; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0014707 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0014707
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description50S ribosomal protein L29, chloroplastic
Genome locationchr07:11923114..11925410
RNA-Seq ExpressionIVF0014707
SyntenyIVF0014707
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001854 - Ribosomal protein L29/L35
IPR036049 - Ribosomal protein L29/L35 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004137190.1 50S ribosomal protein L29, chloroplastic [Cucumis sativus]7.59e-9892.94Show/hide
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XP_008455595.1 PREDICTED: 50S ribosomal protein L29, chloroplastic [Cucumis melo]3.13e-106100Show/hide
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XP_022941582.1 50S ribosomal protein L29, chloroplastic-like [Cucurbita moschata]4.19e-9089.41Show/hide
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XP_022977189.1 50S ribosomal protein L29, chloroplastic-like [Cucurbita maxima]1.20e-8988.82Show/hide
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XP_023531622.1 50S ribosomal protein L29, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.44e-8988.82Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KVL7 Uncharacterized protein6.3e-7592.94Show/hide
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A0A1S3C2I8 50S ribosomal protein L29, chloroplastic2.6e-81100Show/hide
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A0A5D3CWZ4 50S ribosomal protein L292.6e-81100Show/hide
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A0A6J1FMW5 50S ribosomal protein L29, chloroplastic-like3.9e-6989.41Show/hide
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A0A6J1IQR3 50S ribosomal protein L29, chloroplastic-like8.7e-6988.82Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8HMR2 50S ribosomal protein L297.3e-0431.75Show/hide
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        ++KD+   +  E+  +++DLK +L  LRLQK+ R E K  +F+ +R ++++++T++R+R++ +
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P82248 50S ribosomal protein L29, chloroplastic8.5e-3757.14Show/hide
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        K S+F RMRKR++RMLTVKREREIE+GVGKR+SRKLD+ WK+SIVVRPPPSLKKL+E+  A  EAEK+
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Q9FJP3 50S ribosomal protein L29, chloroplastic1.9e-4462.5Show/hide
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        M++LS+A+  +A        ++TS  S F+G++I+   S  VP     +      SVVMM+KRE ELK+IR+KTTE++ EEVVDLKGEL MLRLQKSARN
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        EFKSS+FRRM+K+++RMLTVKREREI+EG+ KR+SRKLDR+WKKSIV RPPPSLKKL+EEEAA E AE
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Q9SWI6 50S ribosomal protein L29, chloroplastic4.7e-3573.15Show/hide
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        R +++V MAKRE+EL++IRA TTE++ EEVVDLKGEL +LRL++SAR EFK+SEF RMRKRI+RMLTVKREREIE+G+ KR+SRKLDRKWK+SIVVRPPP
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        SL+  +EE
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G65220.1 Ribosomal L29 family protein1.3e-4562.5Show/hide
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        EFKSS+FRRM+K+++RMLTVKREREI+EG+ KR+SRKLDR+WKKSIV RPPPSLKKL+EEEAA E AE
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATAAACCTTTCAGTTGCTTCTTTACCTTCGGCCCTTCCAATCCCTTCAAAATTTCTTAATTCGACTTCCAAATCCTTCTTCAATGGCCTTCAAATCCGTTTCCCATT
TTCGTTTTGCGTTCCTCCTAAAACTGCAACTACTGGAGGAGGCCGCAATTCATCGGTGGTAATGATGGCCAAGAGGGAGGAGGAATTGAAGGATATAAGGGCCAAAACTA
CTGAGGAAATAAACGAAGAGGTCGTCGATCTTAAGGGTGAACTTCTTATGCTTCGTCTTCAAAAATCAGCCCGCAATGAGTTTAAGTCTAGCGAATTCCGCCGCATGCGC
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CAGACCACCTCCATCTCTGAAGAAGTTGCGAGAGGAAGAAGCAGCAGCTGAAGAAGCTGAGAAATCTGCTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TAGGGGTAAGAGGGTAATAGGGGATCTCGAAAAGTAACAATAGAAGTGCTGGGAGCTTATCTCATTCTTTAGTAGCAGAGCGCTCTTACAAACTTTGAAGATGATAAACC
TTTCAGTTGCTTCTTTACCTTCGGCCCTTCCAATCCCTTCAAAATTTCTTAATTCGACTTCCAAATCCTTCTTCAATGGCCTTCAAATCCGTTTCCCATTTTCGTTTTGC
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AAACGAAGAGGTCGTCGATCTTAAGGGTGAACTTCTTATGCTTCGTCTTCAAAAATCAGCCCGCAATGAGTTTAAGTCTAGCGAATTCCGCCGCATGCGCAAACGGATTT
CTCGGATGCTAACAGTAAAACGTGAGAGAGAGATTGAAGAGGGTGTGGGCAAAAGGATGTCAAGAAAGTTAGATAGAAAGTGGAAGAAAAGTATTGTTGTCAGACCACCT
CCATCTCTGAAGAAGTTGCGAGAGGAAGAAGCAGCAGCTGAAGAAGCTGAGAAATCTGCTTGAACGAATCAGATACATGCTCGCATTCAATCTTTATGAGTTTGAAGTTG
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GGATCATGTTGAATTTATATGCTTTCACTCCTTAATTTAAATTAGATAAAAGGTATGTTTGGGAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MINLSVASLPSALPIPSKFLNSTSKSFFNGLQIRFPFSFCVPPKTATTGGGRNSSVVMMAKREEELKDIRAKTTEEINEEVVDLKGELLMLRLQKSARNEFKSSEFRRMR
KRISRMLTVKREREIEEGVGKRMSRKLDRKWKKSIVVRPPPSLKKLREEEAAAEEAEKSA