| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0042597.1 putative RNA-binding protein 18 [Cucumis melo var. makuwa] | 8.34e-65 | 100 | Show/hide |
Query: MLTIMALRQGDENFGCSFKVKAVSLVEKEGETEDSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
MLTIMALRQGDENFGCSFKVKAVSLVEKEGETEDSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
Subjt: MLTIMALRQGDENFGCSFKVKAVSLVEKEGETEDSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
|
|
| XP_008437528.1 PREDICTED: probable RNA-binding protein 18 [Cucumis melo] | 1.83e-40 | 100 | Show/hide |
Query: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
Subjt: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
|
|
| XP_011654647.1 probable RNA-binding protein 18 isoform X2 [Cucumis sativus] | 1.83e-40 | 100 | Show/hide |
Query: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
Subjt: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
|
|
| XP_031741097.1 probable RNA-binding protein 18 isoform X1 [Cucumis sativus] | 1.53e-44 | 97.3 | Show/hide |
Query: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVFT
DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLV++
Subjt: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCLVFT
|
|
| XP_038875193.1 probable RNA-binding protein 18 [Benincasa hispida] | 5.38e-40 | 98.51 | Show/hide |
Query: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSP+GKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
Subjt: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0KJM9 RRM domain-containing protein | 1.9e-48 | 97 | Show/hide |
Query: MLTIMALRQGDENFGCSFKVKAVSLVEKEGETEDSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
MLTIMALRQGDENFG SFK+KAVSLVEKEGE+EDSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
Subjt: MLTIMALRQGDENFGCSFKVKAVSLVEKEGETEDSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
|
|
| A0A1S3ATX2 probable RNA-binding protein 18 | 3.5e-31 | 100 | Show/hide |
Query: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
Subjt: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
|
|
| A0A5A7TLJ6 Putative RNA-binding protein 18 | 2.0e-50 | 100 | Show/hide |
Query: MLTIMALRQGDENFGCSFKVKAVSLVEKEGETEDSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
MLTIMALRQGDENFGCSFKVKAVSLVEKEGETEDSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
Subjt: MLTIMALRQGDENFGCSFKVKAVSLVEKEGETEDSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
|
|
| A0A6J1H211 probable RNA-binding protein 18 isoform X1 | 2.3e-30 | 97.01 | Show/hide |
Query: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
DS+GFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIK+FSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
Subjt: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
|
|
| A0A6J1K0K5 probable RNA-binding protein 18 isoform X1 | 2.3e-30 | 97.01 | Show/hide |
Query: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
DS+GFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIK+FSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
Subjt: DSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q5R6W3 Probable RNA-binding protein 18 | 9.6e-10 | 47.27 | Show/hide |
Query: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
+L+IGNLD +ITE L+KL FGK+ DFL+H G G+PRG+ F+ + +K+
Subjt: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
|
|
| Q66J99 Probable RNA-binding protein 18 | 5.6e-10 | 48.15 | Show/hide |
Query: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSK
+L+IGN+D +ITE L+KL FGK+ DFL+H GP G+PRG+ F+ + +K
Subjt: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSK
|
|
| Q6PBM8 Probable RNA-binding protein 18 | 8.7e-11 | 49.09 | Show/hide |
Query: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
+L+IGN+D +ITE L+KL FGK+ DFL+H GP G+PRG+ F+ + +KE
Subjt: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
|
|
| Q96H35 Probable RNA-binding protein 18 | 9.6e-10 | 47.27 | Show/hide |
Query: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
+L+IGNLD +ITE L+KL FGK+ DFL+H G G+PRG+ F+ + +K+
Subjt: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
|
|
| Q9CR83 Probable RNA-binding protein 18 | 9.6e-10 | 47.27 | Show/hide |
Query: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
+L+IGNLD +ITE L+KL FGK+ DFL+H G G+PRG+ F+ + +K+
Subjt: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT3G16380.1 poly(A) binding protein 6 | 1.2e-04 | 32.14 | Show/hide |
Query: SKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
+ LY+ NLD IT + L ++F PFG I+S + + G+ +GF F+++ +++
Subjt: SKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
|
|
| AT3G47120.1 RNA recognition motif (RRM)-containing protein | 2.1e-04 | 25.33 | Show/hide |
Query: GETEDSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCL
G +++++ K + +Y+G + +TE L+ +FS +G+I+ + + R G+ +GFAF+ Y + + L
Subjt: GETEDSNGFVDEKCESKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKEVSCL
|
|
| AT5G03580.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 4.6e-07 | 45 | Show/hide |
Query: SKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKII----SEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
+ LYI NLD +++E L +FS FGK+I ++DF RGE RGFAFIE+ S +
Subjt: SKLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKII----SEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
|
|
| AT5G47620.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.1e-04 | 38.18 | Show/hide |
Query: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
K+++G L +TEA K F+ FG I ++ R + PRGF FI Y S+E
Subjt: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
|
|
| AT5G47620.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.1e-04 | 38.18 | Show/hide |
Query: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
K+++G L +TEA K F+ FG I ++ R + PRGF FI Y S+E
Subjt: KLYIGNLDLRITEAALIKLFSPFGKIISEDFLWHTRGPKRGEPRGFAFIEYSSKE
|
|
