; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0015438 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0015438
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description50S ribosomal protein L7/L12
Genome locationchr05:18701694..18702275
RNA-Seq ExpressionIVF0015438
SyntenyIVF0015438
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000206 - Ribosomal protein L7/L12
IPR013823 - Ribosomal protein L7/L12, C-terminal
IPR014719 - Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008450561.1 PREDICTED: 50S ribosomal protein L7/L12 [Cucumis melo]1.15e-126100Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD
        MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD

Query:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
        GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME

XP_011651634.1 uncharacterized protein LOC101206962 [Cucumis sativus]3.39e-11994.82Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD
        MKLTVVA+SLQ RST  KIIGLSQVRFFQPDFTPRDP AKPKKYKYP FYDPYGPRPPPSDKII LAERI ALPAAER QIGPTLGEKLRHPKLQEISVD
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD

Query:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
        GLDMG EGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME

XP_022949504.1 uncharacterized protein LOC111452831 [Cucurbita moschata]1.11e-10886.53Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD
        MK+  VA+SLQARSTL KIIGL QVRFFQPDFTPRDP AKPK+YKYPPFYDPYGPRPPPS+KII LAERIAALP  ER QIGP L E+L+HPKL++ISVD
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD

Query:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
        G+DMGS GGAA GSS VEEKKEKTAFDVKLEKF+AA+KIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME

XP_023525921.1 uncharacterized protein LOC111789392 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.51e-10987.05Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD
        MK+  VA+SLQARSTL KIIG  QVRFFQPDFTPRDP AKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPS+KII LAERIAALP  ER QIGPTL E+L+HPKL++ISVD
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD

Query:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
        G+DMGS GGAA GSS VEEKKEKTAFDVKLEKF+AA+KIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME

XP_038905834.1 50S ribosomal protein L7/L12 [Benincasa hispida]4.05e-11189.64Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD
        MKLTVVARSLQ RST  KIIGLSQVRFFQ DF  RDP AKPK+YKYPPFYDPYGPRPPPSDKII LAERIAALPA +R QIGPTL E+L+HPKLQ ISVD
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD

Query:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
        GLDMGSEGGA AGSS VEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVR+FTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L907 Ribosomal_L12 domain-containing protein2.4e-9194.82Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD
        MKLTVVA+SLQ RST  KIIGLSQVRFFQPDFTPRDP AKPKKYKYP FYDPYGPRPPPSDKII LAERI ALPAAER QIGPTLGEKLRHPKLQEISVD
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD

Query:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
        GLDMG EGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME

A0A1S3BPI3 50S ribosomal protein L7/L125.1e-97100Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD
        MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD

Query:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
        GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME

A0A5A7U2A3 50S ribosomal protein L7/L125.1e-97100Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD
        MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD

Query:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
        GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME

A0A6J1GD07 uncharacterized protein LOC1114528312.4e-8386.53Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD
        MK+  VA+SLQARSTL KIIGL QVRFFQPDFTPRDP AKPK+YKYPPFYDPYGPRPPPS+KII LAERIAALP  ER QIGP L E+L+HPKL++ISVD
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD

Query:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
        G+DMGS GGAA GSS VEEKKEKTAFDVKLEKF+AA+KIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME

A0A6J1K6S5 uncharacterized protein LOC1114928123.2e-8386.01Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD
        MK+  VA+SLQARS L KIIGL QVRFFQPDFTPRDP AKPK+YKYPPFYDPYGPRPPPS+KII LAERIAALP  ER QIGP L E+L+HPKL++ISVD
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD

Query:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
        G+D+GSEGGAA GSS VEEKKEKTAFDVKLEKF+AA+KIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2C031 50S ribosomal protein L7/L128.0e-1552.94Show/hide
Query:  GAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
        GAAAG    +  +EKT F+V LE FDA+SKIKV+KEVR  T LGL EAK LVE  P  +K+G TKE+A  + + I+A GG   ++
Subjt:  GAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME

A9BDG4 50S ribosomal protein L7/L121.5e-1347.31Show/hide
Query:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
        G+ M + G     S+  E  +EKT FDV LE FDAA+KIKV+KEVR  T LGL EAK +VE  P  +K+G +KE+A  + + I+A GG   ++
Subjt:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME

P41189 50S ribosomal protein L7/L121.8e-1439.23Show/hide
Query:  IIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVDGLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEK
        I ++ E++++L   + +++   L E+        ++V     G    A A         EKT F+V LE FDA  KI VIKEVRA T LGLKEAKD VE 
Subjt:  IIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVDGLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEK

Query:  VPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVM
         P  LK GV+K+EA  + +K++AAG   ++
Subjt:  VPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVM

Q46HH2 50S ribosomal protein L7/L122.3e-1451.76Show/hide
Query:  GAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
        GAAAG    +  +EKT F+V LE F+A+SKIKV+KEVR  T LGL EAK LVE  P  +K+G TKE+A  + + I+A GG   ++
Subjt:  GAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME

Q7U3T9 50S ribosomal protein L7/L122.6e-1350.59Show/hide
Query:  GAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
        GAAAG    E  +EKT FDV LE FDAA+KIKV+K VR  T LGL +AK LVE  P  +K+G++K+EA  + ++I+  GG   ++
Subjt:  GAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G70190.1 Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation;Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like7.1e-2744.24Show/hide
Query:  DPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISV------DGLDMGSEGGAAAGSSNVEEKK-EKTAFDV
        D +  P  Y  P  +DP   R PP+D++  L + I++L   E S++G  + +K    +L  ++V       G+ +G  GG  + S   EE K EKT F++
Subjt:  DPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISV------DGLDMGSEGGAAAGSSNVEEKK-EKTAFDV

Query:  KLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
        KLE F+A++KIK+IKE+R+FT+LGLKEAK LVEK PAILK G++KEE   I+EK+KA G   V+E
Subjt:  KLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME

AT1G70190.2 Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation;Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like7.1e-2744.24Show/hide
Query:  DPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISV------DGLDMGSEGGAAAGSSNVEEKK-EKTAFDV
        D +  P  Y  P  +DP   R PP+D++  L + I++L   E S++G  + +K    +L  ++V       G+ +G  GG  + S   EE K EKT F++
Subjt:  DPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISV------DGLDMGSEGGAAAGSSNVEEKK-EKTAFDV

Query:  KLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
        KLE F+A++KIK+IKE+R+FT+LGLKEAK LVEK PAILK G++KEE   I+EK+KA G   V+E
Subjt:  KLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME

AT3G06040.1 Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein6.0e-5866.84Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD
        MKL  + R++++R    ++I   QVRF Q D      KAKPKKYKYP  YDPYGPRP PS KI+ LAERIAAL   ER QIGP L E LR PK Q IS D
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD

Query:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
        G+    + GA     NVEEKKEKTAFDVKLEKF+A+ KIKVIKEVR FT+LGLKEAK+LVEKVPAILKQGVTKEEAN II KIKA GG+AVME
Subjt:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME

AT3G06040.2 Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein6.0e-5866.84Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD
        MKL  + R++++R    ++I   QVRF Q D      KAKPKKYKYP  YDPYGPRP PS KI+ LAERIAAL   ER QIGP L E LR PK Q IS D
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD

Query:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
        G+    + GA     NVEEKKEKTAFDVKLEKF+A+ KIKVIKEVR FT+LGLKEAK+LVEKVPAILKQGVTKEEAN II KIKA GG+AVME
Subjt:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME

AT3G06040.3 Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein6.0e-5866.84Show/hide
Query:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD
        MKL  + R++++R    ++I   QVRF Q D      KAKPKKYKYP  YDPYGPRP PS KI+ LAERIAAL   ER QIGP L E LR PK Q IS D
Subjt:  MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVD

Query:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME
        G+    + GA     NVEEKKEKTAFDVKLEKF+A+ KIKVIKEVR FT+LGLKEAK+LVEKVPAILKQGVTKEEAN II KIKA GG+AVME
Subjt:  GLDMGSEGGAAAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGCTGACTGTAGTTGCACGATCCCTTCAAGCCCGTTCCACACTTACTAAAATAATTGGGTTGTCGCAGGTCCGCTTCTTTCAGCCTGATTTTACTCCTAGGGACCC
AAAGGCCAAGCCAAAAAAGTACAAGTATCCACCATTTTATGATCCATATGGCCCTAGGCCCCCACCCTCTGATAAAATCATTGCGCTTGCTGAAAGAATTGCAGCACTGC
CTGCTGCTGAGCGTTCCCAGATTGGTCCCACACTCGGCGAAAAACTTAGACATCCTAAGCTGCAGGAAATTTCAGTGGATGGCTTGGACATGGGTTCGGAAGGAGGGGCA
GCGGCAGGATCTTCCAATGTGGAAGAGAAAAAAGAAAAAACTGCTTTTGATGTGAAGCTAGAGAAGTTTGATGCTGCTTCAAAAATTAAGGTGATTAAAGAAGTAAGGGC
CTTCACTAATTTGGGTCTGAAGGAGGCAAAAGACTTGGTAGAGAAAGTACCTGCGATTCTCAAGCAAGGGGTGACCAAGGAGGAAGCAAACGGCATCATCGAAAAGATCA
AAGCTGCTGGAGGAGTTGCTGTGATGGAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAGCTGACTGTAGTTGCACGATCCCTTCAAGCCCGTTCCACACTTACTAAAATAATTGGGTTGTCGCAGGTCCGCTTCTTTCAGCCTGATTTTACTCCTAGGGACCC
AAAGGCCAAGCCAAAAAAGTACAAGTATCCACCATTTTATGATCCATATGGCCCTAGGCCCCCACCCTCTGATAAAATCATTGCGCTTGCTGAAAGAATTGCAGCACTGC
CTGCTGCTGAGCGTTCCCAGATTGGTCCCACACTCGGCGAAAAACTTAGACATCCTAAGCTGCAGGAAATTTCAGTGGATGGCTTGGACATGGGTTCGGAAGGAGGGGCA
GCGGCAGGATCTTCCAATGTGGAAGAGAAAAAAGAAAAAACTGCTTTTGATGTGAAGCTAGAGAAGTTTGATGCTGCTTCAAAAATTAAGGTGATTAAAGAAGTAAGGGC
CTTCACTAATTTGGGTCTGAAGGAGGCAAAAGACTTGGTAGAGAAAGTACCTGCGATTCTCAAGCAAGGGGTGACCAAGGAGGAAGCAAACGGCATCATCGAAAAGATCA
AAGCTGCTGGAGGAGTTGCTGTGATGGAGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKLTVVARSLQARSTLTKIIGLSQVRFFQPDFTPRDPKAKPKKYKYPPFYDPYGPRPPPSDKIIALAERIAALPAAERSQIGPTLGEKLRHPKLQEISVDGLDMGSEGGA
AAGSSNVEEKKEKTAFDVKLEKFDAASKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANGIIEKIKAAGGVAVME