; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0017373 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0017373
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptionprotein RALF-like 33
Genome locationchr05:23102096..23102461
RNA-Seq ExpressionIVF0017373
SyntenyIVF0017373
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0048028.1 Rapid ALkalinization Factor [Cucumis melo var. makuwa]9.92e-84100Show/hide
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KGN60987.2 hypothetical protein Csa_021272 [Cucumis sativus]1.01e-7896.61Show/hide
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XP_022937540.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita moschata]5.98e-7690.08Show/hide
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XP_022966015.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita maxima]3.46e-7589.26Show/hide
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XP_038889183.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]5.32e-7994.21Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFW9 Uncharacterized protein1.1e-6096.69Show/hide
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A0A5A7TYI2 Rapid ALkalinization Factor1.5e-62100Show/hide
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A0A6J1DA82 protein RALF-like 334.8e-5385.95Show/hide
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A0A6J1FH12 protein RALF-like 331.2e-5690.08Show/hide
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A0A6J1HQE4 protein RALF-like 334.6e-5689.26Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 336.5e-3170.97Show/hide
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        A +  Q+S  ++P +S C G+IAEC      EEFE DSEINRRILAT++YISYGALRRN VPCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGC+AITRCR
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Q945T0 Rapid alkalinization factor1.2e-2969.47Show/hide
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        A  G   +  W+ P +S   CKGSI EC    EEFE DSE NRRILAT +YISYGAL++N+VPCSRRGASYYNC+PGAQANPYSRGC+AITRCRS
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Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 231.8e-2866.32Show/hide
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        P ++ C+G+IAEC             +G    GEEFE DSEINRRILAT +YISYGALRRN +PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGC+AITRCR
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Q9MA62 Protein RALF-like 221.5e-2777.63Show/hide
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        S C GSIAEC    EE EFDS+I+RRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPYSRGC+ ITRCR
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Q9SRY3 Protein RALF-like 18.5e-3162.07Show/hide
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        T FL +  + ++F  SS  V AG       +AW     N S C GSIAEC G EE E DSEINRRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ GAQ
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        ANPYSRGC+ I RCRS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 16.0e-3262.07Show/hide
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AT2G33775.1 ralf-like 195.5e-1755.42Show/hide
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        W   +S   G    C G  GE ++  DSE NRR LA  + YISYGALR+NNVPCSRRG SYY+C+   +ANPY RGC+ IT C
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AT3G05490.1 ralf-like 221.1e-2877.63Show/hide
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        S C GSIAEC    EE EFDS+I+RRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPYSRGC+ ITRCR
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AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 231.3e-2966.32Show/hide
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        P ++ C+G+IAEC             +G    GEEFE DSEINRRILAT +YISYGALRRN +PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGC+AITRCR
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AT4G15800.1 ralf-like 334.6e-3270.97Show/hide
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        A +  Q+S  ++P +S C G+IAEC      EEFE DSEINRRILAT++YISYGALRRN VPCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGC+AITRCR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CAGTCTTGCATGGATTCCTAATCAATCTACCTGTAAGGGCTCCATAGCGGAGTGTTTCGGGGGAGAGGAGTTTGAATTTGATTCAGAAATCAACCGCCGTATCTTGGCAA
CTAGCCAGTACATCAGCTACGGCGCTCTTCGGAGGAACAACGTGCCGTGCTCGAGACGTGGTGCGTCTTATTACAATTGTCAGCCCGGAGCTCAGGCCAATCCCTATAGC
CGTGGATGCAACGCCATTACGAGGTGCAGGAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAATGGCCGGATTCAATTCTCCGACCTTCTTCCTGATCTCCGCCGCCGTGTTTCTTATCTTCAGCTGTTCCTCAACCGCCGTCCACGCCGGTATTGGGATCCAAAA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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