| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0050456.1 RNA polymerase sigma factor sigE [Cucumis melo var. makuwa] | 3.06e-310 | 86.84 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRLT--------------------DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
MGVVTVSSSAARTPFRL+ DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRLT--------------------DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Query: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRA----------------IDGLRLDLEKRIALKS
LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSK+SDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRA IDGLRLDLEKRIALKS
Subjt: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRA----------------IDGLRLDLEKRIALKS
Query: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLLR------------LEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRL+R ++MKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Subjt: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLLR------------LEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Query: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Subjt: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Query: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Subjt: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Query: DGKGNRTL------------------VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
DGKGNRTL VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
Subjt: DGKGNRTL------------------VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| TYK03136.1 RNA polymerase sigma factor sigE [Cucumis melo var. makuwa] | 1.07e-310 | 87.02 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRLT--------------------DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
MGVVTVSSSAARTPFRL+ DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRLT--------------------DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Query: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRA----------------IDGLRLDLEKRIALKS
LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRA IDGLRLDLEKRIALKS
Subjt: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRA----------------IDGLRLDLEKRIALKS
Query: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLLR------------LEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRL+R ++MKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Subjt: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLLR------------LEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Query: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Subjt: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Query: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Subjt: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Query: DGKGNRTL------------------VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
DGKGNRTL VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
Subjt: DGKGNRTL------------------VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| XP_008465379.1 PREDICTED: RNA polymerase sigma factor sigE, chloroplastic/mitochondrial [Cucumis melo] | 7.83e-288 | 83.43 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRLT--------------------DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
MGVVTVSSSAARTPFRL+ DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRLT--------------------DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Query: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAIDGLRLDLEKRIALKSNKEGKAAPSLRKQKET
LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSK+SDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNK++ E K+ +++ KET
Subjt: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAIDGLRLDLEKRIALKSNKEGKAAPSLRKQKET
Query: KNEDDEIDRLLR------------LEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKH
KNEDDEIDRL+R ++MKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKH
Subjt: KNEDDEIDRLLR------------LEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKH
Query: NLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTE
NLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTE
Subjt: NLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTE
Query: EEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTL--------
EEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTL
Subjt: EEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTL--------
Query: ----------VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
Subjt: ----------VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| XP_011651413.1 RNA polymerase sigma factor sigE, chloroplastic/mitochondrial isoform X2 [Cucumis sativus] | 2.96e-294 | 83 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRL--------------------TDKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
MGVVTVSS+AARTPFRL DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNR KKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEAT CSLDLDYNEAAAK
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRL--------------------TDKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Query: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRA----------------IDGLRLDLEKRIALKS
LENIFKLSPMTEDSD E KDGRSKRGQ+RSK+S RP DGIVRN+TKRIKRLDLDKRIALKNKKEG+A IDGL L+LEKRIALKS
Subjt: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRA----------------IDGLRLDLEKRIALKS
Query: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLLR------------LEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
NKEGKA PSLRKQKETKNEDDEIDRL+R ++MKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKAL+EVQEELQK LGREPTE ELANATNMNVIQVR
Subjt: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLLR------------LEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Query: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFA+GPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Subjt: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Query: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
RAKLELLCELHRLPTE EI AKVGIS ERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Subjt: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Query: DGKGNRTL------------------VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
DGKGNRTL VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
Subjt: DGKGNRTL------------------VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| XP_031739380.1 RNA polymerase sigma factor sigE, chloroplastic/mitochondrial isoform X1 [Cucumis sativus] | 1.20e-293 | 83 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRL--------------------TDKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
MGVVTVSS+AARTPFRL DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNR KKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEAT CSLDLDYNEAAAK
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRL--------------------TDKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Query: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRA----------------IDGLRLDLEKRIALKS
LENIFKLSPMTEDSD E KDGRSKRGQ+RSK+S RP DGIVRN+TKRIKRLDLDKRIALKNKKEG+A IDGL L+LEKRIALKS
Subjt: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRA----------------IDGLRLDLEKRIALKS
Query: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLLR------------LEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
NKEGKA PSLRKQKETKNEDDEIDRL+R ++MKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKAL+EVQEELQK LGREPTE ELANATNMNVIQVR
Subjt: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLLR------------LEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Query: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFA+GPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Subjt: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Query: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
RAKLELLCELHRLPTE EI AKVGIS ERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Subjt: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Query: DGKGNRTL------------------VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
DGKGNRTL VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
Subjt: DGKGNRTL------------------VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LCQ9 Uncharacterized protein | 1.2e-232 | 83 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRL--------------------TDKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
MGVVTVSS+AARTPFRL DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNR KKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEAT CSLDLDYNEAAAK
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRL--------------------TDKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Query: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRA----------------IDGLRLDLEKRIALKS
LENIFKLSPMTEDSD E KDGRSKRGQ+RSK+S RP DGIVRN+TKRIKRLDLDKRIALKNKKEG+A IDGL L+LEKRIALKS
Subjt: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRA----------------IDGLRLDLEKRIALKS
Query: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLLR------------LEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
NKEGKA PSLRKQKETKNEDDEIDRL+R ++MKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKAL+EVQEELQK LGREPTE ELANATNMNVIQVR
Subjt: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLLR------------LEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Query: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFA+GPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Subjt: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Query: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
RAKLELLCELHRLPTE EI AKVGIS ERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Subjt: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Query: DGKGNRTL------------------VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
DGKGNRTL VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
Subjt: DGKGNRTL------------------VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| A0A1S3CQ87 RNA polymerase sigma factor sigE, chloroplastic/mitochondrial | 3.4e-227 | 83.43 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRLT--------------------DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
MGVVTVSSSAARTPFRL+ DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRLT--------------------DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Query: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAIDGLRLDLEKRIALKSNKEGKAAPSLRKQKET
LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSK+SDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNK++ E K+ +++ KET
Subjt: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAIDGLRLDLEKRIALKSNKEGKAAPSLRKQKET
Query: KNEDDEIDRLLR------------LEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKH
KNEDDEIDRL+R ++MKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKH
Subjt: KNEDDEIDRLLR------------LEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKH
Query: NLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTE
NLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTE
Subjt: NLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTE
Query: EEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTL--------
EEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTL
Subjt: EEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTL--------
Query: ----------VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
Subjt: ----------VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| A0A5A7U8E5 RNA polymerase sigma factor sigE | 8.1e-245 | 86.84 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRLT--------------------DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
MGVVTVSSSAARTPFRL+ DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRLT--------------------DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Query: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRA----------------IDGLRLDLEKRIALKS
LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSK+SDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRA IDGLRLDLEKRIALKS
Subjt: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRA----------------IDGLRLDLEKRIALKS
Query: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLLR------------LEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRL+R ++MKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Subjt: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLLR------------LEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Query: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Subjt: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Query: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Subjt: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Query: DGKGNRTL------------------VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
DGKGNRTL VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
Subjt: DGKGNRTL------------------VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| A0A5D3BY73 RNA polymerase sigma factor sigE | 3.6e-245 | 87.02 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRLT--------------------DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
MGVVTVSSSAARTPFRL+ DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRLT--------------------DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Query: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRA----------------IDGLRLDLEKRIALKS
LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRA IDGLRLDLEKRIALKS
Subjt: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRA----------------IDGLRLDLEKRIALKS
Query: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLLR------------LEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRL+R ++MKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Subjt: NKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLLR------------LEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVR
Query: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Subjt: RQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQ
Query: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Subjt: RAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGL
Query: DGKGNRTL------------------VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
DGKGNRTL VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
Subjt: DGKGNRTL------------------VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| A0A6J1E518 RNA polymerase sigma factor sigE, chloroplastic/mitochondrial-like isoform X2 | 4.0e-212 | 78.15 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTPFRL--------------------TDKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
MGVVTVSSSAARTPFRL DKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNR++KR+G +SK LKRVKAVLIDEAT C+ D+DYNEAAAK
Subjt: MGVVTVSSSAARTPFRL--------------------TDKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLIDEATSCSLDLDYNEAAAK
Query: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAIDGLRLDLEKRIALKSNKEGKAAPSLRKQKET
LENIFKLSP+TED+DME++DGR KRGQQR K+ KRP DG+VRN+TKRIKRLDLD KRIALKSNKEGK+APSL KQK+T
Subjt: LENIFKLSPMTEDSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAIDGLRLDLEKRIALKSNKEGKAAPSLRKQKET
Query: KNEDDEIDRLLR------------LEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKH
K+E DEID L+R ++MKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALI+ QEELQK LGREPTE ELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKH
Subjt: KNEDDEIDRLLR------------LEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKH
Query: NLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTE
NLRLVLFVINKYFEDFA+GPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKR+FRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTE
Subjt: NLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTE
Query: EEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTL--------
EE+IAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEE I+GI DVEGTGGDNRRQ ALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTL
Subjt: EEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTL--------
Query: ----------VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
Subjt: ----------VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O22056 RNA polymerase sigma factor sigB | 4.5e-27 | 28.96 | Show/hide |
Query: KAAPSLRKQKETKNEDDEID--RLLRLEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLI
K S +K++ E D D R LR+ + EH L +Q + L +Q EL + GR+PT A+ A+A ++ +R+++ G ++K+I
Subjt: KAAPSLRKQKETKNEDDEID--RLLRLEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLI
Query: KHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMT-LSSFTRVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRL
K N+RLV+ + Y G QDL Q G +GL+ ++F+ + F+ STYA +WI+ A+ +S++ S R+ F + ++ A+ +L E +
Subjt: KHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMT-LSSFTRVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRL
Query: PTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSE-ELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTLVK--
P EEI G+S +R + V+ + KP SL + + I D E ++ +R LD VLDSL +E VIR R+G++ +TL +
Subjt: PTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSE-ELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTLVK--
Query: ----------------ALMKLKHPARVDYLRRYLI
A KLK+ R ++L++YL+
Subjt: ----------------ALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| P26683 RNA polymerase sigma factor SigA | 1.3e-34 | 32.34 | Show/hide |
Query: KEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLLRLEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKL
K GKAA S R+ + K E L L+E+ +L + E L + + + L V+E L ++L R+P ++E A A + + R +L +GR A++K+
Subjt: KEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLLRLEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKL
Query: IKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFT-RVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHR
++ NLRLV+ + KY G FQDL Q G GLI A ++F+ ++ ++ STYA +WIR AI R++ S T R+ L I++ L E+ R
Subjt: IKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFT-RVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHR
Query: LPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTL----
PTEEEI ++ ++ E+ + ++ + SL + + + + +G +++ LLR L+ VLDSL P+E V+R RYGLD +TL
Subjt: LPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTL----
Query: --------------VKALMKLKHPARVDYLRRYL
KAL KL+HP R L+ Y+
Subjt: --------------VKALMKLKHPARVDYLRRYL
|
|
| P38023 RNA polymerase sigma factor SigA1 | 8.0e-32 | 31.83 | Show/hide |
Query: EGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLLRLEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLI
E AA + K ++T ED L L+E+ +L + E L + + + AL +++EL ++L R P++AE A A + + + RR+L GR A++K++
Subjt: EGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLLRLEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLI
Query: KHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFT-RVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRL
+ NLRLV+ + KY G FQDL Q G GLI A ++F+ ++ ++ STYA +WIR AI R++ S T R+ L I++ L E+ R
Subjt: KHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFT-RVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRL
Query: PTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTL-----
PTEEEI ++ ++ E+ + ++ + SL + + + + +G ++ LLR L+ VL +L P+E V+R RYGLD +TL
Subjt: PTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTL-----
Query: -------------VKALMKLKHPARVDYLRRYL
KAL KL+HP R L+ Y+
Subjt: -------------VKALMKLKHPARVDYLRRYL
|
|
| P74565 RNA polymerase sigma factor SigA | 3.5e-27 | 28.53 | Show/hide |
Query: DLEKRIALKSNKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLLRLEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAE---------------
DLE+ +A KE K +RK K E + L+E+ +L + E L + + + L +++ L +L R+P+E E
Subjt: DLEKRIALKSNKEGKAAPSLRKQKETKNEDDEIDRLLRLEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAE---------------
Query: ----------------LAN-------------ATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEP
LAN N N RR+L + R A++K+++ NLRLV+ + KY G FQDL Q G GLI A ++F+
Subjt: ----------------LAN-------------ATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEP
Query: KRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFT-RVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELING
++ ++ STYA +WIR AI R++ S T R+ L I++ L E+ R PTEEEI K+ ++ E+ + ++ + SL + + +
Subjt: KRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFT-RVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELING
Query: ITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTL------------------VKALMKLKHPARVDYLRRYL
+ +G ++ LLR L++VLD+L P+E V+R RYGLD +TL KAL KL+HP R L+ Y+
Subjt: ITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTL------------------VKALMKLKHPARVDYLRRYL
|
|
| Q9ZNX9 RNA polymerase sigma factor sigE, chloroplastic/mitochondrial | 9.8e-139 | 54.56 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTP---------------------FRLTDKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLI---DEATSCSLDLDYNE
MGVV++SSSAAR+P F+ D + ++ P EQV +P E +N KKR KP K K L + A SCSL +DYNE
Subjt: MGVVTVSSSAARTP---------------------FRLTDKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLI---DEATSCSLDLDYNE
Query: AAAKLENIFKLSPMTE---DSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAIDGLRLDLEKRIALKSNKEGKAAPS
AAA+LE+I+KLSP T + D+E ++K ++R ++ +VRN K+ KR+ LDKRIALK + + + ++K++ + +E K
Subjt: AAAKLENIFKLSPMTE---DSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAIDGLRLDLEKRIALKSNKEGKAAPS
Query: LRKQKETKNEDDEIDRLLRLEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLV
R ++ +D + L ++MKIPPVL S+EH LFKL+QPMKAL+EV++ LQK LGREP EAE+A NM +V++++E+GRAARNKLIKHNLRLV
Subjt: LRKQKETKNEDDEIDRLLRLEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLV
Query: LFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIA
LFV+NKYF +F GPKFQDLCQAG++GLITAIDRFEPKRKFRLSTY LFWIRHAIIRSMT S+FTRV FGL+SVRVEI +AK EL E+ R PTE+E++
Subjt: LFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIA
Query: KVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTL-------------
++ I+PERY EV+RA KPV SL+S+HS T EE INGITDV+G G +N RQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKG+RTL
Subjt: KVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTL-------------
Query: -----VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
VKALMKLKH ARVDYLR+Y++
Subjt: -----VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G08540.1 RNApolymerase sigma subunit 2 | 3.2e-28 | 28.96 | Show/hide |
Query: KAAPSLRKQKETKNEDDEID--RLLRLEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLI
K S +K++ E D D R LR+ + EH L +Q + L +Q EL + GR+PT A+ A+A ++ +R+++ G ++K+I
Subjt: KAAPSLRKQKETKNEDDEID--RLLRLEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLI
Query: KHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMT-LSSFTRVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRL
K N+RLV+ + Y G QDL Q G +GL+ ++F+ + F+ STYA +WI+ A+ +S++ S R+ F + ++ A+ +L E +
Subjt: KHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMT-LSSFTRVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRL
Query: PTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSE-ELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTLVK--
P EEI G+S +R + V+ + KP SL + + I D E ++ +R LD VLDSL +E VIR R+G++ +TL +
Subjt: PTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSE-ELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTLVK--
Query: ----------------ALMKLKHPARVDYLRRYLI
A KLK+ R ++L++YL+
Subjt: ----------------ALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
| AT1G64860.1 sigma factor A | 2.4e-15 | 28.86 | Show/hide |
Query: VLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKG
VL E RL K ++ L + + L+ LG EP++ +LA + ++ +++ L AR KL N+RLV+ + +Y G + DL Q G+ G
Subjt: VLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKG
Query: LITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFT-RVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRH
L+ I++F+ + FR+STY +WIR + R++ +S T R+ L I+ AKL L E P+ + I + +S ++ A V+SL R
Subjt: LITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFT-RVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRH
Query: STTSEELINGITD---VEGTGGDNRRQPALLRLALDD-----VLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKG------------NRTLVK-----ALMKLKHPAR
+ S + G T + T +N LAL + + +L +E +IR YGLD + +R V+ AL KLKH AR
Subjt: STTSEELINGITD---VEGTGGDNRRQPALLRLALDD-----VLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKG------------NRTLVK-----ALMKLKHPAR
|
|
| AT1G64860.2 sigma factor A | 4.1e-15 | 29.01 | Show/hide |
Query: VLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKG
VL E RL K ++ L + + L+ LG EP++ +LA + ++ +++ L AR KL N+RLV+ + +Y G + DL Q G+ G
Subjt: VLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVLFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKG
Query: LITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFT-RVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRH
L+ I++F+ + FR+STY +WIR + R++ +S T R+ L I+ AKL L E P+ + I + +S ++ A V+SL R
Subjt: LITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFT-RVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIAKVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRH
Query: STTSEELINGITD---VEGTGGDNRRQPALLRLALDD-----VLDSLKPKESLVIRQRYGLD
+ S + G T + T +N LAL + + +L +E +IR YGLD
Subjt: STTSEELINGITD---VEGTGGDNRRQPALLRLALDD-----VLDSLKPKESLVIRQRYGLD
|
|
| AT2G36990.1 RNApolymerase sigma-subunit F | 9.7e-25 | 30.03 | Show/hide |
Query: RKQKETKNEDDEIDRLLRLEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVL
+K K+ + DD + L E K +L + E L +Q + L +V+ +L+ + G EPT E A A ++ ++ + GR++R KLI NLRLV+
Subjt: RKQKETKNEDDEIDRLLRLEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLVL
Query: FVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFT-RVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIA
+ +Y G FQDL Q G GL+ ++++F+P+ R +TYA +WIR +I +S+ +S T R+ + + ++ A+ + E + P++EE+
Subjt: FVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFT-RVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIA
Query: KVGISPERYLEVMRATKPVYSLH----SRHSTTSEELI--NGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTL
VG+S E+ +++ T+ S+ S TT +E+ +GI + G L+R + ++L+ L PKE +I+ R+G+DG R+L
Subjt: KVGISPERYLEVMRATKPVYSLH----SRHSTTSEELI--NGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTL
|
|
| AT5G24120.1 sigma factor E | 7.0e-140 | 54.56 | Show/hide |
Query: MGVVTVSSSAARTP---------------------FRLTDKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLI---DEATSCSLDLDYNE
MGVV++SSSAAR+P F+ D + ++ P EQV +P E +N KKR KP K K L + A SCSL +DYNE
Subjt: MGVVTVSSSAARTP---------------------FRLTDKHTNTTLVSPHEQVTLPVESNNRSKKRSGNTSKPLKRVKAVLI---DEATSCSLDLDYNE
Query: AAAKLENIFKLSPMTE---DSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAIDGLRLDLEKRIALKSNKEGKAAPS
AAA+LE+I+KLSP T + D+E ++K ++R ++ +VRN K+ KR+ LDKRIALK + + + ++K++ + +E K
Subjt: AAAKLENIFKLSPMTE---DSDMESKDGRSKRGQQRSKRSDKRPSDGIVRNKTKRIKRLDLDKRIALKNKKEGRAIDGLRLDLEKRIALKSNKEGKAAPS
Query: LRKQKETKNEDDEIDRLLRLEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLV
R ++ +D + L ++MKIPPVL S+EH LFKL+QPMKAL+EV++ LQK LGREP EAE+A NM +V++++E+GRAARNKLIKHNLRLV
Subjt: LRKQKETKNEDDEIDRLLRLEEMKIPPVLPSSEHTRLFKLVQPMKALIEVQEELQKELGREPTEAELANATNMNVIQVRRQLEVGRAARNKLIKHNLRLV
Query: LFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIA
LFV+NKYF +F GPKFQDLCQAG++GLITAIDRFEPKRKFRLSTY LFWIRHAIIRSMT S+FTRV FGL+SVRVEI +AK EL E+ R PTE+E++
Subjt: LFVINKYFEDFATGPKFQDLCQAGVKGLITAIDRFEPKRKFRLSTYALFWIRHAIIRSMTLSSFTRVSFGLDSVRVEIQRAKLELLCELHRLPTEEEIIA
Query: KVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTL-------------
++ I+PERY EV+RA KPV SL+S+HS T EE INGITDV+G G +N RQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKG+RTL
Subjt: KVGISPERYLEVMRATKPVYSLHSRHSTTSEELINGITDVEGTGGDNRRQPALLRLALDDVLDSLKPKESLVIRQRYGLDGKGNRTL-------------
Query: -----VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
VKALMKLKH ARVDYLR+Y++
Subjt: -----VKALMKLKHPARVDYLRRYLI
|
|
