; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0016733 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0016733
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionLOB domain-containing protein
Genome locationchr04:25506626..25510141
RNA-Seq ExpressionIVF0016733
SyntenyIVF0016733
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004883 - Lateral organ boundaries, LOB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_011652293.1 LOB domain-containing protein 25 isoform X2 [Cucumis sativus]1.31e-12299.44Show/hide
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XP_038905774.1 LOB domain-containing protein 25-like [Benincasa hispida]1.83e-12181.58Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI15 LOB domain-containing protein1.2e-10384.1Show/hide
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A0A1S3B938 LOB domain-containing protein 25-like1.2e-95100Show/hide
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A0A5D3BPW0 LOB domain-containing protein 25-like1.2e-95100Show/hide
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A0A6J1DD95 LOB domain-containing protein 25-like3.1e-8894.44Show/hide
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A0A6J1FAW3 LOB domain-containing protein 25-like2.4e-8892.66Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2WXT0 LOB domain-containing protein 68.8e-4063.64Show/hide
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O04479 Protein ASYMMETRIC LEAVES 22.0e-3951.43Show/hide
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        L    ++L +Y    + A +  S        ++      ++T+   HY+   +F P      G   P G+ +D G
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Q8L8Q3 LOB domain-containing protein 251.7e-5184.68Show/hide
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Q8LQH4 LOB domain-containing protein 68.8e-4063.64Show/hide
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Q9FML4 Protein LATERAL ORGAN BOUNDARIES1.1e-5077.17Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27650.1 LOB domain-containing protein 251.2e-5284.68Show/hide
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AT5G63090.1 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein7.9e-5277.17Show/hide
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AT5G63090.2 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein7.9e-5277.17Show/hide
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AT5G63090.3 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein7.9e-5277.17Show/hide
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AT5G63090.4 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein7.9e-5277.17Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AATTTTGATCAATCTACTTGTTTTTCTTTTTTTGAAATTAATTCATTTTCTTTCTCACATCATCATCAATATGACGATGTCTTCTTCCACCTACTCTAATTCTCCCTGTG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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