; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0018775 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0018775
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionPectinesterase
Genome locationchr12:23261964..23262881
RNA-Seq ExpressionIVF0018775
SyntenyIVF0018775
Gene Ontology termsGO:0042545 - cell wall modification (biological process)
GO:0043086 - negative regulation of catalytic activity (biological process)
GO:0045490 - pectin catabolic process (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0030599 - pectinesterase activity (molecular function)
GO:0045330 - aspartyl esterase activity (molecular function)
GO:0046910 - pectinesterase inhibitor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000070 - Pectinesterase, catalytic
IPR011050 - Pectin lyase fold/virulence factor
IPR012334 - Pectin lyase fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0055283.1 putative pectinesterase/pectinesterase inhibitor 41 [Cucumis melo var. makuwa]1.87e-7196.52Show/hide
Query:  MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV
        MNHFKTIIDAIVAA DNSNT+FYIHVTPGTYHERLQIPPTKTF+ALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSD ATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV
Subjt:  MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV

Query:  AVLDQARFTAYHKCR
        AVLDQARFTAYHKCR
Subjt:  AVLDQARFTAYHKCR

KAA0055287.1 putative pectinesterase/pectinesterase inhibitor 41 [Cucumis melo var. makuwa]7.92e-6989.34Show/hide
Query:  MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV
        MN FKTI  AI AAPDNSNT+FYI VTPGTYHERLQIPPTKTF+ALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVN +NF+AKSLTFENSAGPQNGQ V
Subjt:  MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV

Query:  AVLDQARFTAYHKCRFLDFQDS
        AVLDQARFTAYHKCRFL FQD+
Subjt:  AVLDQARFTAYHKCRFLDFQDS

KAA0055288.1 putative pectinesterase/pectinesterase inhibitor 41 [Cucumis melo var. makuwa]3.36e-7086.72Show/hide
Query:  MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV
        MNHFKTI  AI AAPDNSNT+FYI VTPGTYHERLQIPPTKTF+ALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVN NNFLAKSLTFENSAGPQNGQ V
Subjt:  MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV

Query:  AVLDQARFTAYHKCRFLDFQDSCTSEAT
        AVLDQA FTAYHKC+FL FQD+   + T
Subjt:  AVLDQARFTAYHKCRFLDFQDSCTSEAT

TYJ99206.1 putative pectinesterase/pectinesterase inhibitor 41 [Cucumis melo var. makuwa]2.70e-80100Show/hide
Query:  MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV
        MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV
Subjt:  MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV

Query:  AVLDQARFTAYHKCRFLDFQDS
        AVLDQARFTAYHKCRFLDFQDS
Subjt:  AVLDQARFTAYHKCRFLDFQDS

XP_016903572.1 PREDICTED: probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 40 [Cucumis melo]6.07e-94100Show/hide
Query:  MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV
        MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV
Subjt:  MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV

Query:  AVLDQARFTAYHKCRFLDFQDSCTSEATFISLKSVISMAV
        AVLDQARFTAYHKCRFLDFQDSCTSEATFISLKSVISMAV
Subjt:  AVLDQARFTAYHKCRFLDFQDSCTSEATFISLKSVISMAV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4E5T0 Pectinesterase2.6e-71100Show/hide
Query:  MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV
        MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV
Subjt:  MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV

Query:  AVLDQARFTAYHKCRFLDFQDSCTSEATFISLKSVISMAV
        AVLDQARFTAYHKCRFLDFQDSCTSEATFISLKSVISMAV
Subjt:  AVLDQARFTAYHKCRFLDFQDSCTSEATFISLKSVISMAV

A0A5A7UH51 Pectinesterase3.5e-5596.52Show/hide
Query:  MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV
        MNHFKTIIDAIVAA DNSNT+FYIHVTPGTYHERLQIPPTKTF+ALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSD ATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV
Subjt:  MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV

Query:  AVLDQARFTAYHKCR
        AVLDQARFTAYHKCR
Subjt:  AVLDQARFTAYHKCR

A0A5D3BHF7 Pectinesterase1.7e-5489.34Show/hide
Query:  MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV
        MN FKTI  AI AAPDNSNT+FYI VTPGTYHERLQIPPTKTF+ALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVN +NF+AKSLTFENSAGPQNGQ V
Subjt:  MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV

Query:  AVLDQARFTAYHKCRFLDFQDS
        AVLDQARFTAYHKCRFL FQD+
Subjt:  AVLDQARFTAYHKCRFLDFQDS

A0A5D3BJD0 Pectinesterase6.5e-62100Show/hide
Query:  MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV
        MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV
Subjt:  MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV

Query:  AVLDQARFTAYHKCRFLDFQDS
        AVLDQARFTAYHKCRFLDFQDS
Subjt:  AVLDQARFTAYHKCRFLDFQDS

A0A5D3BKF8 Pectinesterase2.0e-5586.72Show/hide
Query:  MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV
        MNHFKTI  AI AAPDNSNT+FYI VTPGTYHERLQIPPTKTF+ALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVN NNFLAKSLTFENSAGPQNGQ V
Subjt:  MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVV

Query:  AVLDQARFTAYHKCRFLDFQDSCTSEAT
        AVLDQA FTAYHKC+FL FQD+   + T
Subjt:  AVLDQARFTAYHKCRFLDFQDSCTSEAT

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22256 Probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 201.6e-1739.02Show/hide
Query:  HFKTIIDAIVAAP---DNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQV
        +F TI  AI AAP   D SN  F I+VT G Y E +++P  K +V +IGD    T+I  +RS   G+ T +SAT  ++  NF+  ++T  N+AGP  GQ 
Subjt:  HFKTIIDAIVAAP---DNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQV

Query:  VAVLDQARFTAYHKCRFLDFQDS
        VA+      + ++ C F  +QD+
Subjt:  VAVLDQARFTAYHKCRFLDFQDS

O49006 Pectinesterase/pectinesterase inhibitor 32.5e-1837.82Show/hide
Query:  FKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVVAVL
        FKT+  A+ AAP+NSN ++ IH+  G Y E +++   K  +  +GD    TII   R+   G  T  SAT+      FLA+ +TF+N+AGP   Q VA+ 
Subjt:  FKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVVAVL

Query:  DQARFTAYHKCRFLDFQDS
          + F+A++ C  L +QD+
Subjt:  DQARFTAYHKCRFLDFQDS

O81301 Probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 403.0e-1940.83Show/hide
Query:  HFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVVAV
        ++ TI +AI AAP++S T+F I++  G Y E ++IP  KT +  IGD    T+I  +RS A G+    SAT+ V  + F+AK L+F N AGP+  Q VA+
Subjt:  HFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVVAV

Query:  LDQARFTAYHKCRFLDFQDS
           +  +AY++C F  +QD+
Subjt:  LDQARFTAYHKCRFLDFQDS

O81415 Probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 395.6e-1837.5Show/hide
Query:  HFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVVAV
        +F TI DA+ AAP+ S T+F I++  G Y E +++P  KT +  IGD    T+I  +RS   G+ T  + T+ V    ++AK ++F NSAGP   Q VA 
Subjt:  HFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVVAV

Query:  LDQARFTAYHKCRFLDFQDS
           +  +A+++C F  +QD+
Subjt:  LDQARFTAYHKCRFLDFQDS

Q9LXK7 Probable pectinesterase/pectinesterase inhibitor 329.5e-1836.67Show/hide
Query:  HFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVVAV
        +F TI DA++AAPD S  ++ IHV  G Y E ++I   K  + ++GD    T+I  +RS   G+ T  SAT  V+   F+A+ +TF+N+AGP+  Q VA+
Subjt:  HFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVVAV

Query:  LDQARFTAYHKCRFLDFQDS
                +++C    +QD+
Subjt:  LDQARFTAYHKCRFLDFQDS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G47550.1 Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily1.2e-1839.02Show/hide
Query:  HFKTIIDAIVAAP---DNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQV
        +F TI  AI AAP   D SN  F I+VT G Y E +++P  K +V +IGD    T+I  +RS   G+ T +SAT  ++  NF+  ++T  N+AGP  GQ 
Subjt:  HFKTIIDAIVAAP---DNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQV

Query:  VAVLDQARFTAYHKCRFLDFQDS
        VA+      + ++ C F  +QD+
Subjt:  VAVLDQARFTAYHKCRFLDFQDS

AT3G14310.1 pectin methylesterase 31.8e-1937.82Show/hide
Query:  FKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVVAVL
        FKT+  A+ AAP+NSN ++ IH+  G Y E +++   K  +  +GD    TII   R+   G  T  SAT+      FLA+ +TF+N+AGP   Q VA+ 
Subjt:  FKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVVAVL

Query:  DQARFTAYHKCRFLDFQDS
          + F+A++ C  L +QD+
Subjt:  DQARFTAYHKCRFLDFQDS

AT3G43270.1 Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily6.8e-1936.67Show/hide
Query:  HFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVVAV
        +F TI DA++AAPD S  ++ IHV  G Y E ++I   K  + ++GD    T+I  +RS   G+ T  SAT  V+   F+A+ +TF+N+AGP+  Q VA+
Subjt:  HFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVVAV

Query:  LDQARFTAYHKCRFLDFQDS
                +++C    +QD+
Subjt:  LDQARFTAYHKCRFLDFQDS

AT4G02300.1 Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily4.0e-1937.5Show/hide
Query:  HFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVVAV
        +F TI DA+ AAP+ S T+F I++  G Y E +++P  KT +  IGD    T+I  +RS   G+ T  + T+ V    ++AK ++F NSAGP   Q VA 
Subjt:  HFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVVAV

Query:  LDQARFTAYHKCRFLDFQDS
           +  +A+++C F  +QD+
Subjt:  LDQARFTAYHKCRFLDFQDS

AT4G02320.1 Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily2.1e-2040.83Show/hide
Query:  HFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVVAV
        ++ TI +AI AAP++S T+F I++  G Y E ++IP  KT +  IGD    T+I  +RS A G+    SAT+ V  + F+AK L+F N AGP+  Q VA+
Subjt:  HFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVVAV

Query:  LDQARFTAYHKCRFLDFQDS
           +  +AY++C F  +QD+
Subjt:  LDQARFTAYHKCRFLDFQDS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATCATTTTAAGACTATCATTGATGCAATTGTAGCAGCTCCAGATAACTCAAATACACAGTTTTATATTCATGTAACTCCCGGCACTTACCATGAGCGTCTTCAAAT
TCCACCAACCAAGACCTTCGTTGCTTTGATCGGTGATAACGCACTCACCACCATTATTGTCGACGATAGAAGTAATGCTCGTGGATTCAAGACAAGCGACTCTGCAACCC
TTACGGTTAACAGTAATAATTTTCTTGCAAAATCATTGACTTTTGAGAACTCCGCCGGTCCTCAAAATGGCCAAGTAGTGGCTGTTCTTGACCAAGCTCGCTTCACTGCG
TATCATAAGTGCAGGTTCTTAGATTTTCAAGACAGTTGTACGTCGGAGGCAACCTTTATTTCTTTAAAGAGTGTGATATCTATGGCAGTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCGCTTTTAATGCAATTGTGTCCTTAGATGGTTCTATGAATCATTTTAAGACTATCATTGATGCAATTGTAGCAGCTCCAGATAACTCAAATACACAGTTTTATATTCAT
GTAACTCCCGGCACTTACCATGAGCGTCTTCAAATTCCACCAACCAAGACCTTCGTTGCTTTGATCGGTGATAACGCACTCACCACCATTATTGTCGACGATAGAAGTAA
TGCTCGTGGATTCAAGACAAGCGACTCTGCAACCCTTACGGTTAACAGTAATAATTTTCTTGCAAAATCATTGACTTTTGAGAACTCCGCCGGTCCTCAAAATGGCCAAG
TAGTGGCTGTTCTTGACCAAGCTCGCTTCACTGCGTATCATAAGTGCAGGTTCTTAGATTTTCAAGACAGTTGTACGTCGGAGGCAACCTTTATTTCTTTAAAGAGTGTG
ATATCTATGGCAGTTTAGACTTTATCTTTGGAAATGGTTTAAGTATGTTTCAAGATTGTAACATCTATGCCCAAGAACCAAATAGATCTATCACGGTCACTACTCAATCC
AAAGAACAATAACTGGTTGCCTGAAACTGGTATTCCATTTAGACGTGGATTTTTTTCTTAATGATAAATTACGGTCACTGCTCAATCCAAAGAACAATTACGAAAAAAAA
GCGGCTTCTCATTTCAAAATTGTACCATCACTGTTTTGTCAGAGATAGCAGCTAGCAAAGCCGACGTCAAAGTCTATCTTGACCGACCGTGGAGACAATATTCACGGGTT
GTGTTCATTAAGTCATTTCTTAATGAGGAAGTGTTGCCCG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNHFKTIIDAIVAAPDNSNTQFYIHVTPGTYHERLQIPPTKTFVALIGDNALTTIIVDDRSNARGFKTSDSATLTVNSNNFLAKSLTFENSAGPQNGQVVAVLDQARFTA
YHKCRFLDFQDSCTSEATFISLKSVISMAV