; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0018734 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0018734
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRetrotransposon protein
Genome locationchr03:13272219..13272623
RNA-Seq ExpressionIVF0018734
SyntenyIVF0018734
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0061282.1 putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa]5.61e-3058.21Show/hide
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KAA0067173.1 retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa]7.60e-3358.96Show/hide
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        QWLSR Q LITLIN TLS S+  HVVGS SSK+L
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KGN50818.1 hypothetical protein Csa_018838 [Cucumis sativus]5.76e-3761.83Show/hide
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        L WLSRDQ LITLIN TLSPS+  HVVGS S
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TYJ97594.1 putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa]2.44e-3062.5Show/hide
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        S  N +VPTSTLFLLSNICNLVP+              SSILKAHS F HIDD+LPCP K L S+ +    EIN EYLQWLSRDQ LITLIN TLS S+ 
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         HVVGS +SK+L
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TYK11141.1 putative mitochondrial protein [Cucumis melo var. makuwa]2.95e-3062.5Show/hide
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        S  N  VPTSTLFLLSNICNLVP+              SSILKAHS F HIDD+LPCP K   S+ +R   EIN EY+QWLSRDQ LITLIN TLS S+ 
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         HVVGS SSK+L
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KMJ5 Uncharacterized protein7.0e-2861.83Show/hide
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        L WLSRDQ LITLIN TLSPS+  HVVGS S
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A0A5A7UZE5 Putative mitochondrial protein1.9e-2558.21Show/hide
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A0A5A7VGG0 Retrotransposon protein2.6e-2758.96Show/hide
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A0A5D3BEU0 Putative mitochondrial protein1.1e-2557.46Show/hide
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        MAT S Q++   T  P      S  N +VPTSTLFLLSNICNLVP+              SSILKAHS F HIDD+LPCP K L S+ +    EIN EYL
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A0A5D3CH60 Putative mitochondrial protein2.5e-2562.5Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCACCTCCAGCTCTCAAAATGAACCCATCTCCACTAAAACGCCTACCATTTCCACAGAGATATCACCACAAAATCAACATGTTCCTACTTCCACCCTCTTCTTACT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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