; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0014441 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0014441
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionprotein TIFY 8-like
Genome locationchr04:2962635..2967558
RNA-Seq ExpressionIVF0014441
SyntenyIVF0014441
Gene Ontology termsGO:0009611 - response to wounding (biological process)
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InterPro domainsIPR010399 - Tify domain
IPR040390 - TIFY/JAZ family


Homology Show/hide homology
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              +  H   +L+NG G     ++ N    + QPPR                                      G Q    +HQ++++  ++ NV P
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Query:  SNISQSAADEGSRTGMKSPGLLSSFNARHDRRHSSQMLLSCDKQKTKTESLAYKSSNSSSPQGLDSDNRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADIIMALAGSN
        S I+Q+AADEGSRTGMK PG+LSSF                    +K ES A   SN+ + + L S  +QMTIFYGGQAHVFDDVHPNKAD+IMALAGS+
Subjt:  SNISQSAADEGSRTGMKSPGLLSSFNARHDRRHSSQMLLSCDKQKTKTESLAYKSSNSSSPQGLDSDNRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADIIMALAGSN

Query:  GGSWSTNLAPK
        GGSWST L+ K
Subjt:  GGSWSTNLAPK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G32570.1 TIFY domain protein 81.9e-4239.87Show/hide
Query:  IFHDFLGIKTKD-ASVLLA--AKTPDVSFSEAS-TPPSALASSSGGRGLISAASDLASENQ-VCDYLEGVPFYSPRNDISGPENGNRIAGIKRGNPDSAF
        +FHDFLG K    AS  +A     PD   ++A+ TP +A ASS+GG G +S+ SDL   +    ++L+G+  + PR+D+SG    NR +G KR N DS F
Subjt:  IFHDFLGIKTKD-ASVLLA--AKTPDVSFSEAS-TPPSALASSSGGRGLISAASDLASENQ-VCDYLEGVPFYSPRNDISGPENGNRIAGIKRGNPDSAF

Query:  MGPYRNQIPH---ILQNGAGGDRPRYNDNEVVYSMQPPRIASSSLTQHSLGTRFNPSVSKWERPIPSNMSSALNSSLGSQFVPRVHQIASNSSREFNVAP
              +  H   +L+NG G     ++ N    + QPPR                                      G Q    +HQ++++  ++ NV P
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Query:  SNISQSAADEGSRTGMKSPGLLSSFNARHDRRHSSQMLLSCDKQKTKTESLAYKSSNSSSPQGLDSDNRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADIIMALAGSN
        S I+Q+AADEGSRTGMK PG+LSSF                    +K ES A   SN+ + + L S  +QMTIFYGGQAHVFDDVHPNKAD+IMALAGS+
Subjt:  SNISQSAADEGSRTGMKSPGLLSSFNARHDRRHSSQMLLSCDKQKTKTESLAYKSSNSSSPQGLDSDNRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADIIMALAGSN

Query:  GGSWSTNLAPK
        GGSWST L+ K
Subjt:  GGSWSTNLAPK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCGTCAAGGCGCTTATTCCGATGCTGGTTACTGCAGCAATGGTGAGAAGAAGAGTACGAGTCAGGTTCCACAGTTAGGTAATGCGATCTTCCATGATTTTCTTGG
CATTAAGACTAAAGATGCTTCCGTACTTTTGGCCGCGAAGACGCCGGATGTAAGCTTCTCAGAGGCATCGACGCCGCCGTCGGCTTTGGCTTCATCCAGTGGCGGCCGTG
GACTCATCTCCGCTGCCTCCGATCTTGCGTCTGAAAATCAGGTTTGTGATTACCTTGAAGGGGTTCCATTCTATAGTCCAAGGAATGATATATCTGGACCTGAAAATGGT
AACCGAATAGCTGGGATTAAACGCGGTAACCCAGATTCTGCTTTCATGGGACCATATAGAAACCAAATTCCTCATATACTACAAAATGGAGCTGGTGGAGATCGACCAAG
ATACAACGATAATGAGGTGGTTTACAGTATGCAGCCACCACGAATTGCTTCTTCTTCCCTCACACAACATTCTCTTGGCACTAGATTCAATCCTAGTGTTTCCAAATGGG
AGAGACCTATTCCATCAAACATGAGTTCTGCACTAAATTCTTCTCTTGGGAGTCAGTTTGTGCCTCGTGTTCATCAAATAGCTTCCAATTCTTCGAGGGAATTTAATGTT
GCTCCTTCCAATATTTCTCAATCTGCTGCTGATGAAGGATCTAGAACTGGGATGAAAAGCCCTGGACTTTTAAGTAGCTTTAATGCTCGACATGATCGAAGACACTCATC
TCAAATGTTGCTAAGTTGCGACAAGCAGAAGACCAAGACCGAAAGTTTGGCATACAAATCTTCTAACTCTTCAAGTCCGCAGGGTCTTGATTCTGACAACAGACAGATGA
CTATTTTCTACGGCGGTCAAGCTCATGTTTTTGATGATGTCCATCCAAACAAGGCTGATATTATAATGGCCTTAGCTGGATCAAATGGGGGCTCTTGGTCAACAAATTTA
GCACCTAAATTAAATGTAACTAGGGTACCTAGTGAGCAAGAGTCAGCTAAAGATTATCATGGAAAGTTATATCATAGTTTGATATCCACCAGTCGAGGTGTTGGCGATAC
TCCGATACCGACACAAACAGCTGTAGGTGATCATCCACGCAGTGTTGCAGTGGAAGAGACCCGAAAACCTGTTCGTGCAGCAGATATCAATGCTGAACAGTACAAAGAAA
GCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTTAACTAAACAATTTGCAACTCAAAACCCAAAATTTCAATTTTCTCTTCAATGGACTGAAGAAGTTGTCTGTCTTCATTCAACAAAATCTTCATCATTCATATTTCCT
TCTCCATGTGATTTTGATTTTGATGAGCTTCACACCTCTTCAAAATTTCCTTCTTCCGCAACAAAATTCGTTAACGAACTCACTGAATTTATCATCATTTAATCAAATTG
CCTCACCGGCGCCGGCGTCGGGAAGTTTTCTCAAGATGCTTTTTCTGTTCTGTTTATCTCGAGAAAAGAGCCTGATTCTTTTTTCAGTTTCCTCTCTCTTCTGATTCTTT
TTACCTTTTTCTTGTTTTTGGTTCTCTGTATGTTTCTTTTCAAAAACCGAGTTTCTTGTCTTTTGTTGTTCTCTACACTCTTGCTCTTTATGCAGAGTGAAATGGATGCT
TTCGTAAAGAGGCATTGCTTGTGGTTCTGTCTCTAATGGCTCGTCAAGGCGCTTATTCCGATGCTGGTTACTGCAGCAATGGTGAGAAGAAGAGTACGAGTCAGGTTCCA
CAGTTAGGTAATGCGATCTTCCATGATTTTCTTGGCATTAAGACTAAAGATGCTTCCGTACTTTTGGCCGCGAAGACGCCGGATGTAAGCTTCTCAGAGGCATCGACGCC
GCCGTCGGCTTTGGCTTCATCCAGTGGCGGCCGTGGACTCATCTCCGCTGCCTCCGATCTTGCGTCTGAAAATCAGGTTTGTGATTACCTTGAAGGGGTTCCATTCTATA
GTCCAAGGAATGATATATCTGGACCTGAAAATGGTAACCGAATAGCTGGGATTAAACGCGGTAACCCAGATTCTGCTTTCATGGGACCATATAGAAACCAAATTCCTCAT
ATACTACAAAATGGAGCTGGTGGAGATCGACCAAGATACAACGATAATGAGGTGGTTTACAGTATGCAGCCACCACGAATTGCTTCTTCTTCCCTCACACAACATTCTCT
TGGCACTAGATTCAATCCTAGTGTTTCCAAATGGGAGAGACCTATTCCATCAAACATGAGTTCTGCACTAAATTCTTCTCTTGGGAGTCAGTTTGTGCCTCGTGTTCATC
AAATAGCTTCCAATTCTTCGAGGGAATTTAATGTTGCTCCTTCCAATATTTCTCAATCTGCTGCTGATGAAGGATCTAGAACTGGGATGAAAAGCCCTGGACTTTTAAGT
AGCTTTAATGCTCGACATGATCGAAGACACTCATCTCAAATGTTGCTAAGTTGCGACAAGCAGAAGACCAAGACCGAAAGTTTGGCATACAAATCTTCTAACTCTTCAAG
TCCGCAGGGTCTTGATTCTGACAACAGACAGATGACTATTTTCTACGGCGGTCAAGCTCATGTTTTTGATGATGTCCATCCAAACAAGGCTGATATTATAATGGCCTTAG
CTGGATCAAATGGGGGCTCTTGGTCAACAAATTTAGCACCTAAATTAAATGTAACTAGGGTACCTAGTGAGCAAGAGTCAGCTAAAGATTATCATGGAAAGTTATATCAT
AGTTTGATATCCACCAGTCGAGGTGTTGGCGATACTCCGATACCGACACAAACAGCTGTAGGTGATCATCCACGCAGTGTTGCAGTGGAAGAGACCCGAAAACCTGTTCG
TGCAGCAGATATCAATGCTGAACAGTACAAAGAAAGCTAAATCGCGACGACAACGGCTTTCTTTCCATCCCCATCCTGCCCTCGCCACCCTCGTGCCTTCTGTTTGCAGC
AAGAGGTAATTAGCCAAAACTCAAGGGTAAAGAGATTTATAATAGAAGGTATTGTTGTTAAGTCCAGTTTTCATGAGCATTGTCGTTATTTATCTTTTTAGCAAATACAA
AAACAGTCAATTGCTTGCTTAAGGGGATGGGGTTCGCTAATATTTGTTTGATGCATAAAAGAAGTTGGTTGCCTTCAAAGCGCTATAAAAATTTCCATATTATCTTATGT
GAAGAGTAGTGGAAAATTAGGTTATACTTTTTTTTTTGCCCCTAATAAATAAGATGTAATGTCATGTCATGGATAGACTCTTTCTTTTTAAGGGTATTTTGGTCATTTCA
ATTTGAGATTAATGGGTTCTTTGGGTTTTTTTTCTTGCTCTTTCCTATTTAAAAACTCAATTCCCTCCGGCATTGATTTGATTTTTTCCTTTTCTTTTTTACTTTTAACT
TTTAAATTTTAATTTTATCGACCCTAATTTTGTCGAGGTTGATTATTGGTCGGTTAGAGTAGGTTTTTCGACTAAAACTTCCACTAAATTGATTATGGTGCGTTTAGTAA
AAAGTTCAAGTCGGCCTTGGCAGCTGAAGAATAAAAGTTGGTCATTGGTTTAGCTCTTTGAATTTTTTTTTTTTTAATTTCTGATTTGAGATTTTTTGAAACCGATACTG
ATCAACCCCTCTCAACCCCTCTTATTCTCCTACCAATCGAGATTTTGGTTCAATTGGATGGCTGGATTTATCGGTCTATCATGGTTATAAGTTTTTTTAAAAAAACAATT
ACCAATAATTCAAGAGTTAAAAATGTGAGAATTCGAAATTTAAGGGAGAAAGTTGATGTACCAAACTTGACCTAAATTACACATTTATGGATTTTTATTAATATTTTAAT
TTTAGTACCGACTCTATTTATTGGGTTGAGAGTGTAAAATATTTTTAATAATATCTATATCCACACATCTCTTGATCACGTGGACTTTTTGATCTTCAACGCACATGTTG
ATGTCAGTTAAGCTACATTCATTTAAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MARQGAYSDAGYCSNGEKKSTSQVPQLGNAIFHDFLGIKTKDASVLLAAKTPDVSFSEASTPPSALASSSGGRGLISAASDLASENQVCDYLEGVPFYSPRNDISGPENG
NRIAGIKRGNPDSAFMGPYRNQIPHILQNGAGGDRPRYNDNEVVYSMQPPRIASSSLTQHSLGTRFNPSVSKWERPIPSNMSSALNSSLGSQFVPRVHQIASNSSREFNV
APSNISQSAADEGSRTGMKSPGLLSSFNARHDRRHSSQMLLSCDKQKTKTESLAYKSSNSSSPQGLDSDNRQMTIFYGGQAHVFDDVHPNKADIIMALAGSNGGSWSTNL
APKLNVTRVPSEQESAKDYHGKLYHSLISTSRGVGDTPIPTQTAVGDHPRSVAVEETRKPVRAADINAEQYKES