; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0014905 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0014905
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionethylene-responsive transcription factor 12
Genome locationchr12:21055364..21056363
RNA-Seq ExpressionIVF0014905
SyntenyIVF0014905
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001471 - AP2/ERF domain
IPR016177 - DNA-binding domain superfamily
IPR036955 - AP2/ERF domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8652722.1 hypothetical protein Csa_014191 [Cucumis sativus]7.81e-8091.91Show/hide
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XP_008442801.1 PREDICTED: ethylene-responsive transcription factor 12 [Cucumis melo]1.20e-9197.81Show/hide
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XP_023001756.1 ethylene-responsive transcription factor 12 [Cucurbita maxima]1.29e-6074.65Show/hide
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XP_038895107.1 ethylene-responsive transcription factor 12 [Benincasa hispida]4.45e-7280.29Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LSE4 AP2/ERF domain-containing protein9.6e-6492.09Show/hide
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A0A1S3B631 ethylene-responsive transcription factor 122.0e-6997.81Show/hide
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A0A5D3DSV2 Ethylene-responsive transcription factor 122.0e-6997.81Show/hide
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A0A6J1EKE1 ethylene-responsive transcription factor 12-like4.5e-4573.1Show/hide
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A0A6J1KJH9 ethylene-responsive transcription factor 126.9e-4674.65Show/hide
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        + ASP LVD+   A +T +ASF+GHVRRGLPFDLNEPPPVWL
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q94ID6 Ethylene-responsive transcription factor 124.3e-2143.98Show/hide
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         GV ND  +      +P+   +S  +A+S+     +G            VRRGL  DLNEPPP+WL
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Q9C5I3 Ethylene-responsive transcription factor 111.7e-0938.85Show/hide
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        P +++RVWLGTFDTPEEAA AYD  A   RG+KAKTNFP        LSL  ++S      +S P  +  S S SS             R     + V A
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           V  + S S SS+     + +  R   L  DLN PPP
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Q9FE67 Ethylene-responsive transcription factor 91.2e-1035.29Show/hide
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        P ++TRVWLGTFDT EEAA AYD AAR  RGSKAKTNF  PLPG S  +N  G   +  +    +++   +                  +SA F      
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           +R ++  +      PV ++ S     T         RR L  DLN  PPV
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Q9LW49 Ethylene-responsive transcription factor 42.2e-0973.17Show/hide
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        P +++RVWLGTFDT EEAA AYD AAR  RG KAKTNFP P
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Q9SXS8 Ethylene-responsive transcription factor 37.7e-1032.95Show/hide
Query:  PLEETRVWLGTFDTPEEAALAYDGAARSLRGSKAKTNFPPPLPG--------------------LSLDLNVSGPWPTPTS------------APPCSSSS
        P ++TRVWLGTFD+ E+AA AYD AAR+LRG KAKTNFP P                          D  +    PT +S             PP     
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Query:  SSSSSARFLLGDFLRHGVRNDMCNLNVDAASPVL------VDTSASASSTASASFIGHVRRGLPFDLNEPPPV
        +++SS ++         V  D C+ + D++S V+       +      + AS+SF    R+ L FDLN PPP+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G24590.1 DORNROSCHEN-like1.2e-1066.67Show/hide
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        PL + R WLGTFDT EEAA AYD AAR++RG KA+TNF  P+P L
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AT1G28360.1 ERF domain protein 123.1e-2243.98Show/hide
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        P ++TRVWLGTFDTPEEAALAYDGAAR LRG KAKTNFP P   LSLDLN     P+  +A                 PP   SS        +   FLR
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         GV ND  +      +P+   +S  +A+S+     +G            VRRGL  DLNEPPP+WL
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AT1G28370.1 ERF domain protein 111.2e-1038.85Show/hide
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        P +++RVWLGTFDTPEEAA AYD  A   RG+KAKTNFP        LSL  ++S      +S P  +  S S SS             R     + V A
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           V  + S S SS+     + +  R   L  DLN PPP
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AT3G15210.1 ethylene responsive element binding factor 47.1e-1176.92Show/hide
Query:  PLEETRVWLGTFDTPEEAALAYDGAARSLRGSKAKTNFP
        P ++TRVWLGTFDT EEAA AYD AAR  RG+KAKTNFP
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AT5G44210.1 erf domain protein 98.4e-1235.29Show/hide
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        P ++TRVWLGTFDT EEAA AYD AAR  RGSKAKTNF  PLPG S  +N  G   +  +    +++   +                  +SA F      
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Query:  RHGVRNDMCNLNVDAASPVLVDTSASASSTASASFIGHVRRGLPFDLNEPPPV
           +R ++  +      PV ++ S     T         RR L  DLN  PPV
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGTCGTTACGCCGCCGAAATACGCGACCCTTGGAAGAAACCCGTGTTTGGTTAGGCACTTTCGATACTCCTGAAGAAGCCGCCCTTGCTTACGACGGTGCTGCCCG
TTCCCTCCGCGGCTCTAAAGCTAAAACCAACTTCCCTCCTCCCCTCCCTGGTCTCTCCCTCGACCTCAACGTATCCGGTCCTTGGCCCACCCCTACCTCTGCACCCCCTT
GTTCCTCCTCCTCCTCGTCCTCGTCCTCAGCTCGTTTTCTCCTCGGCGATTTCCTCCGTCACGGCGTCAGAAATGATATGTGTAATCTCAATGTGGATGCAGCCTCTCCG
GTTCTTGTGGACACAAGCGCTTCAGCTTCTTCCACAGCTTCCGCGTCGTTTATTGGTCATGTCCGACGTGGCCTCCCTTTTGATCTCAACGAGCCTCCACCGGTGTGGCT
ATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCCCTCTCTACTAATCAAAATTCCTATAATTATCGTTTGTATTTATATATTTTATGTGTAGTTTATGCCGTCTACCCGACGATTACGGGTGACTTAGTGGGTCCCTTCTT
TCTTTTCCCCCTTCCACTTCAAACTTCTTCTCTTCCTTTTTATTTTCACTTCCCACATAATCCCTTTTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAATTTCTTTCTTCCCCA
CAAAACAAAACCCCTTTTACTTTTTCTTCACTTCATCTTCATCTTCATGGCTTCCACTCGCGAAGGTCACTACAGAGGCGTCCGAAAGCGTCCATGGGGTCGTTACGCCG
CCGAAATACGCGACCCTTGGAAGAAACCCGTGTTTGGTTAGGCACTTTCGATACTCCTGAAGAAGCCGCCCTTGCTTACGACGGTGCTGCCCGTTCCCTCCGCGGCTCTA
AAGCTAAAACCAACTTCCCTCCTCCCCTCCCTGGTCTCTCCCTCGACCTCAACGTATCCGGTCCTTGGCCCACCCCTACCTCTGCACCCCCTTGTTCCTCCTCCTCCTCG
TCCTCGTCCTCAGCTCGTTTTCTCCTCGGCGATTTCCTCCGTCACGGCGTCAGAAATGATATGTGTAATCTCAATGTGGATGCAGCCTCTCCGGTTCTTGTGGACACAAG
CGCTTCAGCTTCTTCCACAGCTTCCGCGTCGTTTATTGGTCATGTCCGACGTGGCCTCCCTTTTGATCTCAACGAGCCTCCACCGGTGTGGCTATGATCCATTCAACAAA
CCAACCGGCGTTTTTTACGGACATCATTCTCTCATTTCCCTTTTTATTTTTATTTTTAACCGTCCTTTGTATCCACTTTTTCCACCCCCCAAGATTAAAAAAATACATAT
GTTGTAAATACAAGTTTTGGTGGATATTATTGATTGGTCTCTTCCATACTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCCTTTATATTTTACTATTATTATTATTATTATTATTAT
TATTATTATT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGSLRRRNTRPLEETRVWLGTFDTPEEAALAYDGAARSLRGSKAKTNFPPPLPGLSLDLNVSGPWPTPTSAPPCSSSSSSSSSARFLLGDFLRHGVRNDMCNLNVDAASP
VLVDTSASASSTASASFIGHVRRGLPFDLNEPPPVWL