; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0015073 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0015073
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionTransposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein
Genome locationchr04:7127973..7128143
RNA-Seq ExpressionIVF0015073
SyntenyIVF0015073
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0026294.1 cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]9.89e-1169.05Show/hide
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        A+SKDM NACKE+FGD+ YLS+ITS IC+PK E VW  G ER
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KAA0032002.1 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]9.19e-1054.72Show/hide
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        +SKD+ N C+EEFGD  +  +ITS IC P+   VWAIG ERL  L EK+Y  Y
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KAA0062632.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold79G001430 [Cucumis melo var. makuwa]2.69e-0457.89Show/hide
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        M N  KEEF +K +L + TS IC PK   VWAIG+ERL
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TYK07860.1 uncharacterized protein E5676_scaffold1933G00010 [Cucumis melo var. makuwa]6.27e-1361.54Show/hide
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        SKDM N CKEEF    ++ EITS  C+PK E VW +  ERL PLKEKYYK Y
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5D3C951 Uncharacterized protein3.3e-0961.54Show/hide
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        SKDM N CKEEF    ++ EITS  C+PK E VW +  ERL PLKEKYYK Y
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A0A5D3CY29 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein2.7e-0654.72Show/hide
Query:  NSKDMTNACKEEFGDKPYLSEITSTICIPKEEIVWAIGIERLSPLKEKYYKPY
        +SKD+ N C+EEFGD  +  +ITS IC P+   VWAIG ERL  L EK+Y  Y
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A0A5D3DDG5 Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein1.1e-0769.05Show/hide
Query:  ANSKDMTNACKEEFGDKPYLSEITSTICIPKEEIVWAIGIER
        A+SKDM NACKE+FGD+ YLS+ITS IC+PK E VW  G ER
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAAATAGCAAGGATATGACTAATGCGTGCAAAGAGGAATTTGGAGACAAACCCTACCTTAGCGAGATAACTTCCACCATTTGTATTCCGAAAGAAGAAATAGTGTG
GGCAATAGGCATCGAGAGGTTGTCACCCTTAAAAGAGAAGTACTATAAGCCTTATATGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAAATAGCAAGGATATGACTAATGCGTGCAAAGAGGAATTTGGAGACAAACCCTACCTTAGCGAGATAACTTCCACCATTTGTATTCCGAAAGAAGAAATAGTGTG
GGCAATAGGCATCGAGAGGTTGTCACCCTTAAAAGAGAAGTACTATAAGCCTTATATGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MANSKDMTNACKEEFGDKPYLSEITSTICIPKEEIVWAIGIERLSPLKEKYYKPYM