; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0019370 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0019370
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionNudix hydrolase 23
Genome locationchr04:28724640..28730226
RNA-Seq ExpressionIVF0019370
SyntenyIVF0019370
Gene Ontology termsGO:0016787 - hydrolase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000086 - NUDIX hydrolase domain
IPR015797 - NUDIX hydrolase-like domain superfamily
IPR020084 - NUDIX hydrolase, conserved site
IPR029401 - Nudix hydrolase, N-terminal


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_031738511.1 nudix hydrolase 23, chloroplastic isoform X2 [Cucumis sativus]6.65e-20694.12Show/hide
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XP_038904907.1 nudix hydrolase 23, chloroplastic isoform X2 [Benincasa hispida]8.35e-20894.75Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGX9 Nudix hydrolase domain-containing protein3.4e-16495.42Show/hide
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A0A1S3B6M8 nudix hydrolase 23, chloroplastic isoform X16.0e-16998.71Show/hide
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A0A1S3B747 nudix hydrolase 23, chloroplastic isoform X21.1e-170100Show/hide
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A0A5A7TPK7 Nudix hydrolase 231.1e-170100Show/hide
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A0A6J1IY67 nudix hydrolase 23, chloroplastic1.7e-15590.2Show/hide
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B4TCT5 NAD-capped RNA hydrolase NudC1.3e-0624.34Show/hide
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C0Q2S8 NAD-capped RNA hydrolase NudC1.7e-0623.68Show/hide
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P93740 Nudix hydrolase 23, chloroplastic4.1e-9060.34Show/hide
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Q57H59 NAD-capped RNA hydrolase NudC1.7e-0623.68Show/hide
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Q58549 ADP-ribose pyrophosphatase3.3e-0731.45Show/hide
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        Y +P + V  +I  +NK+LL +RK  P  G + LP G++E GE+  +  +RE  EE     +V S       P       +I   +I+ V  G+LK    
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G42070.1 nudix hydrolase homolog 232.9e-9160.34Show/hide
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        +LK   I+G+S     S+RL+ +     SS++   SSS +L              S  S + +   S  P  MS S P S           V S+  +R 
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Query:  IRFCQWCGGQTKHGIPDGEEKLRAICTVCGRITYQNPKMVVGCLIHHENKVLLCRRKIEPSYGLWTLPAGYLEIGESAADGAIRETLEEANAEVEVTSPF
        I+FCQWCGG TKH IPDGEEKLRAICT CG+I YQNPKMVVGCLI HE KVLLC+R I+PS+GLWTLPAGYLE+GESAA GA+RET EEA A VEV SPF
Subjt:  IRFCQWCGGQTKHGIPDGEEKLRAICTVCGRITYQNPKMVVGCLIHHENKVLLCRRKIEPSYGLWTLPAGYLEIGESAADGAIRETLEEANAEVEVTSPF

Query:  AQLDIPLIGQTYIIFVGKLKKPHFSPGPESLECRLFPLDDIPFDSLAFSSMLVTLRLYVEDVKAGRTTFHYGTINKRPGTGASDIHAYTLDYHLR
        AQLDIPLIGQTY+IF+ KLK  HF+PGPESLECRLF LD+IPFDSLAFSS+ VTL LY+ED+K G+  FHYGTINKRPG+  SDI A++LDYHL+
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AT5G20070.1 nudix hydrolase homolog 196.0e-0431.18Show/hide
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        +FC  CG +T      G  K  +  T   R+  +   +V+  +I  EN   L  R+      +W+  AG++E GES  +   RET EE   EV
Subjt:  RFCQWCGGQTKHGIPDGEEKLRAICTVCGRITYQNPKMVVGCLIHHENKVLLCRRKIEPSYGLWTLPAGYLEIGESAADGAIRETLEEANAEV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CATGTTCTGAGGCAAATCAAGAAGGCACTTCCTCGTCTCCTTTGTCTATGTCAGAATCTCCTCCGCCATCATCTTCAACTGTAGTTCACTCTTCTGAAAAAATTCGTAAT
ATACGGTTCTGTCAGTGGTGTGGAGGTCAAACAAAGCATGGAATACCTGATGGAGAGGAGAAATTGAGAGCTATTTGCACAGTTTGTGGGAGGATAACGTATCAAAATCC
GAAGATGGTGGTGGGTTGTTTGATTCATCACGAAAACAAGGTCTTACTTTGTAGGAGGAAGATCGAGCCTTCTTATGGCCTTTGGACTCTTCCAGCTGGTTACTTGGAAA
TTGGGGAGTCAGCAGCTGATGGTGCAATTAGGGAAACCTTGGAAGAAGCAAATGCAGAAGTGGAAGTTACATCCCCTTTTGCTCAGTTAGACATCCCTCTAATTGGCCAA
ACGTATATAATTTTCGTGGGAAAGTTGAAGAAACCCCATTTCTCTCCTGGTCCTGAATCCCTTGAGTGCCGCCTTTTTCCTCTTGACGATATACCTTTTGATTCTCTTGC
ATTTTCATCCATGCTGGTTACCTTAAGACTGTATGTTGAGGATGTCAAGGCAGGAAGAACCACATTCCACTATGGGACCATCAATAAAAGGCCTGGTACAGGTGCCTCAG
ATATTCATGCCTATACTCTTGACTATCATCTAAGATTGTGA
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TCAAATTCCATACAGATTCGAAGAAATTGAAGATAGATAATGCTAAAGTCTGTTCATTTGTTCGGTTGCTCATCTGGGTTTGTTTCAAATCTTCTGAAACCCAATAGCAT
TGTTGGATTCAGTCTTACTTCCATCTCTTCTAAACGGTTGTCAGCGTCGTCTTCATTATCTTGTTCTTCTTCAATATTGTCATGTTCTAGCTCCGCTTCCCTGTTCTTGG
CTCCTCGAACTGGTTCTTTCAAAGCATTTTGTGGGTCTACATGTTCTGAGGCAAATCAAGAAGGCACTTCCTCGTCTCCTTTGTCTATGTCAGAATCTCCTCCGCCATCA
TCTTCAACTGTAGTTCACTCTTCTGAAAAAATTCGTAATATACGGTTCTGTCAGTGGTGTGGAGGTCAAACAAAGCATGGAATACCTGATGGAGAGGAGAAATTGAGAGC
TATTTGCACAGTTTGTGGGAGGATAACGTATCAAAATCCGAAGATGGTGGTGGGTTGTTTGATTCATCACGAAAACAAGGTCTTACTTTGTAGGAGGAAGATCGAGCCTT
CTTATGGCCTTTGGACTCTTCCAGCTGGTTACTTGGAAATTGGGGAGTCAGCAGCTGATGGTGCAATTAGGGAAACCTTGGAAGAAGCAAATGCAGAAGTGGAAGTTACA
TCCCCTTTTGCTCAGTTAGACATCCCTCTAATTGGCCAAACGTATATAATTTTCGTGGGAAAGTTGAAGAAACCCCATTTCTCTCCTGGTCCTGAATCCCTTGAGTGCCG
CCTTTTTCCTCTTGACGATATACCTTTTGATTCTCTTGCATTTTCATCCATGCTGGTTACCTTAAGACTGTATGTTGAGGATGTCAAGGCAGGAAGAACCACATTCCACT
ATGGGACCATCAATAAAAGGCCTGGTACAGGTGCCTCAGATATTCATGCCTATACTCTTGACTATCATCTAAGATTGTGACAAGCTAAGGAGCTCAAAGGGTGAGACTTG
AACTTCTGGGGGGAATTAGGTCCCATCCCATCTGATTCTTTTCAAACTTGAGGAGACAACAAGTCGAAATATGGATCACTTACATTCAAGTAGAGACAAGACATCTGCAA
TTTAAAGTTCATAACAATTCAACCTTGACTTTTGTAATGTGATAAAGAGGAATATTCATGCTTCTGAATATTCAATTACAATTCTTGAGCAAGCTTGTGCAATTTTTGCA
TTGTTCATCATCTACTCTTGTTCTGTTATCAATTTGTTGAAAAGACACCAAAAAATATGAATGATCTTATTGGCTTTCAAGGATATCACTGGATGTCTGAGAGTATAGCT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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