; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0014084 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0014084
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionGag/pol protein
Genome locationchr02:14195102..14195363
RNA-Seq ExpressionIVF0014084
SyntenyIVF0014084
Gene Ontology termsGO:0006749 - glutathione metabolic process (biological process)
GO:0003676 - nucleic acid binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0046778.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa]1.27e-24100Show/hide
Query:  MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDK
        MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDK
Subjt:  MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDK
KAA0047525.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa]1.40e-1986.79Show/hide
Query:  MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDKE
        +GKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVG LNMK KR GKTPKNS GKKV K+
Subjt:  MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDKE
KAA0051354.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa]1.91e-1886.54Show/hide
Query:  MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDK
        MGKGKEVEAN ATTEKELVGGSSSKTRVG LNMK KR G TPKNS GKKV K
Subjt:  MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDK
TYK23861.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa]1.91e-1886.54Show/hide
Query:  MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDK
        MGKGKEVEAN ATTEKELVGGSSSKTRVG LNMK KR G TPKNS GKKV K
Subjt:  MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDK
TYK29670.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa]3.53e-24100Show/hide
Query:  MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDK
        MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDK
Subjt:  MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDK
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TV83 Gag/pol protein8.8e-18100Show/hide
Query:  MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDK
        MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDK
Subjt:  MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDK
A0A5A7U1L7 Gag/pol protein5.9e-1486.79Show/hide
Query:  MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDKE
        +GKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVG LNMK KR GKTPKNS GKKV K+
Subjt:  MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDKE
A0A5A7VKI4 Glutaredoxin active site-containing protein1.0e-1388.46Show/hide
Query:  MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDK
        MGKGKEVE NVATTEKELVGGSSSKTRVG LNMK KR GKTPKNS GKKV K
Subjt:  MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDK
A0A5D3BYQ2 Gag/pol protein2.9e-1386.54Show/hide
Query:  MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDK
        MGKGKEVE NV TTEKELVGGSSSKTRVG LNMK KR GKTPKNS GKKV K
Subjt:  MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDK
A0A5D3E296 Gag/pol protein8.8e-18100Show/hide
Query:  MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDK
        MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDK
Subjt:  MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDK
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTAAAGGGAAGGAAGTGGAAGCAAATGTTGCTACCACAGAGAAAGAGTTAGTAGGAGGATCGTCCTCTAAGACTAGAGTTGGAATTTTAAATATGAAGAATAAAAG
AAATGGGAAGACTCCCAAGAATAGTGTGGGAAAGAAAGTTGATAAAGAAATTTTCCGAAGTACCTTACTCAGAAGAAAGCTGAGAAGGAAGCACAAGGAGACTAGTTCTT
GA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGTAAAGGGAAGGAAGTGGAAGCAAATGTTGCTACCACAGAGAAAGAGTTAGTAGGAGGATCGTCCTCTAAGACTAGAGTTGGAATTTTAAATATGAAGAATAAAAG
AAATGGGAAGACTCCCAAGAATAGTGTGGGAAAGAAAGTTGATAAAGAAATTTTCCGAAGTACCTTACTCAGAAGAAAGCTGAGAAGGAAGCACAAGGAGACTAGTTCTT
GA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGKGKEVEANVATTEKELVGGSSSKTRVGILNMKNKRNGKTPKNSVGKKVDKEIFRSTLLRRKLRRKHKETSS