; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0015509 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0015509
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationchr08:14856869..14857096
RNA-Seq ExpressionIVF0015509
SyntenyIVF0015509
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0032394.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]3.66e-3272Show/hide
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KAA0036099.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]2.65e-3272Show/hide
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KAA0046637.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]2.65e-3272Show/hide
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KAA0053179.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]5.66e-3270.67Show/hide
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KAA0053616.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]2.65e-3272Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TPF3 Retrotransposon protein3.8e-2474.67Show/hide
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A0A5A7TQ37 Retrotransposon protein3.8e-2472Show/hide
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A0A5A7USM3 Retrotransposon protein3.8e-2472Show/hide
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A0A5A7VKT2 Retrotransposon protein2.9e-2473.33Show/hide
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A0A5D3BT72 Retrotransposon protein2.9e-2472Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CGGCACGTTCCAACCAGGTTATGTGGCCCAACTTGTCCGGATGATGACTGTAAAGTTGCCTGAATGTCTTGTCCAAGCCACTACTATTGTAGACTGCCGAATAAAGACAT
TGAAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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