; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0013762 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0013762
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionFra a 1-associated protein
Genome locationchr04:29161613..29175584
RNA-Seq ExpressionIVF0013762
SyntenyIVF0013762
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004136529.1 fra a 1-associated protein [Cucumis sativus]6.02e-12189.34Show/hide
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XP_008442953.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486704 [Cucumis melo]2.43e-142100Show/hide
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XP_022151462.1 uncharacterized protein LOC111019393 [Momordica charantia]4.87e-9774.74Show/hide
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        MGWVW D+ G+ D  A D          SS DRCSTR VV+S C+TEEVEPGKFVRKCERTEEILRDC+GRP EVIQSNKEFTEEDV DQ+VNRSF  G+
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        S H+PF FPGLRSDI+AIE++LFGSMKGFFEAAEEIKNGFFG LRDP  F  +SSSP SMRRGIPIEDH+   FS P EPDSGHVDLSGLARDV
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XP_023539788.1 uncharacterized protein LOC111800367 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.34e-8870.77Show/hide
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        MG VW   +G+LDS A DG   +N +  SS DRCSTR VV+S CKTEEVEPGKFVRKCERTEEILRDCIGRP EVIQSN+EFTEEDVT+++VN RSF  G
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        SSE++PF+FPGLRSDI+AIE SLFGSMKGFF+AAEEI+NGFFGS RDPPLFNR+ SS  SMR+                EPDSGHVDLSGLARDV
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XP_038905970.1 fra a 1-associated protein [Benincasa hispida]1.39e-12389.69Show/hide
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        MGWVW DDTG+LDSSAVD AK +NS  PS SDRCSTR VV+S CKTEEVEPGKFVRKCERTEEILRDCIGRP EVIQSNKEFTEEDVTDQMVNRSF  GS
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGU7 Uncharacterized protein4.9e-9289.34Show/hide
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          SEHRP DFPGLRSDIDAIEQSLFGSMKGFFEAAEEIKNGFFGSLRDPPLFNRDSSS  SMRRGIPI EDHDP FF NPKEPDSGHVDLSGLARDV
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A0A1S3B6X7 uncharacterized protein LOC1034867042.9e-108100Show/hide
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A0A6J1DDK9 uncharacterized protein LOC1110193931.0e-7374.74Show/hide
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        MGWVW D+ G+ D  A D          SS DRCSTR VV+S C+TEEVEPGKFVRKCERTEEILRDC+GRP EVIQSNKEFTEEDV DQ+VNRSF  G+
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        S H+PF FPGLRSDI+AIE++LFGSMKGFFEAAEEIKNGFFG LRDP  F  +SSSP SMRRGIPIEDH+   FS P EPDSGHVDLSGLARDV
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A0A6J1FHK7 uncharacterized protein LOC1114458459.3e-6770.26Show/hide
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        MG VW   +G+LDS A DG   +N +  SS DRCSTR VV+S CKTEEVEPGKFVRKCERTEEILRDCIGRP EVIQSN+EFTEEDVT+++V NRSF  G
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        SSE++PF+FPGLRSDI+AIE SLFGSMKGFF+AAEEI+NGFFGS RDPPLF+R+ SS  SMR+                EPDSGHVDLSGLARDV
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A0A6J1KVN4 uncharacterized protein LOC1114986067.2e-6770.26Show/hide
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        MG VW   +G+LDS A DG   +N +  SS DRCSTR VV+S CKTEEVEPGKFVRKCERTEEILRDCIGRP EVIQSN+EFTEEDVT+++V NRSF  G
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Query:  SSEHRPFDFPGLRSDIDAIEQSLFGSMKGFFEAAEEIKNGFFGSLRDPPLFNRDSSSPGSMRRGIPIEDHDPEFFSNPKEPDSGHVDLSGLARDV
        SSE++PF+FPGLRSDI+AIE SLFGSMKGFF+AAEEI+NGFFGS RDPP+FNR+ SS  SMR+                EPDSGHVDLSGLARDV
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
W5X2N3 Fra a 1-associated protein5.3e-5155Show/hide
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        MGWVW DD    G ++ SA D   + D        DRCSTR VVR+ CKTEEVEPGKF+RKCE+TEE+LRDC+GRP EV+QSNKE+TE+DVTDQ++  S 
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          GS+++  F+FPGL+ DID IE +  G +  FFEAAE++KNGFF S   P +F+   S+S  S RR IPI+     E F       SG VDLSGLARDV
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G35900.1 unknown protein1.5e-4550.98Show/hide
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        MGW+WIDD+    S++  GA   +     S   ++ CST  VVRS CKTEEVEPGKFVRKC++TEEILR C G+P+EV+QSN E TEEDVTDQMV RS  
Subjt:  MGWVWIDDTGDLDSSAVDGAKFDNSTYPSS---SDRCSTRNVVRSHCKTEEVEPGKFVRKCERTEEILRDCIGRPTEVIQSNKEFTEEDVTDQMVNRS-F

Query:  PLGSSEHRPFDFPGLRSDIDAIEQSLFGSMKGFFEAAEEIKNGFFGSLRDPPLFNRDSSSPGSMRRGIPIEDHDP-EFFSN----PKEP-DSGHVDLSGL
        P    +  P +FPGLR D+DAIE+     MK FF+AAEE+ +  F  + D          P + R GIPIE+H   E   N    P  P  SG +DLSGL
Subjt:  PLGSSEHRPFDFPGLRSDIDAIEQSLFGSMKGFFEAAEEIKNGFFGSLRDPPLFNRDSSSPGSMRRGIPIEDHDP-EFFSN----PKEP-DSGHVDLSGL

Query:  ARDV
        A+DV
Subjt:  ARDV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGATGGGTCTGGATAGACGACACCGGCGATTTGGATTCATCTGCCGTTGATGGCGCCAAGTTCGACAATTCCACCTATCCATCCTCCAGCGATCGGTGTTCGACGAG
AAATGTGGTGAGGTCGCACTGCAAGACCGAGGAGGTTGAGCCCGGAAAATTCGTCAGGAAGTGCGAGAGAACCGAGGAGATTCTCAGGGACTGCATTGGAAGGCCAACCG
AAGTGATACAGTCCAACAAGGAATTTACGGAAGAGGATGTAACAGATCAGATGGTCAATAGGTCATTCCCGTTGGGATCATCAGAACATCGACCCTTTGATTTCCCTGGA
CTCCGTAGCGATATCGATGCCATTGAACAGAGTCTCTTTGGTAGCATGAAGGGGTTCTTTGAAGCAGCTGAAGAGATTAAGAATGGTTTCTTTGGTTCTTTAAGAGATCC
ACCCCTATTCAATAGAGATTCTTCCTCTCCCGGATCGATGAGACGTGGTATACCGATTGAAGATCATGATCCAGAGTTCTTCTCCAACCCAAAAGAGCCCGATTCTGGTC
ACGTTGACCTATCTGGATTGGCCAGGGATGTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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