; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0016715 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0016715
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionVQ domain-containing protein
Genome locationchr11:565235..565872
RNA-Seq ExpressionIVF0016715
SyntenyIVF0016715
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039607 - VQ motif-containing protein 8/17/18/20/21/25


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008460908.1 PREDICTED: protein MKS1-like [Cucumis melo]1.96e-11383.8Show/hide
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XP_011649396.1 protein MKS1 [Cucumis sativus]1.88e-11183.26Show/hide
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XP_022947651.1 protein MKS1-like [Cucurbita moschata]2.55e-9374.18Show/hide
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XP_023533977.1 protein MKS1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.09e-9273.71Show/hide
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XP_038901805.1 protein MKS1-like [Benincasa hispida]2.86e-10278.34Show/hide
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           A TDGDLSPAARLATIEKASPRSEREREINVSDMMDLAEVSVELGQIPGILSPAP TLAPIPTGYFSPAIE QS +YSL HELSPHWPSPSALFS P
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        L+SPISSPNIFNNLFDF
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LK21 VQ domain-containing protein3.5e-8583.26Show/hide
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A0A1S3CD17 protein MKS1-like8.4e-8783.8Show/hide
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A0A5A7TBE4 Protein MKS1-like8.4e-8783.8Show/hide
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        ISPISSPNIFNNLFDF
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A0A6J1G715 protein MKS1-like1.7e-7174.65Show/hide
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        MNPPG SA GSP TPRKKEIQLQGPRPPQLRV+QES      P  P   P S   P P A++  P  L      PKV+HVAENNFMSVVQRLTG SS A 
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         TDGDLSPAAR ATIEKASPRSEREREI+VSDMMDL EV VELGQ PGILSPAP +LAPI +G+FSPAIEPQSF+YSL HELSPHWPSPSALF  PL+SP
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        ISSPNIFN+LFDF
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A0A6J1L2G0 protein MKS1-like6.7e-6872.3Show/hide
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        MNPPG SA GSP TPRKKEIQLQGPRPPQLRV+QES      P  P   P S   P P A++  P  L      PKV+HVAENNFMSVVQRLTG SS ++
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          DGDLSPAAR ATIEKASPRS  EREI+VSDMMDL EV VELGQ PGILSPAP +LAPI +G+FSP IEPQSF+YSL HELSPHWPSPSALF  PL+SP
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Query:  ISSPNIFNNLFDF
        ISSPNIFN+LFDF
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4HWF9 Nuclear speckle RNA-binding protein B5.9e-0528.89Show/hide
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        GP+P  L+V  +S     +PP +P  P P     H                    P++IH   NNFM++VQRLTGQ+ST+ T                  
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Query:  ----GDLSPAARLATIEKASPRSEREREINVSDMMDLAEVSVELGQ-------------IPGILSPAPGTLAPIPTGYFS
            G +SPAAR A  EKA+  +E    +     MD         Q               GILSP P +L  +   +FS
Subjt:  ----GDLSPAARLATIEKASPRSEREREINVSDMMDLAEVSVELGQ-------------IPGILSPAPGTLAPIPTGYFS

Q8LGD5 Protein MKS18.8e-1737.14Show/hide
Query:  MNPPGYSAAGSPTTP--RKKEIQLQGPRPPQLRVSQES------PGSPTRPPSSPTGPFPMASTPHNLRHL-PKVIHVAENNFMSVVQRLTGQSSTAVTD
        M+P  Y A G+P+    +K+++Q+ GPRP  L V ++S      P  P  PP+    P  +   P  +  + PKV+H   + FM+VVQRLTG SS    +
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Query:  ----GDLSPAARLATIEKASPRSERE---REINVSDMMDLAEVSVELGQIPGILSPAPGTLAPIPTGYFSPAIEPQSFSYSLFHELSPHWPS-PSALFS-
            GD+SPAARLA+ E ASPR  +E   R+  V     + E +   G  PGILSP+P  L    TG FSP          ++H+     P+ P  LFS 
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Query:  TPLISPISSP
           +SP  SP
Subjt:  TPLISPISSP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G21320.1 nucleotide binding;nucleic acid binding4.2e-0628.89Show/hide
Query:  GPRPPQLRVSQESPGSPTRPPSSPTGPFPMASTPHNLRH---------------LPKVIHVAENNFMSVVQRLTGQSSTAVTD-----------------
        GP+P  L+V  +S     +PP +P  P P     H                    P++IH   NNFM++VQRLTGQ+ST+ T                  
Subjt:  GPRPPQLRVSQESPGSPTRPPSSPTGPFPMASTPHNLRH---------------LPKVIHVAENNFMSVVQRLTGQSSTAVTD-----------------

Query:  ----GDLSPAARLATIEKASPRSEREREINVSDMMDLAEVSVELGQ-------------IPGILSPAPGTLAPIPTGYFS
            G +SPAAR A  EKA+  +E    +     MD         Q               GILSP P +L  +   +FS
Subjt:  ----GDLSPAARLATIEKASPRSEREREINVSDMMDLAEVSVELGQ-------------IPGILSPAPGTLAPIPTGYFS

AT1G21326.1 VQ motif-containing protein1.2e-0828.93Show/hide
Query:  TPRKKEIQLQGPRPPQLRVSQESPGSPTRPPSSPTGPFPMASTPHNLRH---------------LPKVIHVAENNFMSVVQRLTGQSSTAVTD-------
        +PR + I   GPRP  L+V  +S     +PP +P  P P     H                    P++IH   NNFM++VQRLTG++ST+ T        
Subjt:  TPRKKEIQLQGPRPPQLRVSQESPGSPTRPPSSPTGPFPMASTPHNLRH---------------LPKVIHVAENNFMSVVQRLTGQSSTAVTD-------

Query:  --------------GDLSPAARLATIEKASPRSEREREINVSDMMD-----------LAEVSVELG------QIPGILSPAPGTLAPIPTGYFSP--AIE
                      G +SPAAR A  EKA+  +E    +     MD             +     G         GILSP P +L  +   +FS     +
Subjt:  --------------GDLSPAARLATIEKASPRSEREREINVSDMMD-----------LAEVSVELG------QIPGILSPAPGTLAPIPTGYFSP--AIE

Query:  PQSFSYSLFHELSPHWPSPSALFSTPLISPISSPNIFNNLFD
        PQ FS S F++ +    S  +   +P     SS ++FNN FD
Subjt:  PQSFSYSLFHELSPHWPSPSALFSTPLISPISSPNIFNNLFD

AT3G18690.1 MAP kinase substrate 16.3e-1837.14Show/hide
Query:  MNPPGYSAAGSPTTP--RKKEIQLQGPRPPQLRVSQES------PGSPTRPPSSPTGPFPMASTPHNLRHL-PKVIHVAENNFMSVVQRLTGQSSTAVTD
        M+P  Y A G+P+    +K+++Q+ GPRP  L V ++S      P  P  PP+    P  +   P  +  + PKV+H   + FM+VVQRLTG SS    +
Subjt:  MNPPGYSAAGSPTTP--RKKEIQLQGPRPPQLRVSQES------PGSPTRPPSSPTGPFPMASTPHNLRHL-PKVIHVAENNFMSVVQRLTGQSSTAVTD

Query:  ----GDLSPAARLATIEKASPRSERE---REINVSDMMDLAEVSVELGQIPGILSPAPGTLAPIPTGYFSPAIEPQSFSYSLFHELSPHWPS-PSALFS-
            GD+SPAARLA+ E ASPR  +E   R+  V     + E +   G  PGILSP+P  L    TG FSP          ++H+     P+ P  LFS 
Subjt:  ----GDLSPAARLATIEKASPRSERE---REINVSDMMDLAEVSVELGQIPGILSPAPGTLAPIPTGYFSPAIEPQSFSYSLFHELSPHWPS-PSALFS-

Query:  TPLISPISSP
           +SP  SP
Subjt:  TPLISPISSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATCCGCCGGGATATTCCGCCGCCGGCAGTCCCACCACCCCCAGAAAGAAAGAGATCCAGCTACAAGGCCCTCGCCCACCTCAACTCCGCGTCAGTCAAGAATCCCC
CGGTTCCCCCACCCGGCCGCCCTCCTCTCCCACCGGGCCCTTCCCAATGGCCTCAACCCCTCATAATCTACGACATCTCCCCAAAGTCATCCACGTCGCGGAGAACAACT
TCATGTCCGTCGTCCAACGCCTCACTGGACAATCCTCCACTGCCGTAACCGATGGCGACCTCTCCCCGGCGGCTAGACTGGCTACAATCGAGAAAGCCAGTCCCCGATCG
GAAAGAGAAAGAGAAATCAACGTGAGTGATATGATGGATTTGGCAGAGGTTTCGGTGGAATTAGGGCAAATCCCAGGAATCTTATCACCGGCTCCAGGAACTCTGGCTCC
GATTCCAACTGGGTATTTCTCGCCGGCGATTGAACCACAAAGCTTTTCTTATTCATTATTTCATGAATTGAGTCCTCATTGGCCCAGCCCTTCTGCTCTGTTCTCAACTC
CTTTGATTTCCCCAATTTCTTCACCAAATATCTTCAACAATCTCTTTGACTTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAATCCGCCGGGATATTCCGCCGCCGGCAGTCCCACCACCCCCAGAAAGAAAGAGATCCAGCTACAAGGCCCTCGCCCACCTCAACTCCGCGTCAGTCAAGAATCCCC
CGGTTCCCCCACCCGGCCGCCCTCCTCTCCCACCGGGCCCTTCCCAATGGCCTCAACCCCTCATAATCTACGACATCTCCCCAAAGTCATCCACGTCGCGGAGAACAACT
TCATGTCCGTCGTCCAACGCCTCACTGGACAATCCTCCACTGCCGTAACCGATGGCGACCTCTCCCCGGCGGCTAGACTGGCTACAATCGAGAAAGCCAGTCCCCGATCG
GAAAGAGAAAGAGAAATCAACGTGAGTGATATGATGGATTTGGCAGAGGTTTCGGTGGAATTAGGGCAAATCCCAGGAATCTTATCACCGGCTCCAGGAACTCTGGCTCC
GATTCCAACTGGGTATTTCTCGCCGGCGATTGAACCACAAAGCTTTTCTTATTCATTATTTCATGAATTGAGTCCTCATTGGCCCAGCCCTTCTGCTCTGTTCTCAACTC
CTTTGATTTCCCCAATTTCTTCACCAAATATCTTCAACAATCTCTTTGACTTTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNPPGYSAAGSPTTPRKKEIQLQGPRPPQLRVSQESPGSPTRPPSSPTGPFPMASTPHNLRHLPKVIHVAENNFMSVVQRLTGQSSTAVTDGDLSPAARLATIEKASPRS
EREREINVSDMMDLAEVSVELGQIPGILSPAPGTLAPIPTGYFSPAIEPQSFSYSLFHELSPHWPSPSALFSTPLISPISSPNIFNNLFDF