; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0014815 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0014815
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionheterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1
Genome locationchr12:13384750..13389473
RNA-Seq ExpressionIVF0014815
SyntenyIVF0014815
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR034131 - DAZ-associated protein 1, RNA recognition motif 2
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0035665.1 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1 [Cucumis melo var. makuwa]0.0100Show/hide
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A0A1S3CK54 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 11.7e-271100Show/hide
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A0A5D3E516 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 11.7e-271100Show/hide
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A0A6J1CL94 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 12.4e-25794.56Show/hide
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A0A6J1EKS0 heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like isoform X11.7e-25092.26Show/hide
Query:  MDPGKLFIGGISWDTDEDRLREYFRNFGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPVAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGP
        MDPGKLFIGGISWDTDEDRLREYF++FGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPV AARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQN+LSRNNTGILGSPGP
Subjt:  MDPGKLFIGGISWDTDEDRLREYFRNFGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPVAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGP

Query:  TRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNF
        TRTKKIFVGGLASTVTESDFK YFDQFGTI DVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNR+QL  YPY F
Subjt:  TRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNF

Query:  GRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPVTVGRGGLSPISPGYGMGINLDTGLNPNYGTG--PSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGG
        GRVGSYLNGYNQGYNPTSVG YGLRSD RFSPVTVGRGGLSPISPGYG+G+NLDTGLNPNYGTG    SNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGG 
Subjt:  GRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPVTVGRGGLSPISPGYGMGINLDTGLNPNYGTG--PSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGG

Query:  GGNGSILSSSVQNLWGNVSNSAGTNSSHLRTFPGSGGVHTGTNSLNNIGGLWGTSASLGHGENGGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSS
        GGNGSILSSSVQNLWGNV NS GTNSSHLRTFPGSGGVHTGTNSLN IGGLWG SASL HGE+ GSPFN  NLDF +GD S TSGTTVGYARS+GTNVSS
Subjt:  GGNGSILSSSVQNLWGNVSNSAGTNSSHLRTFPGSGGVHTGTNSLNNIGGLWGTSASLGHGENGGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTNVSS

Query:  ASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLPTELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
        ASLYSAPNIYDEVHGNNDEGN+FYGHSSWQ LPTELEDSSS+GFGLGNAASDVISRNN GYTVGYGVSNRQSNRGIAA
Subjt:  ASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLPTELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8W034 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 15.3e-6037.83Show/hide
Query:  DPGKLFIGGISWDTDEDRLREYFRNFGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPVAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSR----NNTGILGS
        D GKLF+GGISW+TDED+LRE+F N+GEV + ++MRD+ TGR RGFGFV+F+DP    RV+ EKH ID R V+ K+A+ R++Q +  R    N +   G 
Subjt:  DPGKLFIGGISWDTDEDRLREYFRNFGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPVAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSR----NNTGILGS

Query:  PGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYP
            +TKKIFVGGL  T+T+ +F++YF+ +G + DV +MYD  T RPRGFGF++++SE++V+ VL+KTFH+L+GK VEVKRA+PK+++P      + G  
Subjt:  PGPTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYP

Query:  YNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRF-SPVTVGRGGLSPISPGYGMGINLDTGLNPNYGTGPSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGG
           G  G Y     QGY        G     RF    +VG G  S  S GYG G          YG G S+   YG      Y G+   YG+     YG 
Subjt:  YNFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRF-SPVTVGRGGLSPISPGYGMGINLDTGLNPNYGTGPSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGG

Query:  ---GGGGNGSILSSSVQNLWGNVSNSAGTNSSHLRTFPGSGGVHTG----------------TNSLNNIGGLWGTSASLGH------------GENGGSP
            G G GS    + +N W   ++S   N  +     GSG  H+G                +N     GG  G+ +  G+            G    +P
Subjt:  ---GGGGNGSILSSSVQNLWGNVSNSAGTNSSHLRTFPGSGGVHTG----------------TNSLNNIGGLWGTSASLGH------------GENGGSP

Query:  FNTANLDFGNGDASFTSGTTVGY
         +   +  G GD S+ S  + GY
Subjt:  FNTANLDFGNGDASFTSGTTVGY

Q920Q6 RNA-binding protein Musashi homolog 21.9e-4638.68Show/hide
Query:  DPGKLFIGGISWDTDEDRLREYFRNFGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPVAAARVVLE-KHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGP
        DPGK+FIGG+SW T  D LR+YF  FGE+ E M+MRD TT R+RGFGFV FADP +  +V+ +  H +D +T++ K A PR  Q  +             
Subjt:  DPGKLFIGGISWDTDEDRLREYFRNFGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPVAAARVVLE-KHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGP

Query:  TRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKE-SSPVPNRNQLAGYPY-
        TRTKKIFVGGL++     D K+YF+QFG + D ++M+D  T R RGFGF+T+E+E+ VEKV    FHE+N KMVE K+A PKE   P   R +  G PY 
Subjt:  TRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKE-SSPVPNRNQLAGYPY-

Query:  ------NFGRVG--SYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPVTVGRGGLSPISPGYGMGINLDTGLNPNYGTGPSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPN
                G +G  +++  Y +GY P     YG +  G F     G    + ++   G  +N                 SY     P++G   +  GS N
Subjt:  ------NFGRVG--SYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPVTVGRGGLSPISPGYGMGINLDTGLNPNYGTGPSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPN

Query:  PMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVSNSAGTNS--SHLRTFPGSGGVH
        P   GG  G N       V +L+G  S  +G  +  S     PGSG  H
Subjt:  PMVYGGGGGGNGSILSSSVQNLWGNVSNSAGTNS--SHLRTFPGSGGVH

Q96DH6 RNA-binding protein Musashi homolog 23.5e-4841.08Show/hide
Query:  DPGKLFIGGISWDTDEDRLREYFRNFGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPVAAARVVLE-KHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGP
        DPGK+FIGG+SW T  D LR+YF  FGE+ E M+MRD TT R+RGFGFV FADP +  +V+ +  H +D +T++ K A PR  Q  +             
Subjt:  DPGKLFIGGISWDTDEDRLREYFRNFGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPVAAARVVLE-KHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGP

Query:  TRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKE-SSPVPNRNQLAGYPY-
        TRTKKIFVGGL++     D K+YF+QFG + D ++M+D  T R RGFGF+T+E+E+ VEKV    FHE+N KMVE K+A PKE   P   R +  G PY 
Subjt:  TRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKE-SSPVPNRNQLAGYPY-

Query:  ------NFGRVG--SYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPVTVGRGGLSPISPGYGMGIN--LDTGLNPNYGTGPSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGS
                G +G  +++  Y +GY P     YG +  G F     G    + ++   G G N     G       GP ++L YG     S  GN     S
Subjt:  ------NFGRVG--SYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPVTVGRGGLSPISPGYGMGIN--LDTGLNPNYGTGPSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGS

Query:  PNPMVYGGGGGGNG
        P P    G G G+G
Subjt:  PNPMVYGGGGGGNG

Q96EP5 DAZ-associated protein 12.4e-4437.11Show/hide
Query:  GKLFIGGISWDTDEDRLREYFRNFGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPVAAARVVLEK-HVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTR
        GKLF+GG+ W T ++ LR YF  +GEVV+ +IM+D+TT ++RGFGFV F DP     V+  + H +DGR ++ K   PR  Q   +R   G    P    
Subjt:  GKLFIGGISWDTDEDRLREYFRNFGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPVAAARVVLEK-HVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGPTR

Query:  TK--KIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYP---
        +K  KIFVGG+     E++ ++YF +FG + +VV++YD   QRPRGFGFIT+E E+SV++ +   FH++ GK VEVKRA P++S     ++Q  G P   
Subjt:  TK--KIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYP---

Query:  -YNFGRVGSYLNG--------YNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPVTVGRGGLSPISPGYGMGINLDTGLNP-------NYGTGPSSNLSYG
         +    V +  NG        + QGY P  +     ++ G + P   GRG   P  P     ++   G  P        YG  P  +  YG
Subjt:  -YNFGRVGSYLNG--------YNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPVTVGRGGLSPISPGYGMGINLDTGLNP-------NYGTGPSSNLSYG

Q9JII5 DAZ-associated protein 18.2e-4537.11Show/hide
Query:  GKLFIGGISWDTDEDRLREYFRNFGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPVAAARVVLEK-HVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSP--GP
        GKLF+GG+ W T ++ LR YF  +GEVV+ +IM+D+TT ++RGFGFV F DP     V+  + H +DGR ++ K   PR  Q   +R   G    P    
Subjt:  GKLFIGGISWDTDEDRLREYFRNFGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPVAAARVVLEK-HVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSP--GP

Query:  TRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYP---
        +++ KIFVGG+     E++ ++YF +FG + +VV++YD   QRPRGFGFIT+E E+SV++ +   FH++ GK VEVKRA P++S     +NQ  G P   
Subjt:  TRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYP---

Query:  -YNFGRVGSYLNG--------YNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPVTVGRGGLSPISPGYGMGINLDTGLNP-------NYGTGPSSNLSYG
         +      S  NG        + QGY P  +     ++ G + P   GRG   P  P     ++   G  P        YG  P  +  YG
Subjt:  -YNFGRVGSYLNG--------YNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPVTVGRGGLSPISPGYGMGINLDTGLNP-------NYGTGPSSNLSYG

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G07810.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein6.7e-12756.31Show/hide
Query:  DPGKLFIGGISWDTDEDRLREYFRNFGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPVAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSR-NNTGILGSP-G
        D GKLFIGGISWDT+E+RL+EYF +FGEV+E +I++DRTTGRARGFGFVVFADP  A  V+ EKH IDGR VEAKKAVPRDDQN+++R N++ I GSP G
Subjt:  DPGKLFIGGISWDTDEDRLREYFRNFGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPVAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSR-NNTGILGSP-G

Query:  PTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQL-AGYPY
        P RT+KIFVGGL S+VTESDFK YF+QFGT  DVVVMYDHNTQRPRGFGFITY+SEE+VEKVL KTFHELNGKMVEVKRAVPKE SP P+R+ L AGY Y
Subjt:  PTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQL-AGYPY

Query:  NFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPVTVGRGGLSPISPGYGMGINLDTGLNPNY--GTGPSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGG
           RV + LNGY QG+NP +VGGYGLR DGRFSPV  GR G +  S GYGM +N D GL   +  GT  + N+ YGR MSP Y GN NR+G P     GG
Subjt:  NFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPVTVGRGGLSPISPGYGMGINLDTGLNPNY--GTGPSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGG

Query:  GGGGNGSILSSSVQNLWGNVS----NSAGTNSSHLRTFPG--SGGVHTGTNSLNNIGGLWGTSASLGHGENGGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYAR
         GGGN S  SS  +NLWGN      N+  TNS+   T+ G  S G +T +    N G  WG     G G N  S  N      GNG++ F  GT    AR
Subjt:  GGGGNGSILSSSVQNLWGNVS----NSAGTNSSHLRTFPG--SGGVHTGTNSLNNIGGLWGTSASLGHGENGGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYAR

Query:  SIGTN----VSSASLYSAPNI--YD-----EVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLPTELEDSSSIGFGLGNA--ASDVISRNNA-GYTVGYGVSNRQSNRGIA
        + G N     SS S  SA N   YD     E +GN       Y   +W+S   E E  +   +G+G    +SDV +R+++ GY   Y V+ RQ NRGIA
Subjt:  SIGTN----VSSASLYSAPNI--YD-----EVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLPTELEDSSSIGFGLGNA--ASDVISRNNA-GYTVGYGVSNRQSNRGIA

AT3G07810.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein7.4e-12656.14Show/hide
Query:  DPGKLFIGGISWDTDEDRLREYFRNFGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPVAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSR-NNTGILGSP-G
        D GKLFIGGISWDT+E+RL+EYF +FGEV+E +I++DRTTGRARGFGFVVFADP  A  V+ EKH IDGR VEAKKAVPRDDQN+++R N++ I GSP G
Subjt:  DPGKLFIGGISWDTDEDRLREYFRNFGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPVAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSR-NNTGILGSP-G

Query:  PTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQL-AGYPY
        P RT+KIFVGGL S+VTESDFK YF+QFGT  DVVVMYDHNTQRPRGFGFITY+SEE+VEKVL KTFHELNGKMVEVKRAVPKE SP P+R+ L AGY Y
Subjt:  PTRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQL-AGYPY

Query:  NFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPVTVGRGGLSPISPGYGMGINLDTGLNPNY--GTGPSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGG
           RV + LNGY QG+NP +VGGYGLR DGRFSPV  GR G +  S GYGM +N D GL   +  GT  + N+ YGR MSP Y GN NR+G P     GG
Subjt:  NFGRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPVTVGRGGLSPISPGYGMGINLDTGLNPNY--GTGPSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGG

Query:  GGGGNGSILSSSVQNLWGNVS----NSAGTNSSHLRTFPG--SGGVHTGTNSLNNIGGLWGTSASLGHGENGGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYAR
         GGGN S  SS  +NLWGN      N+  TNS+   T+ G  S G +T +    N G  WG     G G N  S  N      GNG++ F  GT    AR
Subjt:  GGGGNGSILSSSVQNLWGNVS----NSAGTNSSHLRTFPG--SGGVHTGTNSLNNIGGLWGTSASLGHGENGGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYAR

Query:  SIGTN----VSSASLYSAPNI--YD-----EVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLPTELEDSSSIGFGLGNA--ASDVISRNNA-GYTVGYGVSNRQSNRG
        + G N     SS S  SA N   YD     E +GN       Y   +W+S   E E  +   +G+G    +SDV +R+++ GY   Y V+ RQ NRG
Subjt:  SIGTN----VSSASLYSAPNI--YD-----EVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLPTELEDSSSIGFGLGNA--ASDVISRNNA-GYTVGYGVSNRQSNRG

AT5G47620.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.7e-10949.9Show/hide
Query:  MDPGKLFIGGISWDTDEDRLREYFRNFGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPVAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGP
        M+  KLFIGGISW+T EDRLR+YF +FGEV+E +IM+DR TGRARGFGFVVFADP  A RVVL KH+IDG+ VEAKKAVPRDD  + +++N+ + GSPGP
Subjt:  MDPGKLFIGGISWDTDEDRLREYFRNFGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPVAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGP

Query:  TRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNF
        + +KKIFVGGLAS+VTE++FKKYF QFG I DVVVMYDH TQRPRGFGFI+Y+SEE+V+KVL KTFHELNGKMVEVK AVPK+ +    RNQ+    +  
Subjt:  TRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNF

Query:  GRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPVTVGRGGLSPISPGYGMGINLDTGLNPNYGTGPSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGG
         R+ S LN Y QG++P+ + GYG++ + R+SP    RGG SP   GYG+ +N +     NYG+G S    +GR  SP Y  +L R+GS   M  GG   G
Subjt:  GRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPVTVGRGGLSPISPGYGMGINLDTGLNPNYGTGPSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGG

Query:  NGSILSSSVQN-LWGNVSNSAGTNSSHLR-TFPGSGGVHTGTNSLNNIGGLWGTSA---SLGHGENGGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTN
        NGS+L+++ +N LWGN      +NS   R +F G+ G+    +SL +IG  WGT A   S  HGE GG                      VG     G +
Subjt:  NGSILSSSVQN-LWGNVSNSAGTNSSHLR-TFPGSGGVHTGTNSLNNIGGLWGTSA---SLGHGENGGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTN

Query:  VSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLPTELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
        V   S  S  +I         E ++ Y  S W SLP + E+      GLG    D +SR  AGY       NRQ N GIAA
Subjt:  VSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLPTELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA

AT5G47620.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.7e-10949.9Show/hide
Query:  MDPGKLFIGGISWDTDEDRLREYFRNFGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPVAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGP
        M+  KLFIGGISW+T EDRLR+YF +FGEV+E +IM+DR TGRARGFGFVVFADP  A RVVL KH+IDG+ VEAKKAVPRDD  + +++N+ + GSPGP
Subjt:  MDPGKLFIGGISWDTDEDRLREYFRNFGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPVAAARVVLEKHVIDGRTVEAKKAVPRDDQNILSRNNTGILGSPGP

Query:  TRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNF
        + +KKIFVGGLAS+VTE++FKKYF QFG I DVVVMYDH TQRPRGFGFI+Y+SEE+V+KVL KTFHELNGKMVEVK AVPK+ +    RNQ+    +  
Subjt:  TRTKKIFVGGLASTVTESDFKKYFDQFGTIVDVVVMYDHNTQRPRGFGFITYESEESVEKVLYKTFHELNGKMVEVKRAVPKESSPVPNRNQLAGYPYNF

Query:  GRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPVTVGRGGLSPISPGYGMGINLDTGLNPNYGTGPSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGG
         R+ S LN Y QG++P+ + GYG++ + R+SP    RGG SP   GYG+ +N +     NYG+G S    +GR  SP Y  +L R+GS   M  GG   G
Subjt:  GRVGSYLNGYNQGYNPTSVGGYGLRSDGRFSPVTVGRGGLSPISPGYGMGINLDTGLNPNYGTGPSSNLSYGRVMSPSYGGNLNRYGSPNPMVYGGGGGG

Query:  NGSILSSSVQN-LWGNVSNSAGTNSSHLR-TFPGSGGVHTGTNSLNNIGGLWGTSA---SLGHGENGGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTN
        NGS+L+++ +N LWGN      +NS   R +F G+ G+    +SL +IG  WGT A   S  HGE GG                      VG     G +
Subjt:  NGSILSSSVQN-LWGNVSNSAGTNSSHLR-TFPGSGGVHTGTNSLNNIGGLWGTSA---SLGHGENGGSPFNTANLDFGNGDASFTSGTTVGYARSIGTN

Query:  VSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLPTELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA
        V   S  S  +I         E ++ Y  S W SLP + E+      GLG    D +SR  AGY       NRQ N GIAA
Subjt:  VSSASLYSAPNIYDEVHGNNDEGNTFYGHSSWQSLPTELEDSSSIGFGLGNAASDVISRNNAGYTVGYGVSNRQSNRGIAA

AT5G47620.4 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein8.5e-10647.71Show/hide
Query:  MDPGKLFIGGISWDTDEDRLREYFRNFGEVVEVMIMRDRTTGRARGFGFVVFADPVAAARVVLEKHVIDGR----------------------TVEAKKA
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        VPRDD  + +++N+ + GSPGP+ +KKIFVGGLAS+VTE++FKKYF QFG I DVVVMYDH TQRPRGFGFI+Y+SEE+V+KVL KTFHELNGKMVEVK 
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        AVPK+ +    RNQ+    +   R+ S LN Y QG++P+ + GYG++ + R+SP    RGG SP   GYG+ +N +     NYG+G S    +GR  SP 
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        Y  +L R+GS   M  GG   GNGS+L+++ +N LWGN      +NS   R +F G+ G+    +SL +IG  WGT A   S  HGE GG          
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                    VG     G +V   S  S  +I         E ++ Y  S W SLP + E+      GLG    D +SR  AGY       NRQ N G
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        IAA
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TGGATTTATCACTTACGAGTCAGAGGAATCGGTGGAGAAAGTGTTATACAAAACTTTTCATGAACTCAATGGTAAAATGGTTGAGGTTAAGAGGGCTGTTCCAAAGGAAT
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ATGGTGGTGGTGGTGGAGGTAATGGTTCTATTTTAAGCTCGTCAGTTCAGAATCTGTGGGGAAATGTCAGTAACTCTGCTGGTACGAATTCCTCACACTTGAGGACTTTT
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G
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AATGGTTGAGGTTAAGAGGGCTGTTCCAAAGGAATCATCACCGGTGCCAAATCGAAATCAATTAGCTGGATATCCTTACAATTTTGGTAGAGTTGGTAGCTATTTAAATG
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TTTAAATAGGTACGGTAGCCCAAACCCCATGGTATATGGTGGTGGTGGTGGAGGTAATGGTTCTATTTTAAGCTCGTCAGTTCAGAATCTGTGGGGAAATGTCAGTAACT
CTGCTGGTACGAATTCCTCACACTTGAGGACTTTTCCTGGCTCTGGTGGTGTGCATACAGGAACTAATTCATTAAACAATATCGGAGGGCTTTGGGGTACTTCTGCAAGT
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TCTAATAGACAATCTAATAGAGGAATTGCTGCTTAGGAAGAAGGTGATACAACAGATGTCAAAAATTATAGTAGGTGATGCGTATTTCAGTAAAGCAGGTGTACTGCAAT
TTTTCGTATAATTTCGCCCTTGTGATACACTCCCATTTGATACTGTCAGAGCTAATTTGTTTTCTGTTTCACAAACTGTCCCATAAAGAAGCAGGTTCCAGAGGGTTTTC
TCTTGGTCAGGATTGAGCTTGAAAATATAGGTCTTTCTTCTTTCTTCTTCTACTACTTTCTTTCTTTCTTGTAATTTGATTGATATGTATAATTGGATTGTGGGTAAGGT
ATATATGCAGAACTGTTGCATAATACGCTACTCCGATAAATGATGTCACACGAACGAATCAACATCTTCTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTCTCCTTTTCTTTTCGG
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TGATTTAGTGGTGTGATATTATCCAGCTTCCCAATTCTTCTTTGTTGTAAATTTAGCTCCTTTTTGAGCTAAACCAAAGTTTTCTAAGCTAAGAAACAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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