CuGenDBv2

Gene ID	IVF0014136
Organism	Cucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	transcription factor Pur-alpha 1
Genome location	chr02:2775974..2781303
RNA-Seq Expression	IVF0014136
Synteny	IVF0014136
Gene Ontology terms	GO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process) GO:0005634 - nucleus (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function) GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function) GO:0003729 - mRNA binding (molecular function) GO:0032422 - purine-rich negative regulatory element binding (molecular function)
InterPro domains	IPR006628 - Purine-rich element binding protein family

Homology

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A0A0A0LZP1 Uncharacterized protein

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A0A1S4DZ49 transcription factor Pur-alpha 1 isoform X1

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A0A5A7UN79 Transcription factor Pur-alpha 1 isoform X2

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A0A5D3CEN1 Transcription factor Pur-alpha 1 isoform X2

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O35295 Transcriptional activator protein Pur-beta

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P42669 Transcriptional activator protein Pur-alpha

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        SG G  G GG   GG  +GGG G+ GG      EL  K + +++K FY D+K+N +GR+LKI+E      +S + +  S    F D    +I        
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                  D+P   + S+ L  + + +Y D+ EN+RGRFL++        R T+      NR  G  + +          +   LP Q   E  + LA
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         L DD G                           ++E   L     +  D KRFFFD+GSN  G F+R+SEV    R+SI +P
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Q00577 Transcriptional activator protein Pur-alpha

1.3e-16

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        LA L DD G                           ++E   L     +  D KRFFFD+GSN  G F+R+SEV    R+SI +P
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Q6PAC9 Transcriptional activator protein Pur-beta-A

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28.57

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        G   GG +G  GG            EL  K L +++K FY D+K+N +GR++KI+E  +    + +    G+      +  D   +Y  +    PE    
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                        + S+ L  + + +Y D+ EN+RGRFL++        R TI      NR  G+S      A + ++ +   LP Q   E  + LA
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         L DD G     G   G +   G                   G L     I  D KRFFFD+GSN  G FLR+SEV  + R+SI +PL    +F
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Q9SKZ1 Transcription factor Pur-alpha 1

3.5e-126

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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

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2.5e-127

77.63

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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

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GTGCAAAACACTGCAGGTGGAACACAAGCTGTTTTACTTCGATCTGAAGGAGAATCCCAGAGGTCGATATCTGAAGATTTCAGAGAAAACATCGGCTACAAGGTCAACGA
TCATTGTTCCTTTCTCTGGGATTCCATGGTTCTTAGATCTCTTCAATTACTATATCAATTCTGATGATCCGGAAGTTTTTAGCAAGGAATTGCAGCTGGACACAAAGGTG
TTTTACTTTGACATTGGCGAGAATAGGAGGGGTCGTTTCTTGAAGGTATCTGAAGCTTCAGTTAGTAGAAACCGCAGCACCATTATCGTTCCTGCCGGAAGCAATCGGGA
TGAAGGATGGTCTGCATTTAGAAACATTTTGGCAGATATCAATGAAGCATCTAGGCTTTTTATACTGCCCAATCAGGAAAATTCTGAACATTCAGAACGTCTCGCCGGAC
TTTCGGATGATGTAGGAGCAGGCTTCATATCAGGTCATAGTAGTCAATCTGGGCCAACCTCTGACTTGAATGTAGATAGACAAGTAGACTTGTCAGCTCAAGATGAAATG
GGGAATCTGGGTGTTTCAAAAGTTATCCGAGCTGATCAAAAGAGATTCTTTTTTGATCTCGGAAGTAACAACCGGGGTCATTTCTTGAGGATTTCCGAGGTTGCAGGGGC
AGATCGTTCTTCAATCATTCTCCCATTGTCAGGTCTTAAGCAGTTCTATGAAATAGTAGGACATTTTGTGGAGATCACCAAAGACAGGATTGAAGGAATGACAGGTGTGA
ATGTCCGAACTGTGGATCCACCTCAGAGATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

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CCCTAATTTTCCAGAACCCCTTTTTGTCAAAATCCTTTTTTTTTTTCCTCTCCTTTTCTCTCATGGGGTTCACTTATTAGATCTCCCATTTCTAGGTTTCTGATTATTTT
CTTGTATTTTGGTTGTATACAAGGCATTTGGCGGGTTTTTGCTTCGATTTCTGTTCGAATCGGGGCTCGTTCGTTTTAATTTCTGTGTAATTTTGTCTTTTTTTGTAAAC
CCAATTGAAGAAAATAGATGCTGATTTATTGAATTGAGATTCTTGTACGAATTTAGATAATCGCTTAAATCGTGGGGAATTATAAGTAGAAACCGAGTCAGAGCTGGGAG
TGGAAGATGGAGGGGAATTCCGGCGGAGGTGGAGTAGGAATTGGGGGAACGACGGCAGGTGGCGTGGCGGCGGGAGGAGGGGCTGGTAGTGGCGGAGGGAATGACGTGGA
GTTGATGTGCAAAACACTGCAGGTGGAACACAAGCTGTTTTACTTCGATCTGAAGGAGAATCCCAGAGGTCGATATCTGAAGATTTCAGAGAAAACATCGGCTACAAGGT
CAACGATCATTGTTCCTTTCTCTGGGATTCCATGGTTCTTAGATCTCTTCAATTACTATATCAATTCTGATGATCCGGAAGTTTTTAGCAAGGAATTGCAGCTGGACACA
AAGGTGTTTTACTTTGACATTGGCGAGAATAGGAGGGGTCGTTTCTTGAAGGTATCTGAAGCTTCAGTTAGTAGAAACCGCAGCACCATTATCGTTCCTGCCGGAAGCAA
TCGGGATGAAGGATGGTCTGCATTTAGAAACATTTTGGCAGATATCAATGAAGCATCTAGGCTTTTTATACTGCCCAATCAGGAAAATTCTGAACATTCAGAACGTCTCG
CCGGACTTTCGGATGATGTAGGAGCAGGCTTCATATCAGGTCATAGTAGTCAATCTGGGCCAACCTCTGACTTGAATGTAGATAGACAAGTAGACTTGTCAGCTCAAGAT
GAAATGGGGAATCTGGGTGTTTCAAAAGTTATCCGAGCTGATCAAAAGAGATTCTTTTTTGATCTCGGAAGTAACAACCGGGGTCATTTCTTGAGGATTTCCGAGGTTGC
AGGGGCAGATCGTTCTTCAATCATTCTCCCATTGTCAGGTCTTAAGCAGTTCTATGAAATAGTAGGACATTTTGTGGAGATCACCAAAGACAGGATTGAAGGAATGACAG
GTGTGAATGTCCGAACTGTGGATCCACCTCAGAGATGAACGATATGGGTCCTGGGGGTTTGTGTTTATTCCTTTTAGTGTTTGTGTAGAGCTGCATGCATGCAGGTGTTC
GAGTAGGGTTCAATTTGTGGTCAGTGTGGTTTGATATTTTCCTGTCTTGATTTTCTAGTTCAAGTCTGAATAATCCATCCTGCTAGAGATTAGCAGAGGGTATGGAAAAT
GCTTGAGAAGCTTAATTATTCTTCCATGAATAACAACAGATAAAGAGAGAGAGAGGGGAAAGAGAGATGCTTGTAATTGTCACTTTATAATAATGGTGAGTTCAGGTGTG
TTTTGTTCATTTCATTTGCTGTAGTTACTAACGATTTTCACTTCCATTTCCAGCCTTTCTGCTTTCATCCGAATAATTATTTTTGGATTGAGTTCAACAAAGTATGGAGA
TGAAACTTTGAACCACTTACCTTTCGTATGGGGGTAATGTATGTCTTATTTAG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MEGNSGGGGVGIGGTTAGGVAAGGGAGSGGGNDVELMCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVPFSGIPWFLDLFNYYINSDDPEVFSKELQLDTKV
FYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWSAFRNILADINEASRLFILPNQENSEHSERLAGLSDDVGAGFISGHSSQSGPTSDLNVDRQVDLSAQDEM
GNLGVSKVIRADQKRFFFDLGSNNRGHFLRISEVAGADRSSIILPLSGLKQFYEIVGHFVEITKDRIEGMTGVNVRTVDPPQR

IVF0014136 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome