; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0018654 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0018654
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRING-type E3 ubiquitin transferase
Genome locationchr01:30657741..30661473
RNA-Seq ExpressionIVF0018654
SyntenyIVF0018654
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0061630 - ubiquitin protein ligase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type
IPR039525 - E3 ubiquitin-protein ligase RNF126-like, zinc-ribbon


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0058670.1 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like [Cucumis melo var. makuwa]1.27e-231100Show/hide
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A0A1S3CE92 RING-type E3 ubiquitin transferase4.1e-17999.1Show/hide
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A0A6J1GMD4 RING-type E3 ubiquitin transferase1.0e-15087.31Show/hide
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A0A6J1JS41 RING-type E3 ubiquitin transferase2.0e-14986.96Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22197 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC1A7.3e-1638.94Show/hide
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O22283 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHC2A2.9e-1740.21Show/hide
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Q6AVN2 E3 ubiquitin-protein ligase SIRP11.2e-1540.5Show/hide
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        T+DD     Y+L +   L L QHLA+S  S        N   P  K +V A+PT+K+       + V+ C++C D   +  +AKQ+PC H +H  CILPW
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        L  H SCP+CRF+LPS++  D
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Q8LPN7 E3 ubiquitin-protein ligase RING1-like3.3e-1629.68Show/hide
Query:  SATITATAAAE-RHTYWCHECDMSVTLVSPSSSSSSSSSSSSSSLLCPHCLTDFLEHMDFTIPTSSSSISDHPNSSSS--PTDSDPSSFVV---------
        ++T +A AA E    ++C++C+ +VT+          S SSS+   CP C   FLE  ++  P  + S++ +PNSS S  P  +DP S ++         
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Query:  --------------VDPLPITSDDN----------YLLNSPQFLRL----FQHLADSSESD-------------FVPSV-----------PFNPFTP--I
                      + P   ++  N          +L N  Q LR     F+ + ++  SD             F P +           P    TP   
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Query:  KASVMAIPTIKVTSALLDEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSDDPSDRVRCRTS
        K+++ A+PT+KVT  +L  + +  CA+C D+F    + KQ+PC H++H DC+LPWL  H+SCP+CRF+LP+DDP    R + S
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Q94AK4 E3 ubiquitin-protein ligase RZF15.0e-1738.33Show/hide
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Query:  SDDPSDRVRCRTSALLRARD
        S   S   +   +     R+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39720.1 RING-H2 finger C2A2.1e-1840.21Show/hide
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AT2G44330.1 RING/U-box superfamily protein9.4e-1944.23Show/hide
Query:  SDFVPSVPF----NPFTPIKAS-----VMAIPTIKVTSALL----DEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYHPDCILPWLSNHDSCPLCRFKLPSD
        S F  S PF    NPF   + S     + ++PTIK++S++L     +D  L CAIC++ F++   A++LPC+HLYH DCI+PWL++H+SCPLCR +LP  
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Query:  DPSD
           D
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AT3G56580.1 RING/U-box superfamily protein3.6e-1838.33Show/hide
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        S   S   +   +     R+
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AT3G56580.2 RING/U-box superfamily protein3.6e-1838.33Show/hide
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AT3G60080.1 RING/U-box superfamily protein4.0e-4641.61Show/hide
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        MSS+T T T      ER TYWCHECDMS++L+     SSS S S SS LLCP C  DFLE MD    +SSS++ D            +  + D   +  V
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Query:  DPLPITSDDNYLLNSPQFLRLFQHLADSSESDFVPSVPFNPFTPIKAS-VMAIPTIKVTSALL------DEDPVLICAICKDQFLLEVEAKQLPCSHLYH
        DP  + SDDN+LL+SP   RL +HLA  +      S   +  + +K+S + +IPTI+++S+LL      D D VL+CA+CK+ F++   A++LPCSH+YH
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         DCI+PWLS+H+SCPLCRF+LP+         +   R+R    A + A     ++D  G+R  L  +ARRH  +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCTCCGCCACCATTACCGCCACCGCCGCCGCCGAACGCCACACCTACTGGTGCCACGAGTGCGATATGAGCGTCACTTTGGTTTCCCCTTCTTCTTCTTCATCATC
ATCATCTTCTTCTTCCTCTTCCTCTCTTCTTTGCCCTCACTGCCTCACTGACTTCCTCGAACACATGGATTTCACCATACCCACTTCCTCTTCTTCCATTTCCGACCACC
CCAATTCCTCTTCTTCCCCCACAGATTCCGATCCATCATCCTTCGTCGTTGTCGACCCACTTCCGATCACTTCCGATGACAATTACCTCCTTAACAGCCCTCAATTCCTC
CGTCTTTTCCAGCACCTTGCAGATTCGTCCGAGTCTGATTTCGTCCCATCTGTCCCTTTCAACCCATTTACTCCGATCAAGGCCTCTGTCATGGCGATTCCCACTATTAA
AGTCACCTCCGCCTTGCTCGATGAAGATCCAGTTCTAATTTGTGCTATTTGTAAGGATCAGTTCCTTCTTGAGGTTGAAGCCAAACAGCTCCCTTGTTCTCATCTTTATC
ATCCAGATTGCATTCTTCCTTGGCTTTCTAATCATGATTCTTGCCCGCTTTGCCGTTTTAAGCTTCCTTCCGATGACCCTTCGGATCGTGTGAGATGTAGGACTAGTGCC
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GGATTCGTTTCAATCACCCACTCAGTTTGGGGTTGCTATGATGAGGAGTGGGGAACAGACTGACAGTGTTGAAACTGTTTCGAGTGTGGCTACTGATGATGGGATCGTAA
TTGTCAATAGCAATGGTGATGAAAATGGGTTTGTGGGAATGGATGGACCTATAACTGAGGATGCTGGAACTGTAGTTCAGGATATTGGAGTTTCTCCTTCGAGTTTTGTT
TCTGCATAA
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CTGCCACTAACCACTGCGCTAAAACCCAATTTCCAAACTACATCCTATCTCTCAAAATCTCTTATCTTTACCCAATTTTGAGGGACGAGATCGATTGATACTCCTAATTT
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GTCACTTTGGTTTCCCCTTCTTCTTCTTCATCATCATCATCTTCTTCTTCCTCTTCCTCTCTTCTTTGCCCTCACTGCCTCACTGACTTCCTCGAACACATGGATTTCAC
CATACCCACTTCCTCTTCTTCCATTTCCGACCACCCCAATTCCTCTTCTTCCCCCACAGATTCCGATCCATCATCCTTCGTCGTTGTCGACCCACTTCCGATCACTTCCG
ATGACAATTACCTCCTTAACAGCCCTCAATTCCTCCGTCTTTTCCAGCACCTTGCAGATTCGTCCGAGTCTGATTTCGTCCCATCTGTCCCTTTCAACCCATTTACTCCG
ATCAAGGCCTCTGTCATGGCGATTCCCACTATTAAAGTCACCTCCGCCTTGCTCGATGAAGATCCAGTTCTAATTTGTGCTATTTGTAAGGATCAGTTCCTTCTTGAGGT
TGAAGCCAAACAGCTCCCTTGTTCTCATCTTTATCATCCAGATTGCATTCTTCCTTGGCTTTCTAATCATGATTCTTGCCCGCTTTGCCGTTTTAAGCTTCCTTCCGATG
ACCCTTCGGATCGTGTGAGATGTAGGACTAGTGCCTTGTTAAGGGCTAGAGATCTGATGCATCAAGAAGATAGTTATGGGTTGAGGACTACTTTGGAACTCATGGCTAGA
AGGCATAGTTCTATTTCTAGTGAGGGAATTCATGTGGATTCGTTTCAATCACCCACTCAGTTTGGGGTTGCTATGATGAGGAGTGGGGAACAGACTGACAGTGTTGAAAC
TGTTTCGAGTGTGGCTACTGATGATGGGATCGTAATTGTCAATAGCAATGGTGATGAAAATGGGTTTGTGGGAATGGATGGACCTATAACTGAGGATGCTGGAACTGTAG
TTCAGGATATTGGAGTTTCTCCTTCGAGTTTTGTTTCTGCATAAATTGAGGATATGGCACCACGCAGAAGAGAAAGGGTTAGACGAGGTTGGCCTATTAGAGAAAAAGTT
TAAGTTGCAGGACCCTCTAGTGCTGTAAGATCCTCCACTGCCACAAGATCCTCTTGTGCCATAAATGCAAGGGAAGGTTGCAGGAGGTCAAACTTAGGATGCACCAGAGG
CTTCATAGTAGCAAGCCCCATCCAACGCCGAAAGTGATTTTGTTGCATTGGCAGCACAAGTAGAGGCAATTGTTACAACTATGATGGTGAGAATGCACAGTAGATGGTTG
GAACAGCCGTGGCTGATCAGGTAGCATAGCAGATTCAAGTCTGGGTTTAGGACCACCAAGATTGATCACTTGAAGCCAAGTACTTGCGGAACTTTAGGAAGTATAATCCT
CACACATTTGATGGATCATCGAAGGACCCCATAAAGTGATGAGATCTGGTGGCAGTTCGCAGAGATATGAATTGATACCAAAGCAGGACCTATGACTTGAGAACGATTTA
AGGAATGTTTTTATGAGCAGTATTTCTCCGCCAATACAAGGTAATATAGTAGAATATATGGTTGTTAGATGAATCTTAGAAAGCAGCTACCCCAAGTAGATGATTGATTG
GAAGTGTAAATTGCTACAGAGAAAGACTCTGCTATCTTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCTTCCTCTTCGGTAACCATGTCTCAACATAATAAGAGATGAACCTTATTTACAT
TGTTAATCTTATCACCTAGCAATGTTTCCCTTCTCTCTTTTGGTCATGGTTTGAGTCAATGAGGCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATATA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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LLRARDLMHQEDSYGLRTTLELMARRHSSISSEGIHVDSFQSPTQFGVAMMRSGEQTDSVETVSSVATDDGIVIVNSNGDENGFVGMDGPITEDAGTVVQDIGVSPSSFV
SA