CuGenDBv2

Gene ID	IVF0019665
Organism	Cucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	protodermal factor 1-like isoform X2
Genome location	chr05:2158095..2160326
RNA-Seq Expression	IVF0019665
Synteny	IVF0019665
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR039923 - Protodermal factor 1

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAE8647347.1 hypothetical protein Csa_003649 [Cucumis sativus]

1.12e-223

70.75

Show/hide

Query:  MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS
        MER+LASLLLWT+I+GLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPP+DSHG PPYG+PPPHGSG SHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS
Subjt:  MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS

Query:  KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGY--------------------------------------------------------------------
        KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGY                                                                    
Subjt:  KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGY--------------------------------------------------------------------

Query:  -----------------------------------------YSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS-T
                                                 YSPPTYDPTP SP+TPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGY SPPTYDPTP+ +
Subjt:  -----------------------------------------YSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS-T

Query:  PPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPT----------SGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITN
         PSGGGGY SPPT+DPTPSTPPSGG GY +PPT           GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITN
Subjt:  PPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPT----------SGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITN

Query:  APGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPRT
        APGFGATLSLPQALSNTRTDGLG+LYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEG+FKPRT
Subjt:  APGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPRT

XP_011657562.2 protodermal factor 1 isoform X1 [Cucumis sativus]

5.55e-219

66.86

Show/hide

Query:  MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS
        MER+LASLLLWT+I+GLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPP+DSHG PPYG+PPPHGSG SHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS
Subjt:  MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS

Query:  KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGY--------------------------------------------------------------------
        KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGY                                                                    
Subjt:  KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGY--------------------------------------------------------------------

Query:  ---------------------------------------------------------------------YSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTY
                                                                             YSPPTYDPTP SP+TPSTPSGGGGYSSPPTY
Subjt:  ---------------------------------------------------------------------YSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTY

Query:  DPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS-TPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPT----------SGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTC
        DPTPTPSTPSGGGGY SPPTYDPTP+ + PSGGGGY SPPT+DPTPSTPPSGG GY +PPT           GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTC
Subjt:  DPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPS-TPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPT----------SGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTC

Query:  NYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQM
        NYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLG+LYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQM
Subjt:  NYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQM

Query:  ANEGKFKPRT
        ANEG+FKPRT
Subjt:  ANEGKFKPRT

XP_016900774.1 PREDICTED: protodermal factor 1-like isoform X1 [Cucumis melo]

5.38e-258

92.11

Show/hide

Query:  MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS
        MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS
Subjt:  MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS

Query:  KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPP-------------------------------TYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTP
        KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPP                               TYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTP
Subjt:  KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPP-------------------------------TYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTP

Query:  STPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWW
        STPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWW
Subjt:  STPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWW

Query:  GTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPRT
        GTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPRT
Subjt:  GTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPRT

XP_016900775.1 PREDICTED: protodermal factor 1-like isoform X2 [Cucumis melo]

5.24e-259

93.54

Show/hide

Query:  MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS
        MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS
Subjt:  MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS

Query:  KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPP-------------------------TYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGG
        KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPP                         TYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGG
Subjt:  KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPP-------------------------TYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGG

Query:  GGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSA
        GGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSA
Subjt:  GGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSA

Query:  FGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPRT
        FGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPRT
Subjt:  FGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPRT

XP_031743089.1 protodermal factor 1 isoform X2 [Cucumis sativus]

6.79e-222

68.34

Show/hide

Query:  MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS
        MER+LASLLLWT+I+GLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPP+DSHG PPYG+PPPHGSG SHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS
Subjt:  MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS

Query:  KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGY--------------------------------------------------------------------
        KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGY                                                                    
Subjt:  KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGY--------------------------------------------------------------------

Query:  ---------------------------------------------------------------------YSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTY
                                                                             YSPPTYDPTP SP+TPSTPSGGGGYSSPPTY
Subjt:  ---------------------------------------------------------------------YSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTY

Query:  DPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIW
        DPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGG          TPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIW
Subjt:  DPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIW

Query:  GLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPRT
        GLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLG+LYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEG+FKPRT
Subjt:  GLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPRT

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KGQ1 Uncharacterized protein

1.1e-169

64.34

Show/hide

Query:  MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS
        MER+LASLLLWT+I+GLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPP+DSHG PPYG+PPPHGSG SHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS
Subjt:  MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS

Query:  KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTG------------------------------------------------------------------------
        KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTG                                                                        
Subjt:  KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTG------------------------------------------------------------------------

Query:  ------------------------------------------------------------------------------------------------GGGY
                                                                                                        GGGY
Subjt:  ------------------------------------------------------------------------------------------------GGGY

Query:  YSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTP
        YSPPTYDPTP SP+TPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSG          GTPFYGTP
Subjt:  YSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTP

Query:  PTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRES
        PTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLG+LYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRES
Subjt:  PTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRES

Query:  FVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPRT
        FVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEG+FKPRT
Subjt:  FVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPRT

A0A1S4DXR0 protodermal factor 1-like isoform X1

1.3e-199

92.11

Show/hide

Query:  MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS
        MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS
Subjt:  MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS

Query:  KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPT-------------------------------GGGGYYSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTP
        KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPT                               GGGGYYSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTP
Subjt:  KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPT-------------------------------GGGGYYSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTP

Query:  STPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWW
        STPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWW
Subjt:  STPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWW

Query:  GTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPRT
        GTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPRT
Subjt:  GTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPRT

A0A1S4DYH9 protodermal factor 1-like isoform X2

2.7e-200

93.54

Show/hide

Query:  MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS
        MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS
Subjt:  MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPS

Query:  KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTG-------------------------GGGYYSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGG
        KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTG                         GGGYYSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGG
Subjt:  KPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTG-------------------------GGGYYSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGG

Query:  GGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSA
        GGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSA
Subjt:  GGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSA

Query:  FGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPRT
        FGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPRT
Subjt:  FGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPRT

A0A6J1ES57 protodermal factor 1-like isoform X6

1.1e-150

65.39

Show/hide

Query:  MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPS-DSHGYPPYG-TPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPT
        M   LA LLLWT+ VGLVS ++AIPLTS  +EDQKTYYTPDPHAGSPPS  S G PPYG TPPP GSG SHGGKPP+HGHGGKK  PKPGNCGNPP+TPT
Subjt:  MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPS-DSHGYPPYG-TPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPT

Query:  PSKPPT----------HDPTPSTPSKPPSGGGGHHNP---------------------------------------------------------------
        PSKPP+          ++PTPS PS PPS GGG+++P                                                               
Subjt:  PSKPPT----------HDPTPSTPSKPPSGGGGHHNP---------------------------------------------------------------

Query:  --PTGGGGYYSPPTYDPTPASPT----TPSTPSGG--------------------------GGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDP---TPST
          P+GGGGYYSPPTYDPTP   T    TPSTPSGG                          GGY+SPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDP   TPST
Subjt:  --PTGGGGYYSPPTYDPTPASPT----TPSTPSGG--------------------------GGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDP---TPST

Query:  PPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSL
        PPSGG GY+SPP++DP PSTPPSGGNG+YNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYW THPG IWGLLGWWGTMGS FGIT +PGFGATLSL
Subjt:  PPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSL

Query:  PQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPR
        PQALSNTRTDGLG+LYREGAAAFLNS+VNNRYPFTTN+VR+SFVSALSSN+AAAAQA+VFQMANEG+FKPR
Subjt:  PQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPR

A0A6J1EXH9 protodermal factor 1-like isoform X7

1.8e-151

66.38

Show/hide

Query:  MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPS-DSHGYPPYG-TPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPT
        M   LA LLLWT+ VGLVS ++AIPLTS  +EDQKTYYTPDPHAGSPPS  S G PPYG TPPP GSG SHGGKPP+HGHGGKK  PKPGNCGNPP+TPT
Subjt:  MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPS-DSHGYPPYG-TPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPT

Query:  PSKPPT----------HDPTPSTPSKPPSGGGGHHNP----------------------------------------------------------PTGGG
        PSKPP+          ++PTPS PS PPS GGG+++P                                                          P+GGG
Subjt:  PSKPPT----------HDPTPSTPSKPPSGGGGHHNP----------------------------------------------------------PTGGG

Query:  GYYSPPTYDPTPASPT----TPSTPSGG--------------------------GGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDP---TPSTPPSGGGG
        GYYSPPTYDPTP   T    TPSTPSGG                          GGY+SPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDP   TPSTPPSGG G
Subjt:  GYYSPPTYDPTPASPT----TPSTPSGG--------------------------GGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDP---TPSTPPSGGGG

Query:  YNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNT
        Y+SPP++DP PSTPPSGGNG+YNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYW THPG IWGLLGWWGTMGS FGIT +PGFGATLSLPQALSNT
Subjt:  YNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNT

Query:  RTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPR
        RTDGLG+LYREGAAAFLNS+VNNRYPFTTN+VR+SFVSALSSN+AAAAQA+VFQMANEG+FKPR
Subjt:  RTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPR

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q9S728 Protodermal factor 1

3.2e-57

46.28

Show/hide

Query:  RRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSKP
        R + S  +W +   L+SQ +   + S   ED KTYY       SPPS SHG PP  TPP      S+ G PP          P P     P +TPTPS  
Subjt:  RRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSKP

Query:  PTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPP
        P+H PTP TPS  P+     H PP   G   SPP++  TP+ P+TPS                 PTPS P  GG Y SPP   P   TPPS        P
Subjt:  PTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPP

Query:  TFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGI----TNAPGFGATLSLPQALSNTR
          D  P TP  GG    +PP   TP     P T   PF+P P  P TGTC+YWR HP +IWGLLGWWGT+G AFG     ++ PGF   ++L QALSNTR
Subjt:  TFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGI----TNAPGFGATLSLPQALSNTR

Query:  TDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPR
        +D +GALYREG A++LNSMVN+++PFTT QVR+ FV+ LSSNKAA  QA  F++ANEG+ KPR
Subjt:  TDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPR

Q9SN46 Leucine-rich repeat extensin-like protein 5

1.8e-04

37.24

Show/hide

Query:  TPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGK------KHKPKPGNCGNP--PYTPTPSKPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGH----HNPP
        TP P  GSPPS      P G+PP   +  S GG PPS                 P + G+P  P +PTPS P    PTPSTP  P S G        +PP
Subjt:  TPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGK------KHKPKPGNCGNP--PYTPTPSKPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGH----HNPP

Query:  TGGGGYYSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGY--------YS--------PPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPST
          G    SPP+    P  P  PS P  G   SSPP   PTP  S P    GY        YS        PPT+ P+PS PP        P T+ P P  
Subjt:  TGGGGYYSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGY--------YS--------PPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPST

Query:  PPSGGNGYYNPPTS-----GTPFYGTPPTTSAPPFVPDP
        PP     YY P  S      +P YGTPP  S  P++P P
Subjt:  PPSGGNGYYNPPTS-----GTPFYGTPPTTSAPPFVPDP

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G42840.1 protodermal factor 1

2.3e-58

46.28

Show/hide

Query:  RRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSKP
        R + S  +W +   L+SQ +   + S   ED KTYY       SPPS SHG PP  TPP      S+ G PP          P P     P +TPTPS  
Subjt:  RRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSKP

Query:  PTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPP
        P+H PTP TPS  P+     H PP   G   SPP++  TP+ P+TPS                 PTPS P  GG Y SPP   P   TPPS        P
Subjt:  PTHDPTPSTPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPP

Query:  TFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGI----TNAPGFGATLSLPQALSNTR
          D  P TP  GG    +PP   TP     P T   PF+P P  P TGTC+YWR HP +IWGLLGWWGT+G AFG     ++ PGF   ++L QALSNTR
Subjt:  TFDPTPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGI----TNAPGFGATLSLPQALSNTR

Query:  TDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPR
        +D +GALYREG A++LNSMVN+++PFTT QVR+ FV+ LSSNKAA  QA  F++ANEG+ KPR
Subjt:  TDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPR

AT4G18670.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein

1.3e-05

37.24

Show/hide

Query:  TPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGK------KHKPKPGNCGNP--PYTPTPSKPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGH----HNPP
        TP P  GSPPS      P G+PP   +  S GG PPS                 P + G+P  P +PTPS P    PTPSTP  P S G        +PP
Subjt:  TPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGK------KHKPKPGNCGNP--PYTPTPSKPPTHDPTPSTPSKPPSGGGGH----HNPP

Query:  TGGGGYYSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGY--------YS--------PPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPST
          G    SPP+    P  P  PS P  G   SSPP   PTP  S P    GY        YS        PPT+ P+PS PP        P T+ P P  
Subjt:  TGGGGYYSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGY--------YS--------PPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPST

Query:  PPSGGNGYYNPPTS-----GTPFYGTPPTTSAPPFVPDP
        PP     YY P  S      +P YGTPP  S  P++P P
Subjt:  PPSGGNGYYNPPTS-----GTPFYGTPPTTSAPPFVPDP

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAAAGAAGACTAGCTTCTCTCCTTCTATGGACTGTAATTGTTGGGTTGGTTTCTCAAAACATAGCTATCCCTTTGACGTCTGCAGGCAATGAAGATCAGAAAACTTA
TTACACTCCAGACCCACATGCAGGAAGCCCCCCCTCAGATTCACATGGGTATCCACCTTATGGAACTCCACCACCTCATGGTTCGGGAGAAAGCCATGGAGGAAAACCAC
CCTCTCATGGGCATGGTGGTAAGAAACACAAGCCAAAACCAGGGAACTGCGGGAACCCACCATACACTCCTACTCCGTCAAAACCTCCTACACATGATCCAACCCCATCA
ACTCCATCGAAGCCTCCTTCCGGTGGTGGTGGACATCACAACCCTCCCACTGGTGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCAACATATGATCCCACTCCAGCGTCACCAACGAC
TCCATCAACTCCTTCCGGTGGTGGTGGATACTCTAGCCCTCCAACATATGATCCTACTCCAACCCCATCAACTCCTTCAGGTGGTGGTGGATATTATAGCCCACCAACTT
ATGATCCTACTCCATCAACTCCTCCATCAGGTGGTGGTGGATACAATAGCCCTCCAACTTTTGATCCAACACCATCAACTCCTCCTTCAGGTGGTAATGGCTACTACAAC
CCTCCAACTTCTGGTACACCATTCTATGGAACCCCACCAACCACATCAGCACCTCCTTTTGTTCCTGATCCCAATTCTCCCTTCACTGGCACATGCAACTATTGGAGGAC
GCATCCAGGAATAATATGGGGTTTGTTAGGCTGGTGGGGAACAATGGGCAGTGCTTTTGGTATAACAAACGCTCCAGGCTTCGGAGCTACTCTCAGCTTACCACAAGCAC
TCTCAAACACACGAACTGATGGCCTAGGAGCACTTTACCGAGAAGGAGCTGCGGCTTTCCTGAACTCCATGGTCAACAACAGGTACCCCTTCACAACCAATCAAGTCCGT
GAAAGTTTTGTTTCGGCATTAAGCTCAAACAAAGCAGCAGCAGCACAGGCCCAGGTTTTCCAGATGGCTAACGAGGGTAAATTCAAGCCTAGAACCTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CCTGCAACATATCAACTAACCACATAACCTTCTACCTGCAAATATTTACTTCACTCTCTACCTCACTCCGTCTTTTATATGTTTCGTTTAGTCTTCTCATGCATTTTCAT
CAACAATATATAATCCATCGTCTTCCTTTTCTTCCTTCTCAGTAAAACATACATACCACAATGGAAAGAAGACTAGCTTCTCTCCTTCTATGGACTGTAATTGTTGGGTT
GGTTTCTCAAAACATAGCTATCCCTTTGACGTCTGCAGGCAATGAAGATCAGAAAACTTATTACACTCCAGACCCACATGCAGGAAGCCCCCCCTCAGATTCACATGGGT
ATCCACCTTATGGAACTCCACCACCTCATGGTTCGGGAGAAAGCCATGGAGGAAAACCACCCTCTCATGGGCATGGTGGTAAGAAACACAAGCCAAAACCAGGGAACTGC
GGGAACCCACCATACACTCCTACTCCGTCAAAACCTCCTACACATGATCCAACCCCATCAACTCCATCGAAGCCTCCTTCCGGTGGTGGTGGACATCACAACCCTCCCAC
TGGTGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCAACATATGATCCCACTCCAGCGTCACCAACGACTCCATCAACTCCTTCCGGTGGTGGTGGATACTCTAGCCCTCCAACATATG
ATCCTACTCCAACCCCATCAACTCCTTCAGGTGGTGGTGGATATTATAGCCCACCAACTTATGATCCTACTCCATCAACTCCTCCATCAGGTGGTGGTGGATACAATAGC
CCTCCAACTTTTGATCCAACACCATCAACTCCTCCTTCAGGTGGTAATGGCTACTACAACCCTCCAACTTCTGGTACACCATTCTATGGAACCCCACCAACCACATCAGC
ACCTCCTTTTGTTCCTGATCCCAATTCTCCCTTCACTGGCACATGCAACTATTGGAGGACGCATCCAGGAATAATATGGGGTTTGTTAGGCTGGTGGGGAACAATGGGCA
GTGCTTTTGGTATAACAAACGCTCCAGGCTTCGGAGCTACTCTCAGCTTACCACAAGCACTCTCAAACACACGAACTGATGGCCTAGGAGCACTTTACCGAGAAGGAGCT
GCGGCTTTCCTGAACTCCATGGTCAACAACAGGTACCCCTTCACAACCAATCAAGTCCGTGAAAGTTTTGTTTCGGCATTAAGCTCAAACAAAGCAGCAGCAGCACAGGC
CCAGGTTTTCCAGATGGCTAACGAGGGTAAATTCAAGCCTAGAACCTGAAGCAGAAAAAATTACCATATTTGTGAGTGCATTATGTCTAAGGTAGCAAGCCCCACAGTTT
GTTTCTGTTGTTAAGTATATTACATTTCCTTCCTGTCCCCCTTGTTCTATTCGCTAGTCTACAGTGCGATGGATATCATATGTTACATTTTGATACTTTGCTCGAG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MERRLASLLLWTVIVGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPSDSHGYPPYGTPPPHGSGESHGGKPPSHGHGGKKHKPKPGNCGNPPYTPTPSKPPTHDPTPS
TPSKPPSGGGGHHNPPTGGGGYYSPPTYDPTPASPTTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPPSGGGGYNSPPTFDPTPSTPPSGGNGYYN
PPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVR
ESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGKFKPRT

IVF0019665 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome