| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG7025359.1 hypothetical protein SDJN02_11854 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 1.83e-145 | 74.1 | Show/hide |
Query: MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKLVSL---------------------RHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVE
MAN A+ L+ SS SS S IL K N KQLHS PSS HFD+ KL L RHNHG RFPVLFTVLD E+A+T E I E
Subjt: MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKLVSL---------------------RHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVE
Query: GDVKSESSVSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDM
VKSE SVSNQEVK LARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKP+GTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSI ALD SDVGGREMRVRFAVDM
Subjt: GDVKSESSVSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDM
Query: NPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGF
NPK RN NNL+SSP+KNIIYESPYK+Y+GNL+WDV+P DLRNLF +FGTVVSAK+LNDRRAGKSR+YGFLSFSSAAERDA+ISL+GTEF RKL+V+EG
Subjt: NPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGF
Query: ERSES
ER+ES
Subjt: ERSES
|
|
| XP_004140529.1 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic [Cucumis sativus] | 2.16e-188 | 95.1 | Show/hide |
Query: MANLATSLTFSSSSSPS--LWILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQEVKKLAR
MANLATSLTFSSSSSPS LWILKHKSP+YCTFKQLHSF SSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSE S+SNQEVKKLAR
Subjt: MANLATSLTFSSSSSPS--LWILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQEVKKLAR
Query: PCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNII
PCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSI ALDGSDVGGREMRVRFAVDMN K RNLNNL+SSPKKNII
Subjt: PCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNII
Query: YESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGFERSES
YESPYKVYVGNLSWDV+PGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTE+N RKLVVREG ERSES
Subjt: YESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGFERSES
|
|
| XP_008459818.1 PREDICTED: 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic [Cucumis melo] | 7.42e-200 | 100 | Show/hide |
Query: MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQEVKKLARPC
MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQEVKKLARPC
Subjt: MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQEVKKLARPC
Query: ELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYE
ELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYE
Subjt: ELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYE
Query: SPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGFERSES
SPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGFERSES
Subjt: SPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGFERSES
|
|
| XP_022156980.1 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic [Momordica charantia] | 6.25e-152 | 75.4 | Show/hide |
Query: MANLATSLTFSSSSSPSL----WILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKL---------------------VSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEE
MAN AT LT SSSSS S WIL+ +CT KQLHS PSS HF Y+KL SL HN RF VL +LD ESA+TEE
Subjt: MANLATSLTFSSSSSPSL----WILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKL---------------------VSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEE
Query: AIVEGDVKSESSVSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRF
AI E DVKSE + SNQEVKK A+PCELYVCNLPR+CDIAELVEMFKP+GTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRF
Subjt: AIVEGDVKSESSVSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRF
Query: AVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVV
AVDM+PK RN+ NLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNL+WDV+PGDLR+LFS+FGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAER+A+ISLDGTEFN RKL+V
Subjt: AVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVV
Query: REGFERSES
REG ER+ES
Subjt: REGFERSES
|
|
| XP_038906862.1 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic [Benincasa hispida] | 2.03e-183 | 90.41 | Show/hide |
Query: MANLATSLTFSSSSS--------PSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQE
MANLATSLTFSSSSS PSLWILKHKSPNYC+FK+LHSFPSS HFD+TKLVSLRHNHG RFPVLFTVL+NESALTEE I EGDVKSE SVSNQE
Subjt: MANLATSLTFSSSSS--------PSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQE
Query: VKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSS
VKK ARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPK RNLNNL+SS
Subjt: VKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSS
Query: PKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGFERSES
PKKNIIYESPYKVY+GNL+WDV+PGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDA+ISLDGTE+N RKLVVREG ER+ES
Subjt: PKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGFERSES
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0KAH9 Uncharacterized protein | 1.6e-147 | 95.1 | Show/hide |
Query: MANLATSLTFSSSS--SPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQEVKKLAR
MANLATSLTFSSSS SPSLWILKHKSP+YCTFKQLHSF SSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSE S+SNQEVKKLAR
Subjt: MANLATSLTFSSSS--SPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQEVKKLAR
Query: PCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNII
PCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSI ALDGSDVGGREMRVRFAVDMN K RNLNNL+SSPKKNII
Subjt: PCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNII
Query: YESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGFERSES
YESPYKVYVGNLSWDV+PGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTE+N RKLVVREG ERSES
Subjt: YESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGFERSES
|
|
| A0A1S3CB56 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 3.2e-156 | 100 | Show/hide |
Query: MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQEVKKLARPC
MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQEVKKLARPC
Subjt: MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQEVKKLARPC
Query: ELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYE
ELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYE
Subjt: ELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYE
Query: SPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGFERSES
SPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGFERSES
Subjt: SPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGFERSES
|
|
| A0A5D3DM74 28 kDa ribonucleoprotein | 3.2e-156 | 100 | Show/hide |
Query: MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQEVKKLARPC
MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQEVKKLARPC
Subjt: MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQEVKKLARPC
Query: ELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYE
ELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYE
Subjt: ELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYE
Query: SPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGFERSES
SPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGFERSES
Subjt: SPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGFERSES
|
|
| A0A6J1DRW5 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 4.8e-120 | 75.4 | Show/hide |
Query: MANLATSLTFSSSSSPSL----WILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKL---------------------VSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEE
MAN AT LT SSSSS S WIL+ +CT KQLHS PSS HF Y+KL SL HN RF VL +LD ESA+TEE
Subjt: MANLATSLTFSSSSSPSL----WILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKL---------------------VSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEE
Query: AIVEGDVKSESSVSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRF
AI E DVKSE + SNQEVKK A+PCELYVCNLPR+CDIAELVEMFKP+GTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRF
Subjt: AIVEGDVKSESSVSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRF
Query: AVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVV
AVDM+PK RN+ NLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNL+WDV+PGDLR+LFS+FGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAER+A+ISLDGTEFN RKL+V
Subjt: AVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVV
Query: REGFERSES
REG ER+ES
Subjt: REGFERSES
|
|
| A0A6J1H6A5 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 1.0e-114 | 74.43 | Show/hide |
Query: MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKL------------VS---------LRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVE
MAN A+ L+ SS SS S IL K N KQLHS PSS HFD+ KL VS LRH HG RFPV+FTVLD E+A+T E I E
Subjt: MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSFPSSFHFDYTKL------------VS---------LRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVE
Query: GDVKSESSVSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDM
VKSE SVSNQEVK LARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKP+GTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSI ALD SDVGGREMRVRFAVDM
Subjt: GDVKSESSVSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDM
Query: NPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGF
NPK RN NNL+SSP+KNIIYESPYK+Y+GNL+WDV+P DLRNLFS+FGTVVSAK+LNDRRAGKSR+YGFLSFSSAAERDA+ISL+GTEF RKL+V+EG
Subjt: NPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGF
Query: ERSES
ER+ES
Subjt: ERSES
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P19682 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 1.4e-23 | 30.48 | Show/hide |
Query: PNYCTFKQLHSF--------PSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVL--DNESALTEEAIVEGDVKS--ESSVSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDI
P + T K + S+ P S L+SL + +FP +VL D+ + + ++ GD S + +E ++ + +L+V NLP D
Subjt: PNYCTFKQLHSF--------PSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVL--DNESALTEEAIVEGDVKS--ESSVSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDI
Query: AELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWD
L ++F+ G V AEV N ET S+G G+VTM ++ A ++ D+ GR + V A + +P+ ++ Y++YVGN+ WD
Subjt: AELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWD
Query: VQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASI-SLDGTEFNKRKLVVREGFER
+ L +FS G VVSA+V+ DR +G+SR +GF++ SS AE +I +LDG + R + V ER
Subjt: VQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASI-SLDGTEFNKRKLVVREGFER
|
|
| P28644 28 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 3.3e-25 | 35.24 | Show/hide |
Query: GERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAK
GE P +E+ +++E VEG Q + +L+V NLP D +L +F G V AEV N ET S+G G+VTM ++ A+
Subjt: GERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAK
Query: VSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAA
++ L+G D+ GR++ V A R +P+ + +E +VYVGNL WDV L LFS G VVSA+V++DR G+SR +GF++ SS +
Subjt: VSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAA
Query: E-RDASISLDGTEFNKRKLVVREGFER
E DA +LDG + R + V ER
Subjt: E-RDASISLDGTEFNKRKLVVREGFER
|
|
| Q04836 31 kDa ribonucleoprotein, chloroplastic | 9.5e-25 | 36.57 | Show/hide |
Query: NESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQ-EVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDV
+E ++E EGDV SE +VS + E + + +L+V NL + L +F+ GTV AEV N ET S+G G+VTM S++ A+ ++ + D+
Subjt: NESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQ-EVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDV
Query: GGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASIS-LDG
GR + V A + +P+ +YE ++VYVGNL WDV G L LFS G VV A+V+ DR G+SR +GF++ S E + +IS LDG
Subjt: GGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASIS-LDG
Query: TEFNKRKLVVREGFER
R + V ER
Subjt: TEFNKRKLVVREGFER
|
|
| Q08935 29 kDa ribonucleoprotein A, chloroplastic | 1.4e-23 | 33.94 | Show/hide |
Query: MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSF-PSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQEVKKLARP
MA+ A+SL F S + +L + K S T S PSS + L S RF T+ D + E + +GD E E + +
Subjt: MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTFKQLHSF-PSSFHFDYTKLVSLRHNHGERFPVLFTVLDNESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQEVKKLARP
Query: CELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIY
+++V NLP S D A L E+F+ G V EV + TG S+G G+VTM S + + +G ++ GR +RV P+ R ++ + +
Subjt: CELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIY
Query: ESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASI-SLDGTEFNKRKLVV
+S +VYVGNL+W V L LFS G VV AKV+ DR +G+SR +GF+++SSA E + +I SLDG + N R + V
Subjt: ESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASI-SLDGTEFNKRKLVV
|
|
| Q9FGS0 RNA-binding protein CP31B, chloroplastic | 1.4e-23 | 33.98 | Show/hide |
Query: VEGDVKSESSVSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAV
V+ +SE V E + A+ L+V NLP D L +F+ GTV +EV N +T S+G G+VTM ++ A+ ++ + +V GR + V
Subjt: VEGDVKSESSVSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAV
Query: DMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASI-SLDGTEFNKRKLVVR
NR + ++ +Y++ +++YVGNL WDV G L LFS G VV A+V++DR G+SR +GF+ S+ E + +I +LDG R + V
Subjt: DMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASI-SLDGTEFNKRKLVVR
Query: EGFERS
ER+
Subjt: EGFERS
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G01080.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 8.2e-72 | 50.17 | Show/hide |
Query: MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTF--KQLHSFPSSFHFDYTKLVSLRHNHGER----FPVLFTVLDNESAL----TEEAIVEGDVK--SESSV
MA ++ SSSS S + P Y T +S+ S ++ S H+ R P+ V +E ++ EE +V+G+ + +S V
Subjt: MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTF--KQLHSFPSSFHFDYTKLVSLRHNHGER----FPVLFTVLDNESAL----TEEAIVEGDVK--SESSV
Query: SNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNP-KNRNLN
S E K RPCELYVCN+PRS DIA+L++MF+P+GTV++ EVSRNP+TG S+G GYVTMGSINSAK++IA+LDG++VGGREMRVR++VDMNP RN
Subjt: SNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNP-KNRNLN
Query: NLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGFERSES
LNS+PKK ++YES +KVYVGNL W QP LRN FS+FGT+VS +VL+DR+ G++RV+ FLSF+S ERDA++S +GT++ R+++VREG E+SES
Subjt: NLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGFERSES
|
|
| AT1G01080.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.0e-70 | 50 | Show/hide |
Query: MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTF--KQLHSFPSSFHFDYTKLVSLRHNHGER----FPVLFTVLDNESAL----TEEAIVEGDVK--SESSV
MA ++ SSSS S + P Y T +S+ S ++ S H+ R P+ V +E ++ EE +V+G+ + +S V
Subjt: MANLATSLTFSSSSSPSLWILKHKSPNYCTF--KQLHSFPSSFHFDYTKLVSLRHNHGER----FPVLFTVLDNESAL----TEEAIVEGDVK--SESSV
Query: SNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAE-VSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNP-KNRNL
S E K RPCELYVCN+PRS DIA+L++MF+P+GTV++ E VSRNP+TG S+G GYVTMGSINSAK++IA+LDG++VGGREMRVR++VDMNP RN
Subjt: SNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAE-VSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAVDMNP-KNRNL
Query: NNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGFERSES
LNS+PKK ++YES +KVYVGNL W QP LRN FS+FGT+VS +VL+DR+ G++RV+ FLSF+S ERDA++S +GT++ R+++VREG E+SES
Subjt: NNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASISLDGTEFNKRKLVVREGFERSES
|
|
| AT3G52380.1 chloroplast RNA-binding protein 33 | 1.8e-23 | 32.55 | Show/hide |
Query: EEAIVEGDV-KSESSVSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMR
EE EGD + E Q + LYV NLP + +EL ++F GTV+ ++ + T S+G G+VTMGSI AK ++ + S +GGR ++
Subjt: EEAIVEGDV-KSESSVSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMR
Query: VRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAE-RDASISLDGTEFNKR
V F + +SP+KVY GNL W++ L++ F V+ AKV+ +R G+SR +GF+SF SA + A +++G E R
Subjt: VRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAE-RDASISLDGTEFNKR
Query: KLVVREGFERSE
L + ER +
Subjt: KLVVREGFERSE
|
|
| AT4G24770.1 31-kDa RNA binding protein | 6.8e-26 | 36.57 | Show/hide |
Query: NESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQ-EVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDV
+E ++E EGDV SE +VS + E + + +L+V NL + L +F+ GTV AEV N ET S+G G+VTM S++ A+ ++ + D+
Subjt: NESALTEEAIVEGDVKSESSVSNQ-EVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDV
Query: GGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASIS-LDG
GR + V A + +P+ +YE ++VYVGNL WDV G L LFS G VV A+V+ DR G+SR +GF++ S E + +IS LDG
Subjt: GGREMRVRFAVDMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASIS-LDG
Query: TEFNKRKLVVREGFER
R + V ER
Subjt: TEFNKRKLVVREGFER
|
|
| AT5G50250.1 chloroplast RNA-binding protein 31B | 9.8e-25 | 33.98 | Show/hide |
Query: VEGDVKSESSVSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAV
V+ +SE V E + A+ L+V NLP D L +F+ GTV +EV N +T S+G G+VTM ++ A+ ++ + +V GR + V
Subjt: VEGDVKSESSVSNQEVKKLARPCELYVCNLPRSCDIAELVEMFKPYGTVLAAEVSRNPETGISKGCGYVTMGSINSAKVSIAALDGSDVGGREMRVRFAV
Query: DMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASI-SLDGTEFNKRKLVVR
NR + ++ +Y++ +++YVGNL WDV G L LFS G VV A+V++DR G+SR +GF+ S+ E + +I +LDG R + V
Subjt: DMNPKNRNLNNLNSSPKKNIIYESPYKVYVGNLSWDVQPGDLRNLFSRFGTVVSAKVLNDRRAGKSRVYGFLSFSSAAERDASI-SLDGTEFNKRKLVVR
Query: EGFERS
ER+
Subjt: EGFERS
|
|
