; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0016805 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0016805
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionFlocculation protein FLO11-like
Genome locationchr05:6731192..6731847
RNA-Seq ExpressionIVF0016805
SyntenyIVF0016805
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0031999.1 putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa]8.16e-7281.82Show/hide
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KAA0049940.1 flocculation protein FLO11-like [Cucumis melo var. makuwa]1.00e-1549.56Show/hide
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        D +S SSDGDDS+VL KLL  FKIGD F  SST AP AQGI SSP   + P NV   T + +        ES ED D+DY+P  ++THVP+E+ V     
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        TLS  N+T +P +
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KAA0054111.1 flocculation protein FLO11-like [Cucumis melo var. makuwa]8.24e-1556.63Show/hide
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        K+ DR  P ST A AAQ    SP  +SPPQ+    +  ++DES  DT EDYV  S+KTH+PKE+IV +DDPTLSR+NRTP+PQ
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KAA0056471.1 flocculation protein FLO11-like [Cucumis melo var. makuwa]7.62e-1146.36Show/hide
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        D DSASS+ D+SIVLSKLL+  K  DR  P ST AP AQG  S P D+SPP ++VPP+TA R                            D+  EDTDED
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        YV  SEK  V
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TYK00112.1 flocculation protein FLO11-like [Cucumis melo var. makuwa]1.33e-1044.34Show/hide
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        D DS S +GDDSIVLS LL+ +KI D+     +  P A  + +     S PQ++      + DESGEDTD+DYV   E+T+VPKE+ V  DD   S  N+
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Query:  TPKPQI
        T +PQ+
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7SRV0 Putative mitochondrial protein2.8e-5681.82Show/hide
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A0A5A7U3T5 Flocculation protein FLO11-like1.1e-1246.51Show/hide
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        SSS + S +       D +S SSDGDDS+VL KLL  FKIGD F  SST AP AQGI SSP   + P NV   T + +        ES ED D+DY+P  
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        ++THVP+E+ V     TLS  N+T +P +
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A0A5D3BN12 Flocculation protein FLO11-like1.7e-0841.8Show/hide
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        SSS   S +   +   D DS S +GDDSIVLS LL+ +KI D+     +  P A  + +     S PQ++      + DESGEDTD+DYV   E+T+VPK
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Query:  ESIVLVDDPTLSRDNRTPKPQI
        E+ V  DD   S  N+T +PQ+
Subjt:  ESIVLVDDPTLSRDNRTPKPQI

A0A5D3DZG0 Flocculation protein FLO11-like2.9e-0843.65Show/hide
Query:  SSSTAPSPLKNALYAKDPDSASSDGDDSIVLSKLLQLFKIGDRFSPSSTSAPAAQGICSSPRDIS-PPQNVPPQTANR----------------------
        SSS + S +       D DSASS+ D+SIVLSKLL+  K  DR  P ST AP AQG  S P D+S PP++VPP+TA R                      
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Query:  ------DESGEDTDEDYVPESEKTHV
              D+  EDTDEDYV  SEK  V
Subjt:  ------DESGEDTDEDYVPESEKTHV

A0A5D3E1D9 Flocculation protein FLO11-like2.1e-1156.63Show/hide
Query:  KIGDRFSPSSTSAPAAQGICSSPRDISPPQNVPPQT-ANRDESGEDTDEDYVPESEKTHVPKESIVLVDDPTLSRDNRTPKPQ
        K+ DR  P ST A AAQ    SP  +SPPQ+    +  ++DES  DT EDYV  S+KTH+PKE+IV +DDPTLSR+NRTP+PQ
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTATTGATTCATCTTCCACGGCTCCATCTCCTCTCAAGAATGCGTTATATGCTAAAGATCCAGATTCCGCTTCCTCGGATGGTGATGACTCAATCGTTCTCTCGAA
GCTACTTCAGCTATTCAAGATAGGGGATCGATTTAGTCCTTCGTCTACTTCGGCCCCAGCTGCACAGGGTATATGTTCATCACCTCGTGACATTTCTCCTCCTCAAAATG
TTCCTCCTCAAACTGCAAATCGTGATGAGTCGGGTGAAGATACTGATGAGGACTATGTTCCAGAATCTGAGAAAACCCATGTTCCAAAAGAATCCATTGTCCTAGTTGAT
GACCCTACTCTGTCTCGTGACAACCGAACGCCTAAGCCTCAAATCAACTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTATTGATTCATCTTCCACGGCTCCATCTCCTCTCAAGAATGCGTTATATGCTAAAGATCCAGATTCCGCTTCCTCGGATGGTGATGACTCAATCGTTCTCTCGAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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