; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0015964 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0015964
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionC2H2-type domain-containing protein
Genome locationtig00000135:924394..925104
RNA-Seq ExpressionIVF0015964
SyntenyIVF0015964
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0049241.1 hypothetical protein E6C27_scaffold171G004810 [Cucumis melo var. makuwa]4.44e-168100Show/hide
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KAG6582389.1 hypothetical protein SDJN03_22391, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.65e-2337.14Show/hide
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        MAFLL+ P           PS+  PW SS F KS  NPS  ++LFTS ++S RP R+NTIFGAPCGLCGQ I  SE LNHH     L + L        P
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           +  +             P  +L    T   +LR H  AA          +DMAH+LPLHPLLA+PPP   T                     N+IR 
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          G                       + EN+CSS GSE LDLTLS
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KAG6597359.1 hypothetical protein SDJN03_10539, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.21e-8563.71Show/hide
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        LFFLT+FSPS + PW+SS + KSG NPSL+++L  S E+SSRP R+ +TIFGAPCGLCGQVIFGSEALNHHYNYHFLQN+LAS+     P S  S RPP 
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           +FHGQASASREPQ+TLN+ LTMPP     SLRS+    +DMAH LPLHPLLA+PPP  R +T N +N    +  A QR QGNQ + NNG  R    +
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         A+EQ QP Q+VIDL+S EENDCSSDGS+GLDLTLSL
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KGN56847.1 hypothetical protein Csa_010766 [Cucumis sativus]1.25e-14187.14Show/hide
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        P SG+S RPP    +FHGQASASREPQMTLNDYLTMPPSLRS+SGAAIDMAHFLPLHPLLA+PPPLPRTST N MNFQQNQAVA  RRQGNQ++WNNG V
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        REVGGQPASE+QPPQDVIDL+SEENDCSSD SEGLDLTLSL
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L892 C2H2-type domain-containing protein2.9e-11087.14Show/hide
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        M FLLQPPLFALFFLTSFSPS S P NSSSFG+S SNPSL++MLFTSSESS RPS R+NTIFGAPCGLCGQVIFGSEALNHHYNYHFLQNELASFRGHSN
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A0A5A7U6I9 C2H2-type domain-containing protein2.5e-130100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCTTCCTCCTTCAACCTCCTCTGTTTGCTCTGTTTTTCCTCACATCCTTCTCTCCTTCTTGGTCTCTTCCATGGAATTCTTCCTCCTTTGGTAAATCGGGCTCCAA
CCCATCACTCGACGACATGTTGTTCACCTCCAGCGAGTCTTCCAGCAGGCCGTCTCGCCAAAACACAATTTTTGGTGCCCCTTGTGGGCTCTGTGGCCAAGTGATTTTTG
GCTCTGAAGCTCTTAATCATCATTACAATTACCATTTCTTGCAGAATGAGCTTGCTTCTTTTAGAGGCCACTCTAATCCTTGCTCCGGTGTCTCTCACCGGCCACCGTTT
TTCCATGGCCAAGCCTCTGCTTCTCGAGAACCCCAAATGACGCTTAACGATTATTTAACGATGCCTCCATCTTTGAGAAGCCATTCAGGCGCCGCCATTGATATGGCTCA
CTTTCTTCCGCTTCATCCTTTGTTGGCTCGACCGCCGCCGCTGCCGCGAACCAGCACCCCCAATAGTATGAACTTTCAACAGAATCAGGCTGTGGCACGGCAGAGAAGGC
AGGGGAACCAAATCCGATGGAATAACGGCAGAGTGAGGGAAGTTGGTGGCCAGCCGGCATCAGAACAGCAACCACCCCAAGATGTGATTGATCTGAGTAGTGAGGAGAAT
GATTGTAGCTCTGATGGTTCGGAAGGCTTGGATTTGACACTGAGTCTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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