| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0041253.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 5.81e-116 | 86.11 | Show/hide |
Query: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGV--VLVQAKRPIAYFSKILSMRDR
+RG LGLTGYYRRFV+NYGSI+APLTQLLK+GAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVL MPDFNLPFEIESDASGFGV VLVQAKRP+AYFSK+LSMRDR
Subjt: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGV--VLVQAKRPIAYFSKILSMRDR
Query: ARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEV
ARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLL Y FEV+YKPGLENKAADALSR+GPTAHLNQLTAPALLDVEV
Subjt: ARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEV
Query: IREEVRKDPALHEIIG
I++EVRKDPAL EII
Subjt: IREEVRKDPALHEIIG
|
|
| KAA0057268.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 8.93e-126 | 94.37 | Show/hide |
Query: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGVVLVQAKRPIAYFSKILSMRDRAR
MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGVVLVQAKRPIAYFSKILSMRDRAR
Subjt: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGVVLVQAKRPIAYFSKILSMRDRAR
Query: PVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEVIR
PVYERELIAVVWAVQRWRPYL SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEVIR
Subjt: PVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEVIR
Query: EEVRKDPALHEII
EEVRKDPALHEII
Subjt: EEVRKDPALHEII
|
|
| KAA0061635.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.01e-114 | 85.19 | Show/hide |
Query: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGV--VLVQAKRPIAYFSKILSMRDR
+RG LGLTGYYRRFV+NYGSI+APLTQLLK+G YKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVL MPDFNLPFE ESDASGFGV VLVQAKRP+AYFSK+LSMRDR
Subjt: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGV--VLVQAKRPIAYFSKILSMRDR
Query: ARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEV
ARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLL Y FEV+YKPGLENKAADALSR+GPTAHLNQLTAPALLDVEV
Subjt: ARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEV
Query: IREEVRKDPALHEIIG
I++EVRKDPAL EII
Subjt: IREEVRKDPALHEIIG
|
|
| TYK16053.1 Transposon Ty3-G Gag-Pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 2.65e-119 | 86.11 | Show/hide |
Query: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGV--VLVQAKRPIAYFSKILSMRDR
+RG LGLTGYYRRFV+NYGSI+APLTQLLK+GAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVL MPDFNLPFEIESDASGFGV VLVQAKRP+AYFSK+LSMRDR
Subjt: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGV--VLVQAKRPIAYFSKILSMRDR
Query: ARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEV
ARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLL Y FEV+YKPGLENKAADALSR+GPTAHLNQLTAPALLDVEV
Subjt: ARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEV
Query: IREEVRKDPALHEIIG
I++EVRKDPAL EII
Subjt: IREEVRKDPALHEIIG
|
|
| TYK27646.1 Ty3/gypsy retrotransposon protein [Cucumis melo var. makuwa] | 1.79e-125 | 94.37 | Show/hide |
Query: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGVVLVQAKRPIAYFSKILSMRDRAR
MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGVVLVQAKRPIAYFSKILSMRDRAR
Subjt: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGVVLVQAKRPIAYFSKILSMRDRAR
Query: PVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEVIR
PVYERELIAVVWAVQRWRPYL SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEVIR
Subjt: PVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEVIR
Query: EEVRKDPALHEII
EEVRKDPALHEII
Subjt: EEVRKDPALHEII
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7TDM4 Ty3/gypsy retrotransposon protein | 9.0e-97 | 86.51 | Show/hide |
Query: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGV--VLVQAKRPIAYFSKILSMRDR
+RG LGLTGYYRRFV+NYGSI+APLTQLLK+GAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVL MPDFNLPFEIESDASGFGV VLVQAKRP+AYFSK+LSMRDR
Subjt: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGV--VLVQAKRPIAYFSKILSMRDR
Query: ARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEV
ARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLL Y FEV+YKPGLENKAADALSR+GPTAHLNQLTAPALLDVEV
Subjt: ARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEV
Query: IREEVRKDPALHEII
I++EVRKDPAL EII
Subjt: IREEVRKDPALHEII
|
|
| A0A5A7UQ78 Ty3/gypsy retrotransposon protein | 4.0e-105 | 94.37 | Show/hide |
Query: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGVVLVQAKRPIAYFSKILSMRDRAR
MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGVVLVQAKRPIAYFSKILSMRDRAR
Subjt: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGVVLVQAKRPIAYFSKILSMRDRAR
Query: PVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEVIR
PVYERELIAVVWAVQRWRPYL SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEVIR
Subjt: PVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEVIR
Query: EEVRKDPALHEII
EEVRKDPALHEII
Subjt: EEVRKDPALHEII
|
|
| A0A5A7V7S9 Ty3/gypsy retrotransposon protein | 1.2e-96 | 86.98 | Show/hide |
Query: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGV--VLVQAKRPIAYFSKILSMRDR
MRG LGLTGYYRRFV+NYGSI+APL QLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVL MPDFNLPFEIESDASGFGV VLVQAKRP+AYFSK+LSMRDR
Subjt: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGV--VLVQAKRPIAYFSKILSMRDR
Query: ARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEV
ARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLL Y FEV+YKPGLENKAADALSR+GPTAHLNQLTAPALLDVEV
Subjt: ARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEV
Query: IREEVRKDPALHEII
I+ EVRKDPAL EII
Subjt: IREEVRKDPALHEII
|
|
| A0A5D3CW07 Transposon Ty3-G Gag-Pol polyprotein | 9.0e-97 | 86.51 | Show/hide |
Query: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGV--VLVQAKRPIAYFSKILSMRDR
+RG LGLTGYYRRFV+NYGSI+APLTQLLK+GAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVL MPDFNLPFEIESDASGFGV VLVQAKRP+AYFSK+LSMRDR
Subjt: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGV--VLVQAKRPIAYFSKILSMRDR
Query: ARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEV
ARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLL Y FEV+YKPGLENKAADALSR+GPTAHLNQLTAPALLDVEV
Subjt: ARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEV
Query: IREEVRKDPALHEII
I++EVRKDPAL EII
Subjt: IREEVRKDPALHEII
|
|
| A0A5D3DV91 Ty3/gypsy retrotransposon protein | 4.0e-105 | 94.37 | Show/hide |
Query: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGVVLVQAKRPIAYFSKILSMRDRAR
MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGVVLVQAKRPIAYFSKILSMRDRAR
Subjt: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGFGVVLVQAKRPIAYFSKILSMRDRAR
Query: PVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEVIR
PVYERELIAVVWAVQRWRPYL SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEVIR
Subjt: PVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAHLNQLTAPALLDVEVIR
Query: EEVRKDPALHEII
EEVRKDPALHEII
Subjt: EEVRKDPALHEII
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P04323 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 | 6.4e-23 | 36.07 | Show/hide |
Query: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWT--EETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDAS--GFGVVLVQAKRPIAYFSKILSMR
++ LGLTGYYR+F+ N+ IA P+T+ LK T E ++AF+KLK + P+L +PDF F + +DAS G VL Q P++Y S+ L+
Subjt: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWT--EETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDAS--GFGVVLVQAKRPIAYFSKILSMR
Query: DRARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRM
+ E+EL+A+VWA + +R YL L +L + + +W KL ++ F++ Y G EN ADALSR+
Subjt: DRARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRM
|
|
| P10401 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon gypsy | 1.3e-20 | 32.42 | Show/hide |
Query: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAG------------AYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPV-LTMPDFNLPFEIESD--ASGFGVVLVQAKRP
+R LGL YYR F+K++ +IA P+T +LK ++ E AF++L+ + + V L PDF PF++ +D ASG G VL Q RP
Subjt: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAG------------AYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPV-LTMPDFNLPFEIESD--ASGFGVVLVQAKRP
Query: IAYFSKILSMRDRARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL-------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAH
I S+ L ++ EREL+A+VWA+ + + +L L F + R + ++W + + + +V YKPG EN ADALSR +
Subjt: IAYFSKILSMRDRARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL-------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMGPTAH
Query: LNQLTAPALLDVEVIREEV
LN L D I E+
Subjt: LNQLTAPALLDVEVIREEV
|
|
| P20825 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 | 8.9e-25 | 37.7 | Show/hide |
Query: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETE--AAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDAS--GFGVVLVQAKRPIAYFSKILSMR
+R LGLTGYYR+F+ NY IA P+T LK T++ E AFEKLK ++ P+L +PDF F + +DAS G VL Q PI++ S+ L+
Subjt: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETE--AAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDAS--GFGVVLVQAKRPIAYFSKILSMR
Query: DRARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRM
+ E+EL+A+VWA + +R YL L++L + + ++W +L +Y F++ Y G EN ADALSR+
Subjt: DRARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRM
|
|
| P92523 Uncharacterized mitochondrial protein AtMg00860 | 6.2e-18 | 65.15 | Show/hide |
Query: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPF
+RG LGLTGYYRRFVKNYG I PLT+LLK + KWTE AF+ LK A+ TLPVL +PD LPF
Subjt: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEAAFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPF
|
|
| Q8I7P9 Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon opus | 1.4e-22 | 33.01 | Show/hide |
Query: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEA-------------AFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGF--GVVLVQ----
++ LG+T YYR+F+++Y +A PLT L + G Y + +++ +F LK + + +L P F PF + +DAS + G VL Q
Subjt: MRGLLGLTGYYRRFVKNYGSIAAPLTQLLKAGAYKWTEETEA-------------AFEKLKKAMMTLPVLTMPDFNLPFEIESDASGF--GVVLVQ----
Query: AKRPIAYFSKILSMRDRARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL-------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMG
RPIAY S+ L+ + E+E++A++W++ R YL L F L R + ++W A++ +Y E+IYKPG N ADALSR+
Subjt: AKRPIAYFSKILSMRDRARPVYERELIAVVWAVQRWRPYL-------------SLKFLLEQRVIQPQYQQWIAKLLDYLFEVIYKPGLENKAADALSRMG
Query: PTAHLNQLT
P LNQL+
Subjt: PTAHLNQLT
|
|
