CuGenDBv2

Gene ID	IVF0019036
Organism	Cucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	30S ribosomal protein S3, chloroplastic
Genome location	tig00000662:69067..70308
RNA-Seq Expression	IVF0019036
Synteny	IVF0019036
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0005840 - ribosome (cellular component) GO:0009507 - chloroplast (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function) GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domains	IPR001351 - Ribosomal protein S3, C-terminal IPR004044 - K Homology domain, type 2 IPR005704 - Ribosomal protein S3, bacterial-type IPR009019 - K homology domain superfamily, prokaryotic type IPR015946 - K homology domain-like, alpha/beta IPR018280 - Ribosomal protein S3, conserved site IPR036419 - Ribosomal protein S3, C-terminal domain superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

AHM88937.1 ribosomal protein S3 [Lagenaria siceraria]

1.49e-155

99.54

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHP+KYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

ASY96325.1 ribosomal protein S3 [Cucumis melo subsp. agrestis]

4.13e-155

99.54

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIF DEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

YP_004841822.1 ribosomal protein S3 [Cucumis melo subsp. melo]

3.53e-156

100

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

YP_009326028.1 ribosomal protein S3 [Citrullus lanatus]

2.04e-155

99.08

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHP+KYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQ+QIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

YP_009456184.1 ribosomal protein S3 [Lagenaria siceraria]

1.44e-155

99.54

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHP+KYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S4EU44 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

2.8e-120

100

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

A0A249RXQ1 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

2.8e-120

100

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

A0A249RYX6 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

2.8e-120

100

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

A0A249RZG7 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

2.8e-120

100

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

A0A286NFY0 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

2.8e-120

100

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

A0ZZ73 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

1.8e-108

88.99

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLG TQ HHSLWFA PKKYSEGLQED+KIRDCI+NYVQKN R+ SGVEGIARIEIQKR+DLIQVII+MGFPKLLIE   RK+EELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELN  NRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQA TKGIQ+QIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTI AKI+YC Y V
Subjt:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIF+DE+
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

A6MM75 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

1.2e-107

89.45

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLG TQGHHSLWFA PK YSEGLQEDQKIRDCI+NYVQKNMRI SG EGIARIEIQKRIDLIQVII+MGFPKLLIEG  R +EELQ+NVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KE NS NRKLNIAITRI  PYG PNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQA TKGIQ+QIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKI YC Y V
Subjt:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDE+
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

Q0ZIY0 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

8.2e-109

89.91

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLG TQGHHSLWFA PK YS+GLQEDQKIRDCI+NYVQKN+RI SGVEGIARIEIQKRIDLIQVII+MGFPKLL+EG  R+IEELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELN  NRKLNIAITRI  PYGHPNILAEFIAGQL+NRVSFRKA+KKAIELTEQA TKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYC Y V
Subjt:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDE+
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

Q2L946 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

1.8e-108

88.99

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLG TQ HHSLWFA PKKYSEGLQED+KIRDCI+NYVQKN R+ SGVEGIARIEIQKR+DLIQVII+MGFPKLLIE   RK+EELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELN  NRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQA TKGIQ+QIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTI AKI+YC Y V
Subjt:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIF+DE+
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

Q4VZN0 30S ribosomal protein S3, chloroplastic

7.9e-120

96.79

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCI+NYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKL+I+ GSRKIEELQ+NVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KE NSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
Subjt:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYG+LGIKIWIFVDEQ
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

ATCG00800.1 structural constituent of ribosome

1.1e-108

88.53

Show/hide

Query:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ
        MGQKINPLGFRLG TQ HHSLWFA PKKYSEGL+ED+KIRDCI+NYVQKN+RI SG+EGIARIEIQKRIDLIQ+II+MGFPKLLIE   R++EELQMNVQ
Subjt:  MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQ

Query:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV
        KELN  NRKLNIAITRI NPYG PNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQA TKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTI AKIDYC Y V
Subjt:  KELNSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPV

Query:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ
        RTIYGVLGIKIWIFVDE+
Subjt:  RTIYGVLGIKIWIFVDEQ

ATMG00090.1 structural constituent of ribosome;protein binding

4.1e-07

32.14

Show/hide

Query:  NSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKN-RVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRI-DGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPVR
        N  N K  I   +I + Y   + +A+ I+ QLKN R SF     K ++   + G +GI++  +GR+ D  E A+ +  +  +        KIDY    V 
Subjt:  NSGNRKLNIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKN-RVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRI-DGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPVR

Query:  TIYGVLGIKIWI
        T YG+ G+K+WI
Subjt:  TIYGVLGIKIWI

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGGACAAAAAATAAATCCACTCGGTTTTAGACTTGGTGCAACCCAAGGGCATCATTCTCTGTGGTTTGCACACCCCAAAAAATATTCTGAAGGTTTACAAGAAGATCA
AAAAATACGAGATTGTATCCGGAATTATGTACAAAAAAACATGAGAATATTTTCTGGTGTTGAAGGAATTGCACGTATCGAGATTCAAAAAAGAATTGATCTTATTCAAG
TGATAATCTTTATGGGATTCCCAAAGTTATTAATAGAAGGTGGGTCTCGAAAAATCGAAGAATTACAGATGAATGTACAAAAAGAATTAAATTCTGGGAACCGAAAACTT
AACATTGCTATTACAAGAATAGGAAACCCTTATGGACACCCTAATATTCTCGCAGAATTTATAGCCGGACAATTAAAGAATAGAGTTTCATTTCGCAAAGCAATGAAAAA
AGCTATTGAATTAACTGAACAGGCGGGTACAAAGGGAATTCAAGTACAAATTGCCGGACGTATAGACGGAAAAGAAATTGCACGTGTCGAATGGATCAGAGAAGGACGGG
TTCCTCTACAAACCATTCGAGCTAAAATTGATTATTGTTGCTATCCAGTTCGAACTATCTATGGGGTATTAGGCATCAAAATTTGGATATTTGTAGACGAGCAATAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

TGTGAAAAATGATAATAGACCTCGTCGTTAATAATTAATATTATGAAAAAAAAAGTGAATAGTGAATATAGATACCTATCGTTCATTACTAAGAGGTAAACCTTATGATA
AAGAAGAGAAAAAAAAATCAATCTGAAGTATACGCTTTAGGTCAACATATATGTATGTCCCCTCACAAAGCGCGAAGAGTAATTGATCAGATTCGTGGACGTTCCTACGA
AGAAACAATGATGATACTCGAACTCATGCCTTATCGAACATGTTATGCAATTTTAAAATTGGTTTATTCGGCAGCAGCAAATGCTAGCCACAATATGGGTTTCAACGAAA
GAGATTTAGTCATTAGTAAAGCAGAGGTCAATCAAGGTACTACTGTGAAAAAATTAAAACCTCGAGCTAGAGGGCGAAGTTATCCCATAAAACGACCCACTTGTTCTATA
ACTATTGTATTGAAAAATACATCTGTGAATAAAGAAGAATTTAAAAGATACCAATACACCATAAACAAACCTGGTGGATTGATAACTAAAGAAAAGTACACAGATATGAC
GTGTTATGAGATGTATACTAATGGGGGATTATGGGACAAAAAATAAATCCACTCGGTTTTAGACTTGGTGCAACCCAAGGGCATCATTCTCTGTGGTTTGCACACCCCAA
AAAATATTCTGAAGGTTTACAAGAAGATCAAAAAATACGAGATTGTATCCGGAATTATGTACAAAAAAACATGAGAATATTTTCTGGTGTTGAAGGAATTGCACGTATCG
AGATTCAAAAAAGAATTGATCTTATTCAAGTGATAATCTTTATGGGATTCCCAAAGTTATTAATAGAAGGTGGGTCTCGAAAAATCGAAGAATTACAGATGAATGTACAA
AAAGAATTAAATTCTGGGAACCGAAAACTTAACATTGCTATTACAAGAATAGGAAACCCTTATGGACACCCTAATATTCTCGCAGAATTTATAGCCGGACAATTAAAGAA
TAGAGTTTCATTTCGCAAAGCAATGAAAAAAGCTATTGAATTAACTGAACAGGCGGGTACAAAGGGAATTCAAGTACAAATTGCCGGACGTATAGACGGAAAAGAAATTG
CACGTGTCGAATGGATCAGAGAAGGACGGGTTCCTCTACAAACCATTCGAGCTAAAATTGATTATTGTTGCTATCCAGTTCGAACTATCTATGGGGTATTAGGCATCAAA
ATTTGGATATTTGTAGACGAGCAATAATAAGC

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MGQKINPLGFRLGATQGHHSLWFAHPKKYSEGLQEDQKIRDCIRNYVQKNMRIFSGVEGIARIEIQKRIDLIQVIIFMGFPKLLIEGGSRKIEELQMNVQKELNSGNRKL
NIAITRIGNPYGHPNILAEFIAGQLKNRVSFRKAMKKAIELTEQAGTKGIQVQIAGRIDGKEIARVEWIREGRVPLQTIRAKIDYCCYPVRTIYGVLGIKIWIFVDEQ

IVF0019036 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome