; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0014525 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0014525
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2
Genome locationchr06:12984086..12987042
RNA-Seq ExpressionIVF0014525
SyntenyIVF0014525
Gene Ontology termsGO:0033615 - mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex assembly (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
InterPro domainsIPR011419 - ATP12, ATP synthase F1-assembly protein
IPR023335 - ATP12 orthogonal Bundle domain superfamily
IPR042272 - ATP12, ATP synthase F1-assembly protein, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0066952.1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]4.55e-201100Show/hide
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XP_004145687.1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2 [Cucumis sativus]1.53e-18591.89Show/hide
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XP_008450034.1 PREDICTED: ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2 isoform X1 [Cucumis melo]3.86e-20499.32Show/hide
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XP_008450035.1 PREDICTED: ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2 isoform X2 [Cucumis melo]4.64e-20499.32Show/hide
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XP_038878129.1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2 isoform X3 [Benincasa hispida]1.87e-17687.67Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L8R2 Uncharacterized protein1.2e-14691.89Show/hide
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A0A1S3BNC6 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2 isoform X22.5e-16099.32Show/hide
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A0A1S3BNE3 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2 isoform X18.5e-16199.32Show/hide
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A0A5D3E2W0 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2 isoform X12.3e-158100Show/hide
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E5GCD8 ATP12-like protein8.5e-16199.32Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q1LZ96 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 21.6e-1527.85Show/hide
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         T+L+  P  R K  +I   +   + D V  R  E +    + E Q  + DP++ W    +G +    +S+ G +      + +   L   +   L  I+
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         + +   SL++ +G+   +L +E+A+ L RLEE++Q+
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Q8N5M1 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 25.9e-1829.61Show/hide
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        R  E +    + E Q  + DP+++W    +G +    +S+ G +      + +   L   +   L  I+ +A+   S+++ +G+   +L +E+A+ L RL
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Q91YY4 ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 22.9e-1729.13Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G40660.1 ATP12 protein-related1.3e-10065.33Show/hide
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        LTS V++ QVE IDPLL+W+ SEF  KP VYSS+FGG Q+D L+KAVE+LL+KT+D ELASIDA+ ++AHS++IA+GIF GKLQI++AI+LIRLEED QV
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCGACCTCAATTTTATCAAAAATGGCTAAATCAATCAGAATCACCAATCCCACGCTAACTCCATCTCATTCTTTCCGCTACCGTATGCTTTGTACCAGTGTCGCCAC
CGCTCCCGAACAATCTCCTTCAGACGCCGCCTCCTTCACTTTCTCCAATGACAGCCCTAGAGAAGAGCCTGTTTTCATTAAGGCCCCACGTTCTAATTCGTCATCCCCTT
CCAGCTCCTCCGTCACGATGCCGACCTCGTTCATGACTGGTTCCATTGTGGGTAAGCGCTTTTACCAGAAAGTCACTACGAGGGAAGCGGATGATGGGAATGGATGGACG
GTGATGCTTGATTACCGGACGCTTAAGACTCCTACCAAGAGGCCTCTGAAGCTACCGACTCTCGGCCTCGCCAAGGCCGTTGCTGCCGAGTGGGAATATCAGGAAACAGA
TGGGATTAGACCCTTCACAATGCCTCTAATGAAATTGGCCTGTACCGCTTTGGAAAGAGTGCCTCTAACCCGGCCCAAGATTATCGAACATTTGATGGGGAAATTCAATC
GTGATCTGGTTTTCTGTCGTGCTCCAGAGGACGATTTAACAAGTGGAGTTTACGAACGACAAGTGGAGAAAATCGATCCTTTACTTGACTGGGTGCATTCAGAATTTGGC
TTTAAGCCTATTGTATATTCCAGTCTTTTTGGTGGGAATCAGGAGGACGGTCTTATAAAGGCTGTTGAAGATCTTCTGAGAAAAACCGATGACTGTGAATTGGCATCAAT
CGATGCCATCGCGTCAGCCGCACACTCTTTAATAATTGCTATTGGAATTTTTCGTGGAAAGTTGCAGATCGAAGAAGCAATTGAGTTGATTAGACTCGAAGAAGATTTCC
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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