; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0018392 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0018392
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionDNA polymerase delta subunit 4
Genome locationchr09:19754054..19755608
RNA-Seq ExpressionIVF0018392
SyntenyIVF0018392
Gene Ontology termsGO:0000731 - DNA synthesis involved in DNA repair (biological process)
GO:0006261 - DNA-dependent DNA replication (biological process)
GO:0043625 - delta DNA polymerase complex (cellular component)
GO:0003887 - DNA-directed DNA polymerase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR007218 - DNA polymerase delta, subunit 4


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6605696.1 DNA polymerase delta subunit 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.15e-6480.8Show/hide
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XP_022957680.1 uncharacterized protein LOC111459143 [Cucurbita moschata]4.15e-6480.8Show/hide
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XP_038875328.1 DNA polymerase delta subunit 4 [Benincasa hispida]1.67e-7390.55Show/hide
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A0A0A0KND6 Uncharacterized protein9.3e-6096.8Show/hide
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A0A1S3CT23 DNA polymerase delta subunit 41.5e-62100Show/hide
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A0A5A7UNL0 DNA polymerase delta subunit 41.5e-62100Show/hide
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A0A6J1H180 uncharacterized protein LOC1114591434.8e-4880.8Show/hide
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A0A6J1K4T3 uncharacterized protein LOC1114911821.2e-4679.2Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O59835 DNA polymerase delta subunit 41.5e-0653.49Show/hide
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        E +L  FD    YGP LGMTRM RW+RA +  LNPP+ +G +L
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Q3T0X9 DNA polymerase delta subunit 41.4e-0739.29Show/hide
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        S G +  + A  +    L L  D  E E +LRQFD+   YGPC G+TR+ RW RA  +GL PP ++  +L++  G  + +C LW
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Q9CWP8 DNA polymerase delta subunit 41.8e-0753.49Show/hide
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Q9HCU8 DNA polymerase delta subunit 41.0e-0742.19Show/hide
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        +D+      +LRQFD+   YGPC G+TR+ RW RA  +GL PP ++  +LK   G  + +C LW
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09815.1 polymerase delta 46.4e-3760.8Show/hide
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        MA+T   LK FYKQ KS+       SKPSSRK  +P ++A+ GS+  QPAAL+SHGS+DL +DY + E MLRQFDMN+ YGPCLGMTR+ RWERA  LG+
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        NPP +I  LLK GKVQ +CLW  RV
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTCAACGCGAGGAGGGTTGAAAGATTTCTACAAGCAAAGGAAAAGCAGTGGAATCTCCAAAGCAAAGGCTTCAAAGCCCTCTTCTAGGAAAACCAAATCTCCGGC
CAACTCTGCATCTTTGGGCTCCAATGCCGTCCAACCGGCTGCTCTCGTTTCTCACGGATCCCTCGACCTTCAAGATGATTATGGCGAGTCTGAGAATATGCTGAGGCAAT
TTGATATGAACATGGCATATGGACCATGCCTCGGAATGACCAGAATGGCACGATGGGAGCGTGCCTGTAGTCTTGGTCTGAACCCTCCAAAAGACATTGGGACACTCTTA
AAGGCTGGAAAAGTGCAGTTGGAGTGCTTATGGGATTCTCGAGTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACCAAGAACAAATTTGAAATTTGAAATTCCGAACTCGATCGATCGCAGAGAAGGAGCAAAATCAAAGATGGCGTCAACGCGAGGAGGGTTGAAAGATTTCTACAAGCAAA
GGAAAAGCAGTGGAATCTCCAAAGCAAAGGCTTCAAAGCCCTCTTCTAGGAAAACCAAATCTCCGGCCAACTCTGCATCTTTGGGCTCCAATGCCGTCCAACCGGCTGCT
CTCGTTTCTCACGGATCCCTCGACCTTCAAGATGATTATGGCGAGTCTGAGAATATGCTGAGGCAATTTGATATGAACATGGCATATGGACCATGCCTCGGAATGACCAG
AATGGCACGATGGGAGCGTGCCTGTAGTCTTGGTCTGAACCCTCCAAAAGACATTGGGACACTCTTAAAGGCTGGAAAAGTGCAGTTGGAGTGCTTATGGGATTCTCGAG
TTTAAACTTCTAAGCTTGGTGTGTTATTTTTGTTTAATGTATGAAGTGTACGCTGTGCTTATGCTTTTGGACAAAATGGTTCAGCCCCTAGCTGAAACGATAATCACTTT
TCCTGTGATATGAATGGGCTTAGAATGTTTGCTGATGACAGCTCCCTTAGTTATTTACTTCTTACTTATGTTGAAAACTTATAACAAGTAGTTGTATAGTTAAATTTGGT
GATATTTTCCTTTCCTAGTGTTACACATGAACTTGATATGATGTGTGAATCCGTGACTCAAGACACCTTTCGATTCCCACTAATTGAAGAGGAAGGGAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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