; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0016381 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0016381
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionPentatricopeptide repeat-containing protein
Genome locationchr08:28314779..28320944
RNA-Seq ExpressionIVF0016381
SyntenyIVF0016381
Gene Ontology termsGO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002885 - Pentatricopeptide repeat
IPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily
IPR033443 - Pentacotripeptide-repeat region of PRORP


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ARV85580.1 pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo]0.099.76Show/hide
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A0A1S3BHG8 Pentatricopeptide repeat-containing protein0.0e+00100Show/hide
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A0A2D0WXK6 Pentatricopeptide repeat-containing protein0.0e+0099.88Show/hide
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A0A2D0WXL1 Pentatricopeptide repeat-containing protein0.0e+0099.76Show/hide
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A0A2D0WXL2 Pentatricopeptide repeat-containing protein0.0e+0099.76Show/hide
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A0A5A7TZE2 Pentatricopeptide repeat-containing protein0.0e+00100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q3ECK2 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62680, mitochondrial9.5e-2825.49Show/hide
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        +++Y    +I+    C     + +I   ++     P+     SL+N     + ++    L   M  +G   D+ +YN ++ + C   RV+ A D ++E+ 
Subjt:  SNMYIHRSIIDVCGLCGDYKKSRNIYQDLVNQNVTPNIFVFNSLMN--VNAHDLNYTFQLYKDMQNLGVPADMASYNILLKACCLAGRVDLAQDIYREVK

Query:  HLETTGVLKLDVFTYSTIVKVFADAKLWKMALRVKEDMQSAGVSPNIVTWSSLISSCANSGLVELAIQLFEEMVSAGYEPNTQCCNILLHACVEARQFDR
          E  G+ + +V TY+ +V    ++  W  A R+  DM    ++PN++T+S+L+ +   +G V  A +LFEEMV    +P+    + L++      + D 
Subjt:  HLETTGVLKLDVFTYSTIVKVFADAKLWKMALRVKEDMQSAGVSPNIVTWSSLISSCANSGLVELAIQLFEEMVSAGYEPNTQCCNILLHACVEARQFDR

Query:  AFRLFRSWREKE-LWDGIERKSSIDDNLDADSTSQLCTTNMLNAPSHEHQISCVGNFAFKPTVTTYNTLMKAC--GTDYYHAKALMEEMKSVGLTPNHIS
        A ++F     K  L D +   + I+    A          +    S    +S            TYNTL++      D   A+    +M   G++P+  +
Subjt:  AFRLFRSWREKE-LWDGIERKSSIDDNLDADSTSQLCTTNMLNAPSHEHQISCVGNFAFKPTVTTYNTLMKAC--GTDYYHAKALMEEMKSVGLTPNHIS

Query:  WSILIDVCGESHDVESAVQILTTMRMAGVDPDVVAYTTAIK-VCVEGKNWKLAFSLFEEMKRFEIQPNLVTYSTLLRARSTYGSLHEVQQCLAVYQDMRK
        ++IL+    ++ ++E A+ I   M+   +D D+V YTT I+ +C  GK  + A+SLF  +    ++P++VTY+T++    T G LHEV+   A+Y  M++
Subjt:  WSILIDVCGESHDVESAVQILTTMRMAGVDPDVVAYTTAIK-VCVEGKNWKLAFSLFEEMKRFEIQPNLVTYSTLLRARSTYGSLHEVQQCLAVYQDMRK

Query:  SGFKSNDHYLKE
         G   ND  L +
Subjt:  SGFKSNDHYLKE

Q8GYL7 Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g02830, chloroplastic2.4e-24151.09Show/hide
Query:  MRVFLILGSTSASIAGPRRYRHRHSHCKAPK--------SSLSNISPT--GTHLPFSSHTSTRHSPPALLSSVELDIAGASSGGRIPIQHYAGVATKLAE
        MR F+I+  +S++I  P  + HR  +  AP+        SS + + P+    H P  +  S  HS  +  S+V   I   S      +++YA  A+KLAE
Subjt:  MRVFLILGSTSASIAGPRRYRHRHSHCKAPK--------SSLSNISPT--GTHLPFSSHTSTRHSPPALLSSVELDIAGASSGGRIPIQHYAGVATKLAE

Query:  RGKLEDFAMVVESVVV-AGVEPSQFGAMLAVELVAKGISRCLREGKLWSVVQVLRKVEELGISALGLCDESAVESLRRDCRRMAKSGELEELVEFLEVLS
         G++ED A++ E++   +G   ++F +M+  +L++KGIS  LR+GK+ SVV  L+++E++GI+ L L D+S+V+ +R+  R MA S ++E+ ++ +E+L+
Subjt:  RGKLEDFAMVVESVVV-AGVEPSQFGAMLAVELVAKGISRCLREGKLWSVVQVLRKVEELGISALGLCDESAVESLRRDCRRMAKSGELEELVEFLEVLS

Query:  GFGLSVKEMMKPFEVIKLCVDYRNPKMAIRYASILPHADILFCTTINEFGKKRDLKSAYIAYAESKANMNGSNMYIHRSIIDVCGLCGDYKKSRNIYQDL
        G G  +KE++ PF+V+K CV+  NP++AIRYA +LPH ++L C  I+ FGKK D+ S   AY   K  ++  NMYI R++IDVCGLCGDY KSR IY+DL
Subjt:  GFGLSVKEMMKPFEVIKLCVDYRNPKMAIRYASILPHADILFCTTINEFGKKRDLKSAYIAYAESKANMNGSNMYIHRSIIDVCGLCGDYKKSRNIYQDL

Query:  VNQNVTPNIFVFNSLMNVNAHDLNYTFQLYKDMQNLGVPADMASYNILLKACCLAGRVDLAQDIYREVKHLETTGVLKLDVFTYSTIVKVFADAKLWKMA
        + +N+ PNI+V NSLMNVN+HDL YT ++YK+MQ L V ADM SYNILLK CCLAGRVDLAQDIY+E K +E++G+LKLD FTY TI+KVFADAK+WK A
Subjt:  VNQNVTPNIFVFNSLMNVNAHDLNYTFQLYKDMQNLGVPADMASYNILLKACCLAGRVDLAQDIYREVKHLETTGVLKLDVFTYSTIVKVFADAKLWKMA

Query:  LRVKEDMQSAGVSPNIVTWSSLISSCANSGLVELAIQLFEEMVSAGYEPNTQCCNILLHACVEARQFDRAFRLFRSWREKELWDGIERKSSIDDNLDAD-
        L+VK+DM+S GV+PN  TWSSLIS+CAN+GLVE A  LFEEM+++G EPN+QC NILLHACVEA Q+DRAFRLF+SW          + SS++++L AD 
Subjt:  LRVKEDMQSAGVSPNIVTWSSLISSCANSGLVELAIQLFEEMVSAGYEPNTQCCNILLHACVEARQFDRAFRLFRSWREKELWDGIERKSSIDDNLDAD-

Query:  -------STSQLCTTN----MLNAPSHEHQISCVGNFAFKPTVTTYNTLMKACGTDYYHAKALMEEMKSVGLTPNHISWSILIDVCGESHDVESAVQILT
               S+  +   N    ++N  S+   I     F FKPT  TYN L+KACGTDYY  K LM+EMKS+GL+PN I+WS LID+CG S DVE AV+IL 
Subjt:  -------STSQLCTTN----MLNAPSHEHQISCVGNFAFKPTVTTYNTLMKACGTDYYHAKALMEEMKSVGLTPNHISWSILIDVCGESHDVESAVQILT

Query:  TMRMAGVDPDVVAYTTAIKVCVEGKNWKLAFSLFEEMKRFEIQPNLVTYSTLLRARSTYGSLHEVQQCLAVYQDMRKSGFKSNDHYLKELIAEWCEGVLQ
        TM  AG  PDVVAYTTAIK+C E K  KLAFSLFEEM+R++I+PN VTY+TLL+ARS YGSL EV+QCLA+YQDMR +G+K NDH+LKELI EWCEGV+Q
Subjt:  TMRMAGVDPDVVAYTTAIKVCVEGKNWKLAFSLFEEMKRFEIQPNLVTYSTLLRARSTYGSLHEVQQCLAVYQDMRKSGFKSNDHYLKELIAEWCEGVLQ

Query:  NNNQQQVETTPCNKIDIAKPRCLILEKVADHLQKSFAESLTIDLQELTKVEARIVVLAVLRMIKENYALGESVKDDIFIILEVNKVQTDLIRKNFEVRDA
         N Q Q + +     +  +P  L++EKVA H+Q+  A +L IDLQ LTK+EAR+VVLAVLRMIKE+Y  G+ V DD+ II+  ++  T   ++   V++A
Subjt:  NNNQQQVETTPCNKIDIAKPRCLILEKVADHLQKSFAESLTIDLQELTKVEARIVVLAVLRMIKENYALGESVKDDIFIILEVNKVQTDLIRKNFEVRDA

Query:  ITKLLQDELGLEVLPTGPTIPLDKVPNSESSNMSHTKLKGTMGRNKYFTRKPADVQRLKVTKKSLQDWLQRNR
        + KLL+DEL L VLP G    +      + ++  +TK   ++      TR+PA ++RL VTK SL  WLQR +
Subjt:  ITKLLQDELGLEVLPTGPTIPLDKVPNSESSNMSHTKLKGTMGRNKYFTRKPADVQRLKVTKKSLQDWLQRNR

Q940A6 Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g19440, chloroplastic4.0e-2624.77Show/hide
Query:  LFCTTINEFGKKRDLKSAYIAYAESKANMNGSNMYIHRSIIDVCGLCGDYKKSRNIYQDLVNQNVTPNIFVFNSLMN--VNAHDLNYTFQLYKDMQNLGV
        LF T IN F K   ++ A   +++ +      N+    ++ID  G+CG Y ++    + +V + + P +  ++ L+     A  +   + + K+M   G 
Subjt:  LFCTTINEFGKKRDLKSAYIAYAESKANMNGSNMYIHRSIIDVCGLCGDYKKSRNIYQDLVNQNVTPNIFVFNSLMN--VNAHDLNYTFQLYKDMQNLGV

Query:  PADMASYNILLKACCLAGRVDLAQDIYREVKHLETTGVLKLDVFTYSTIVKVFADAKLWKMALRVKEDMQSAGVSPNIVTWSSLISSCANSGLVELAIQL
        P ++  YN L+ +   AG ++ A     E+K L  +  L L   TY+T++K +        A R+ ++M S G + N  +++S+I    +  + + A++ 
Subjt:  PADMASYNILLKACCLAGRVDLAQDIYREVKHLETTGVLKLDVFTYSTIVKVFADAKLWKMALRVKEDMQSAGVSPNIVTWSSLISSCANSGLVELAIQL

Query:  FEEMVSAGYEPNTQCCNILLHACVEARQFDRAFRLFRSWREKELWDGIERKSSIDDNLDADSTSQ-LCTTNMLNAPSHEHQISCVGNFAFKPTVTTYNTL
          EM+     P       L+    +  +  +A          ELW     K  + D   +++    LC    L+  +   Q   +G       V +YNTL
Subjt:  FEEMVSAGYEPNTQCCNILLHACVEARQFDRAFRLFRSWREKELWDGIERKSSIDDNLDADSTSQ-LCTTNMLNAPSHEHQISCVGNFAFKPTVTTYNTL

Query:  MKACGTDYYHAKALM--EEMKSVGLTPNHISWSILIDVCGESHDVESAVQILTTMRMAGVDPDVVAYTTAIKVCVEGKNWKLAFSLFEEMKRFEIQPNLV
        +  C       +A M  +EM   GL P++ ++SILI      + VE A+Q     +  G+ PDV  Y+  I  C + +  +     F+EM    +QPN V
Subjt:  MKACGTDYYHAKALM--EEMKSVGLTPNHISWSILIDVCGESHDVESAVQILTTMRMAGVDPDVVAYTTAIKVCVEGKNWKLAFSLFEEMKRFEIQPNLV

Query:  TYSTLLRARSTYGSLHEVQQCLAVYQDMRKSGFKSNDHYLKELI
         Y+ L+RA    G L      L + +DM+  G   N      LI
Subjt:  TYSTLLRARSTYGSLHEVQQCLAVYQDMRKSGFKSNDHYLKELI

Q9FIX3 Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g397102.5e-2823.1Show/hide
Query:  KRDLKSAYIAYAESKANMNGSNMYIHRSIIDVCGLCGDYKKSRNIYQDLVNQNVTPNIFVFNSLMN--VNAHDLNYTFQLYKDMQNLGVPADMASYNILL
        KR++  A   + E   +    N++ +  +I      G+   +  ++  +  +   PN+  +N+L++       ++  F+L + M   G+  ++ SYN+++
Subjt:  KRDLKSAYIAYAESKANMNGSNMYIHRSIIDVCGLCGDYKKSRNIYQDLVNQNVTPNIFVFNSLMN--VNAHDLNYTFQLYKDMQNLGVPADMASYNILL

Query:  KACCLAGRVDLAQDIYREVKHLETTGVLKLDVFTYSTIVKVFADAKLWKMALRVKEDMQSAGVSPNIVTWSSLISSCANSGLVELAIQLFEEMVSAGYEP
           C  GR+     +  E+          LD  TY+T++K +     +  AL +  +M   G++P+++T++SLI S   +G +  A++  ++M   G  P
Subjt:  KACCLAGRVDLAQDIYREVKHLETTGVLKLDVFTYSTIVKVFADAKLWKMALRVKEDMQSAGVSPNIVTWSSLISSCANSGLVELAIQLFEEMVSAGYEP

Query:  NTQCCNILLHACVEARQFDRAFRLFRSWREKELWDGIERKSSIDDNLDADSTSQLCTTNMLNAPSHEHQISCVGNFAFKPTVTTYNTLMKA-CGTDYYH-
        N +    L+    +    + A+R+ R                ++DN                               F P+V TYN L+   C T     
Subjt:  NTQCCNILLHACVEARQFDRAFRLFRSWREKELWDGIERKSSIDDNLDADSTSQLCTTNMLNAPSHEHQISCVGNFAFKPTVTTYNTLMKA-CGTDYYH-

Query:  AKALMEEMKSVGLTPNHISWSILIDVCGESHDVESAVQILTTMRMAGVDPDVVAYTTAIKVCVEGKNWKLAFSLFEEMKRFEIQPNLVTYSTLLRARSTY
        A A++E+MK  GL+P+ +S+S ++     S+DV+ A+++   M   G+ PD + Y++ I+   E +  K A  L+EEM R  + P+  TY+ L+ A    
Subjt:  AKALMEEMKSVGLTPNHISWSILIDVCGESHDVESAVQILTTMRMAGVDPDVVAYTTAIKVCVEGKNWKLAFSLFEEMKRFEIQPNLVTYSTLLRARSTY

Query:  GSLHEVQQCLAVYQDMRKSG
        G L   ++ L ++ +M + G
Subjt:  GSLHEVQQCLAVYQDMRKSG

Q9LYZ9 Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g028604.6e-3020.66Show/hide
Query:  VEPSQFGAMLAVELVAKGISRCLREGKLWSVVQVLRKVEELGISALGLCDESAVESLRRDCR---------RMAKSGELEELVEFLEVLSGFGLSVKEMM
        ++   + +ML   +VA  IS   +EG++ S   +   ++E G S       S + +     R         +M + G    L+ +  +L+ FG    +M 
Subjt:  VEPSQFGAMLAVELVAKGISRCLREGKLWSVVQVLRKVEELGISALGLCDESAVESLRRDCR---------RMAKSGELEELVEFLEVLSGFGLSVKEMM

Query:  KPFEVIKLCVDYRNPKMAIRYASILPHADILFCTTINEFGKKRDL-KSAYIAYAESKANMNGSNMYIHRSIIDVCGLCGDYKKSRNIYQDLVNQNVTPNI
         P+  I   V+       ++   I P  D     T+    K+  L + A   + E KA     +   + +++DV G     K++  +  ++V    +P+I
Subjt:  KPFEVIKLCVDYRNPKMAIRYASILPHADILFCTTINEFGKKRDL-KSAYIAYAESKANMNGSNMYIHRSIIDVCGLCGDYKKSRNIYQDLVNQNVTPNI

Query:  FVFNSLMNVNAHD--LNYTFQLYKDMQNLGVPADMASYNILLKACCLAGRVDLAQDIYREVKHLETTGVLKLDVFTYSTIVKVFADAKLWKMALRVKEDM
          +NSL++  A D  L+   +L   M   G   D+ +Y  LL     AG+V+ A  I+ E+++       K ++ T++  +K++ +   +   +++ +++
Subjt:  FVFNSLMNVNAHD--LNYTFQLYKDMQNLGVPADMASYNILLKACCLAGRVDLAQDIYREVKHLETTGVLKLDVFTYSTIVKVFADAKLWKMALRVKEDM

Query:  QSAGVSPNIVTWSSLISSCANSGLVELAIQLFEEMVSAGYEPNTQCCNILLHACVEARQFDRAFRLFRSWREKELWDGIERKSSI------------DDN
           G+SP+IVTW++L++    +G+      +F+EM  AG+ P  +  N L+ A      F++A  ++R   +  +   +   +++             + 
Subjt:  QSAGVSPNIVTWSSLISSCANSGLVELAIQLFEEMVSAGYEPNTQCCNILLHACVEARQFDRAFRLFRSWREKELWDGIERKSSI------------DDN

Query:  LDADSTSQLCTTNMLN------------------------------------------------APSHEHQISCVGNFAFKPTVTTYNTLMKACGTDYYH
        + A+     C  N L                                                  P  E   S +    F P +TT N+++   G     
Subjt:  LDADSTSQLCTTNMLN------------------------------------------------APSHEHQISCVGNFAFKPTVTTYNTLMKACGTDYYH

Query:  AKA--LMEEMKSVGLTPNHISWSILIDVCGESHDVESAVQILTTMRMAGVDPDVVAYTTAIKVCVEGKNWKLAFSLFEEMKRFEIQPNLVTYSTLLRARS
        AKA  +++ MK  G TP+  +++ L+ +   S D   + +IL  +   G+ PD+++Y T I         + A  +F EM+   I P+++TY+T +    
Subjt:  AKA--LMEEMKSVGLTPNHISWSILIDVCGESHDVESAVQILTTMRMAGVDPDVVAYTTAIKVCVEGKNWKLAFSLFEEMKRFEIQPNLVTYSTLLRARS

Query:  TYGSLHEVQQCLAVYQDMRKSGFKSNDHYLKELIAEWCE
        +Y +    ++ + V + M K G + N +    ++  +C+
Subjt:  TYGSLHEVQQCLAVYQDMRKSGFKSNDHYLKELIAEWCE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G62680.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein6.7e-2925.49Show/hide
Query:  SNMYIHRSIIDVCGLCGDYKKSRNIYQDLVNQNVTPNIFVFNSLMN--VNAHDLNYTFQLYKDMQNLGVPADMASYNILLKACCLAGRVDLAQDIYREVK
        +++Y    +I+    C     + +I   ++     P+     SL+N     + ++    L   M  +G   D+ +YN ++ + C   RV+ A D ++E+ 
Subjt:  SNMYIHRSIIDVCGLCGDYKKSRNIYQDLVNQNVTPNIFVFNSLMN--VNAHDLNYTFQLYKDMQNLGVPADMASYNILLKACCLAGRVDLAQDIYREVK

Query:  HLETTGVLKLDVFTYSTIVKVFADAKLWKMALRVKEDMQSAGVSPNIVTWSSLISSCANSGLVELAIQLFEEMVSAGYEPNTQCCNILLHACVEARQFDR
          E  G+ + +V TY+ +V    ++  W  A R+  DM    ++PN++T+S+L+ +   +G V  A +LFEEMV    +P+    + L++      + D 
Subjt:  HLETTGVLKLDVFTYSTIVKVFADAKLWKMALRVKEDMQSAGVSPNIVTWSSLISSCANSGLVELAIQLFEEMVSAGYEPNTQCCNILLHACVEARQFDR

Query:  AFRLFRSWREKE-LWDGIERKSSIDDNLDADSTSQLCTTNMLNAPSHEHQISCVGNFAFKPTVTTYNTLMKAC--GTDYYHAKALMEEMKSVGLTPNHIS
        A ++F     K  L D +   + I+    A          +    S    +S            TYNTL++      D   A+    +M   G++P+  +
Subjt:  AFRLFRSWREKE-LWDGIERKSSIDDNLDADSTSQLCTTNMLNAPSHEHQISCVGNFAFKPTVTTYNTLMKAC--GTDYYHAKALMEEMKSVGLTPNHIS

Query:  WSILIDVCGESHDVESAVQILTTMRMAGVDPDVVAYTTAIK-VCVEGKNWKLAFSLFEEMKRFEIQPNLVTYSTLLRARSTYGSLHEVQQCLAVYQDMRK
        ++IL+    ++ ++E A+ I   M+   +D D+V YTT I+ +C  GK  + A+SLF  +    ++P++VTY+T++    T G LHEV+   A+Y  M++
Subjt:  WSILIDVCGESHDVESAVQILTTMRMAGVDPDVVAYTTAIK-VCVEGKNWKLAFSLFEEMKRFEIQPNLVTYSTLLRARSTYGSLHEVQQCLAVYQDMRK

Query:  SGFKSNDHYLKE
         G   ND  L +
Subjt:  SGFKSNDHYLKE

AT4G19440.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein2.8e-2724.77Show/hide
Query:  LFCTTINEFGKKRDLKSAYIAYAESKANMNGSNMYIHRSIIDVCGLCGDYKKSRNIYQDLVNQNVTPNIFVFNSLMN--VNAHDLNYTFQLYKDMQNLGV
        LF T IN F K   ++ A   +++ +      N+    ++ID  G+CG Y ++    + +V + + P +  ++ L+     A  +   + + K+M   G 
Subjt:  LFCTTINEFGKKRDLKSAYIAYAESKANMNGSNMYIHRSIIDVCGLCGDYKKSRNIYQDLVNQNVTPNIFVFNSLMN--VNAHDLNYTFQLYKDMQNLGV

Query:  PADMASYNILLKACCLAGRVDLAQDIYREVKHLETTGVLKLDVFTYSTIVKVFADAKLWKMALRVKEDMQSAGVSPNIVTWSSLISSCANSGLVELAIQL
        P ++  YN L+ +   AG ++ A     E+K L  +  L L   TY+T++K +        A R+ ++M S G + N  +++S+I    +  + + A++ 
Subjt:  PADMASYNILLKACCLAGRVDLAQDIYREVKHLETTGVLKLDVFTYSTIVKVFADAKLWKMALRVKEDMQSAGVSPNIVTWSSLISSCANSGLVELAIQL

Query:  FEEMVSAGYEPNTQCCNILLHACVEARQFDRAFRLFRSWREKELWDGIERKSSIDDNLDADSTSQ-LCTTNMLNAPSHEHQISCVGNFAFKPTVTTYNTL
          EM+     P       L+    +  +  +A          ELW     K  + D   +++    LC    L+  +   Q   +G       V +YNTL
Subjt:  FEEMVSAGYEPNTQCCNILLHACVEARQFDRAFRLFRSWREKELWDGIERKSSIDDNLDADSTSQ-LCTTNMLNAPSHEHQISCVGNFAFKPTVTTYNTL

Query:  MKACGTDYYHAKALM--EEMKSVGLTPNHISWSILIDVCGESHDVESAVQILTTMRMAGVDPDVVAYTTAIKVCVEGKNWKLAFSLFEEMKRFEIQPNLV
        +  C       +A M  +EM   GL P++ ++SILI      + VE A+Q     +  G+ PDV  Y+  I  C + +  +     F+EM    +QPN V
Subjt:  MKACGTDYYHAKALM--EEMKSVGLTPNHISWSILIDVCGESHDVESAVQILTTMRMAGVDPDVVAYTTAIKVCVEGKNWKLAFSLFEEMKRFEIQPNLV

Query:  TYSTLLRARSTYGSLHEVQQCLAVYQDMRKSGFKSNDHYLKELI
         Y+ L+RA    G L      L + +DM+  G   N      LI
Subjt:  TYSTLLRARSTYGSLHEVQQCLAVYQDMRKSGFKSNDHYLKELI

AT5G02830.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein1.7e-24251.09Show/hide
Query:  MRVFLILGSTSASIAGPRRYRHRHSHCKAPK--------SSLSNISPT--GTHLPFSSHTSTRHSPPALLSSVELDIAGASSGGRIPIQHYAGVATKLAE
        MR F+I+  +S++I  P  + HR  +  AP+        SS + + P+    H P  +  S  HS  +  S+V   I   S      +++YA  A+KLAE
Subjt:  MRVFLILGSTSASIAGPRRYRHRHSHCKAPK--------SSLSNISPT--GTHLPFSSHTSTRHSPPALLSSVELDIAGASSGGRIPIQHYAGVATKLAE

Query:  RGKLEDFAMVVESVVV-AGVEPSQFGAMLAVELVAKGISRCLREGKLWSVVQVLRKVEELGISALGLCDESAVESLRRDCRRMAKSGELEELVEFLEVLS
         G++ED A++ E++   +G   ++F +M+  +L++KGIS  LR+GK+ SVV  L+++E++GI+ L L D+S+V+ +R+  R MA S ++E+ ++ +E+L+
Subjt:  RGKLEDFAMVVESVVV-AGVEPSQFGAMLAVELVAKGISRCLREGKLWSVVQVLRKVEELGISALGLCDESAVESLRRDCRRMAKSGELEELVEFLEVLS

Query:  GFGLSVKEMMKPFEVIKLCVDYRNPKMAIRYASILPHADILFCTTINEFGKKRDLKSAYIAYAESKANMNGSNMYIHRSIIDVCGLCGDYKKSRNIYQDL
        G G  +KE++ PF+V+K CV+  NP++AIRYA +LPH ++L C  I+ FGKK D+ S   AY   K  ++  NMYI R++IDVCGLCGDY KSR IY+DL
Subjt:  GFGLSVKEMMKPFEVIKLCVDYRNPKMAIRYASILPHADILFCTTINEFGKKRDLKSAYIAYAESKANMNGSNMYIHRSIIDVCGLCGDYKKSRNIYQDL

Query:  VNQNVTPNIFVFNSLMNVNAHDLNYTFQLYKDMQNLGVPADMASYNILLKACCLAGRVDLAQDIYREVKHLETTGVLKLDVFTYSTIVKVFADAKLWKMA
        + +N+ PNI+V NSLMNVN+HDL YT ++YK+MQ L V ADM SYNILLK CCLAGRVDLAQDIY+E K +E++G+LKLD FTY TI+KVFADAK+WK A
Subjt:  VNQNVTPNIFVFNSLMNVNAHDLNYTFQLYKDMQNLGVPADMASYNILLKACCLAGRVDLAQDIYREVKHLETTGVLKLDVFTYSTIVKVFADAKLWKMA

Query:  LRVKEDMQSAGVSPNIVTWSSLISSCANSGLVELAIQLFEEMVSAGYEPNTQCCNILLHACVEARQFDRAFRLFRSWREKELWDGIERKSSIDDNLDAD-
        L+VK+DM+S GV+PN  TWSSLIS+CAN+GLVE A  LFEEM+++G EPN+QC NILLHACVEA Q+DRAFRLF+SW          + SS++++L AD 
Subjt:  LRVKEDMQSAGVSPNIVTWSSLISSCANSGLVELAIQLFEEMVSAGYEPNTQCCNILLHACVEARQFDRAFRLFRSWREKELWDGIERKSSIDDNLDAD-

Query:  -------STSQLCTTN----MLNAPSHEHQISCVGNFAFKPTVTTYNTLMKACGTDYYHAKALMEEMKSVGLTPNHISWSILIDVCGESHDVESAVQILT
               S+  +   N    ++N  S+   I     F FKPT  TYN L+KACGTDYY  K LM+EMKS+GL+PN I+WS LID+CG S DVE AV+IL 
Subjt:  -------STSQLCTTN----MLNAPSHEHQISCVGNFAFKPTVTTYNTLMKACGTDYYHAKALMEEMKSVGLTPNHISWSILIDVCGESHDVESAVQILT

Query:  TMRMAGVDPDVVAYTTAIKVCVEGKNWKLAFSLFEEMKRFEIQPNLVTYSTLLRARSTYGSLHEVQQCLAVYQDMRKSGFKSNDHYLKELIAEWCEGVLQ
        TM  AG  PDVVAYTTAIK+C E K  KLAFSLFEEM+R++I+PN VTY+TLL+ARS YGSL EV+QCLA+YQDMR +G+K NDH+LKELI EWCEGV+Q
Subjt:  TMRMAGVDPDVVAYTTAIKVCVEGKNWKLAFSLFEEMKRFEIQPNLVTYSTLLRARSTYGSLHEVQQCLAVYQDMRKSGFKSNDHYLKELIAEWCEGVLQ

Query:  NNNQQQVETTPCNKIDIAKPRCLILEKVADHLQKSFAESLTIDLQELTKVEARIVVLAVLRMIKENYALGESVKDDIFIILEVNKVQTDLIRKNFEVRDA
         N Q Q + +     +  +P  L++EKVA H+Q+  A +L IDLQ LTK+EAR+VVLAVLRMIKE+Y  G+ V DD+ II+  ++  T   ++   V++A
Subjt:  NNNQQQVETTPCNKIDIAKPRCLILEKVADHLQKSFAESLTIDLQELTKVEARIVVLAVLRMIKENYALGESVKDDIFIILEVNKVQTDLIRKNFEVRDA

Query:  ITKLLQDELGLEVLPTGPTIPLDKVPNSESSNMSHTKLKGTMGRNKYFTRKPADVQRLKVTKKSLQDWLQRNR
        + KLL+DEL L VLP G    +      + ++  +TK   ++      TR+PA ++RL VTK SL  WLQR +
Subjt:  ITKLLQDELGLEVLPTGPTIPLDKVPNSESSNMSHTKLKGTMGRNKYFTRKPADVQRLKVTKKSLQDWLQRNR

AT5G02860.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein3.2e-3120.66Show/hide
Query:  VEPSQFGAMLAVELVAKGISRCLREGKLWSVVQVLRKVEELGISALGLCDESAVESLRRDCR---------RMAKSGELEELVEFLEVLSGFGLSVKEMM
        ++   + +ML   +VA  IS   +EG++ S   +   ++E G S       S + +     R         +M + G    L+ +  +L+ FG    +M 
Subjt:  VEPSQFGAMLAVELVAKGISRCLREGKLWSVVQVLRKVEELGISALGLCDESAVESLRRDCR---------RMAKSGELEELVEFLEVLSGFGLSVKEMM

Query:  KPFEVIKLCVDYRNPKMAIRYASILPHADILFCTTINEFGKKRDL-KSAYIAYAESKANMNGSNMYIHRSIIDVCGLCGDYKKSRNIYQDLVNQNVTPNI
         P+  I   V+       ++   I P  D     T+    K+  L + A   + E KA     +   + +++DV G     K++  +  ++V    +P+I
Subjt:  KPFEVIKLCVDYRNPKMAIRYASILPHADILFCTTINEFGKKRDL-KSAYIAYAESKANMNGSNMYIHRSIIDVCGLCGDYKKSRNIYQDLVNQNVTPNI

Query:  FVFNSLMNVNAHD--LNYTFQLYKDMQNLGVPADMASYNILLKACCLAGRVDLAQDIYREVKHLETTGVLKLDVFTYSTIVKVFADAKLWKMALRVKEDM
          +NSL++  A D  L+   +L   M   G   D+ +Y  LL     AG+V+ A  I+ E+++       K ++ T++  +K++ +   +   +++ +++
Subjt:  FVFNSLMNVNAHD--LNYTFQLYKDMQNLGVPADMASYNILLKACCLAGRVDLAQDIYREVKHLETTGVLKLDVFTYSTIVKVFADAKLWKMALRVKEDM

Query:  QSAGVSPNIVTWSSLISSCANSGLVELAIQLFEEMVSAGYEPNTQCCNILLHACVEARQFDRAFRLFRSWREKELWDGIERKSSI------------DDN
           G+SP+IVTW++L++    +G+      +F+EM  AG+ P  +  N L+ A      F++A  ++R   +  +   +   +++             + 
Subjt:  QSAGVSPNIVTWSSLISSCANSGLVELAIQLFEEMVSAGYEPNTQCCNILLHACVEARQFDRAFRLFRSWREKELWDGIERKSSI------------DDN

Query:  LDADSTSQLCTTNMLN------------------------------------------------APSHEHQISCVGNFAFKPTVTTYNTLMKACGTDYYH
        + A+     C  N L                                                  P  E   S +    F P +TT N+++   G     
Subjt:  LDADSTSQLCTTNMLN------------------------------------------------APSHEHQISCVGNFAFKPTVTTYNTLMKACGTDYYH

Query:  AKA--LMEEMKSVGLTPNHISWSILIDVCGESHDVESAVQILTTMRMAGVDPDVVAYTTAIKVCVEGKNWKLAFSLFEEMKRFEIQPNLVTYSTLLRARS
        AKA  +++ MK  G TP+  +++ L+ +   S D   + +IL  +   G+ PD+++Y T I         + A  +F EM+   I P+++TY+T +    
Subjt:  AKA--LMEEMKSVGLTPNHISWSILIDVCGESHDVESAVQILTTMRMAGVDPDVVAYTTAIKVCVEGKNWKLAFSLFEEMKRFEIQPNLVTYSTLLRARS

Query:  TYGSLHEVQQCLAVYQDMRKSGFKSNDHYLKELIAEWCE
        +Y +    ++ + V + M K G + N +    ++  +C+
Subjt:  TYGSLHEVQQCLAVYQDMRKSGFKSNDHYLKELIAEWCE

AT5G39710.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein1.8e-2923.1Show/hide
Query:  KRDLKSAYIAYAESKANMNGSNMYIHRSIIDVCGLCGDYKKSRNIYQDLVNQNVTPNIFVFNSLMN--VNAHDLNYTFQLYKDMQNLGVPADMASYNILL
        KR++  A   + E   +    N++ +  +I      G+   +  ++  +  +   PN+  +N+L++       ++  F+L + M   G+  ++ SYN+++
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Query:  KACCLAGRVDLAQDIYREVKHLETTGVLKLDVFTYSTIVKVFADAKLWKMALRVKEDMQSAGVSPNIVTWSSLISSCANSGLVELAIQLFEEMVSAGYEP
           C  GR+     +  E+          LD  TY+T++K +     +  AL +  +M   G++P+++T++SLI S   +G +  A++  ++M   G  P
Subjt:  KACCLAGRVDLAQDIYREVKHLETTGVLKLDVFTYSTIVKVFADAKLWKMALRVKEDMQSAGVSPNIVTWSSLISSCANSGLVELAIQLFEEMVSAGYEP

Query:  NTQCCNILLHACVEARQFDRAFRLFRSWREKELWDGIERKSSIDDNLDADSTSQLCTTNMLNAPSHEHQISCVGNFAFKPTVTTYNTLMKA-CGTDYYH-
        N +    L+    +    + A+R+ R                ++DN                               F P+V TYN L+   C T     
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Query:  AKALMEEMKSVGLTPNHISWSILIDVCGESHDVESAVQILTTMRMAGVDPDVVAYTTAIKVCVEGKNWKLAFSLFEEMKRFEIQPNLVTYSTLLRARSTY
        A A++E+MK  GL+P+ +S+S ++     S+DV+ A+++   M   G+ PD + Y++ I+   E +  K A  L+EEM R  + P+  TY+ L+ A    
Subjt:  AKALMEEMKSVGLTPNHISWSILIDVCGESHDVESAVQILTTMRMAGVDPDVVAYTTAIKVCVEGKNWKLAFSLFEEMKRFEIQPNLVTYSTLLRARSTY

Query:  GSLHEVQQCLAVYQDMRKSG
        G L   ++ L ++ +M + G
Subjt:  GSLHEVQQCLAVYQDMRKSG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATCTCCTACCGGAACGCATTTGCCGTTCTCTTCACACACCTCAACACGCCATTCCCCTCCAGCTCTTCTGTCCTCCGTTGAATTGGACATTGCCGGCGCCTCATCCGGCG
GAAGAATTCCTATACAACACTATGCCGGTGTCGCAACGAAGCTCGCCGAGCGCGGGAAGCTTGAGGATTTTGCAATGGTGGTGGAAAGTGTGGTTGTCGCTGGTGTTGAG
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TCTTGGAGGTTCTTTCCGGTTTTGGTTTGTCAGTCAAAGAAATGATGAAGCCGTTCGAAGTAATTAAACTGTGTGTTGATTACCGTAATCCTAAAATGGCAATTAGGTAT
GCTAGCATTTTACCACACGCAGATATATTGTTCTGTACAACTATAAATGAATTTGGAAAGAAAAGGGACTTGAAATCTGCTTACATAGCATATGCAGAATCCAAGGCAAA
TATGAATGGTTCTAATATGTATATCCACCGCTCAATAATTGATGTATGTGGTCTCTGTGGCGACTACAAGAAATCAAGGAACATCTATCAGGATTTGGTCAATCAGAATG
TCACCCCAAATATATTCGTTTTCAACAGTCTCATGAATGTAAATGCCCACGATTTGAACTACACATTTCAACTATACAAAGATATGCAGAATCTTGGTGTACCAGCTGAT
ATGGCCTCATATAATATCCTTCTCAAGGCCTGTTGTTTAGCAGGAAGAGTTGATTTGGCTCAGGACATTTACAGGGAAGTAAAGCATTTGGAAACAACAGGTGTATTGAA
GTTGGATGTCTTCACCTACAGCACAATTGTAAAGGTTTTTGCAGATGCAAAATTGTGGAAAATGGCACTTAGAGTCAAAGAAGACATGCAATCAGCTGGAGTCTCCCCAA
ATATCGTGACCTGGTCTTCGTTGATAAGTTCATGTGCTAATTCGGGTCTTGTTGAGCTGGCTATCCAATTGTTTGAAGAGATGGTTTCAGCAGGCTATGAACCTAATACT
CAGTGTTGTAATATCCTATTACATGCTTGTGTCGAAGCTCGCCAGTTCGATAGAGCTTTTCGTCTATTTCGCTCCTGGAGGGAGAAGGAGCTCTGGGATGGTATAGAAAG
AAAAAGTAGCATTGACGATAATTTGGATGCAGATTCAACATCTCAATTGTGTACTACGAATATGCTTAATGCTCCATCTCATGAACATCAAATCAGCTGTGTAGGGAACT
TTGCTTTTAAACCTACAGTTACAACATATAATACTCTAATGAAAGCCTGTGGTACTGATTACTACCATGCTAAAGCTTTGATGGAGGAGATGAAAAGTGTTGGACTTACG
CCCAATCACATTAGCTGGTCAATTTTGATTGACGTATGTGGAGAATCTCATGATGTGGAAAGCGCTGTACAGATCTTGACAACTATGAGAATGGCTGGAGTCGATCCTGA
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TGACCTATAGTACACTTCTGAGAGCCCGCAGTACGTATGGTTCATTACACGAAGTTCAGCAGTGCCTTGCTGTATATCAGGACATGAGGAAATCAGGGTTCAAATCCAAT
GATCATTATCTCAAAGAGTTGATTGCGGAGTGGTGTGAAGGAGTTCTACAGAATAACAATCAGCAGCAAGTTGAGACAACTCCCTGCAACAAAATTGACATTGCGAAACC
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TCGCAGTTTTACGAATGATCAAAGAAAATTATGCATTAGGAGAGTCGGTAAAAGATGATATATTCATCATCTTAGAAGTGAATAAAGTTCAAACAGATTTAATTCGAAAG
AACTTCGAGGTGAGAGATGCAATAACCAAACTCTTGCAAGATGAATTAGGGCTTGAGGTTCTTCCTACAGGACCTACAATTCCTCTTGATAAAGTGCCAAATTCAGAAAG
CTCAAACATGTCACATACAAAACTGAAAGGAACTATGGGAAGGAATAAGTACTTCACTAGGAAACCAGCAGATGTACAGAGGCTAAAAGTCACCAAGAAATCACTGCAAG
ATTGGCTGCAAAGAAATAGGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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GCTTCCATTGCCGGACCTCGCCGCTACCGCCACCGCCACAGCCATTGCAAAGCTCCCAAATCATCTCTCTCCAACATATCTCCTACCGGAACGCATTTGCCGTTCTCTTC
ACACACCTCAACACGCCATTCCCCTCCAGCTCTTCTGTCCTCCGTTGAATTGGACATTGCCGGCGCCTCATCCGGCGGAAGAATTCCTATACAACACTATGCCGGTGTCG
CAACGAAGCTCGCCGAGCGCGGGAAGCTTGAGGATTTTGCAATGGTGGTGGAAAGTGTGGTTGTCGCTGGTGTTGAGCCCTCGCAGTTCGGTGCGATGTTGGCTGTTGAG
CTTGTAGCGAAGGGGATATCGCGGTGTCTTAGAGAGGGAAAGCTATGGAGCGTCGTGCAGGTCTTGAGGAAGGTCGAGGAGCTTGGGATTTCGGCTTTGGGACTTTGTGA
CGAGTCTGCCGTAGAATCGCTGAGGAGAGACTGTCGCCGTATGGCCAAGTCTGGAGAATTAGAAGAACTTGTTGAGTTCTTGGAGGTTCTTTCCGGTTTTGGTTTGTCAG
TCAAAGAAATGATGAAGCCGTTCGAAGTAATTAAACTGTGTGTTGATTACCGTAATCCTAAAATGGCAATTAGGTATGCTAGCATTTTACCACACGCAGATATATTGTTC
TGTACAACTATAAATGAATTTGGAAAGAAAAGGGACTTGAAATCTGCTTACATAGCATATGCAGAATCCAAGGCAAATATGAATGGTTCTAATATGTATATCCACCGCTC
AATAATTGATGTATGTGGTCTCTGTGGCGACTACAAGAAATCAAGGAACATCTATCAGGATTTGGTCAATCAGAATGTCACCCCAAATATATTCGTTTTCAACAGTCTCA
TGAATGTAAATGCCCACGATTTGAACTACACATTTCAACTATACAAAGATATGCAGAATCTTGGTGTACCAGCTGATATGGCCTCATATAATATCCTTCTCAAGGCCTGT
TGTTTAGCAGGAAGAGTTGATTTGGCTCAGGACATTTACAGGGAAGTAAAGCATTTGGAAACAACAGGTGTATTGAAGTTGGATGTCTTCACCTACAGCACAATTGTAAA
GGTTTTTGCAGATGCAAAATTGTGGAAAATGGCACTTAGAGTCAAAGAAGACATGCAATCAGCTGGAGTCTCCCCAAATATCGTGACCTGGTCTTCGTTGATAAGTTCAT
GTGCTAATTCGGGTCTTGTTGAGCTGGCTATCCAATTGTTTGAAGAGATGGTTTCAGCAGGCTATGAACCTAATACTCAGTGTTGTAATATCCTATTACATGCTTGTGTC
GAAGCTCGCCAGTTCGATAGAGCTTTTCGTCTATTTCGCTCCTGGAGGGAGAAGGAGCTCTGGGATGGTATAGAAAGAAAAAGTAGCATTGACGATAATTTGGATGCAGA
TTCAACATCTCAATTGTGTACTACGAATATGCTTAATGCTCCATCTCATGAACATCAAATCAGCTGTGTAGGGAACTTTGCTTTTAAACCTACAGTTACAACATATAATA
CTCTAATGAAAGCCTGTGGTACTGATTACTACCATGCTAAAGCTTTGATGGAGGAGATGAAAAGTGTTGGACTTACGCCCAATCACATTAGCTGGTCAATTTTGATTGAC
GTATGTGGAGAATCTCATGATGTGGAAAGCGCTGTACAGATCTTGACAACTATGAGAATGGCTGGAGTCGATCCTGATGTTGTTGCATACACGACAGCTATCAAGGTTTG
CGTTGAAGGTAAAAACTGGAAGCTGGCGTTTTCATTATTTGAAGAAATGAAAAGATTTGAGATACAGCCAAATTTAGTGACCTATAGTACACTTCTGAGAGCCCGCAGTA
CGTATGGTTCATTACACGAAGTTCAGCAGTGCCTTGCTGTATATCAGGACATGAGGAAATCAGGGTTCAAATCCAATGATCATTATCTCAAAGAGTTGATTGCGGAGTGG
TGTGAAGGAGTTCTACAGAATAACAATCAGCAGCAAGTTGAGACAACTCCCTGCAACAAAATTGACATTGCGAAACCACGATGTTTGATTCTTGAAAAAGTTGCCGACCA
TCTGCAGAAGAGTTTTGCTGAAAGCCTAACAATTGACCTTCAGGAGCTTACAAAGGTTGAAGCTCGAATAGTAGTTCTCGCAGTTTTACGAATGATCAAAGAAAATTATG
CATTAGGAGAGTCGGTAAAAGATGATATATTCATCATCTTAGAAGTGAATAAAGTTCAAACAGATTTAATTCGAAAGAACTTCGAGGTGAGAGATGCAATAACCAAACTC
TTGCAAGATGAATTAGGGCTTGAGGTTCTTCCTACAGGACCTACAATTCCTCTTGATAAAGTGCCAAATTCAGAAAGCTCAAACATGTCACATACAAAACTGAAAGGAAC
TATGGGAAGGAATAAGTACTTCACTAGGAAACCAGCAGATGTACAGAGGCTAAAAGTCACCAAGAAATCACTGCAAGATTGGCTGCAAAGAAATAGGTAATAGTAGAAGA
TGGGTGTTCAAAACTCCCAAAATGATTTTTTCGTTAAGGATATAATCATGATGTCCAATATCTTGTAATTACTTTTCTTTTTCTGTATAGCAGTACAAGTCATGTTACTC
CATGGTCTCTCTTGTAAACTCCAAATGAAAATCTTTACCATCATTCATTAATAAAAAGTATACACCCCTTTTGTTCAATTACTATGTTTTCTTTTCATGAATAACCAAAC
TTTTATTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRVFLILGSTSASIAGPRRYRHRHSHCKAPKSSLSNISPTGTHLPFSSHTSTRHSPPALLSSVELDIAGASSGGRIPIQHYAGVATKLAERGKLEDFAMVVESVVVAGVE
PSQFGAMLAVELVAKGISRCLREGKLWSVVQVLRKVEELGISALGLCDESAVESLRRDCRRMAKSGELEELVEFLEVLSGFGLSVKEMMKPFEVIKLCVDYRNPKMAIRY
ASILPHADILFCTTINEFGKKRDLKSAYIAYAESKANMNGSNMYIHRSIIDVCGLCGDYKKSRNIYQDLVNQNVTPNIFVFNSLMNVNAHDLNYTFQLYKDMQNLGVPAD
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PNHISWSILIDVCGESHDVESAVQILTTMRMAGVDPDVVAYTTAIKVCVEGKNWKLAFSLFEEMKRFEIQPNLVTYSTLLRARSTYGSLHEVQQCLAVYQDMRKSGFKSN
DHYLKELIAEWCEGVLQNNNQQQVETTPCNKIDIAKPRCLILEKVADHLQKSFAESLTIDLQELTKVEARIVVLAVLRMIKENYALGESVKDDIFIILEVNKVQTDLIRK
NFEVRDAITKLLQDELGLEVLPTGPTIPLDKVPNSESSNMSHTKLKGTMGRNKYFTRKPADVQRLKVTKKSLQDWLQRNR