CuGenDBv2

Gene ID	IVF0019848
Organism	Cucumis melo ssp. agrestis cv. IVF77 (Melon (IVF77) v1)
Description	Cytochrome b559 subunit alpha
Genome location	chr07:15437953..15438204
RNA-Seq Expression	IVF0019848
Synteny	IVF0019848
Gene Ontology terms	GO:0009767 - photosynthetic electron transport chain (biological process) GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component) GO:0009539 - photosystem II reaction center (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0005506 - iron ion binding (molecular function) GO:0009055 - electron transfer activity (molecular function) GO:0020037 - heme binding (molecular function)
InterPro domains	IPR006216 - Photosystem II cytochrome b559, conserved site IPR006217 - Photosystem II cytochrome b559, alpha subunit IPR013081 - Photosystem II cytochrome b559, N-terminal IPR013082 - Photosystem II cytochrome b559, alpha subunit, lumenal region IPR037025 - Photosystem II cytochrome b559, alpha subunit superfamily

Homology

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e value

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QEV84727.1 photosystem II cytochrome b559 alpha subunit [Hexalectris grandiflora]

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YP_001595525.1 PSII reaction center subunit V [Lemna minor]

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YP_009725837.1 PsbE [Allium fasciculatum]

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A0A1D8RD36 Cytochrome b559 subunit alpha

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A0A3P8MMX8 Cytochrome b559 subunit alpha

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A0A650CZ32 Cytochrome b559 subunit alpha

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H2FA99 Cytochrome b559 subunit alpha

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H2FAA0 Cytochrome b559 subunit alpha

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SwissProt top hits

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P56779 Cytochrome b559 subunit alpha

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P59702 Cytochrome b559 subunit alpha

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P69382 Cytochrome b559 subunit alpha

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Q4VZH5 Cytochrome b559 subunit alpha

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Q70XY9 Cytochrome b559 subunit alpha

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ATCG00580.1 photosystem II reaction center protein E

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Sequences

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ATGTCTGGAAGCACAGGAGAACATTCTTTTGTTGATATTATCACCAGTATTCGATATTGGGTCATTCATAGCATTACTATACCTTCTCCATTCATTGCAGGTTGGTTATT
CGTCAGCACGGGTTTAGCTTACGATGTTTTTGGAAGCCCTCGTCCAAATGAGTATTATACAGAGAGTCGACAAGGAATTCCATTAATAACTGGCCGTTTTGATTCTTTGG
AACAACTCGATGAATTTAGTAGGTCTTTTTAG

mRNA sequence

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Protein sequence

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MSGSTGEHSFVDIITSIRYWVIHSITIPSPFIAGWLFVSTGLAYDVFGSPRPNEYYTESRQGIPLITGRFDSLEQLDEFSRSF

IVF0019848 (gene) of Melon (IVF77) v1 genome