT5G60430.2 drug transmembrane transporters;antiporters9.6e-1443.28Show/hide
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        +RE +++ GGGWHG GW+G GKW + +  +   G C SC+++L C+D +  ET+ F  SL  LA +R
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATGGCATTTTCTTTGGTGAAGCAGATGGAGGATTATCATATTGCACCAAGATTGAGGTCATATGGACCAGCACTGTTTGGTTTCTGTAGGAAGCTAATGCCCGAAGGAGC
TTATGAAGTTGATTCTCATATGCTTGCATCTGCGGTAGAACCTGAAGAACCTGAGCTTTCTGCTCTTCTAAAACTCAGTTCTGATGTGAAGAGGGCTGATAAAGTCTATG
AGTTGTTGCATCGGTTAAGAAGAACAGTGAGGCAGGTTTCTGAACCTACTGCCAAAGTTATTGAAGATTGGTTCAATTCTGAAAGTGCATCAGAAGTTGGAAAGAAACAT
TGGGATGTGAACAAGGTTAGGGAAGGTATCGTTAGACGTGGTGGAGGGTGGCATGGAGAAGGTTGGCTGGGTAGTGGTAAGTGGAGGCTGGTGAGAACTGGAATTGATGA
TAATGGTGTTTGTCATTCATGTGCTCAAAAACTTGTTTGCATTGATATTGATCCAAAAGAAACTGAAGACTTTGCTTCCTCATTGACCAAGTTGGCTAACCAAAGAGTTA
AAGATAATTTTGGTAAATTCCGGGGCTTGACTTTGATGCCACAGTCAGATTTATGTCTTCCACTTGTTGCAGATGGAATCAGGTTCACATTTTCTCTTTCAAGTCAAACC
ATCCTTGAATGGGTAAAGGTGATCACTGCCGTGGTCACTTTTTTGGTCTTCGAGAATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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ATCCTTGAATGGGTAAAGGTGATCACTGCCGTGGTCACTTTTTTGGTCTTCGAGAATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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MAFSLVKQMEDYHIAPRLRSYGPALFGFCRKLMPEGAYEVDSHMLASAVEPEEPELSALLKLSSDVKRADKVYELLHRLRRTVRQVSEPTAKVIEDWFNSESASEVGKKH
WDVNKVREGIVRRGGGWHGEGWLGSGKWRLVRTGIDDNGVCHSCAQKLVCIDIDPKETEDFASSLTKLANQRVKDNFGKFRGLTLMPQSDLCLPLVADGIRFTFSLSSQT
ILEWVKVITAVVTFLVFEN