; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0018912 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0018912
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Descriptiontranscription factor HY5-like
Genome locationchr03:23257449..23258820
RNA-Seq ExpressionIVF0018912
SyntenyIVF0018912
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR004827 - Basic-leucine zipper domain
IPR044280 - Transcriptional activator Hac1/HY5


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6598576.1 Transcription factor HY5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.92e-8796.84Show/hide
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NP_001284656.1 Transcription factor HY5-like [Cucumis melo]2.61e-90100Show/hide
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XP_022962152.1 transcription factor HY5-like [Cucurbita moschata]2.40e-8696.2Show/hide
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XP_022996780.1 transcription factor HY5-like [Cucurbita maxima]2.06e-8796.84Show/hide
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XP_023545723.1 transcription factor HY5-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.90e-8796.84Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LPK1 BZIP domain-containing protein6.2e-69100Show/hide
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A0A5A7VGC0 Transcription factor HY56.2e-69100Show/hide
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A0A6J1BRS2 transcription factor HY5-like6.2e-69100Show/hide
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A0A6J1K7Q9 transcription factor HY5-like9.9e-6796.84Show/hide
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F1DQG1 BZIP26.2e-69100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O24646 Transcription factor HY56.0e-5378.48Show/hide
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        SAQQARERKKAYL++LE RVKDLE KNSELEERLSTLQNENQMLR ILKNTT ++R G
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Q54WN7 Probable basic-leucine zipper transcription factor F4.7e-0544.44Show/hide
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        ++  KR +RL++NR +AQ  R+R+KAY+ DLE +V DL   NSE   R+  L +EN+++R+ L
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Q8TFU8 Transcriptional activator hacA1.4e-0439.24Show/hide
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        RKR ++  +KE +R++R+LRNR +AQ +RERK+  +  LE    D+E++N  L +RL+ ++ EN  L Q +   +A  R
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Q8W191 Transcription factor HY5-like5.7e-1950.69Show/hide
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        SL   +  SSSS+ H + K   ESDEE+  VP++  E+AG++   +S  D G V  P+  Q        +R+RGR+P DKE + LKRLLRNRVSAQQARE
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        RKK Y++DLE R  +L+  N +LEE++STL NEN MLR++L NT
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Q9SM50 Transcription factor HY57.4e-5181.01Show/hide
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        SAQQARERKKAYL DLE RVK+LE KN+ELEERLSTLQNENQMLR ILKNTTA  + G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G17609.1 HY5-homolog9.3e-1746.09Show/hide
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        + L+   G  S     +  +    S    +S  D G V  P+  Q        +R+RGR+P DKE + LKRLLRNRVSAQQARERKK Y++DLE R  +L
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        +  N +LEE++STL NEN MLR++L NT
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AT3G17609.2 HY5-homolog4.0e-2050.69Show/hide
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        RKK Y++DLE R  +L+  N +LEE++STL NEN MLR++L NT
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AT3G17609.3 HY5-homolog1.4e-1752.63Show/hide
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        VP++  E+AG++   +S  D G V  P+  Q        +R+RGR+P DKE + LKRLLRNRVSAQQARERKK Y++DLE R  +L+  N +LEE++STL
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AT3G17609.4 HY5-homolog3.2e-1746.09Show/hide
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        +  N +LEE++STL NEN MLR++L NT
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AT5G11260.1 Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein4.3e-5478.48Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAGGAGCAAGCGACGAGTTCAGCCGCCGCTAGTTCTTTGCCTTCGAGCAGTGAAAGATCTTCCAGCTCTGCTCTTCACCTCGAAGTTAAAGAAGGAATGGAGAGCGA
TGAGGAGATCCGGAGAGTGCCGGAGATAGGCGGTGAATCGGCCGGAACATCGGCTTCCGGTAGGGATACCGGTTCGGTCGCCGGTCCGGACCGGGTTCAAGTTTCTCGGG
AGGGTCAAAGGAAAAGAGGGAGAAGTCCGGCTGATAAAGAAAGCAAGAGACTCAAGAGATTGCTGAGGAATAGAGTATCGGCACAGCAAGCAAGGGAGAGAAAAAAGGCT
TATTTGAATGATTTAGAGATAAGGGTGAAGGATTTGGAGAAGAAGAACTCTGAACTTGAAGAAAGGCTTTCCACTTTACAGAATGAGAATCAGATGCTTAGACAAATTTT
GAAGAACACAACGGCAAGTAGGAGAAGCGGTGAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTCAGTGTGAAGCTTTTATGTCCCGCTCTTTCTCTCTTTCTCCTCTTCTAGAAAATATCTTAACTAAATAAATTAAAATTATTGCAAAAGGGATTTTTATCGACCTCTGT
CTTTGATTGTTCGAAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGGTTGACGAAGAAATGCAGGAGCAAGCGACGAGTTCAGCCGCCGCTAGTTCTTTGCCTT
CGAGCAGTGAAAGATCTTCCAGCTCTGCTCTTCACCTCGAAGTTAAAGAAGGAATGGAGAGCGATGAGGAGATCCGGAGAGTGCCGGAGATAGGCGGTGAATCGGCCGGA
ACATCGGCTTCCGGTAGGGATACCGGTTCGGTCGCCGGTCCGGACCGGGTTCAAGTTTCTCGGGAGGGTCAAAGGAAAAGAGGGAGAAGTCCGGCTGATAAAGAAAGCAA
GAGACTCAAGAGATTGCTGAGGAATAGAGTATCGGCACAGCAAGCAAGGGAGAGAAAAAAGGCTTATTTGAATGATTTAGAGATAAGGGTGAAGGATTTGGAGAAGAAGA
ACTCTGAACTTGAAGAAAGGCTTTCCACTTTACAGAATGAGAATCAGATGCTTAGACAAATTTTGAAGAACACAACGGCAAGTAGGAGAAGCGGTGAGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQEQATSSAAASSLPSSSERSSSSALHLEVKEGMESDEEIRRVPEIGGESAGTSASGRDTGSVAGPDRVQVSREGQRKRGRSPADKESKRLKRLLRNRVSAQQARERKKA
YLNDLEIRVKDLEKKNSELEERLSTLQNENQMLRQILKNTTASRRSGE