CuGenDBv2

Gene ID	IVF0013880
Organism	Cucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	Membrane fusion protein Use1
Genome location	tig00000135:979974..985449
RNA-Seq Expression	IVF0013880
Synteny	IVF0013880
Gene Ontology terms	GO:0015031 - protein transport (biological process) GO:0005789 - endoplasmic reticulum membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR019150 - Vesicle transport protein, Use1

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

XP_004134064.1 uncharacterized protein LOC101209335 [Cucumis sativus]

1.21e-134

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1.54e-137

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XP_022921329.1 uncharacterized protein LOC111429634 isoform X1 [Cucurbita moschata]

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XP_038879131.1 uncharacterized protein LOC120071129 isoform X2 [Benincasa hispida]

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XP_038879132.1 uncharacterized protein LOC120071129 isoform X3 [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

e value

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A0A1S3AWP3 uncharacterized protein LOC103483591

5.3e-106

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A0A5A7U6J9 Cation exchanger family protein

5.3e-106

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A0A6J1C2Z7 uncharacterized protein LOC111007470

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A0A6J1E043 uncharacterized protein LOC111429634 isoform X1

4.5e-97

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A0A6J1JGJ9 uncharacterized protein LOC111484922 isoform X1

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91.2

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

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Alignment

AT1G54110.1 Membrane fusion protein Use1

3.0e-53

55.81

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          TP+SP   RR  PASS  +++S+     D S P+KLD AA   + K RKLQEDLTDEMV LA+QLKE S ++S+S++NTEKILDSTE+A+E SLA+TG
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AT3G55600.1 Membrane fusion protein Use1

1.4e-58

59.53

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGGTTTAAGTAAAACGGAAATCAACTTGAAGCGGCTCCTGGCAACTGCCCCTCATCAGAAGGATCAGGCTAAACTTATACATTATGTGACTACTCTAAGAGAACAGTT
GGAGCAACTTGCAGAAGAGAAAACACCCGAAGGCTTATCAAGAGTTTCAAAGGCTTTGCTTGGCGATTATTCAGAGAAGATAGAGGCCATTGCTTCAAAATTAATTGTAC
CATTGCCTGATGTGGAAGAGTCTTCTGAGCCCTCTACAAGTACTTCTGTTCGAGAAATTTCGTCTGTAGCTGAAGGAGATTTAAACACCCCCAGTTCACCTACGGGACTA
AGGAGGAGATTTCCGGCATCCTCTACTGTGGAAGATAGATCTCATGGCACCATCAAAGAAGACTCCTCAGCACCTGTCAAGTTGGATGCTGCAGCAATAAACCACATTGA
GAAACACAGGAAGCTTCAAGAGGATTTGACTGATGAAATGGTTGGGTTAGCGAAGCAATTGAAAGAGAGCAGTCTGATAATGAGCAAATCTTTGGAGAACACTGAAAAGA
TACTGGATTCCACGGAAAAGGCCGTTGAGGATAGCTTGGCAACCACTGGTCGTGTCAACAAACGTGCTGTCCAGATTTACTCGGAGAGCTCAAAAATTCATGCTTCACTT
GGCTGGCGATCTTCGCAATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

TGAATTTTGGATCAGTTTGGGCAATTTTCCCATATCCTCTTCTCTCACTCTCTCATCGACCCGCTCCATTTTTTCTTCTTTCTACTTTCTCCTCCAACGACGCAGCCACT
CCCCGCGTGTCCTGAAACGTGCCGCGACCGAGCCCGCCAATTGCTCCAACGAACGGCGCTCGACAATCCTCCCTCTCCGGCGACCTGCTTCAACAGCAGCTGCAAGCATT
TGAATCTATAATGCAGCCGCAGCGGCGACATTTTGAGTAAGATTACTCACAACCCTCTGGAAGGAATCCAGATCAAAATATCACAGCTCGTAAAGGATTTTTCCTCTTTT
CTAAATGGGTTTAAGTAAAACGGAAATCAACTTGAAGCGGCTCCTGGCAACTGCCCCTCATCAGAAGGATCAGGCTAAACTTATACATTATGTGACTACTCTAAGAGAAC
AGTTGGAGCAACTTGCAGAAGAGAAAACACCCGAAGGCTTATCAAGAGTTTCAAAGGCTTTGCTTGGCGATTATTCAGAGAAGATAGAGGCCATTGCTTCAAAATTAATT
GTACCATTGCCTGATGTGGAAGAGTCTTCTGAGCCCTCTACAAGTACTTCTGTTCGAGAAATTTCGTCTGTAGCTGAAGGAGATTTAAACACCCCCAGTTCACCTACGGG
ACTAAGGAGGAGATTTCCGGCATCCTCTACTGTGGAAGATAGATCTCATGGCACCATCAAAGAAGACTCCTCAGCACCTGTCAAGTTGGATGCTGCAGCAATAAACCACA
TTGAGAAACACAGGAAGCTTCAAGAGGATTTGACTGATGAAATGGTTGGGTTAGCGAAGCAATTGAAAGAGAGCAGTCTGATAATGAGCAAATCTTTGGAGAACACTGAA
AAGATACTGGATTCCACGGAAAAGGCCGTTGAGGATAGCTTGGCAACCACTGGTCGTGTCAACAAACGTGCTGTCCAGATTTACTCGGAGAGCTCAAAAATTCATGCTTC
ACTTGGCTGGCGATCTTCGCAATGACGTGTATTTTCATAATGGTTGTGCTTCTCATTCGAGTTACTTGAAATACTAGAAATTATTATTTGGATTCTCAGTAAAAGGTTCA
AGCATTCTTGAACTTGTATACACACACTTCTCCGGTAAAAAAGAAAACGAGATCACTCGTTGGATAGGATAACCGTTTGTAATTTTAACTCATCATTGATATTTTTGTTT
AATATCAAACAAACGATATTAAAGCCAGAA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MGLSKTEINLKRLLATAPHQKDQAKLIHYVTTLREQLEQLAEEKTPEGLSRVSKALLGDYSEKIEAIASKLIVPLPDVEESSEPSTSTSVREISSVAEGDLNTPSSPTGL
RRRFPASSTVEDRSHGTIKEDSSAPVKLDAAAINHIEKHRKLQEDLTDEMVGLAKQLKESSLIMSKSLENTEKILDSTEKAVEDSLATTGRVNKRAVQIYSESSKIHASL
GWRSSQ

IVF0013880 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome