; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0015662 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0015662
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionTLC domain-containing protein
Genome locationchr12:17174458..17178473
RNA-Seq ExpressionIVF0015662
SyntenyIVF0015662
Gene Ontology termsGO:0055088 - lipid homeostasis (biological process)
GO:0005783 - endoplasmic reticulum (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR006634 - TRAM/LAG1/CLN8 homology domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M188 TLC domain-containing protein1.8e-10298.48Show/hide
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A0A1S4E2B6 transmembrane protein 56-like4.4e-104100Show/hide
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A0A5D3E1H6 Transmembrane protein 56-like4.4e-104100Show/hide
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A0A6J1EH94 transmembrane protein 56-like9.1e-10296.95Show/hide
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A0A6J1KGK7 transmembrane protein 56-like9.1e-10296.95Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q550T0 TLC domain-containing protein 4 A8.1e-0725.62Show/hide
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Q5XIY2 TLC domain-containing protein 4-B2.1e-0724.24Show/hide
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Q6GLX2 TLC domain-containing protein 4-A1.2e-0524Show/hide
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Q6PGS5 TLC domain-containing protein 4-B7.9e-1027.72Show/hide
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Q8CGF5 TLC domain-containing protein 44.6e-1027.14Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G31300.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein4.9e-8475.63Show/hide
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AT1G31300.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein4.9e-8475.63Show/hide
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AT4G10360.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.0e-5250.77Show/hide
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AT4G19645.1 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.4e-7874.24Show/hide
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AT4G19645.2 TRAM, LAG1 and CLN8 (TLC) lipid-sensing domain containing protein1.4e-7874.24Show/hide
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Query:  SEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR
        SE+TTPEIN+RWYLD AG+KRS AYL+NG+ IFFAWL ARILLF Y FYHVY HYDQVI+MH  GYLLVF VP  L +MNL+WFGKIVKGL KT+ KR
Subjt:  SEITTPEINMRWYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR


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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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WYLDTAGMKRSCAYLINGIVIFFAWLIARILLFGYTFYHVYLHYDQVIKMHVIGYLLVFGVPTVLGMMNLMWFGKIVKGLMKTISKR