CuGenDBv2

Gene ID	IVF0013898
Organism	Cucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like
Genome location	chr12:528921..533677
RNA-Seq Expression	IVF0013898
Synteny	IVF0013898
Gene Ontology terms	GO:0006413 - translational initiation (biological process) GO:0003743 - translation initiation factor activity (molecular function) GO:0004497 - monooxygenase activity (molecular function) GO:0005506 - iron ion binding (molecular function) GO:0016705 - oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen (molecular function) GO:0020037 - heme binding (molecular function)
InterPro domains	IPR000504 - RNA recognition motif domain IPR001876 - Zinc finger, RanBP2-type IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily IPR035979 - RNA-binding domain superfamily IPR036443 - Zinc finger, RanBP2-type superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_008457317.1 PREDICTED: transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X1 [Cucumis melo]

2.98e-310

100

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGDR
        MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGDR
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGDR

Query:  GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSR
        GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSR
Subjt:  GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSR

Query:  GGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAG
        GGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAG
Subjt:  GGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAG

Query:  GRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
        GRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
Subjt:  GRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG

Query:  NNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        NNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  NNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

XP_011658817.1 transcription initiation factor TFIID subunit 15b [Cucumis sativus]

1.57e-296

97.17

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGG--RGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGG
        MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGG AGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGG  RGYGGRGGGGG  YGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGG
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGG--RGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGG

Query:  DRGGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDR--GGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNE
        DRGGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDR  GGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNE
Subjt:  DRGGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDR--GGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNE

Query:  GGSRGGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGG
        GGSRGGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGS+DYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAA RGGPS GYDGG
Subjt:  GGSRGGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGG

Query:  YNAGGRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
        YNAGGRGGYNAGGRGGSYNASGGR GGYGST AAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVT DELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
Subjt:  YNAGGRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT

Query:  DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPP YNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

XP_016902120.1 PREDICTED: transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X2 [Cucumis melo]

4.48e-293

93.88

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGDR
        MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGG                              GGYQGGDR
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGDR

Query:  GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSR
        GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSR
Subjt:  GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSR

Query:  GGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAG
        GGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAG
Subjt:  GGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAG

Query:  GRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
        GRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
Subjt:  GRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG

Query:  NNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        NNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  NNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

XP_016902121.1 PREDICTED: transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X3 [Cucumis melo]

3.28e-292

93.27

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGDR
        MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGG                                 YQGGDR
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGDR

Query:  GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSR
        GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSR
Subjt:  GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSR

Query:  GGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAG
        GGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAG
Subjt:  GGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAG

Query:  GRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
        GRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
Subjt:  GRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG

Query:  NNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        NNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  NNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

XP_038894092.1 transcription initiation factor TFIID subunit 15b [Benincasa hispida]

2.15e-282

93.51

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGDR
        MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGG      KGGDGGYGGGGRGGGGG  RGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGG      GGGYQGGDR
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGDR

Query:  GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDR--GGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG
        GGRGAGR GGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDR  GGGGGGGYNRGG D GYGG+RNGRGGS+HGGRSG HDGGRNEGG
Subjt:  GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDR--GGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG

Query:  SRGGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYN
        +RGGNS+GGHQGGEDS YGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYH G+ADYGTDAVPPPASYSGTTYPP+YG PTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYN
Subjt:  SRGGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYN

Query:  AGGRGGYNAGGRGG-SYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTD
        AGGRGGYNAGGRGG SYNASGGRGGGYGST  AEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTD
Subjt:  AGGRGGYNAGGRGG-SYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTD

Query:  EMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        EMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  EMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LYC4 Uncharacterized protein

2.7e-232

97.17

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGR--GGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGG
        MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGY GGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGR  GGGGGGGRGYGGR  GGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGG
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGR--GGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGG

Query:  DRGGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDR--GGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNE
        DRGGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDR  GGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNE
Subjt:  DRGGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDR--GGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNE

Query:  GGSRGGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGG
        GGSRGGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGS+DYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAA RGGPS GYDGG
Subjt:  GGSRGGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGG

Query:  YNAGGRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
        YNAGGRGGYNAGGRGGSYNASGGR GGYGST AAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVT DELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
Subjt:  YNAGGRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT

Query:  DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPP YNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

A0A1S3C4S9 transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X1

1.0e-242

100

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGDR
        MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGDR
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGDR

Query:  GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSR
        GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSR
Subjt:  GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSR

Query:  GGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAG
        GGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAG
Subjt:  GGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAG

Query:  GRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
        GRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
Subjt:  GRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG

Query:  NNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        NNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  NNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

A0A1S4E1L8 transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X3

8.3e-229

93.27

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGDR
        MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGG                                 GGGYQGGDR
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGDR

Query:  GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSR
        GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSR
Subjt:  GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSR

Query:  GGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAG
        GGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAG
Subjt:  GGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAG

Query:  GRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
        GRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
Subjt:  GRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG

Query:  NNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        NNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  NNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

A0A1S4E2C0 transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X2

2.2e-229

93.88

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGDR
        MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGG                              GGGYQGGDR
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGDR

Query:  GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSR
        GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSR
Subjt:  GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSR

Query:  GGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAG
        GGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAG
Subjt:  GGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAG

Query:  GRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
        GRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
Subjt:  GRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG

Query:  NNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        NNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
Subjt:  NNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

A0A5A7UXQ0 Transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X3

6.1e-216

98.89

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGDR
        MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGDR
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGDR

Query:  GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSR
        GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSR
Subjt:  GGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSR

Query:  GGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAG
        GGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAG
Subjt:  GGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAG

Query:  GRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
        GRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
Subjt:  GRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG

Query:  NNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHG
        NNKGDACVSYEDPSAAHSAG    +YDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHG
Subjt:  NNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHG

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q94KD0 Transcription initiation factor TFIID subunit 15b

1.5e-94

58.92

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGG-GGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGD
        M+GMY+Q           GGGG      GG GYGGGG   GYG  GGD GYGG G  GGG     YGGRGG GGGGG G RGGG        GGGYQGGD
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGG-GGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGD

Query:  RGGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGG-GGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG
        RGGRG+        GG GRDGDW CPNP CGN+NFARRVECNKCGA +P G S      GGGGY+RGGGDS  GG R GR  S   GRS  ++  R +GG
Subjt:  RGGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGG-GGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG

Query:  SRGGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSA--PSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGG
        SR G SYG     E+  YGQ PP +A  PS  G +GSYPP        YG +AVPPP SYSG   PP+YGGP GGYG D+   G    GRGG SGGYDGG
Subjt:  SRGGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSA--PSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGG

Query:  YNAGGRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
                          +A   +   Y   + A   +VKQCD +CDD+CDN+RIY+SNLPPDVT DEL++LFGGIGQ+GRIKQKRGYKDQWP+NIKIYT
Subjt:  YNAGGRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT

Query:  DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGG-----YGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        DE GN KGDAC++YEDPSAAHSAGGF+NNY++RG  I+V MAEKSAPRA PT++  GGGRGG      GGGGDRRRD+Y    SGPDR+ HGGNRSRPY
Subjt:  DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGG-----YGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G58470.1 TBP-associated factor 15B

1.1e-95

58.92

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGG-GGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGD
        M+GMY+Q           GGGG      GG GYGGGG   GYG  GGD GYGG G  GGG     YGGRGG GGGGG G RGGG        GGGYQGGD
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGG-GGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGD

Query:  RGGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGG-GGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG
        RGGRG+        GG GRDGDW CPNP CGN+NFARRVECNKCGA +P G S      GGGGY+RGGGDS  GG R GR  S   GRS  ++  R +GG
Subjt:  RGGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGG-GGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG

Query:  SRGGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSA--PSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGG
        SR G SYG     E+  YGQ PP +A  PS  G +GSYPP        YG +AVPPP SYSG   PP+YGGP GGYG D+   G    GRGG SGGYDGG
Subjt:  SRGGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSA--PSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGG

Query:  YNAGGRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
                          +A   +   Y   + A   +VKQCD +CDD+CDN+RIY+SNLPPDVT DEL++LFGGIGQ+GRIKQKRGYKDQWP+NIKIYT
Subjt:  YNAGGRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT

Query:  DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGG-----YGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        DE GN KGDAC++YEDPSAAHSAGGF+NNY++RG  I+V MAEKSAPRA PT++  GGGRGG      GGGGDRRRD+Y    SGPDR+ HGGNRSRPY
Subjt:  DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGG-----YGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

AT5G58470.2 TBP-associated factor 15B

1.1e-95

58.92

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGG-GGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGD
        M+GMY+Q           GGGG      GG GYGGGG   GYG  GGD GYGG G  GGG     YGGRGG GGGGG G RGGG        GGGYQGGD
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGG-GGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGD

Query:  RGGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGG-GGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG
        RGGRG+        GG GRDGDW CPNP CGN+NFARRVECNKCGA +P G S      GGGGY+RGGGDS  GG R GR  S   GRS  ++  R +GG
Subjt:  RGGRGAGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGG-GGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG

Query:  SRGGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSA--PSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGG
        SR G SYG     E+  YGQ PP +A  PS  G +GSYPP        YG +AVPPP SYSG   PP+YGGP GGYG D+   G    GRGG SGGYDGG
Subjt:  SRGGNSYGGHQGGEDSGYGQVPPSSA--PSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGG

Query:  YNAGGRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT
                          +A   +   Y   + A   +VKQCD +CDD+CDN+RIY+SNLPPDVT DEL++LFGGIGQ+GRIKQKRGYKDQWP+NIKIYT
Subjt:  YNAGGRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYT

Query:  DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGG-----YGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY
        DE GN KGDAC++YEDPSAAHSAGGF+NNY++RG  I+V MAEKSAPRA PT++  GGGRGG      GGGGDRRRD+Y    SGPDR+ HGGNRSRPY
Subjt:  DEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEKSAPRAPPTYNHGGGGRGG-----YGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTCTGGTATGTACGATCAAGGAGGAGACGCTGCTCCGTCTTACGGAGCCCCTGGAGGCGGTGGAGGGTACGGTGGTGGAGGTGGAGGCGGTGGATACGGAGGCGGTGG
TGGTGGTGCAGGCTATGGTGGAAAAGGCGGTGATGGTGGTTATGGAGGCGGAGGCCGTGGCGGCGGTGGCGGCGGTGGTAGAGGCTATGGAGGACGAGGTGGCGGCGGAG
GCGGAGGCTACGGTGGTCGTGGCGGCGGTGGCGGATATCAAGGAGGAGATCGCGGAGGCGGATATCAAGGAGGAGACCGAGGAGGGCGAGGCGCTGGACGTGGTGGCGGG
GGTGGTCGTGGCGGAAGCGGCAGAGATGGGGATTGGGTCTGCCCTAATCCTGGCTGTGGAAATTTGAACTTTGCTAGAAGAGTGGAGTGTAACAAGTGTGGTGCACCCTC
ACCTGGTGGTGCTAGCGATCGAGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTTATAATAGAGGTGGAGGTGACAGTGGCTATGGTGGCAGTCGTAATGGAAGAGGTGGTAGTTTCCACG
GTGGTAGAAGTGGAACTCATGATGGAGGTCGAAATGAAGGAGGGAGCAGAGGTGGTAATTCTTATGGTGGTCACCAGGGAGGAGAAGATAGCGGGTACGGTCAAGTTCCC
CCATCCTCAGCACCTTCATCTGGCGGTCTTGCTGGCTCTTATCCACCATCTTACCATGGTGGAAGTGCAGATTACGGGACTGATGCAGTTCCTCCTCCTGCAAGCTATAG
TGGAACGACATATCCTCCAACTTATGGTGGTCCCACTGGTGGCTATGGTGGTGACAGTCTAGGTGATGGGCGTGGTGCTGCTGGTCGTGGTGGGCCATCAGGTGGATATG
ATGGTGGCTACAATGCGGGTGGTAGAGGTGGCTATAATGCTGGTGGTAGAGGAGGAAGCTATAATGCCAGTGGTGGTAGAGGTGGTGGTTATGGAAGTACACAAGCAGCA
GAGCCAGCACAGGTTAAACAGTGTGATGATAATTGTGATGATTCGTGTGATAACTCTAGAATCTATGTATCTAATTTGCCACCAGATGTGACCATTGATGAATTGAGGGA
ATTATTTGGTGGAATTGGTCAAATTGGAAGAATCAAGCAGAAGAGGGGCTACAAGGATCAATGGCCTTGGAACATAAAAATATATACAGATGAGATGGGAAATAACAAAG
GCGATGCATGTGTATCATATGAAGACCCCTCAGCAGCACATTCTGCTGGCGGTTTCTATAACAATTATGATTTGAGAGGTTATAGCATCAATGTTGCAATGGCTGAGAAG
TCTGCACCAAGGGCTCCACCTACATATAACCATGGTGGTGGTGGTAGAGGTGGATATGGAGGTGGTGGAGATAGGCGCAGAGATAGCTACAGGGACGGAGGCTCTGGACC
TGATAGACATCAGCATGGTGGAAATAGATCGCGTCCTTACTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AATCCATCTTCTTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTGAACTCTGAAGTTAGCCCTAAAAAAAGCTAATGTCTGGTATGTACGATCAAGGAGGAGACGCTGCTCCGTCTTACGG
AGCCCCTGGAGGCGGTGGAGGGTACGGTGGTGGAGGTGGAGGCGGTGGATACGGAGGCGGTGGTGGTGGTGCAGGCTATGGTGGAAAAGGCGGTGATGGTGGTTATGGAG
GCGGAGGCCGTGGCGGCGGTGGCGGCGGTGGTAGAGGCTATGGAGGACGAGGTGGCGGCGGAGGCGGAGGCTACGGTGGTCGTGGCGGCGGTGGCGGATATCAAGGAGGA
GATCGCGGAGGCGGATATCAAGGAGGAGACCGAGGAGGGCGAGGCGCTGGACGTGGTGGCGGGGGTGGTCGTGGCGGAAGCGGCAGAGATGGGGATTGGGTCTGCCCTAA
TCCTGGCTGTGGAAATTTGAACTTTGCTAGAAGAGTGGAGTGTAACAAGTGTGGTGCACCCTCACCTGGTGGTGCTAGCGATCGAGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTTATA
ATAGAGGTGGAGGTGACAGTGGCTATGGTGGCAGTCGTAATGGAAGAGGTGGTAGTTTCCACGGTGGTAGAAGTGGAACTCATGATGGAGGTCGAAATGAAGGAGGGAGC
AGAGGTGGTAATTCTTATGGTGGTCACCAGGGAGGAGAAGATAGCGGGTACGGTCAAGTTCCCCCATCCTCAGCACCTTCATCTGGCGGTCTTGCTGGCTCTTATCCACC
ATCTTACCATGGTGGAAGTGCAGATTACGGGACTGATGCAGTTCCTCCTCCTGCAAGCTATAGTGGAACGACATATCCTCCAACTTATGGTGGTCCCACTGGTGGCTATG
GTGGTGACAGTCTAGGTGATGGGCGTGGTGCTGCTGGTCGTGGTGGGCCATCAGGTGGATATGATGGTGGCTACAATGCGGGTGGTAGAGGTGGCTATAATGCTGGTGGT
AGAGGAGGAAGCTATAATGCCAGTGGTGGTAGAGGTGGTGGTTATGGAAGTACACAAGCAGCAGAGCCAGCACAGGTTAAACAGTGTGATGATAATTGTGATGATTCGTG
TGATAACTCTAGAATCTATGTATCTAATTTGCCACCAGATGTGACCATTGATGAATTGAGGGAATTATTTGGTGGAATTGGTCAAATTGGAAGAATCAAGCAGAAGAGGG
GCTACAAGGATCAATGGCCTTGGAACATAAAAATATATACAGATGAGATGGGAAATAACAAAGGCGATGCATGTGTATCATATGAAGACCCCTCAGCAGCACATTCTGCT
GGCGGTTTCTATAACAATTATGATTTGAGAGGTTATAGCATCAATGTTGCAATGGCTGAGAAGTCTGCACCAAGGGCTCCACCTACATATAACCATGGTGGTGGTGGTAG
AGGTGGATATGGAGGTGGTGGAGATAGGCGCAGAGATAGCTACAGGGACGGAGGCTCTGGACCTGATAGACATCAGCATGGTGGAAATAGATCGCGTCCTTACTGAGAGA
TTCGGCATTGAGCATTTTATGTAATGGGAATTGTGATCTTAAGTGTTTTAGTTTTGTTCCATGGCTGGATTCTTGAATTGGAGACCAAAGAGGTAGGTTGTTCACTTTCT
ATGGGCAAGAGACCTCTTTGCTCCTTTTTATCTATAGTGGTACCTGGAGGATTATAATCTTGCTGGGGCTTGAGATTAATCTAGTTGTGTGGATGTTTTTTTTTATAGAG
GCAGGCGGATAATCTCCAAACTGCTTGTTGCTAAGGTAGGTGTTGATGTTTTCAGGTGAGTGCTTCTCTTTCCATAACCGTTCTTAGAATTATGCACTTGGTGCTCTGAT
GTATAAAGCTCCACCTGATCTCTCAGCTACGTCCTTGTTGGATCTGATGCAAGCATATCTTAGCTTTGATCATAATTCTGCATTCATATTTTAATTATTAATTATTTACT
TGCCATGTTCTTTACCCTTTAACGTCCTTTATTATTATTATTATAATTTATTATCTATTTGCTAGGGATGGCCTGAATTTTTTTCTTATTCATCTCACATGTGTGTTCAA
GGCTGCTTGTGATCATATGATGTTTGATTTAGCTTGTTTTTATCTTAAAAAAGACTATCATATTAGTAAGTCAAACTAGGTATTACGTTGTAGTGGTAAGTTACTTCTGT
CACGTAGAACTGTCAACTGTCGCCCCATAGAACTTTGGAATTGTTCACTTTTTGGATTGGGGTTTTATGATGGGACACTCAAGTTAGACGTCGGGTTGTCGATTTGGGTT
TTTGGCAATGTTGCATTTTTTTTCTGGAACGCTGTGGTGCAACAATGTCTGACACTCCAAATGTTCTAAAGATTTATTTTAGTTGGGTCTTAAGGCAAACACTAACCTCA
TGGATTCTGATGCCGTGGTGCTGCCATTTACATTCTGCACATTCATTTGCTGCGTTAGTGGCTTCTTTGGAGCTGTGCCGAGGAAATATTCAGCATTAATTTTGGATTTG
TCTTAGGAGTCGATTTTGTTATTGAAAAAAGACACATGTACTTGTTTTTTCCCCTAGAAGGGCAGAGGGGGTTGTTTTGTTACCCGATTTTTGACCTATTGCATAAACTA
GTGTGTTTGAGCAATGGATTACAAATTTCTGTATGTTCATATATTTCTTCCCAAACCATCAATAAAATTTTAATAATACACTATTAGAG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MSGMYDQGGDAAPSYGAPGGGGGYGGGGGGGGYGGGGGGAGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGGGGYQGGDRGGGYQGGDRGGRGAGRGGG
GGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASDRGGGGGGGYNRGGGDSGYGGSRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGSRGGNSYGGHQGGEDSGYGQVP
PSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPTGGYGGDSLGDGRGAAGRGGPSGGYDGGYNAGGRGGYNAGGRGGSYNASGGRGGGYGSTQAA
EPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPPDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPSAAHSAGGFYNNYDLRGYSINVAMAEK
SAPRAPPTYNHGGGGRGGYGGGGDRRRDSYRDGGSGPDRHQHGGNRSRPY

IVF0013898 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome