; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0014470 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0014470
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionProtein of unknown function, DUF538
Genome locationchr02:7667259..7670585
RNA-Seq ExpressionIVF0014470
SyntenyIVF0014470
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR007493 - Protein of unknown function DUF538
IPR036758 - At5g01610-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK28128.1 uncharacterized protein E5676_scaffold289G00340 [Cucumis melo var. makuwa]2.52e-109100Show/hide
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XP_008450299.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103491951 [Cucumis melo]1.46e-10899.39Show/hide
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XP_038880734.1 uncharacterized protein LOC120072336 isoform X1 [Benincasa hispida]2.24e-7775Show/hide
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XP_038880736.1 uncharacterized protein LOC120072336 isoform X2 [Benincasa hispida]2.09e-7775Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M0C4 Uncharacterized protein4.9e-6982.93Show/hide
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A0A1S3BPX6 uncharacterized protein LOC1034919511.2e-8399.39Show/hide
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A0A5A7UJ73 Uncharacterized protein1.2e-8399.39Show/hide
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A0A5D3DXH8 Uncharacterized protein3.2e-84100Show/hide
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A0A6J1H9I3 uncharacterized protein LOC1114613581.1e-5267.07Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02816.1 Protein of unknown function, DUF5386.7e-1031.25Show/hide
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        L P S+F   L     + L  +A D  + ++  + LL  Y FPVG+LP  V SY L    G F    + +C   +Q +  + Y  TI G +S   ++ ++
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        G++VK LF WL I  + V  +   +EF VG  S       F   P C      + KT+T+
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AT1G55265.1 Protein of unknown function, DUF5381.4e-3951.46Show/hide
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        S +L+ FS LFL +L +S+  +L             FS+ +L    L + DIHDLLP YGFP GLLP+NVKSYT+SDDG F ++L S+CYV+F+D LV+Y
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        GK I GKLSYGS+ DV GIQ K+ F WLPIT M     S ++ F VGF+S+ LP SMFE++P+C +   L+
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AT4G02370.1 Protein of unknown function, DUF5382.0e-0932.17Show/hide
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        L IL+ S     S +A  +    SD    + LL  Y FPVG+LP  V +Y L +  G F    + +C         + Y  TI G +S   L  ++G++V
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        K LF WL I  + V  +   +EF VG  S       F   P C
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AT5G19860.1 Protein of unknown function, DUF5386.0e-2743.54Show/hide
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        L PF  S+F+  L + T T  S +  D     S +++LLP YG P GLLP  V  +TLSDDG FV+ L ++C ++F  LV+Y KTI G++ YGS++++ G
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        IQVKK F WL +  ++V    S SI F+VGF+++ L    F++I +C
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AT5G54530.1 Protein of unknown function, DUF5381.0e-1834.69Show/hide
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        +++L+ + +  LS S+         +HD+L   G P GLLP  V SY L +DG   + L + CY +F   V++   ++G LSYGSL  V G+  K+LF W
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        L +  + V + +S  I F +G   + L  S+FE  P C+    L+ K
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCCTTCTCCAGAATCCTCTCCCCATTTTCACTATTTCTTCTGATTCTTGTCATCTCCACTCAAACCCACCTCTCCTTTTCAGCAAGGGATCTTCTCCTC
AAGTCATCTGATATCCACGATCTTCTTCCCCTTTACGGTTTTCCAGTCGGTCTCTTACCCAGCAATGTCAAGTCCTACACTCTCTCAGACGATGGTAGCTTCGTA
ATCGAACTCGATAGCGCTTGCTATGTCCAGTTCGCTGATCTGGTCTATTACGGCAAGACGATCAAGGGGAAATTGAGCTATGGGTCATTGAGCGATGTTTCTGGG
ATTCAAGTCAAGAAGTTGTTCGCCTGGCTTCCTATTACTGGAATGAGGGTTACTTCAGACTCTAAATCCATCGAGTTTCAGGTTGGGTTCTTGTCTGAGGCTTTG
CCGTTCAGCATGTTTGAGTCCATTCCTACATGCAGAAAGAAAGCTTGCCTAGAAGGGAAAACAGAGACAGTGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGACGAAATATTTTATCACTTGTTGGCATTTATTTAAACATGTTTCAACGAAGCAAGCGGCAACCAACTTTCTCCCCATTTTCTTCCTCAAACCTCCATCAATGG
CTTCCTTCTCCAGAATCCTCTCCCCATTTTCACTATTTCTTCTGATTCTTGTCATCTCCACTCAAACCCACCTCTCCTTTTCAGCAAGGGATCTTCTCCTCAAGT
CATCTGATATCCACGATCTTCTTCCCCTTTACGGTTTTCCAGTCGGTCTCTTACCCAGCAATGTCAAGTCCTACACTCTCTCAGACGATGGTAGCTTCGTAATCG
AACTCGATAGCGCTTGCTATGTCCAGTTCGCTGATCTGGTCTATTACGGCAAGACGATCAAGGGGAAATTGAGCTATGGGTCATTGAGCGATGTTTCTGGGATTC
AAGTCAAGAAGTTGTTCGCCTGGCTTCCTATTACTGGAATGAGGGTTACTTCAGACTCTAAATCCATCGAGTTTCAGGTTGGGTTCTTGTCTGAGGCTTTGCCGT
TCAGCATGTTTGAGTCCATTCCTACATGCAGAAAGAAAGCTTGCCTAGAAGGGAAAACAGAGACAGTGTGAGGTGGAAATAATAGCTTTCCAAAACGCTTATCCT
TTTCATTGGGTGAGAGAAGCATGTTGGTCTTTGCAAGAAGAATAATGTAATCTTTGTTTTTATGTCATGAACCTACGGTGTTCATTTTTAATCTTTTTCCTACAT
GTTCATCTATATTTATATCTATATCATAAATATTCTCACATGTTTACCTAATGTTTTCTTTCAATAATATTATCTTTTTACGAAAGTAATCCATAACCTAGTGTG
GCTGGGAGACGAGGAAGTGTGTCGAAAAATTGAAAATTAAGCTGTGTATATGTCAAATGTTGGTCCCGATGATCTGTTTATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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