; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

IVF0019558 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome

Gene IDIVF0019558
OrganismCucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
DescriptionRNA-binding KH domain-containing protein PEPPER
Genome locationchr05:19834454..19842115
RNA-Seq ExpressionIVF0019558
SyntenyIVF0019558
Gene Ontology termsGO:0006396 - RNA processing (biological process)
GO:0009299 - mRNA transcription (biological process)
GO:0010468 - regulation of gene expression (biological process)
GO:0048467 - gynoecium development (biological process)
GO:0048577 - negative regulation of short-day photoperiodism, flowering (biological process)
GO:0048579 - negative regulation of long-day photoperiodism, flowering (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR004087 - K Homology domain
IPR004088 - K Homology domain, type 1
IPR036612 - K Homology domain, type 1 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
TYK03085.1 RNA-binding KH domain-containing protein PEPPER [Cucumis melo var. makuwa]7.60e-30295.32Show/hide
Query:  MATNTTTDNGSTDAIANPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG
        MATNTTTDNGSTDAIANPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG
Subjt:  MATNTTTDNGSTDAIANPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG

Query:  DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA
        DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA
Subjt:  DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA

Query:  SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFL
        SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFL
Subjt:  SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFL

Query:  DRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSGV-----------TQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR----------QSRGLPDEITVEIKGTSSQVQ
        DRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSGV           TQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR          +SRGLPDEITVEIKGTSSQVQ
Subjt:  DRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSGV-----------TQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR----------QSRGLPDEITVEIKGTSSQVQ

Query:  MAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL
        MAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL
Subjt:  MAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL

XP_004149510.2 RNA-binding KH domain-containing protein PEPPER isoform X1 [Cucumis sativus]7.07e-29192.13Show/hide
Query:  MATNTTTDNGSTDAIANPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG
        MATNTTT+NGSTDAI NP SSTLPSLAAAE DSTE GDDDSD DPSNQDYSS+PPSDSAAHEPS+HTG SDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG
Subjt:  MATNTTTDNGSTDAIANPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG

Query:  DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA
        DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEEL+SPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASF SIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA
Subjt:  DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA

Query:  SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFL
        SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEY PSTKRESLFL
Subjt:  SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFL

Query:  DRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSGV-----------TQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR----------QSRGLPDEITVEIKGTSSQVQ
        DRE H DSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSGV           TQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR          +SRGLPDEITVEIKGTSSQVQ
Subjt:  DRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSGV-----------TQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR----------QSRGLPDEITVEIKGTSSQVQ

Query:  MAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL
        MAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSS+TSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL
Subjt:  MAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL

XP_016901887.1 PREDICTED: RNA-binding KH domain-containing protein PEPPER [Cucumis melo]3.59e-30194.51Show/hide
Query:  MATNTTTDNGSTDAIANPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG
        MATNTTTDNGSTDAIANPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG
Subjt:  MATNTTTDNGSTDAIANPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG

Query:  DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA
        DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA
Subjt:  DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA

Query:  SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFL
        SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFL
Subjt:  SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFL

Query:  DRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSGV---------------TQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR----------QSRGLPDEITVEIKGTS
        DRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSGV               TQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR          +SRGLPDEITVEIKGTS
Subjt:  DRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSGV---------------TQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR----------QSRGLPDEITVEIKGTS

Query:  SQVQMAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL
        SQVQMAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL
Subjt:  SQVQMAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL

XP_031736379.1 RNA-binding KH domain-containing protein PEPPER isoform X2 [Cucumis sativus]1.28e-27091.82Show/hide
Query:  MATNTTTDNGSTDAIANPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG
        MATNTTT+NGSTDAI NP SSTLPSLAAAE DSTE GDDDSD DPSNQDYSS+PPSDSAAHEPS+HTG SDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG
Subjt:  MATNTTTDNGSTDAIANPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG

Query:  DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA
        DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEEL+SPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASF SIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA
Subjt:  DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA

Query:  SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFL
        SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEY PSTKRESLFL
Subjt:  SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFL

Query:  DRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSGV-----------TQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR----------QSRGLPDEITVEIKGTSSQVQ
        DRE H DSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSGV           TQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR          +SRGLPDEITVEIKGTSSQVQ
Subjt:  DRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSGV-----------TQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR----------QSRGLPDEITVEIKGTSSQVQ

Query:  MAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAAS
        MAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAAS
Subjt:  MAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAAS

XP_038890982.1 RNA-binding KH domain-containing protein PEPPER-like [Benincasa hispida]4.23e-27989.22Show/hide
Query:  MATNTTTDNGSTDAIA---NPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIG
        MAT TTT+NGSTDA A   NPQSSTL SLAAAE DSTE G  +SDIDPSN+DY S+P SDSAA+E  +HTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIG
Subjt:  MATNTTTDNGSTDAIA---NPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIG

Query:  RKGDLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQES
        RKGDLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELD+PLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASF SIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQES
Subjt:  RKGDLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQES

Query:  TGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRES
        TGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQ +TWADKSSLLTASQSIIS EYPPSTKRES
Subjt:  TGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRES

Query:  LFLDRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSGV-----------TQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR----------QSRGLPDEITVEIKGTSS
        LFLDRETHLDSHI SSGISLYGQDRVLPTIRSSGV           TQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR          +SRGLPDEITVEIKGTSS
Subjt:  LFLDRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSGV-----------TQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR----------QSRGLPDEITVEIKGTSS

Query:  QVQMAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL
        QVQMAQQLIQEAV+APKEPVTSSSYGRLD TGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGY+TFRL
Subjt:  QVQMAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LMH4 Uncharacterized protein1.1e-22792.13Show/hide
Query:  MATNTTTDNGSTDAIANPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG
        MATNTTT+NGSTDAI NP SSTLPSLAAAE DSTE GDDDSD DPSNQDYSS+PPSDSAAHEPS+HTG SDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG
Subjt:  MATNTTTDNGSTDAIANPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG

Query:  DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA
        DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEEL+SPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASF SIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA
Subjt:  DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA

Query:  SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFL
        SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEY PSTKRESLFL
Subjt:  SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFL

Query:  DRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSG-----------VTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR----------QSRGLPDEITVEIKGTSSQVQ
        DRE H DSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSG           VTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR          +SRGLPDEITVEIKGTSSQVQ
Subjt:  DRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSG-----------VTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR----------QSRGLPDEITVEIKGTSSQVQ

Query:  MAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL
        MAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSS+TSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL
Subjt:  MAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL

A0A1S4E0X0 RNA-binding KH domain-containing protein PEPPER1.4e-23594.51Show/hide
Query:  MATNTTTDNGSTDAIANPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG
        MATNTTTDNGSTDAIANPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG
Subjt:  MATNTTTDNGSTDAIANPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG

Query:  DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA
        DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA
Subjt:  DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA

Query:  SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFL
        SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFL
Subjt:  SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFL

Query:  DRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSG---------------VTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR----------QSRGLPDEITVEIKGTS
        DRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSG               VTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR          +SRGLPDEITVEIKGTS
Subjt:  DRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSG---------------VTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR----------QSRGLPDEITVEIKGTS

Query:  SQVQMAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL
        SQVQMAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL
Subjt:  SQVQMAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL

A0A5D3BVI2 RNA-binding KH domain-containing protein PEPPER4.9e-23695.32Show/hide
Query:  MATNTTTDNGSTDAIANPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG
        MATNTTTDNGSTDAIANPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG
Subjt:  MATNTTTDNGSTDAIANPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG

Query:  DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA
        DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA
Subjt:  DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA

Query:  SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFL
        SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFL
Subjt:  SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFL

Query:  DRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSG-----------VTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR----------QSRGLPDEITVEIKGTSSQVQ
        DRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSG           VTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR          +SRGLPDEITVEIKGTSSQVQ
Subjt:  DRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSG-----------VTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR----------QSRGLPDEITVEIKGTSSQVQ

Query:  MAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL
        MAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL
Subjt:  MAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL

A0A6J1D9V1 RNA-binding KH domain-containing protein PEPPER2.2e-20483.65Show/hide
Query:  MATNTTTDNGSTDAIA---NPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIG
        MATN   +NGSTDA A   NPQSSTL S+AAAE DSTE G  +SD+DPSN DY S+P SDS A E S+HTG+SDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIG
Subjt:  MATNTTTDNGSTDAIA---NPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIG

Query:  RKGDLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQES
        RKGDLIKKMCEET+ARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEE ++PLSPAMDAVIRVFKRVSG SENED+ KASF SIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQES
Subjt:  RKGDLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQES

Query:  TGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRES
        TGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALE VVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNT ASQDRQT+TWADKSSL TASQS+IS EYPP+TKRES
Subjt:  TGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRES

Query:  LFLDRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSG-----------VTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR----------QSRGLPDEITVEIKGTSS
        LF DRE+HLDSH++SSGISLYGQDR+LP IRSSG           VTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR          +SRGLPDEITVEIKGTSS
Subjt:  LFLDRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSG-----------VTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR----------QSRGLPDEITVEIKGTSS

Query:  QVQMAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSY----TSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL
        QVQMAQQLIQEAV+ PKEPVTSSSYGRLD  GLRSSYSQLA SGSSY    TSSSLSSQSYGGYGSSGLGGY+TFRL
Subjt:  QVQMAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSY----TSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL

A0A6J1FC72 RNA-binding KH domain-containing protein PEPPER-like1.0e-20483.62Show/hide
Query:  MATNTTTDNGSTDAIANPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG
        MATNTTT+NGSTDA A   S+ L   AA E DSTE    +S IDPSNQDY S P SDS  HE  +H GASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGR+G
Subjt:  MATNTTTDNGSTDAIANPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKG

Query:  DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA
        DLIKK+CEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEE ++P SPAMDAV+RVFKRVSG SENEDEAKASF S+RLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA
Subjt:  DLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGA

Query:  SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFL
        SVRVLSGDEMPFYAG DERMVELQGE+LKVLKALE VVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQT++WADKSSLL+ASQS+IS EYPPS+KRESLFL
Subjt:  SVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFL

Query:  DRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSG-----------VTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR----------QSRGLPDEITVEIKGTSSQVQ
        DRETHLDSHISSSGISLYG DRVLP IRSSG           VTQTMQIPLSYAEDIIGVGG NIAFIR          +SRGLPDEITVEIKGTSSQVQ
Subjt:  DRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSG-----------VTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIR----------QSRGLPDEITVEIKGTSSQVQ

Query:  MAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL
        MAQQLIQEA++ PKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQL ASGSSYT SSLSSQSYGGYGSSGLGGY+TFRL
Subjt:  MAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGYTTFRL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4KDN0 KH domain-containing protein HEN41.2e-1631.67Show/hide
Query:  GDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKGDLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLI---------------------SGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGL
        G   FRL+ P+  VG++IG+ G++IK++ + T A+IRV +   G+PDRV+ I                       K+E +  +S A  A+I+VF+ ++  
Subjt:  GDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKGDLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLI---------------------SGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGL

Query:  SENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGV
             EA +     RLL  S+ A  +IGK G ++ SI++ TG  + +   + +P  A  D+ MVE++G ++ V KAL  +
Subjt:  SENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGV

P57721 Poly(rC)-binding protein 38.9e-1727.97Show/hide
Query:  VGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTG---ASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKGDLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISG
        +G+ D+   PS   +S+L    + +H P    G    S     G       RL++   +VGSIIG+KG+ +KKM EE+ ARI + +G    P+R+V I+G
Subjt:  VGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTG---ASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKGDLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISG

Query:  KEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFS--------SIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQ
                    DA+ + F  ++   E +     S S        ++RL+V ++Q  +LIGK GS IK I+ESTGA V+V +GD +P    + ER V + 
Subjt:  KEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFS--------SIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQ

Query:  GESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPA------SQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAE--YPPSTKRESLFLDRETHLDSHISSSGIS
        G    +++ ++ +   + +     + +P   K  +TP       +   Q +        LT    +   +  +PP  +    F   +  L  H S    +
Subjt:  GESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPA------SQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAE--YPPSTKRESLFLDRETHLDSHISSSGIS

Query:  LYGQDRVLPTIRSSGVTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIRQSRGLPDEIT----------VEIKGTSSQVQMAQQLI
        L GQ   L     +  T  + IP      IIG  GT I  IRQ  G   +I           + I GT + + +AQ LI
Subjt:  LYGQDRVLPTIRSSGVTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIRQSRGLPDEIT----------VEIKGTSSQVQMAQQLI

P57722 Poly(rC)-binding protein 35.2e-1727.97Show/hide
Query:  VGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGA---SDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKGDLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISG
        +G+ D+   P    +S+L    + +H P  H G    S     G       RL++   +VGSIIG+KG+ +KKM EE+ ARI + +G    P+R+V I+G
Subjt:  VGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGA---SDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKGDLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISG

Query:  KEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFS--------SIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQ
                    DA+ + F  ++   E +     S S        ++RL+V ++Q  +LIGK GS IK I+ESTGA V+V +GD +P    + ER V + 
Subjt:  KEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFS--------SIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQ

Query:  GESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPA------SQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAE--YPPSTKRESLFLDRETHLDSHISSSGIS
        G    +++ ++ +   + +     + +P   K  +TP       +   Q +        LT    +   +  +PP  +    F   +  L  H S    +
Subjt:  GESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPA------SQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAE--YPPSTKRESLFLDRETHLDSHISSSGIS

Query:  LYGQDRVLPTIRSSGVTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIRQSRGLPDEIT----------VEIKGTSSQVQMAQQLI
        L GQ   L     +  T  + IP      IIG  GT I  IRQ  G   +I           + I GT + + +AQ LI
Subjt:  LYGQDRVLPTIRSSGVTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIRQSRGLPDEIT----------VEIKGTSSQVQMAQQLI

Q9SR13 Flowering locus K homology domain1.3e-6538.63Show/hide
Query:  EVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKGDLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKE
        EV D   D +   +   SL  S+    E  +  G  +K+WPGWPG+ VFR++VP  KVGSIIGRKGD+IKK+ EETRARI++LDG  GT +R V++SGKE
Subjt:  EVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKGDLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKE

Query:  ELDSPLSPAMDAVIRVFKR-VSGLSENEDEA-KASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLK
        E +S L P+MD ++RV  R V GL     +A   S  S RLLV ++QA +LIGKQG  +K+IQE++   VRVL  +++P +A  D+R+VE+ GE   V +
Subjt:  ELDSPLSPAMDAVIRVFKR-VSGLSENEDEA-KASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLK

Query:  ALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQ----DRQTETWADKSSLLTA---------------SQSIISAEYPPSTKRESLFLDRETHLDSHISSS
        ALE +  HLRKFLVD S++P FE     P  Q        ++W        +                     + YPP   R+   ++++ H        
Subjt:  ALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQ----DRQTETWADKSSLLTA---------------SQSIISAEYPPSTKRESLFLDRETHLDSHISSS

Query:  GISLYGQDRVL-------PTIRSSGVTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAF----------IRQSRGLPDEITVEIKGTSSQVQMAQQLIQE-----AVNA
        GIS YG++  +       P + +  VTQ MQIPLSYA+ +IG  G+NI++          I+++RG+P E+TVE+ GT SQVQ A QLIQ         A
Subjt:  GISLYGQDRVL-------PTIRSSGVTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAF----------IRQSRGLPDEITVEIKGTSSQVQMAQQLIQE-----AVNA

Query:  PKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGY
        P +P T +          +  Y+  A  GS Y ++  +    GGY +    GY
Subjt:  PKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGY

Q9SZH4 RNA-binding KH domain-containing protein PEPPER3.3e-11250.51Show/hide
Query:  DAIANPQSSTLP---SLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKGDLIKKMCEE
        D++ N  S  LP   +L  A   +  + D++S   P      SL  +++   + +    +++++WPGWPGDCVFR+IVPV KVG+IIGRKGD IKKMCEE
Subjt:  DAIANPQSSTLP---SLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKGDLIKKMCEE

Query:  TRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDE----AKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGASVRVL
        TRARI+VLDG V TPDR+VLISGKEE ++ +SPAMDAV+RVF+RVSGL +N+D+    A + FSS+RLLVASTQAINLIGKQGSLIKSI E++GASVR+L
Subjt:  TRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDE----AKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGASVRVL

Query:  SGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWAD-KSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFLDRET
        S +E PFYA  DER+V+LQGE+LK+LKALE +VGHLR+FLVDH+V+PLFEK +    SQ RQ E  A+ KSSL T S +++  ++    +RE LFL+R++
Subjt:  SGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWAD-KSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFLDRET

Query:  HLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSG-----------VTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIRQSRGL---------PDEITVEIKGTSSQVQMAQQL
         +DS +  SG+S+Y QD VL    S G           V+QTMQIP SYAEDIIGV G NIA+IR+  G          PD+ITVEIKGT+SQVQ A+QL
Subjt:  HLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSG-----------VTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIRQSRGL---------PDEITVEIKGTSSQVQMAQQL

Query:  IQEAVNAPKEPVT-SSSYGRLDTTGL---------------------------RSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGG--YGSSGLGGYTTFRL
        IQE +   KEPV+ S  Y R+D+  +                            ++YSQL   G S  + +L+ Q+YG     +S +GGY+++ L
Subjt:  IQEAVNAPKEPVT-SSSYGRLDTTGL---------------------------RSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGG--YGSSGLGGYTTFRL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G14170.1 RNA-binding KH domain-containing protein3.7e-1832.43Show/hide
Query:  DPSNQDYSSLPPSDSAAHEP----------SSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKGDLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGK
        +PS   +  L  S S+ H+P          SSH   + ++      +     I P   VG +IG+ G  I ++ +ET A IRV        D ++ IS K
Subjt:  DPSNQDYSSLPPSDSAAHEP----------SSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKGDLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGK

Query:  EELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKA
        E  +   SPA++A IR+ +R S   +   +A     S RLLV+S+Q   LIGK G++I  ++  T A++R+L  +++P  A  DE MV++ G     +KA
Subjt:  EELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKA

Query:  LEGVVGHLR--KFLVDHSVLPL
        L  V+  LR   F +DH ++ L
Subjt:  LEGVVGHLR--KFLVDHSVLPL

AT1G14170.2 RNA-binding KH domain-containing protein3.7e-1832.43Show/hide
Query:  DPSNQDYSSLPPSDSAAHEP----------SSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKGDLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGK
        +PS   +  L  S S+ H+P          SSH   + ++      +     I P   VG +IG+ G  I ++ +ET A IRV        D ++ IS K
Subjt:  DPSNQDYSSLPPSDSAAHEP----------SSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKGDLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGK

Query:  EELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKA
        E  +   SPA++A IR+ +R S   +   +A     S RLLV+S+Q   LIGK G++I  ++  T A++R+L  +++P  A  DE MV++ G     +KA
Subjt:  EELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKA

Query:  LEGVVGHLR--KFLVDHSVLPL
        L  V+  LR   F +DH ++ L
Subjt:  LEGVVGHLR--KFLVDHSVLPL

AT1G51580.1 RNA-binding KH domain-containing protein3.7e-1833.54Show/hide
Query:  DCVFRLIVPVVKVGSIIGRKGDLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQ
        +  FRL+ P  KVGS+IG+ G +++ +  E+ A I+V D    + +R+++IS +E L+   S A D V+RV  R+  +      A  +    RLLV S  
Subjt:  DCVFRLIVPVVKVGSIIGRKGDLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQ

Query:  AINLIGKQGSLIKSIQESTGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRK
           L+GK G LI  ++ +TGAS+RV + D+   Y    + +V++ G    V  AL  ++  LR+
Subjt:  AINLIGKQGSLIKSIQESTGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRK

AT3G04610.1 RNA-binding KH domain-containing protein9.6e-6738.63Show/hide
Query:  EVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKGDLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKE
        EV D   D +   +   SL  S+    E  +  G  +K+WPGWPG+ VFR++VP  KVGSIIGRKGD+IKK+ EETRARI++LDG  GT +R V++SGKE
Subjt:  EVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKGDLIKKMCEETRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKE

Query:  ELDSPLSPAMDAVIRVFKR-VSGLSENEDEA-KASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLK
        E +S L P+MD ++RV  R V GL     +A   S  S RLLV ++QA +LIGKQG  +K+IQE++   VRVL  +++P +A  D+R+VE+ GE   V +
Subjt:  ELDSPLSPAMDAVIRVFKR-VSGLSENEDEA-KASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGASVRVLSGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLK

Query:  ALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQ----DRQTETWADKSSLLTA---------------SQSIISAEYPPSTKRESLFLDRETHLDSHISSS
        ALE +  HLRKFLVD S++P FE     P  Q        ++W        +                     + YPP   R+   ++++ H        
Subjt:  ALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQ----DRQTETWADKSSLLTA---------------SQSIISAEYPPSTKRESLFLDRETHLDSHISSS

Query:  GISLYGQDRVL-------PTIRSSGVTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAF----------IRQSRGLPDEITVEIKGTSSQVQMAQQLIQE-----AVNA
        GIS YG++  +       P + +  VTQ MQIPLSYA+ +IG  G+NI++          I+++RG+P E+TVE+ GT SQVQ A QLIQ         A
Subjt:  GISLYGQDRVL-------PTIRSSGVTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAF----------IRQSRGLPDEITVEIKGTSSQVQMAQQLIQE-----AVNA

Query:  PKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGY
        P +P T +          +  Y+  A  GS Y ++  +    GGY +    GY
Subjt:  PKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSGLGGY

AT4G26000.1 RNA-binding KH domain-containing protein2.3e-11350.51Show/hide
Query:  DAIANPQSSTLP---SLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKGDLIKKMCEE
        D++ N  S  LP   +L  A   +  + D++S   P      SL  +++   + +    +++++WPGWPGDCVFR+IVPV KVG+IIGRKGD IKKMCEE
Subjt:  DAIANPQSSTLP---SLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKGDLIKKMCEE

Query:  TRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDE----AKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGASVRVL
        TRARI+VLDG V TPDR+VLISGKEE ++ +SPAMDAV+RVF+RVSGL +N+D+    A + FSS+RLLVASTQAINLIGKQGSLIKSI E++GASVR+L
Subjt:  TRARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDE----AKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGASVRVL

Query:  SGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWAD-KSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFLDRET
        S +E PFYA  DER+V+LQGE+LK+LKALE +VGHLR+FLVDH+V+PLFEK +    SQ RQ E  A+ KSSL T S +++  ++    +RE LFL+R++
Subjt:  SGDEMPFYAGADERMVELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWAD-KSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFLDRET

Query:  HLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSG-----------VTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIRQSRGL---------PDEITVEIKGTSSQVQMAQQL
         +DS +  SG+S+Y QD VL    S G           V+QTMQIP SYAEDIIGV G NIA+IR+  G          PD+ITVEIKGT+SQVQ A+QL
Subjt:  HLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSSG-----------VTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIRQSRGL---------PDEITVEIKGTSSQVQMAQQL

Query:  IQEAVNAPKEPVT-SSSYGRLDTTGL---------------------------RSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGG--YGSSGLGGYTTFRL
        IQE +   KEPV+ S  Y R+D+  +                            ++YSQL   G S  + +L+ Q+YG     +S +GGY+++ L
Subjt:  IQEAVNAPKEPVT-SSSYGRLDTTGL---------------------------RSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGG--YGSSGLGGYTTFRL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCACCAACACAACTACAGACAATGGCTCCACTGATGCCATTGCCAACCCTCAAAGCTCCACACTTCCCTCTCTAGCTGCTGCAGAAGCCGACTCTACAGAAGTCGG
TGACGATGATTCCGACATCGATCCTTCTAACCAAGACTACTCATCTCTTCCCCCTTCCGATTCTGCAGCTCACGAACCATCCAGTCATACCGGCGCCTCCGATAAAAAGT
GGCCCGGATGGCCCGGGGACTGCGTCTTCCGCCTTATTGTGCCGGTTGTTAAAGTTGGCAGCATTATTGGGCGCAAGGGGGATCTTATCAAGAAGATGTGTGAAGAAACT
AGGGCTAGAATACGTGTTCTTGATGGTGCTGTTGGCACTCCTGATCGCGTTGTGTTGATATCAGGAAAAGAAGAGCTTGATTCACCCCTTTCCCCTGCTATGGACGCAGT
TATAAGAGTCTTCAAACGTGTGTCTGGATTGTCTGAGAATGAAGATGAAGCTAAAGCCTCATTTTCTTCAATTCGGCTACTGGTGGCATCAACTCAAGCAATCAATCTAA
TTGGAAAACAGGGTTCATTAATCAAATCTATACAGGAGAGTACAGGGGCCTCTGTAAGAGTATTATCGGGAGATGAGATGCCATTCTATGCTGGTGCAGATGAGAGAATG
GTGGAATTGCAGGGAGAATCCTTAAAGGTTCTCAAGGCTCTAGAGGGAGTGGTGGGCCACCTAAGGAAGTTTTTAGTTGATCATAGTGTTCTTCCTCTTTTTGAAAAAAG
TTTTAATACACCTGCCTCACAAGATCGCCAAACGGAAACCTGGGCTGACAAGTCCTCACTTCTTACTGCATCTCAAAGCATAATCTCTGCCGAGTATCCTCCGTCCACAA
AAAGAGAATCTCTATTTCTTGATCGTGAAACTCATCTTGATTCTCATATTTCATCATCTGGTATTTCTTTATATGGGCAAGATCGAGTTCTTCCTACTATTCGATCATCA
GGTGTTACTCAGACAATGCAGATCCCGTTATCTTATGCTGAAGATATCATTGGGGTTGGAGGAACAAATATTGCATTCATCCGTCAGAGCAGGGGATTACCCGATGAGAT
AACTGTGGAAATAAAAGGCACTTCATCACAAGTTCAGATGGCTCAGCAATTAATTCAGGAAGCAGTAAATGCACCCAAGGAGCCAGTTACAAGCAGCAGCTATGGAAGGC
TGGACACGACAGGATTGAGGTCATCTTACTCCCAGTTGGCTGCTTCAGGTTCATCCTATACTTCATCTTCTTTATCTTCACAATCATATGGTGGATATGGGTCTTCTGGT
TTAGGAGGCTACACTACCTTCAGGCTCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCACCAACACAACTACAGACAATGGCTCCACTGATGCCATTGCCAACCCTCAAAGCTCCACACTTCCCTCTCTAGCTGCTGCAGAAGCCGACTCTACAGAAGTCGG
TGACGATGATTCCGACATCGATCCTTCTAACCAAGACTACTCATCTCTTCCCCCTTCCGATTCTGCAGCTCACGAACCATCCAGTCATACCGGCGCCTCCGATAAAAAGT
GGCCCGGATGGCCCGGGGACTGCGTCTTCCGCCTTATTGTGCCGGTTGTTAAAGTTGGCAGCATTATTGGGCGCAAGGGGGATCTTATCAAGAAGATGTGTGAAGAAACT
AGGGCTAGAATACGTGTTCTTGATGGTGCTGTTGGCACTCCTGATCGCGTTGTGTTGATATCAGGAAAAGAAGAGCTTGATTCACCCCTTTCCCCTGCTATGGACGCAGT
TATAAGAGTCTTCAAACGTGTGTCTGGATTGTCTGAGAATGAAGATGAAGCTAAAGCCTCATTTTCTTCAATTCGGCTACTGGTGGCATCAACTCAAGCAATCAATCTAA
TTGGAAAACAGGGTTCATTAATCAAATCTATACAGGAGAGTACAGGGGCCTCTGTAAGAGTATTATCGGGAGATGAGATGCCATTCTATGCTGGTGCAGATGAGAGAATG
GTGGAATTGCAGGGAGAATCCTTAAAGGTTCTCAAGGCTCTAGAGGGAGTGGTGGGCCACCTAAGGAAGTTTTTAGTTGATCATAGTGTTCTTCCTCTTTTTGAAAAAAG
TTTTAATACACCTGCCTCACAAGATCGCCAAACGGAAACCTGGGCTGACAAGTCCTCACTTCTTACTGCATCTCAAAGCATAATCTCTGCCGAGTATCCTCCGTCCACAA
AAAGAGAATCTCTATTTCTTGATCGTGAAACTCATCTTGATTCTCATATTTCATCATCTGGTATTTCTTTATATGGGCAAGATCGAGTTCTTCCTACTATTCGATCATCA
GGTGTTACTCAGACAATGCAGATCCCGTTATCTTATGCTGAAGATATCATTGGGGTTGGAGGAACAAATATTGCATTCATCCGTCAGAGCAGGGGATTACCCGATGAGAT
AACTGTGGAAATAAAAGGCACTTCATCACAAGTTCAGATGGCTCAGCAATTAATTCAGGAAGCAGTAAATGCACCCAAGGAGCCAGTTACAAGCAGCAGCTATGGAAGGC
TGGACACGACAGGATTGAGGTCATCTTACTCCCAGTTGGCTGCTTCAGGTTCATCCTATACTTCATCTTCTTTATCTTCACAATCATATGGTGGATATGGGTCTTCTGGT
TTAGGAGGCTACACTACCTTCAGGCTCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MATNTTTDNGSTDAIANPQSSTLPSLAAAEADSTEVGDDDSDIDPSNQDYSSLPPSDSAAHEPSSHTGASDKKWPGWPGDCVFRLIVPVVKVGSIIGRKGDLIKKMCEET
RARIRVLDGAVGTPDRVVLISGKEELDSPLSPAMDAVIRVFKRVSGLSENEDEAKASFSSIRLLVASTQAINLIGKQGSLIKSIQESTGASVRVLSGDEMPFYAGADERM
VELQGESLKVLKALEGVVGHLRKFLVDHSVLPLFEKSFNTPASQDRQTETWADKSSLLTASQSIISAEYPPSTKRESLFLDRETHLDSHISSSGISLYGQDRVLPTIRSS
GVTQTMQIPLSYAEDIIGVGGTNIAFIRQSRGLPDEITVEIKGTSSQVQMAQQLIQEAVNAPKEPVTSSSYGRLDTTGLRSSYSQLAASGSSYTSSSLSSQSYGGYGSSG
LGGYTTFRL